data_1XVR
#
_model_server_result.job_id            bDSjrynAgM9LLWj9OARBkA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-06 09:28:37' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1xvr 
#
_model_server_params.name     atom_site 
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_entry.id    1XVR 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            2-CARBOXYQUINOXALINE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_cell.length_c            34.143 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1XVR 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
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#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 G N N 
? 4 H N N 
? 4 I N N 
? 4 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 E MG MG . A MG 201 1_555 K O HOH . A HOH 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc2 E MG MG . A MG 201 1_555 K O HOH . A HOH 2005 2_657 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc3 E MG MG . A MG 201 1_555 K O HOH . A HOH 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? 
metalc ? metalc4 E MG MG . A MG 201 1_555 K O HOH . A HOH 2006 2_657 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.981 ? 
metalc ? metalc5 E MG MG . A MG 201 1_555 M O HOH . D HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? 
metalc ? metalc6 E MG MG . A MG 201 1_555 M O HOH . D HOH 2001 2_657 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc7 F MG MG . C MG 211 1_555 N O HOH . E HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc8 F MG MG . C MG 211 1_555 N O HOH . E HOH 2001 2_657 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc9 F MG MG . C MG 211 1_555 L O HOH . C HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc10 F MG MG . C MG 211 1_555 L O HOH . C HOH 2002 2_657 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc11 F MG MG . C MG 211 1_555 L O HOH . C HOH 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? 
metalc ? metalc12 F MG MG . C MG 211 1_555 L O HOH . C HOH 2003 2_657 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? 
covale ? covale1 G C QUI . D QUI 0 1_555 C N DSN 1 D DSN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.361 ? 
covale ? covale2 C C DSN 1 D DSN 1 1_555 C N ALA 2 D ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale3 C OG DSN 1 D DSN 1 1_555 C C MVA 8 D MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale4 C C ALA 2 D ALA 2 1_555 C N N2C 3 D N2C 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale5 C C N2C 3 D N2C 3 1_555 C N MVA 4 D MVA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? 
covale ? covale6 C CB N2C 3 D N2C 3 1_555 C SG NCY 7 D NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.797 ? 
covale ? covale7 C C MVA 4 D MVA 4 1_555 C OG DSN 5 D DSN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.313 ? 
covale ? covale8 C C DSN 5 D DSN 5 1_555 C N ALA 6 D ALA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale9 C N DSN 5 D DSN 5 1_555 H C QUI . D QUI 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.36 ? 
covale ? covale10 C C ALA 6 D ALA 6 1_555 C N NCY 7 D NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale11 C C NCY 7 D NCY 7 1_555 C N MVA 8 D MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale12 I C QUI . E QUI 0 1_555 D N DSN 1 E DSN 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.366 ? 
covale ? covale13 D OG DSN 1 E DSN 1 1_555 D C MVA 8 E MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale14 D C DSN 1 E DSN 1 1_555 D N ALA 2 E ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale15 D C ALA 2 E ALA 2 1_555 D N N2C 3 E N2C 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
covale ? covale16 D CB N2C 3 E N2C 3 1_555 D SG NCY 7 E NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.802 ? 
covale ? covale17 D C N2C 3 E N2C 3 1_555 D N MVA 4 E MVA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale18 D C MVA 4 E MVA 4 1_555 D OG DSN 5 E DSN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.308 ? 
covale ? covale19 D C DSN 5 E DSN 5 1_555 D N ALA 6 E ALA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale20 D N DSN 5 E DSN 5 1_555 J C QUI . E QUI 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? 
covale ? covale21 D C ALA 6 E ALA 6 1_555 D N NCY 7 E NCY 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale22 D C NCY 7 E NCY 7 1_555 D N MVA 8 E MVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 DC 1 A DC 2 1_555 B N1 DG 6 C DG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N4 DC 1 A DC 2 1_555 B O6 DG 6 C DG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O2 DC 1 A DC 2 1_555 B N2 DG 6 C DG 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 DG 2 A DG 3 1_555 B N3 DC 5 C DC 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 DG 2 A DG 3 1_555 B O2 DC 5 C DC 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 DG 2 A DG 3 1_555 B N4 DC 5 C DC 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog HOOGSTEEN hydrog7 A N3 DT 3 A DT 4 1_555 B N7 DA 4 C DA 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog HOOGSTEEN hydrog8 A O4 DT 3 A DT 4 1_555 B N6 DA 4 C DA 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog HOOGSTEEN hydrog9 A N6 DA 4 A DA 5 1_555 B O4 DT 3 C DT 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog HOOGSTEEN hydrog10 A N7 DA 4 A DA 5 1_555 B N3 DT 3 C DT 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 DC 5 A DC 6 1_555 B N1 DG 2 C DG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N4 DC 5 A DC 6 1_555 B O6 DG 2 C DG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A O2 DC 5 A DC 6 1_555 B N2 DG 2 C DG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N1 DG 6 A DG 7 1_555 B N3 DC 1 C DC 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N2 DG 6 A DG 7 1_555 B O2 DC 1 C DC 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O6 DG 6 A DG 7 1_555 B N4 DC 1 C DC 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C9 H6 N2 O2' 
_chem_comp.formula_weight    174.156 
_chem_comp.id                QUI 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-CARBOXYQUINOXALINE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1XVR 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.033885 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.015793 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.01597 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.032314 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 MG A 1 201 201 MG MG . 
F 3 MG C 1 211 211 MG MG . 
G 4 QUI D 1 0 0 QUI QUI . 
H 4 QUI D 1 9 9 QUI QUI . 
I 4 QUI E 1 0 0 QUI QUI . 
J 4 QUI E 1 9 9 QUI QUI . 
K 5 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
K 5 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
K 5 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . 
K 5 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . 
K 5 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . 
K 5 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . 
K 5 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . 
K 5 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . 
K 5 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . 
K 5 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . 
K 5 HOH A 11 2011 2011 HOH HOH . 
K 5 HOH A 12 2012 2012 HOH HOH . 
K 5 HOH A 13 2013 2013 HOH HOH . 
K 5 HOH A 14 2014 2014 HOH HOH . 
K 5 HOH A 15 2015 2015 HOH HOH . 
K 5 HOH A 16 2016 2016 HOH HOH . 
K 5 HOH A 17 2017 2017 HOH HOH . 
L 5 HOH C 1 2001 2001 HOH HOH . 
L 5 HOH C 2 2002 2002 HOH HOH . 
L 5 HOH C 3 2003 2003 HOH HOH . 
L 5 HOH C 4 2004 2004 HOH HOH . 
L 5 HOH C 5 2005 2005 HOH HOH . 
L 5 HOH C 6 2006 2006 HOH HOH . 
L 5 HOH C 7 2007 2007 HOH HOH . 
L 5 HOH C 8 2008 2008 HOH HOH . 
L 5 HOH C 9 2009 2009 HOH HOH . 
L 5 HOH C 10 2010 2010 HOH HOH . 
L 5 HOH C 11 2011 2011 HOH HOH . 
L 5 HOH C 12 2012 2012 HOH HOH . 
L 5 HOH C 13 2013 2013 HOH HOH . 
L 5 HOH C 14 2014 2014 HOH HOH . 
M 5 HOH D 1 2001 2001 HOH HOH . 
M 5 HOH D 2 2002 2002 HOH HOH . 
M 5 HOH D 3 2003 2003 HOH HOH . 
M 5 HOH D 4 2004 2004 HOH HOH . 
M 5 HOH D 5 2005 2005 HOH HOH . 
N 5 HOH E 1 2001 2001 HOH HOH . 
N 5 HOH E 2 2002 2002 HOH HOH . 
N 5 HOH E 3 2003 2003 HOH HOH . 
N 5 HOH E 4 2004 2004 HOH HOH . 
N 5 HOH E 5 2005 2005 HOH HOH . 
N 5 HOH E 6 2006 2006 HOH HOH . 
N 5 HOH E 7 2007 2007 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 N N1 QUI . . . H 4 7.01 41.933 23.521 1 23.47 ? N1 QUI 9 D 1 
HETATM 2 C C2 QUI . . . H 4 6.226 41.151 22.783 1 22.31 ? C2 QUI 9 D 1 
HETATM 3 C C3 QUI . . . H 4 5.262 40.285 23.352 1 22.35 ? C3 QUI 9 D 1 
HETATM 4 N N4 QUI . . . H 4 5.065 40.211 24.633 1 23.99 ? N4 QUI 9 D 1 
HETATM 5 C C5 QUI . . . H 4 5.726 40.937 26.844 1 25.47 ? C5 QUI 9 D 1 
HETATM 6 C C6 QUI . . . H 4 6.484 41.762 27.637 1 27.23 ? C6 QUI 9 D 1 
HETATM 7 C C7 QUI . . . H 4 7.499 42.572 27.071 1 27.73 ? C7 QUI 9 D 1 
HETATM 8 C C8 QUI . . . H 4 7.637 42.696 25.708 1 26.12 ? C8 QUI 9 D 1 
HETATM 9 C C9 QUI . . . H 4 6.856 41.85 24.87 1 24.68 ? C9 QUI 9 D 1 
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HETATM 11 C C QUI . . . H 4 6.294 41.23 21.306 1 20.62 ? C QUI 9 D 1 
HETATM 12 O O1 QUI . . . H 4 5.728 40.486 20.528 1 21.39 ? O1 QUI 9 D 1 
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