data_1YN2
#
_model_server_result.job_id            KTBKSQu7CA3R0rTEZ04QNA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-07-30 22:05:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1yn2 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":710}' 
#
_entry.id    1YN2 
#
_exptl.entry_id    1YN2 
_exptl.method      'SOLUTION NMR' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              54.938 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MANGANESE (II) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 B N N 
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 B MN MN . A MN 707 1_555 F O HOH . A HOH 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc2 B MN MN . A MN 707 1_555 F O HOH . A HOH 712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc3 B MN MN . A MN 707 1_555 F O HOH . A HOH 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc4 B MN MN . A MN 707 1_555 F O HOH . A HOH 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc5 B MN MN . A MN 707 1_555 F O HOH . A HOH 715 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc6 B MN MN . A MN 707 1_555 F O HOH . A HOH 716 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc7 C MN MN . A MN 708 1_555 F O HOH . A HOH 717 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc8 C MN MN . A MN 708 1_555 F O HOH . A HOH 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc9 C MN MN . A MN 708 1_555 F O HOH . A HOH 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? 
metalc ? metalc10 C MN MN . A MN 708 1_555 F O HOH . A HOH 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc11 C MN MN . A MN 708 1_555 F O HOH . A HOH 721 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc12 C MN MN . A MN 708 1_555 F O HOH . A HOH 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc13 D MN MN . A MN 709 1_555 F O HOH . A HOH 723 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc14 D MN MN . A MN 709 1_555 F O HOH . A HOH 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc15 D MN MN . A MN 709 1_555 F O HOH . A HOH 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc16 D MN MN . A MN 709 1_555 F O HOH . A HOH 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc17 D MN MN . A MN 709 1_555 F O HOH . A HOH 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc18 D MN MN . A MN 709 1_555 F O HOH . A HOH 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc19 E MN MN . A MN 710 1_555 F O HOH . A HOH 729 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc20 E MN MN . A MN 710 1_555 F O HOH . A HOH 730 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? 
metalc ? metalc21 E MN MN . A MN 710 1_555 F O HOH . A HOH 731 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? 
metalc ? metalc22 E MN MN . A MN 710 1_555 F O HOH . A HOH 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc23 E MN MN . A MN 710 1_555 F O HOH . A HOH 733 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
metalc ? metalc24 E MN MN . A MN 710 1_555 F O HOH . A HOH 734 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 A G 690 1_555 A N3 C 17 A C 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 A G 690 1_555 A O2 C 17 A C 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 A G 690 1_555 A N4 C 17 A C 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 C 2 A C 691 1_555 A N1 G 16 A G 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 C 2 A C 691 1_555 A O6 G 16 A G 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 C 2 A C 691 1_555 A N2 G 16 A G 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 G 3 A G 692 1_555 A N3 C 15 A C 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 G 3 A G 692 1_555 A O2 C 15 A C 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 G 3 A G 692 1_555 A N4 C 15 A C 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 A 4 A A 693 1_555 A N3 U 14 A U 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N6 A 4 A A 693 1_555 A O4 U 14 A U 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N1 G 5 A G 694 1_555 A N3 C 13 A C 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N2 G 5 A G 694 1_555 A O2 C 13 A C 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O6 G 5 A G 694 1_555 A N4 C 13 A C 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 U 6 A U 695 1_555 A N1 A 12 A A 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O4 U 6 A U 695 1_555 A N6 A 12 A A 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'Mn 2' 
_chem_comp.formula_weight    54.938 
_chem_comp.id                MN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MANGANESE (II) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1YN2 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 MN A 1 707 707 MN MN6 . 
C 2 MN A 1 708 708 MN MN6 . 
D 2 MN A 1 709 709 MN MN6 . 
E 2 MN A 1 710 710 MN MN6 . 
F 3 HOH A 1 711 707 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 2 712 707 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 3 713 707 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 4 714 707 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 5 715 707 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 6 716 707 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 7 717 708 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 8 718 708 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 9 719 708 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 10 720 708 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 11 721 708 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 12 722 708 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 13 723 709 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 14 724 709 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 15 725 709 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 16 726 709 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 17 727 709 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 18 728 709 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 19 729 710 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 20 730 710 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 21 731 710 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 22 732 710 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 23 733 710 HOH MN6 . 
F 3 HOH A 24 734 710 HOH MN6 . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MN 
_atom_site.label_atom_id         MN 
_atom_site.label_comp_id         MN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         E 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -6.291 
_atom_site.Cartn_y               4.429 
_atom_site.Cartn_z               0.981 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        1.22 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MN 
_atom_site.auth_comp_id          MN 
_atom_site.auth_seq_id           710 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              36 
_model_server_stats.parse_time_ms           32 
_model_server_stats.create_model_time_ms    30 
_model_server_stats.query_time_ms           7712 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#