data_1XXI
#
_model_server_result.job_id            vglCqYuIU4OiFPP0_uQ-MQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 14:59:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          1xxi 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":401}' 
#
_entry.id    1XXI 
#
_exptl.entry_id    1XXI 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1XXI 
_cell.length_a            98.208 
_cell.length_b            106.574 
_cell.length_c            535.829 
_cell.Z_PDB               24 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1XXI 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA pentameric 5 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA pentameric 5 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,K,L,M,N,O,P,Q 1 1 
F,G,H,I,J,R,S,T,U,V 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 K N N 
? 4 N N N 
? 4 O N N 
? 4 Q N N 
? 4 R N N 
? 4 S N N 
? 4 T N N 
? 4 V N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 B SG CYS 64 B CYS 64 1_555 K ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc2 B SG CYS 73 B CYS 73 1_555 K ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 76 B CYS 76 1_555 K ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 79 B CYS 79 1_555 K ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? 
metalc ? metalc5 C SG CYS 64 C CYS 64 1_555 N ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc6 C SG CYS 73 C CYS 73 1_555 N ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc7 C SG CYS 76 C CYS 76 1_555 N ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc8 C SG CYS 79 C CYS 79 1_555 N ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc9 D SG CYS 64 D CYS 64 1_555 O ZN ZN . D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? 
metalc ? metalc10 D SG CYS 73 D CYS 73 1_555 O ZN ZN . D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc11 D SG CYS 76 D CYS 76 1_555 O ZN ZN . D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc12 D SG CYS 79 D CYS 79 1_555 O ZN ZN . D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? 
metalc ? metalc13 E SG CYS 50 E CYS 50 1_555 Q ZN ZN . E ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc14 E SG CYS 59 E CYS 59 1_555 Q ZN ZN . E ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc15 E SG CYS 62 E CYS 62 1_555 Q ZN ZN . E ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc16 E SG CYS 65 E CYS 65 1_555 Q ZN ZN . E ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc17 G SG CYS 64 G CYS 64 1_555 R ZN ZN . G ZN 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc18 G SG CYS 73 G CYS 73 1_555 R ZN ZN . G ZN 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? 
metalc ? metalc19 G SG CYS 76 G CYS 76 1_555 R ZN ZN . G ZN 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc20 G SG CYS 79 G CYS 79 1_555 R ZN ZN . G ZN 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc21 H SG CYS 64 H CYS 64 1_555 S ZN ZN . H ZN 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc22 H SG CYS 73 H CYS 73 1_555 S ZN ZN . H ZN 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc23 H SG CYS 76 H CYS 76 1_555 S ZN ZN . H ZN 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc24 H SG CYS 79 H CYS 79 1_555 S ZN ZN . H ZN 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc25 I SG CYS 64 I CYS 64 1_555 T ZN ZN . I ZN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? 
metalc ? metalc26 I SG CYS 73 I CYS 73 1_555 T ZN ZN . I ZN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc27 I SG CYS 76 I CYS 76 1_555 T ZN ZN . I ZN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc28 I SG CYS 79 I CYS 79 1_555 T ZN ZN . I ZN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc29 J SG CYS 50 J CYS 50 1_555 V ZN ZN . J ZN 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc30 J SG CYS 59 J CYS 59 1_555 V ZN ZN . J ZN 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc31 J SG CYS 62 J CYS 62 1_555 V ZN ZN . J ZN 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc32 J SG CYS 65 J CYS 65 1_555 V ZN ZN . J ZN 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1XXI 
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_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 4 ZN B 1 403 403 ZN ZN . 
L 5 ADP B 1 802 802 ADP ADP . 
M 6 PO4 C 1 1300 1300 PO4 PO4 . 
N 4 ZN C 1 401 401 ZN ZN . 
O 4 ZN D 1 402 402 ZN ZN . 
P 5 ADP D 1 801 801 ADP ADP . 
Q 4 ZN E 1 404 404 ZN ZN . 
R 4 ZN G 1 407 407 ZN ZN . 
S 4 ZN H 1 405 405 ZN ZN . 
T 4 ZN I 1 406 406 ZN ZN . 
U 5 ADP I 1 803 803 ADP ADP . 
V 4 ZN J 1 408 408 ZN ZN . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         N 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               10.687 
_atom_site.Cartn_y               78.663 
_atom_site.Cartn_z               42.638 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        147.36 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           401 
_atom_site.auth_asym_id          C 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              26 
_model_server_stats.parse_time_ms           38 
_model_server_stats.create_model_time_ms    105 
_model_server_stats.query_time_ms           274 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           1 
#