data_1XUZ
#
_model_server_result.job_id            x7krb9DuFYYgeCmUyi6JpA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-21 03:59:46' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1xuz 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1001}' 
#
_entry.id    1XUZ 
#
_exptl.entry_id    1XUZ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              54.938 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MANGANESE (II) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1XUZ 
_cell.length_a            58.531 
_cell.length_b            75.654 
_cell.length_c            77.866 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1XUZ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        18 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA,PQS 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_855 -x+3,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 175.593 0 0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             C 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 215 A HIS 215 1_555 C MN MN . A MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc2 A NE2 HIS 236 A HIS 236 1_555 C MN MN . A MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc3 C MN MN . A MN 1001 1_555 D O2P PEP . A PEP 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
metalc ? metalc4 C MN MN . A MN 1001 1_555 B O1 MMN . A MMN 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc5 C MN MN . A MN 1001 1_555 E O HOH . A HOH 3020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc6 C MN MN . A MN 1001 1_555 E O HOH . A HOH 3035 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mn 2' 
_chem_comp.formula_weight    54.938 
_chem_comp.id                MN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MANGANESE (II) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1XUZ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017085 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013218 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012843 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 MMN A 1 3001 3001 MMN NML . 
C 3 MN A 1 1001 1001 MN MN2 . 
D 4 PEP A 1 2001 2001 PEP PEP . 
E 5 HOH A 1 3002 1 HOH WAT . 
E 5 HOH A 2 3003 2 HOH WAT . 
E 5 HOH A 3 3004 3 HOH WAT . 
E 5 HOH A 4 3005 4 HOH WAT . 
E 5 HOH A 5 3006 5 HOH WAT . 
E 5 HOH A 6 3007 6 HOH WAT . 
E 5 HOH A 7 3008 7 HOH WAT . 
E 5 HOH A 8 3009 8 HOH WAT . 
E 5 HOH A 9 3010 9 HOH WAT . 
E 5 HOH A 10 3011 10 HOH WAT . 
E 5 HOH A 11 3012 11 HOH WAT . 
E 5 HOH A 12 3013 12 HOH WAT . 
E 5 HOH A 13 3014 13 HOH WAT . 
E 5 HOH A 14 3015 14 HOH WAT . 
E 5 HOH A 15 3016 15 HOH WAT . 
E 5 HOH A 16 3017 16 HOH WAT . 
E 5 HOH A 17 3018 17 HOH WAT . 
E 5 HOH A 18 3019 18 HOH WAT . 
E 5 HOH A 19 3020 19 HOH WAT . 
E 5 HOH A 20 3021 20 HOH WAT . 
E 5 HOH A 21 3022 21 HOH WAT . 
E 5 HOH A 22 3023 22 HOH WAT . 
E 5 HOH A 23 3024 23 HOH WAT . 
E 5 HOH A 24 3025 24 HOH WAT . 
E 5 HOH A 25 3026 25 HOH WAT . 
E 5 HOH A 26 3027 26 HOH WAT . 
E 5 HOH A 27 3028 27 HOH WAT . 
E 5 HOH A 28 3029 28 HOH WAT . 
E 5 HOH A 29 3030 29 HOH WAT . 
E 5 HOH A 30 3031 30 HOH WAT . 
E 5 HOH A 31 3032 31 HOH WAT . 
E 5 HOH A 32 3033 32 HOH WAT . 
E 5 HOH A 33 3034 33 HOH WAT . 
E 5 HOH A 34 3035 34 HOH WAT . 
E 5 HOH A 35 3036 35 HOH WAT . 
E 5 HOH A 36 3037 36 HOH WAT . 
E 5 HOH A 37 3038 37 HOH WAT . 
E 5 HOH A 38 3039 38 HOH WAT . 
E 5 HOH A 39 3040 39 HOH WAT . 
E 5 HOH A 40 3041 40 HOH WAT . 
E 5 HOH A 41 3042 41 HOH WAT . 
E 5 HOH A 42 3043 42 HOH WAT . 
E 5 HOH A 43 3044 43 HOH WAT . 
E 5 HOH A 44 3045 44 HOH WAT . 
E 5 HOH A 45 3046 45 HOH WAT . 
E 5 HOH A 46 3047 46 HOH WAT . 
E 5 HOH A 47 3048 47 HOH WAT . 
E 5 HOH A 48 3049 48 HOH WAT . 
E 5 HOH A 49 3050 49 HOH WAT . 
E 5 HOH A 50 3051 50 HOH WAT . 
E 5 HOH A 51 3052 51 HOH WAT . 
E 5 HOH A 52 3053 52 HOH WAT . 
E 5 HOH A 53 3054 53 HOH WAT . 
E 5 HOH A 54 3055 54 HOH WAT . 
E 5 HOH A 55 3056 55 HOH WAT . 
E 5 HOH A 56 3057 56 HOH WAT . 
E 5 HOH A 57 3058 57 HOH WAT . 
E 5 HOH A 58 3059 58 HOH WAT . 
E 5 HOH A 59 3060 59 HOH WAT . 
E 5 HOH A 60 3061 60 HOH WAT . 
E 5 HOH A 61 3062 61 HOH WAT . 
E 5 HOH A 62 3063 62 HOH WAT . 
E 5 HOH A 63 3064 63 HOH WAT . 
E 5 HOH A 64 3065 64 HOH WAT . 
E 5 HOH A 65 3066 65 HOH WAT . 
E 5 HOH A 66 3067 66 HOH WAT . 
E 5 HOH A 67 3068 67 HOH WAT . 
E 5 HOH A 68 3069 68 HOH WAT . 
E 5 HOH A 69 3070 69 HOH WAT . 
E 5 HOH A 70 3071 70 HOH WAT . 
E 5 HOH A 71 3072 71 HOH WAT . 
E 5 HOH A 72 3073 72 HOH WAT . 
E 5 HOH A 73 3074 73 HOH WAT . 
E 5 HOH A 74 3075 74 HOH WAT . 
E 5 HOH A 75 3076 75 HOH WAT . 
E 5 HOH A 76 3077 76 HOH WAT . 
E 5 HOH A 77 3078 77 HOH WAT . 
E 5 HOH A 78 3079 78 HOH WAT . 
E 5 HOH A 79 3080 79 HOH WAT . 
E 5 HOH A 80 3081 80 HOH WAT . 
E 5 HOH A 81 3082 81 HOH WAT . 
E 5 HOH A 82 3083 82 HOH WAT . 
E 5 HOH A 83 3084 83 HOH WAT . 
E 5 HOH A 84 3085 84 HOH WAT . 
E 5 HOH A 85 3086 85 HOH WAT . 
E 5 HOH A 86 3087 86 HOH WAT . 
E 5 HOH A 87 3088 87 HOH WAT . 
E 5 HOH A 88 3089 88 HOH WAT . 
E 5 HOH A 89 3090 89 HOH WAT . 
E 5 HOH A 90 3091 90 HOH WAT . 
E 5 HOH A 91 3092 91 HOH WAT . 
E 5 HOH A 92 3093 92 HOH WAT . 
E 5 HOH A 93 3094 93 HOH WAT . 
E 5 HOH A 94 3095 94 HOH WAT . 
E 5 HOH A 95 3096 95 HOH WAT . 
E 5 HOH A 96 3097 96 HOH WAT . 
E 5 HOH A 97 3098 97 HOH WAT . 
E 5 HOH A 98 3099 98 HOH WAT . 
E 5 HOH A 99 3100 99 HOH WAT . 
E 5 HOH A 100 3101 100 HOH WAT . 
E 5 HOH A 101 3102 101 HOH WAT . 
E 5 HOH A 102 3103 102 HOH WAT . 
E 5 HOH A 103 3104 103 HOH WAT . 
E 5 HOH A 104 3105 104 HOH WAT . 
E 5 HOH A 105 3106 105 HOH WAT . 
E 5 HOH A 106 3107 106 HOH WAT . 
E 5 HOH A 107 3108 107 HOH WAT . 
E 5 HOH A 108 3109 108 HOH WAT . 
E 5 HOH A 109 3110 109 HOH WAT . 
E 5 HOH A 110 3111 110 HOH WAT . 
E 5 HOH A 111 3112 111 HOH WAT . 
E 5 HOH A 112 3113 112 HOH WAT . 
E 5 HOH A 113 3114 113 HOH WAT . 
E 5 HOH A 114 3115 114 HOH WAT . 
E 5 HOH A 115 3116 115 HOH WAT . 
E 5 HOH A 116 3117 116 HOH WAT . 
E 5 HOH A 117 3118 117 HOH WAT . 
E 5 HOH A 118 3119 118 HOH WAT . 
E 5 HOH A 119 3120 119 HOH WAT . 
E 5 HOH A 120 3121 120 HOH WAT . 
E 5 HOH A 121 3122 121 HOH WAT . 
E 5 HOH A 122 3123 122 HOH WAT . 
E 5 HOH A 123 3124 123 HOH WAT . 
E 5 HOH A 124 3125 124 HOH WAT . 
E 5 HOH A 125 3126 125 HOH WAT . 
E 5 HOH A 126 3127 126 HOH WAT . 
E 5 HOH A 127 3128 127 HOH WAT . 
E 5 HOH A 128 3129 128 HOH WAT . 
E 5 HOH A 129 3130 129 HOH WAT . 
E 5 HOH A 130 3131 130 HOH WAT . 
E 5 HOH A 131 3132 131 HOH WAT . 
E 5 HOH A 132 3133 132 HOH WAT . 
E 5 HOH A 133 3134 133 HOH WAT . 
E 5 HOH A 134 3135 134 HOH WAT . 
E 5 HOH A 135 3136 135 HOH WAT . 
E 5 HOH A 136 3137 136 HOH WAT . 
E 5 HOH A 137 3138 137 HOH WAT . 
E 5 HOH A 138 3139 138 HOH WAT . 
E 5 HOH A 139 3140 139 HOH WAT . 
E 5 HOH A 140 3141 140 HOH WAT . 
E 5 HOH A 141 3142 141 HOH WAT . 
E 5 HOH A 142 3143 142 HOH WAT . 
E 5 HOH A 143 3144 143 HOH WAT . 
E 5 HOH A 144 3145 144 HOH WAT . 
E 5 HOH A 145 3146 145 HOH WAT . 
E 5 HOH A 146 3147 146 HOH WAT . 
E 5 HOH A 147 3148 147 HOH WAT . 
E 5 HOH A 148 3149 148 HOH WAT . 
E 5 HOH A 149 3150 149 HOH WAT . 
E 5 HOH A 150 3151 150 HOH WAT . 
E 5 HOH A 151 3152 151 HOH WAT . 
E 5 HOH A 152 3153 152 HOH WAT . 
E 5 HOH A 153 3154 153 HOH WAT . 
E 5 HOH A 154 3155 154 HOH WAT . 
E 5 HOH A 155 3156 155 HOH WAT . 
E 5 HOH A 156 3157 156 HOH WAT . 
E 5 HOH A 157 3158 157 HOH WAT . 
E 5 HOH A 158 3159 158 HOH WAT . 
E 5 HOH A 159 3160 159 HOH WAT . 
E 5 HOH A 160 3161 160 HOH WAT . 
E 5 HOH A 161 3162 161 HOH WAT . 
E 5 HOH A 162 3163 162 HOH WAT . 
E 5 HOH A 163 3164 163 HOH WAT . 
E 5 HOH A 164 3165 164 HOH WAT . 
E 5 HOH A 165 3166 165 HOH WAT . 
E 5 HOH A 166 3167 166 HOH WAT . 
E 5 HOH A 167 3168 167 HOH WAT . 
E 5 HOH A 168 3169 168 HOH WAT . 
E 5 HOH A 169 3170 169 HOH WAT . 
E 5 HOH A 170 3171 170 HOH WAT . 
E 5 HOH A 171 3172 171 HOH WAT . 
E 5 HOH A 172 3173 172 HOH WAT . 
E 5 HOH A 173 3174 173 HOH WAT . 
E 5 HOH A 174 3175 174 HOH WAT . 
E 5 HOH A 175 3176 175 HOH WAT . 
E 5 HOH A 176 3177 176 HOH WAT . 
E 5 HOH A 177 3178 177 HOH WAT . 
E 5 HOH A 178 3179 178 HOH WAT . 
E 5 HOH A 179 3180 179 HOH WAT . 
E 5 HOH A 180 3181 180 HOH WAT . 
E 5 HOH A 181 3182 181 HOH WAT . 
E 5 HOH A 182 3183 182 HOH WAT . 
E 5 HOH A 183 3184 183 HOH WAT . 
E 5 HOH A 184 3185 184 HOH WAT . 
E 5 HOH A 185 3186 185 HOH WAT . 
E 5 HOH A 186 3187 186 HOH WAT . 
E 5 HOH A 187 3188 187 HOH WAT . 
E 5 HOH A 188 3189 188 HOH WAT . 
E 5 HOH A 189 3190 189 HOH WAT . 
E 5 HOH A 190 3191 190 HOH WAT . 
E 5 HOH A 191 3192 191 HOH WAT . 
E 5 HOH A 192 3193 192 HOH WAT . 
E 5 HOH A 193 3194 193 HOH WAT . 
E 5 HOH A 194 3195 194 HOH WAT . 
E 5 HOH A 195 3196 195 HOH WAT . 
E 5 HOH A 196 3197 196 HOH WAT . 
E 5 HOH A 197 3198 197 HOH WAT . 
E 5 HOH A 198 3199 198 HOH WAT . 
E 5 HOH A 199 3200 199 HOH WAT . 
E 5 HOH A 200 3201 200 HOH WAT . 
E 5 HOH A 201 3202 201 HOH WAT . 
E 5 HOH A 202 3203 202 HOH WAT . 
E 5 HOH A 203 3204 203 HOH WAT . 
E 5 HOH A 204 3205 204 HOH WAT . 
E 5 HOH A 205 3206 205 HOH WAT . 
E 5 HOH A 206 3207 206 HOH WAT . 
E 5 HOH A 207 3208 207 HOH WAT . 
E 5 HOH A 208 3209 208 HOH WAT . 
E 5 HOH A 209 3210 209 HOH WAT . 
E 5 HOH A 210 3211 210 HOH WAT . 
E 5 HOH A 211 3212 211 HOH WAT . 
E 5 HOH A 212 3213 212 HOH WAT . 
E 5 HOH A 213 3214 213 HOH WAT . 
E 5 HOH A 214 3215 214 HOH WAT . 
E 5 HOH A 215 3216 215 HOH WAT . 
E 5 HOH A 216 3217 216 HOH WAT . 
E 5 HOH A 217 3218 217 HOH WAT . 
E 5 HOH A 218 3219 218 HOH WAT . 
E 5 HOH A 219 3220 219 HOH WAT . 
E 5 HOH A 220 3221 220 HOH WAT . 
E 5 HOH A 221 3222 221 HOH WAT . 
E 5 HOH A 222 3223 222 HOH WAT . 
E 5 HOH A 223 3224 223 HOH WAT . 
E 5 HOH A 224 3225 224 HOH WAT . 
E 5 HOH A 225 3226 225 HOH WAT . 
E 5 HOH A 226 3227 226 HOH WAT . 
E 5 HOH A 227 3228 227 HOH WAT . 
E 5 HOH A 228 3229 228 HOH WAT . 
E 5 HOH A 229 3230 229 HOH WAT . 
E 5 HOH A 230 3231 230 HOH WAT . 
E 5 HOH A 231 3232 231 HOH WAT . 
E 5 HOH A 232 3233 232 HOH WAT . 
E 5 HOH A 233 3234 233 HOH WAT . 
E 5 HOH A 234 3235 234 HOH WAT . 
E 5 HOH A 235 3236 235 HOH WAT . 
E 5 HOH A 236 3237 236 HOH WAT . 
E 5 HOH A 237 3238 237 HOH WAT . 
E 5 HOH A 238 3239 238 HOH WAT . 
E 5 HOH A 239 3240 239 HOH WAT . 
E 5 HOH A 240 3241 240 HOH WAT . 
E 5 HOH A 241 3242 241 HOH WAT . 
E 5 HOH A 242 3243 242 HOH WAT . 
E 5 HOH A 243 3244 243 HOH WAT . 
E 5 HOH A 244 3245 244 HOH WAT . 
E 5 HOH A 245 3246 245 HOH WAT . 
E 5 HOH A 246 3247 246 HOH WAT . 
E 5 HOH A 247 3248 247 HOH WAT . 
E 5 HOH A 248 3249 248 HOH WAT . 
E 5 HOH A 249 3250 249 HOH WAT . 
E 5 HOH A 250 3251 250 HOH WAT . 
E 5 HOH A 251 3252 251 HOH WAT . 
E 5 HOH A 252 3253 252 HOH WAT . 
E 5 HOH A 253 3254 253 HOH WAT . 
E 5 HOH A 254 3255 254 HOH WAT . 
E 5 HOH A 255 3256 255 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MN 
_atom_site.label_atom_id         MN 
_atom_site.label_comp_id         MN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         C 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               95.501 
_atom_site.Cartn_y               -18.514 
_atom_site.Cartn_z               51.392 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        16.27 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MN 
_atom_site.auth_comp_id          MN 
_atom_site.auth_seq_id           1001 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    8 
_model_server_stats.query_time_ms           279 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#