data_1XD1 # _model_server_result.job_id SZ-ddb6Snz9GZK6wy2qWNA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 15:30:35' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1xd1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":498}' # _entry.id 1XD1 # _exptl.entry_id 1XD1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 35.453 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CHLORIDE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1XD1 _cell.length_a 52.7 _cell.length_b 69 _cell.length_c 132.3 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1XD1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 5 _struct_asym.id E _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 28 A CYS 28 1_555 A SG CYS 86 A CYS 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 70 A CYS 70 1_555 A SG CYS 115 A CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 141 A CYS 141 1_555 A SG CYS 160 A CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 378 A CYS 378 1_555 A SG CYS 384 A CYS 384 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 450 A CYS 450 1_555 A SG CYS 462 A CYS 462 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? covale ? covale1 A C PCA 1 A PCA 1 1_555 A N TYR 2 A TYR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 461 A ASN 461 1_555 B C1 NAG . A NAG 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASN 100 A ASN 100 1_555 D CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? metalc ? metalc2 A O ARG 158 A ARG 158 1_555 D CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 167 A ASP 167 1_555 D CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.597 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 167 A ASP 167 1_555 D CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc5 A O HIS 201 A HIS 201 1_555 D CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? # _chem_comp.formula 'Cl -1' _chem_comp.formula_weight 35.453 _chem_comp.id CL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CHLORIDE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1XD1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018975 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014493 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007559 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NAG A 1 499 499 NAG NAG . C 3 6SA A 1 501 501 6SA HEX . D 4 CA A 1 497 497 CA CA . E 5 CL A 1 498 498 CL CL . F 6 HOH A 1 502 502 HOH WAT . F 6 HOH A 2 503 503 HOH WAT . F 6 HOH A 3 504 504 HOH WAT . F 6 HOH A 4 505 505 HOH WAT . F 6 HOH A 5 506 506 HOH WAT . F 6 HOH A 6 507 507 HOH WAT . F 6 HOH A 7 508 508 HOH WAT . F 6 HOH A 8 509 509 HOH WAT . F 6 HOH A 9 510 510 HOH WAT . F 6 HOH A 10 511 511 HOH WAT . F 6 HOH A 11 512 512 HOH WAT . F 6 HOH A 12 513 513 HOH WAT . F 6 HOH A 13 514 514 HOH WAT . F 6 HOH A 14 515 515 HOH WAT . F 6 HOH A 15 516 516 HOH WAT . F 6 HOH A 16 517 517 HOH WAT . F 6 HOH A 17 518 518 HOH WAT . F 6 HOH A 18 519 519 HOH WAT . F 6 HOH A 19 520 520 HOH WAT . F 6 HOH A 20 521 521 HOH WAT . F 6 HOH A 21 522 522 HOH WAT . F 6 HOH A 22 523 523 HOH WAT . F 6 HOH A 23 524 524 HOH WAT . F 6 HOH A 24 525 525 HOH WAT . F 6 HOH A 25 526 526 HOH WAT . F 6 HOH A 26 527 527 HOH WAT . F 6 HOH A 27 528 528 HOH WAT . F 6 HOH A 28 529 529 HOH WAT . F 6 HOH A 29 530 530 HOH WAT . F 6 HOH A 30 531 531 HOH WAT . F 6 HOH A 31 532 532 HOH WAT . F 6 HOH A 32 533 533 HOH WAT . F 6 HOH A 33 534 534 HOH WAT . F 6 HOH A 34 535 535 HOH WAT . F 6 HOH A 35 536 536 HOH WAT . F 6 HOH A 36 537 537 HOH WAT . F 6 HOH A 37 538 538 HOH WAT . F 6 HOH A 38 539 539 HOH WAT . F 6 HOH A 39 540 540 HOH WAT . F 6 HOH A 40 541 541 HOH WAT . F 6 HOH A 41 542 542 HOH WAT . F 6 HOH A 42 543 543 HOH WAT . F 6 HOH A 43 544 544 HOH WAT . F 6 HOH A 44 545 545 HOH WAT . F 6 HOH A 45 546 546 HOH WAT . F 6 HOH A 46 547 547 HOH WAT . F 6 HOH A 47 548 548 HOH WAT . F 6 HOH A 48 549 549 HOH WAT . F 6 HOH A 49 550 550 HOH WAT . F 6 HOH A 50 551 551 HOH WAT . F 6 HOH A 51 552 552 HOH WAT . F 6 HOH A 52 553 553 HOH WAT . F 6 HOH A 53 554 554 HOH WAT . F 6 HOH A 54 555 555 HOH WAT . F 6 HOH A 55 556 556 HOH WAT . F 6 HOH A 56 557 557 HOH WAT . F 6 HOH A 57 558 558 HOH WAT . F 6 HOH A 58 559 559 HOH WAT . F 6 HOH A 59 560 560 HOH WAT . F 6 HOH A 60 561 561 HOH WAT . F 6 HOH A 61 562 562 HOH WAT . F 6 HOH A 62 563 563 HOH WAT . F 6 HOH A 63 564 564 HOH WAT . F 6 HOH A 64 565 565 HOH WAT . F 6 HOH A 65 566 566 HOH WAT . F 6 HOH A 66 567 567 HOH WAT . F 6 HOH A 67 568 568 HOH WAT . F 6 HOH A 68 569 569 HOH WAT . F 6 HOH A 69 570 570 HOH WAT . F 6 HOH A 70 571 571 HOH WAT . F 6 HOH A 71 572 572 HOH WAT . F 6 HOH A 72 573 573 HOH WAT . F 6 HOH A 73 574 574 HOH WAT . F 6 HOH A 74 575 575 HOH WAT . F 6 HOH A 75 576 576 HOH WAT . F 6 HOH A 76 577 577 HOH WAT . F 6 HOH A 77 578 578 HOH WAT . F 6 HOH A 78 579 579 HOH WAT . F 6 HOH A 79 580 580 HOH WAT . F 6 HOH A 80 581 581 HOH WAT . F 6 HOH A 81 582 582 HOH WAT . F 6 HOH A 82 583 583 HOH WAT . F 6 HOH A 83 584 584 HOH WAT . F 6 HOH A 84 585 585 HOH WAT . F 6 HOH A 85 586 586 HOH WAT . F 6 HOH A 86 587 587 HOH WAT . F 6 HOH A 87 588 588 HOH WAT . F 6 HOH A 88 589 589 HOH WAT . F 6 HOH A 89 590 590 HOH WAT . F 6 HOH A 90 591 591 HOH WAT . F 6 HOH A 91 592 592 HOH WAT . F 6 HOH A 92 593 593 HOH WAT . F 6 HOH A 93 594 594 HOH WAT . F 6 HOH A 94 595 595 HOH WAT . F 6 HOH A 95 596 596 HOH WAT . F 6 HOH A 96 597 597 HOH WAT . F 6 HOH A 97 598 598 HOH WAT . F 6 HOH A 98 599 599 HOH WAT . F 6 HOH A 99 600 600 HOH WAT . F 6 HOH A 100 601 601 HOH WAT . F 6 HOH A 101 602 602 HOH WAT . F 6 HOH A 102 603 603 HOH WAT . F 6 HOH A 103 604 604 HOH WAT . F 6 HOH A 104 605 605 HOH WAT . F 6 HOH A 105 606 606 HOH WAT . F 6 HOH A 106 607 607 HOH WAT . F 6 HOH A 107 608 608 HOH WAT . F 6 HOH A 108 609 609 HOH WAT . F 6 HOH A 109 610 610 HOH WAT . F 6 HOH A 110 612 612 HOH WAT . F 6 HOH A 111 613 613 HOH WAT . F 6 HOH A 112 614 614 HOH WAT . F 6 HOH A 113 615 615 HOH WAT . F 6 HOH A 114 616 616 HOH WAT . F 6 HOH A 115 617 617 HOH WAT . F 6 HOH A 116 618 618 HOH WAT . F 6 HOH A 117 619 619 HOH WAT . F 6 HOH A 118 620 620 HOH WAT . F 6 HOH A 119 622 622 HOH WAT . F 6 HOH A 120 623 623 HOH WAT . F 6 HOH A 121 624 624 HOH WAT . F 6 HOH A 122 625 625 HOH WAT . F 6 HOH A 123 626 626 HOH WAT . F 6 HOH A 124 627 627 HOH WAT . F 6 HOH A 125 628 628 HOH WAT . F 6 HOH A 126 629 629 HOH WAT . F 6 HOH A 127 630 630 HOH WAT . F 6 HOH A 128 631 631 HOH WAT . F 6 HOH A 129 632 632 HOH WAT . F 6 HOH A 130 633 633 HOH WAT . F 6 HOH A 131 634 634 HOH WAT . F 6 HOH A 132 635 635 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CL _atom_site.label_atom_id CL _atom_site.label_comp_id CL _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 7.467 _atom_site.Cartn_y 23.304 _atom_site.Cartn_z 48.971 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 18.4 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CL _atom_site.auth_comp_id CL _atom_site.auth_seq_id 498 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 269 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #