data_1XP7 # _model_server_result.job_id '_S-5o7WKNvFld1PWrcP9eg' _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 20:03:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1xp7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":103}' # _entry.id 1XP7 # _exptl.entry_id 1XP7 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1XP7 _cell.length_a 27.38 _cell.length_b 116.19 _cell.length_c 94.5 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1XP7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O2' C 1 A C 1 1_555 F NA NA . A NA 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc ? metalc2 A O2 C 1 A C 1 1_555 F NA NA . A NA 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc3 C MG MG . A MG 103 1_555 J O HOH . A HOH 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? metalc ? metalc4 G MG MG . B MG 101 1_555 K O HOH . B HOH 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.908 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 C 1 A C 1 1_555 A N1 G 23 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N4 C 1 A C 1 1_555 A O6 G 23 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O2 C 1 A C 1 1_555 A N2 G 23 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 U 2 A U 2 1_555 A N1 A 22 A A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A O4 U 2 A U 2 1_555 A N6 A 22 A A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N3 U 3 A U 3 1_555 A N1 A 21 A A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A O4 U 3 A U 3 1_555 A N6 A 21 A A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N1 G 4 A G 4 1_555 A N3 C 20 A C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N2 G 4 A G 4 1_555 A O2 C 20 A C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A O6 G 4 A G 4 1_555 A N4 C 20 A C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 C 5 A C 5 1_555 A N1 G 19 A G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N4 C 5 A C 5 1_555 A O6 G 19 A G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A O2 C 5 A C 5 1_555 A N2 G 19 A G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N3 U 6 A U 6 1_555 A N1 A 18 A A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A O4 U 6 A U 6 1_555 A N6 A 18 A A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N1 G 7 A G 7 1_555 A N3 C 17 A C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N2 G 7 A G 7 1_555 A O2 C 17 A C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A O6 G 7 A G 7 1_555 A N4 C 17 A C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N1 G 10 A G 10 1_555 B N3 C 15 B C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N2 G 10 A G 10 1_555 B O2 C 15 B C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O6 G 10 A G 10 1_555 B N4 C 15 B C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N3 U 11 A U 11 1_555 B N1 A 14 B A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A O4 U 11 A U 11 1_555 B N6 A 14 B A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N1 G 12 A G 12 1_555 B N3 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N2 G 12 A G 12 1_555 B O2 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A O6 G 12 A G 12 1_555 B N4 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N3 C 13 A C 13 1_555 B N1 G 12 B G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N4 C 13 A C 13 1_555 B O6 G 12 B G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A O2 C 13 A C 13 1_555 B N2 G 12 B G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N1 A 14 A A 14 1_555 B N3 U 11 B U 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N6 A 14 A A 14 1_555 B O4 U 11 B U 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N3 C 15 A C 15 1_555 B N1 G 10 B G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N4 C 15 A C 15 1_555 B O6 G 10 B G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O2 C 15 A C 15 1_555 B N2 G 10 B G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B N3 C 1 B C 1 1_555 B N1 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N4 C 1 B C 1 1_555 B O6 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B O2 C 1 B C 1 1_555 B N2 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B N3 U 2 B U 2 1_555 B N1 A 22 B A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B O4 U 2 B U 2 1_555 B N6 A 22 B A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N3 U 3 B U 3 1_555 B N1 A 21 B A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O4 U 3 B U 3 1_555 B N6 A 21 B A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N1 G 4 B G 4 1_555 B N3 C 20 B C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N2 G 4 B G 4 1_555 B O2 C 20 B C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B O6 G 4 B G 4 1_555 B N4 C 20 B C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N3 C 5 B C 5 1_555 B N1 G 19 B G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N4 C 5 B C 5 1_555 B O6 G 19 B G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B O2 C 5 B C 5 1_555 B N2 G 19 B G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B N3 U 6 B U 6 1_555 B N1 A 18 B A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B O4 U 6 B U 6 1_555 B N6 A 18 B A 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B N1 G 7 B G 7 1_555 B N3 C 17 B C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B N2 G 7 B G 7 1_555 B O2 C 17 B C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B O6 G 7 B G 7 1_555 B N4 C 17 B C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1XP7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.036523 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008607 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010582 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 MG A 1 103 103 MG MG . D 3 SO4 A 1 104 104 SO4 SO4 . E 2 MG A 1 105 105 MG MG . F 4 NA A 1 107 107 NA NA . G 2 MG B 1 101 101 MG MG . H 2 MG B 1 102 102 MG MG . I 3 SO4 B 1 106 106 SO4 SO4 . J 5 HOH A 1 108 4 HOH TIP . J 5 HOH A 2 109 5 HOH TIP . J 5 HOH A 3 110 8 HOH TIP . J 5 HOH A 4 111 10 HOH TIP . J 5 HOH A 5 112 12 HOH TIP . J 5 HOH A 6 113 13 HOH TIP . J 5 HOH A 7 114 14 HOH TIP . J 5 HOH A 8 115 16 HOH TIP . J 5 HOH A 9 116 20 HOH TIP . J 5 HOH A 10 117 21 HOH TIP . J 5 HOH A 11 118 22 HOH TIP . J 5 HOH A 12 119 23 HOH TIP . J 5 HOH A 13 120 24 HOH TIP . J 5 HOH A 14 121 25 HOH TIP . J 5 HOH A 15 122 30 HOH TIP . J 5 HOH A 16 123 33 HOH TIP . J 5 HOH A 17 124 35 HOH TIP . J 5 HOH A 18 125 36 HOH TIP . J 5 HOH A 19 126 40 HOH TIP . J 5 HOH A 20 127 45 HOH TIP . J 5 HOH A 21 128 46 HOH TIP . K 5 HOH B 1 107 1 HOH TIP . K 5 HOH B 2 108 2 HOH TIP . K 5 HOH B 3 109 3 HOH TIP . K 5 HOH B 4 110 6 HOH TIP . K 5 HOH B 5 111 7 HOH TIP . K 5 HOH B 6 112 9 HOH TIP . K 5 HOH B 7 113 11 HOH TIP . K 5 HOH B 8 114 17 HOH TIP . K 5 HOH B 9 115 18 HOH TIP . K 5 HOH B 10 116 19 HOH TIP . K 5 HOH B 11 117 26 HOH TIP . K 5 HOH B 12 118 27 HOH TIP . K 5 HOH B 13 119 28 HOH TIP . K 5 HOH B 14 120 29 HOH TIP . K 5 HOH B 15 121 31 HOH TIP . K 5 HOH B 16 122 32 HOH TIP . K 5 HOH B 17 123 34 HOH TIP . K 5 HOH B 18 124 37 HOH TIP . K 5 HOH B 19 125 38 HOH TIP . K 5 HOH B 20 126 39 HOH TIP . K 5 HOH B 21 127 41 HOH TIP . K 5 HOH B 22 128 42 HOH TIP . K 5 HOH B 23 129 43 HOH TIP . K 5 HOH B 24 130 44 HOH TIP . K 5 HOH B 25 131 47 HOH TIP . K 5 HOH B 26 132 48 HOH TIP . K 5 HOH B 27 133 49 HOH TIP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 26.513 _atom_site.Cartn_y 66.907 _atom_site.Cartn_z 55.424 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 49.03 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 103 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 5 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 247 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #