data_1YRH # _model_server_result.job_id 3uAtq-waf6OYKvCGInLAjg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 18:12:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1yrh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":407}' # _entry.id 1YRH # _exptl.entry_id 1YRH _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 456.344 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FLAVIN MONONUCLEOTIDE' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1YRH _cell.length_a 122.327 _cell.length_b 122.327 _cell.length_c 208.735 _cell.Z_PDB 48 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1YRH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I,J,K,L,Q,R,S,T 1 1 E,F,G,H,M,N,O,P,U,V,W,X 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ALA 22 A ALA 20 1_555 A N MSE 23 A MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale2 A C MSE 23 A MSE 21 1_555 A N ALA 24 A ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale3 A C ALA 64 A ALA 62 1_555 A N MSE 65 A MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale4 A C MSE 65 A MSE 63 1_555 A N LYS 66 A LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale5 A C GLN 96 A GLN 94 1_555 A N MSE 97 A MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale6 A C MSE 97 A MSE 95 1_555 A N ARG 98 A ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale7 A C ALA 120 A ALA 118 1_555 A N MSE 121 A MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale8 A C MSE 121 A MSE 119 1_555 A N THR 122 A THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale9 A C TYR 139 A TYR 137 1_555 A N MSE 140 A MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale10 A C MSE 140 A MSE 138 1_555 A N THR 141 A THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale11 A C ALA 142 A ALA 140 1_555 A N MSE 143 A MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale12 A C MSE 143 A MSE 141 1_555 A N HIS 144 A HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale13 B C ALA 22 B ALA 20 1_555 B N MSE 23 B MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale14 B C MSE 23 B MSE 21 1_555 B N ALA 24 B ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale15 B C ALA 64 B ALA 62 1_555 B N MSE 65 B MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale16 B C MSE 65 B MSE 63 1_555 B N LYS 66 B LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale17 B C GLN 96 B GLN 94 1_555 B N MSE 97 B MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale18 B C MSE 97 B MSE 95 1_555 B N ARG 98 B ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale19 B C ALA 120 B ALA 118 1_555 B N MSE 121 B MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale20 B C MSE 121 B MSE 119 1_555 B N THR 122 B THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale21 B C TYR 139 B TYR 137 1_555 B N MSE 140 B MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale22 B C MSE 140 B MSE 138 1_555 B N THR 141 B THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? covale ? covale23 B C ALA 142 B ALA 140 1_555 B N MSE 143 B MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale24 B C MSE 143 B MSE 141 1_555 B N HIS 144 B HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale25 C C ALA 22 C ALA 20 1_555 C N MSE 23 C MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale26 C C MSE 23 C MSE 21 1_555 C N ALA 24 C ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale27 C C ALA 64 C ALA 62 1_555 C N MSE 65 C MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale28 C C MSE 65 C MSE 63 1_555 C N LYS 66 C LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale29 C C GLN 96 C GLN 94 1_555 C N MSE 97 C MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale30 C C MSE 97 C MSE 95 1_555 C N ARG 98 C ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale31 C C ALA 120 C ALA 118 1_555 C N MSE 121 C MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale32 C C MSE 121 C MSE 119 1_555 C N THR 122 C THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale ? covale33 C C TYR 139 C TYR 137 1_555 C N MSE 140 C MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale34 C C MSE 140 C MSE 138 1_555 C N THR 141 C THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale35 C C ALA 142 C ALA 140 1_555 C N MSE 143 C MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale36 C C MSE 143 C MSE 141 1_555 C N HIS 144 C HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale37 D C ALA 22 D ALA 20 1_555 D N MSE 23 D MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale38 D C MSE 23 D MSE 21 1_555 D N ALA 24 D ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale39 D C ALA 64 D ALA 62 1_555 D N MSE 65 D MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale40 D C MSE 65 D MSE 63 1_555 D N LYS 66 D LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale41 D C GLN 96 D GLN 94 1_555 D N MSE 97 D MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale42 D C MSE 97 D MSE 95 1_555 D N ARG 98 D ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale43 D C ALA 120 D ALA 118 1_555 D N MSE 121 D MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale44 D C MSE 121 D MSE 119 1_555 D N THR 122 D THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale45 D C TYR 139 D TYR 137 1_555 D N MSE 140 D MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale46 D C MSE 140 D MSE 138 1_555 D N THR 141 D THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale47 D C ALA 142 D ALA 140 1_555 D N MSE 143 D MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale48 D C MSE 143 D MSE 141 1_555 D N HIS 144 D HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale49 E C ALA 22 E ALA 20 1_555 E N MSE 23 E MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale50 E C MSE 23 E MSE 21 1_555 E N ALA 24 E ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale51 E C ALA 64 E ALA 62 1_555 E N MSE 65 E MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale52 E C MSE 65 E MSE 63 1_555 E N LYS 66 E LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale53 E C GLN 96 E GLN 94 1_555 E N MSE 97 E MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale54 E C MSE 97 E MSE 95 1_555 E N ARG 98 E ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale55 E C ALA 120 E ALA 118 1_555 E N MSE 121 E MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale56 E C MSE 121 E MSE 119 1_555 E N THR 122 E THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale57 E C TYR 139 E TYR 137 1_555 E N MSE 140 E MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale58 E C MSE 140 E MSE 138 1_555 E N THR 141 E THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale59 E C ALA 142 E ALA 140 1_555 E N MSE 143 E MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale60 E C MSE 143 E MSE 141 1_555 E N HIS 144 E HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale61 F C ALA 22 F ALA 20 1_555 F N MSE 23 F MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale62 F C MSE 23 F MSE 21 1_555 F N ALA 24 F ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale63 F C ALA 64 F ALA 62 1_555 F N MSE 65 F MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale64 F C MSE 65 F MSE 63 1_555 F N LYS 66 F LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale65 F C GLN 96 F GLN 94 1_555 F N MSE 97 F MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale66 F C MSE 97 F MSE 95 1_555 F N ARG 98 F ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale67 F C ALA 120 F ALA 118 1_555 F N MSE 121 F MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale68 F C MSE 121 F MSE 119 1_555 F N THR 122 F THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale69 F C TYR 139 F TYR 137 1_555 F N MSE 140 F MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale70 F C MSE 140 F MSE 138 1_555 F N THR 141 F THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale71 F C ALA 142 F ALA 140 1_555 F N MSE 143 F MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale72 F C MSE 143 F MSE 141 1_555 F N HIS 144 F HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale73 G C ALA 22 G ALA 20 1_555 G N MSE 23 G MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale74 G C MSE 23 G MSE 21 1_555 G N ALA 24 G ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale75 G C ALA 64 G ALA 62 1_555 G N MSE 65 G MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale76 G C MSE 65 G MSE 63 1_555 G N LYS 66 G LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale77 G C GLN 96 G GLN 94 1_555 G N MSE 97 G MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale78 G C MSE 97 G MSE 95 1_555 G N ARG 98 G ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale79 G C ALA 120 G ALA 118 1_555 G N MSE 121 G MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale80 G C MSE 121 G MSE 119 1_555 G N THR 122 G THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale81 G C TYR 139 G TYR 137 1_555 G N MSE 140 G MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale82 G C MSE 140 G MSE 138 1_555 G N THR 141 G THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale83 G C ALA 142 G ALA 140 1_555 G N MSE 143 G MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale84 G C MSE 143 G MSE 141 1_555 G N HIS 144 G HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale85 H C ALA 22 H ALA 20 1_555 H N MSE 23 H MSE 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale86 H C MSE 23 H MSE 21 1_555 H N ALA 24 H ALA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale87 H C ALA 64 H ALA 62 1_555 H N MSE 65 H MSE 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale88 H C MSE 65 H MSE 63 1_555 H N LYS 66 H LYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale89 H C GLN 96 H GLN 94 1_555 H N MSE 97 H MSE 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale90 H C MSE 97 H MSE 95 1_555 H N ARG 98 H ARG 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale91 H C ALA 120 H ALA 118 1_555 H N MSE 121 H MSE 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale92 H C MSE 121 H MSE 119 1_555 H N THR 122 H THR 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale93 H C TYR 139 H TYR 137 1_555 H N MSE 140 H MSE 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale94 H C MSE 140 H MSE 138 1_555 H N THR 141 H THR 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale95 H C ALA 142 H ALA 140 1_555 H N MSE 143 H MSE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale96 H C MSE 143 H MSE 141 1_555 H N HIS 144 H HIS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? # _chem_comp.formula 'C17 H21 N4 O9 P' _chem_comp.formula_weight 456.344 _chem_comp.id FMN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FLAVIN MONONUCLEOTIDE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'RIBOFLAVIN MONOPHOSPHATE' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 FMN sing 70 n n N1 C10 FMN doub 71 n n C2 O2 FMN doub 72 n n C2 N3 FMN sing 73 n n N3 C4 FMN sing 74 n n N3 HN3 FMN sing 75 n n C4 O4 FMN doub 76 n n C4 C4A FMN sing 77 n n C4A N5 FMN doub 78 n n C4A C10 FMN sing 79 n n N5 C5A FMN sing 80 n n C5A C6 FMN doub 81 n y C5A C9A FMN sing 82 n y C6 C7 FMN sing 83 n y C6 H6 FMN sing 84 n n C7 C7M FMN sing 85 n n C7 C8 FMN doub 86 n y C7M HM71 FMN sing 87 n n C7M HM72 FMN sing 88 n n C7M HM73 FMN sing 89 n n C8 C8M FMN sing 90 n n C8 C9 FMN sing 91 n y C8M HM81 FMN sing 92 n n C8M HM82 FMN sing 93 n n C8M HM83 FMN sing 94 n n C9 C9A FMN doub 95 n y C9 H9 FMN sing 96 n n C9A N10 FMN sing 97 n n N10 C10 FMN sing 98 n n N10 C1' FMN sing 99 n n C1' C2' FMN sing 100 n n C1' "H1'1" FMN sing 101 n n C1' "H1'2" FMN sing 102 n n C2' O2' FMN sing 103 n n C2' C3' FMN sing 104 n n C2' H2' FMN sing 105 n n O2' HO2' FMN sing 106 n n C3' O3' FMN sing 107 n n C3' C4' FMN sing 108 n n C3' H3' FMN sing 109 n n O3' HO3' FMN sing 110 n n C4' O4' FMN sing 111 n n C4' C5' FMN sing 112 n n C4' H4' FMN sing 113 n n O4' HO4' FMN sing 114 n n C5' O5' FMN sing 115 n n C5' "H5'1" FMN sing 116 n n C5' "H5'2" FMN sing 117 n n O5' P FMN sing 118 n n P O1P FMN doub 119 n n P O2P FMN sing 120 n n P O3P FMN sing 121 n n O2P HOP2 FMN sing 122 n n O3P HOP3 FMN sing 123 n n # _atom_sites.entry_id 1YRH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008175 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.00472 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009439 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004791 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 2 FMN A 1 404 403 FMN FMN . J 2 FMN B 1 403 403 FMN FMN . K 2 FMN C 1 402 403 FMN FMN . L 2 FMN D 1 401 403 FMN FMN . M 2 FMN E 1 408 403 FMN FMN . N 2 FMN F 1 407 403 FMN FMN . O 2 FMN G 1 406 403 FMN FMN . P 2 FMN H 1 405 403 FMN FMN . Q 3 HOH A 1 405 1 HOH HOH . Q 3 HOH A 2 406 2 HOH HOH . Q 3 HOH A 3 407 3 HOH HOH . Q 3 HOH A 4 408 7 HOH HOH . Q 3 HOH A 5 409 8 HOH HOH . Q 3 HOH A 6 410 14 HOH HOH . Q 3 HOH A 7 411 16 HOH HOH . Q 3 HOH A 8 412 20 HOH HOH . Q 3 HOH A 9 413 27 HOH HOH . Q 3 HOH A 10 414 31 HOH HOH . Q 3 HOH A 11 415 50 HOH HOH . Q 3 HOH A 12 416 58 HOH HOH . Q 3 HOH A 13 417 63 HOH HOH . Q 3 HOH A 14 418 64 HOH HOH . Q 3 HOH A 15 419 68 HOH HOH . Q 3 HOH A 16 420 74 HOH HOH . Q 3 HOH A 17 421 76 HOH HOH . Q 3 HOH A 18 422 77 HOH HOH . Q 3 HOH A 19 423 78 HOH HOH . Q 3 HOH A 20 424 86 HOH HOH . Q 3 HOH A 21 425 98 HOH HOH . Q 3 HOH A 22 426 114 HOH HOH . Q 3 HOH A 23 427 132 HOH HOH . Q 3 HOH A 24 428 146 HOH HOH . Q 3 HOH A 25 429 147 HOH HOH . Q 3 HOH A 26 430 149 HOH HOH . Q 3 HOH A 27 431 151 HOH HOH . Q 3 HOH A 28 432 153 HOH HOH . Q 3 HOH A 29 433 155 HOH HOH . R 3 HOH B 1 404 5 HOH HOH . R 3 HOH B 2 405 6 HOH HOH . R 3 HOH B 3 406 11 HOH HOH . R 3 HOH B 4 407 13 HOH HOH . R 3 HOH B 5 408 23 HOH HOH . R 3 HOH B 6 409 41 HOH HOH . R 3 HOH B 7 410 55 HOH HOH . R 3 HOH B 8 411 57 HOH HOH . R 3 HOH B 9 412 61 HOH HOH . R 3 HOH B 10 413 95 HOH HOH . R 3 HOH B 11 414 99 HOH HOH . R 3 HOH B 12 415 100 HOH HOH . R 3 HOH B 13 416 107 HOH HOH . R 3 HOH B 14 417 109 HOH HOH . R 3 HOH B 15 418 111 HOH HOH . R 3 HOH B 16 419 112 HOH HOH . R 3 HOH B 17 420 135 HOH HOH . R 3 HOH B 18 421 138 HOH HOH . R 3 HOH B 19 422 143 HOH HOH . R 3 HOH B 20 423 150 HOH HOH . R 3 HOH B 21 424 156 HOH HOH . S 3 HOH C 1 403 15 HOH HOH . S 3 HOH C 2 404 21 HOH HOH . S 3 HOH C 3 405 26 HOH HOH . S 3 HOH C 4 406 30 HOH HOH . S 3 HOH C 5 407 43 HOH HOH . S 3 HOH C 6 408 44 HOH HOH . S 3 HOH C 7 409 46 HOH HOH . S 3 HOH C 8 410 53 HOH HOH . S 3 HOH C 9 411 54 HOH HOH . S 3 HOH C 10 412 60 HOH HOH . S 3 HOH C 11 413 65 HOH HOH . S 3 HOH C 12 414 66 HOH HOH . S 3 HOH C 13 415 69 HOH HOH . S 3 HOH C 14 416 72 HOH HOH . S 3 HOH C 15 417 75 HOH HOH . S 3 HOH C 16 418 93 HOH HOH . S 3 HOH C 17 419 96 HOH HOH . S 3 HOH C 18 420 105 HOH HOH . S 3 HOH C 19 421 113 HOH HOH . S 3 HOH C 20 422 116 HOH HOH . S 3 HOH C 21 423 134 HOH HOH . S 3 HOH C 22 424 136 HOH HOH . S 3 HOH C 23 425 160 HOH HOH . T 3 HOH D 1 402 10 HOH HOH . T 3 HOH D 2 403 17 HOH HOH . T 3 HOH D 3 404 25 HOH HOH . T 3 HOH D 4 405 28 HOH HOH . T 3 HOH D 5 406 33 HOH HOH . T 3 HOH D 6 407 36 HOH HOH . T 3 HOH D 7 408 42 HOH HOH . T 3 HOH D 8 409 48 HOH HOH . T 3 HOH D 9 410 56 HOH HOH . T 3 HOH D 10 411 59 HOH HOH . T 3 HOH D 11 412 80 HOH HOH . T 3 HOH D 12 413 84 HOH HOH . T 3 HOH D 13 414 87 HOH HOH . T 3 HOH D 14 415 90 HOH HOH . T 3 HOH D 15 416 117 HOH HOH . T 3 HOH D 16 417 118 HOH HOH . T 3 HOH D 17 418 121 HOH HOH . T 3 HOH D 18 419 122 HOH HOH . T 3 HOH D 19 420 125 HOH HOH . T 3 HOH D 20 421 127 HOH HOH . T 3 HOH D 21 422 130 HOH HOH . T 3 HOH D 22 423 131 HOH HOH . T 3 HOH D 23 424 139 HOH HOH . T 3 HOH D 24 425 148 HOH HOH . U 3 HOH E 1 409 19 HOH HOH . U 3 HOH E 2 410 45 HOH HOH . U 3 HOH E 3 411 47 HOH HOH . U 3 HOH E 4 412 88 HOH HOH . U 3 HOH E 5 413 94 HOH HOH . U 3 HOH E 6 414 101 HOH HOH . U 3 HOH E 7 415 119 HOH HOH . U 3 HOH E 8 416 124 HOH HOH . U 3 HOH E 9 417 133 HOH HOH . U 3 HOH E 10 418 140 HOH HOH . U 3 HOH E 11 419 141 HOH HOH . U 3 HOH E 12 420 142 HOH HOH . V 3 HOH F 1 408 18 HOH HOH . V 3 HOH F 2 409 32 HOH HOH . V 3 HOH F 3 410 34 HOH HOH . V 3 HOH F 4 411 35 HOH HOH . V 3 HOH F 5 412 39 HOH HOH . V 3 HOH F 6 413 49 HOH HOH . V 3 HOH F 7 414 70 HOH HOH . V 3 HOH F 8 415 79 HOH HOH . V 3 HOH F 9 416 82 HOH HOH . V 3 HOH F 10 417 89 HOH HOH . V 3 HOH F 11 418 91 HOH HOH . V 3 HOH F 12 419 92 HOH HOH . V 3 HOH F 13 420 97 HOH HOH . V 3 HOH F 14 421 103 HOH HOH . V 3 HOH F 15 422 108 HOH HOH . V 3 HOH F 16 423 120 HOH HOH . V 3 HOH F 17 424 137 HOH HOH . V 3 HOH F 18 425 144 HOH HOH . V 3 HOH F 19 426 145 HOH HOH . V 3 HOH F 20 427 154 HOH HOH . V 3 HOH F 21 428 161 HOH HOH . W 3 HOH G 1 407 4 HOH HOH . W 3 HOH G 2 408 9 HOH HOH . W 3 HOH G 3 409 12 HOH HOH . W 3 HOH G 4 410 29 HOH HOH . W 3 HOH G 5 411 62 HOH HOH . W 3 HOH G 6 412 81 HOH HOH . W 3 HOH G 7 413 83 HOH HOH . W 3 HOH G 8 414 85 HOH HOH . W 3 HOH G 9 415 102 HOH HOH . W 3 HOH G 10 416 126 HOH HOH . W 3 HOH G 11 417 157 HOH HOH . W 3 HOH G 12 418 158 HOH HOH . X 3 HOH H 1 406 22 HOH HOH . X 3 HOH H 2 407 24 HOH HOH . X 3 HOH H 3 408 37 HOH HOH . X 3 HOH H 4 409 38 HOH HOH . X 3 HOH H 5 410 40 HOH HOH . X 3 HOH H 6 411 51 HOH HOH . X 3 HOH H 7 412 52 HOH HOH . X 3 HOH H 8 413 67 HOH HOH . X 3 HOH H 9 414 71 HOH HOH . X 3 HOH H 10 415 73 HOH HOH . X 3 HOH H 11 416 104 HOH HOH . X 3 HOH H 12 417 106 HOH HOH . X 3 HOH H 13 418 110 HOH HOH . X 3 HOH H 14 419 115 HOH HOH . X 3 HOH H 15 420 123 HOH HOH . X 3 HOH H 16 421 128 HOH HOH . X 3 HOH H 17 422 129 HOH HOH . X 3 HOH H 18 423 152 HOH HOH . X 3 HOH H 19 424 159 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 FMN . . . N 2 24.648 31.668 93.289 1 36.83 ? N1 FMN 407 F 1 HETATM 2 C C2 FMN . . . N 2 23.624 31.731 92.367 1 36.61 ? C2 FMN 407 F 1 HETATM 3 O O2 FMN . . . N 2 22.499 31.387 92.692 1 36.4 ? O2 FMN 407 F 1 HETATM 4 N N3 FMN . . . N 2 23.858 32.175 91.084 1 36.66 ? N3 FMN 407 F 1 HETATM 5 C C4 FMN . . . N 2 25.134 32.544 90.716 1 36.96 ? C4 FMN 407 F 1 HETATM 6 O O4 FMN . . . N 2 25.37 32.555 89.514 1 37.2 ? O4 FMN 407 F 1 HETATM 7 C C4A FMN . . . N 2 26.186 32.482 91.644 1 36.96 ? C4A FMN 407 F 1 HETATM 8 N N5 FMN . . . N 2 27.467 32.866 91.29 1 36.78 ? N5 FMN 407 F 1 HETATM 9 C C5A FMN . . . N 2 28.488 32.814 92.223 1 37.31 ? C5A FMN 407 F 1 HETATM 10 C C6 FMN . . . N 2 29.785 33.207 91.86 1 37.47 ? C6 FMN 407 F 1 HETATM 11 C C7 FMN . . . N 2 30.848 33.171 92.773 1 37.11 ? C7 FMN 407 F 1 HETATM 12 C C7M FMN . . . N 2 31.984 34.138 92.559 1 36.53 ? C7M FMN 407 F 1 HETATM 13 C C8 FMN . . . N 2 30.587 32.712 94.062 1 37.24 ? C8 FMN 407 F 1 HETATM 14 C C8M FMN . . . N 2 31.723 32.264 94.935 1 38.18 ? C8M FMN 407 F 1 HETATM 15 C C9 FMN . . . N 2 29.296 32.326 94.431 1 37.41 ? C9 FMN 407 F 1 HETATM 16 C C9A FMN . . . N 2 28.232 32.371 93.523 1 37.19 ? C9A FMN 407 F 1 HETATM 17 N N10 FMN . . . N 2 26.949 31.976 93.882 1 36.91 ? N10 FMN 407 F 1 HETATM 18 C C10 FMN . . . N 2 25.933 32.044 92.944 1 36.81 ? C10 FMN 407 F 1 HETATM 19 C C1' FMN . . . N 2 26.702 31.205 95.157 1 37.4 ? C1' FMN 407 F 1 HETATM 20 C C2' FMN . . . N 2 27.363 29.831 95.167 1 38 ? C2' FMN 407 F 1 HETATM 21 O O2' FMN . . . N 2 27.119 29.152 93.957 1 39.3 ? O2' FMN 407 F 1 HETATM 22 C C3' FMN . . . N 2 26.809 29.028 96.33 1 38.35 ? C3' FMN 407 F 1 HETATM 23 O O3' FMN . . . N 2 27.296 29.664 97.483 1 39.93 ? O3' FMN 407 F 1 HETATM 24 C C4' FMN . . . N 2 27.198 27.545 96.296 1 38.15 ? C4' FMN 407 F 1 HETATM 25 O O4' FMN . . . N 2 26.155 26.847 95.652 1 37.44 ? O4' FMN 407 F 1 HETATM 26 C C5' FMN . . . N 2 27.439 26.948 97.689 1 38.44 ? C5' FMN 407 F 1 HETATM 27 O O5' FMN . . . N 2 27.744 25.557 97.631 1 38.87 ? O5' FMN 407 F 1 HETATM 28 P P FMN . . . N 2 29.141 24.917 98.14 1 37.01 ? P FMN 407 F 1 HETATM 29 O O1P FMN . . . N 2 29.369 23.66 97.334 1 36.1 ? O1P FMN 407 F 1 HETATM 30 O O2P FMN . . . N 2 30.233 25.956 97.932 1 35.04 ? O2P FMN 407 F 1 HETATM 31 O O3P FMN . . . N 2 29.029 24.501 99.585 1 36.58 ? O3P FMN 407 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 20 _model_server_stats.query_time_ms 327 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 31 #