data_1Z1Y # _model_server_result.job_id oRzY7_ilxGkXcx2TtKxpkw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-25 07:57:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1z1y # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":187}' # _entry.id 1Z1Y # _exptl.entry_id 1Z1Y _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 173.04 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'YTTERBIUM (III) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 103.15 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1Z1Y _cell.length_a 57.164 _cell.length_b 43.7 _cell.length_c 65.65 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1Z1Y _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 13 A CYS 8 1_555 A SG CYS 27 A CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 29 A CYS 24 1_555 A SG CYS 41 A CYS 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 47 A CYS 42 1_555 A SG CYS 62 A CYS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 56 A CYS 51 1_555 A SG CYS 76 A CYS 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 78 A CYS 73 1_555 A SG CYS 89 A CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 94 A CYS 89 1_555 A SG CYS 105 A CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 99 A CYS 94 1_555 A SG CYS 118 A CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 120 A CYS 115 1_555 A SG CYS 134 A CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 142 A CYS 137 1_555 A SG CYS 153 A CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 146 A CYS 141 1_555 A SG CYS 162 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 164 A CYS 159 1_555 A SG CYS 177 A CYS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 13 B CYS 8 1_555 B SG CYS 27 B CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 29 B CYS 24 1_555 B SG CYS 41 B CYS 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 47 B CYS 42 1_555 B SG CYS 62 B CYS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 56 B CYS 51 1_555 B SG CYS 76 B CYS 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 78 B CYS 73 1_555 B SG CYS 89 B CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 94 B CYS 89 1_555 B SG CYS 105 B CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 99 B CYS 94 1_555 B SG CYS 118 B CYS 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 120 B CYS 115 1_555 B SG CYS 134 B CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 142 B CYS 137 1_555 B SG CYS 153 B CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 146 B CYS 141 1_555 B SG CYS 162 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 164 B CYS 159 1_555 B SG CYS 177 B CYS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A C CYS 13 A CYS 8 1_555 A N MLY 14 A MLY 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale2 A C MLY 14 A MLY 9 1_555 A N ASN 15 A ASN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale3 A C PHE 25 A PHE 20 1_555 A N MLY 26 A MLY 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale4 A C MLY 26 A MLY 21 1_555 A N CYS 27 A CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale5 A C GLU 43 A GLU 38 1_555 A N MLY 44 A MLY 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale6 A C MLY 44 A MLY 39 1_555 A N ASN 45 A ASN 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale7 A C CYS 47 A CYS 42 1_555 A N MLY 48 A MLY 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale8 A C MLY 48 A MLY 43 1_555 A N MLY 49 A MLY 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale9 A C MLY 49 A MLY 44 1_555 A N GLU 50 A GLU 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale10 A C GLY 53 A GLY 48 1_555 A N MLY 54 A MLY 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale11 A C MLY 54 A MLY 49 1_555 A N ALA 55 A ALA 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 67 A ASP 62 1_555 I YB YB . A YB 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 67 A ASP 62 1_555 I YB YB . A YB 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? covale ? covale12 A C TYR 74 A TYR 69 1_555 A N MLY 75 A MLY 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale13 A C MLY 75 A MLY 70 1_555 A N CYS 76 A CYS 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale14 A C LEU 84 A LEU 79 1_555 A N MLY 85 A MLY 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale15 A C MLY 85 A MLY 80 1_555 A N GLU 86 A GLU 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale16 A C TYR 96 A TYR 91 1_555 A N MLY 97 A MLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale17 A C MLY 97 A MLY 92 1_555 A N ASN 98 A ASN 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 112 A GLU 107 1_555 H YB YB . A YB 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? covale ? covale18 A C GLY 123 A GLY 118 1_555 A N MLY 124 A MLY 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale19 A C MLY 124 A MLY 119 1_555 A N VAL 125 A VAL 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 130 A ASP 125 1_555 D YB YB . A YB 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? covale ? covale20 A C GLU 131 A GLU 126 1_555 A N MLY 132 A MLY 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 131 A GLU 126 1_555 D YB YB . A YB 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 131 A GLU 126 1_555 D YB YB . A YB 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.046 ? covale ? covale21 A C MLY 132 A MLY 127 1_555 A N MLY 133 A MLY 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale22 A C MLY 133 A MLY 128 1_555 A N CYS 134 A CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale23 A C THR 135 A THR 130 1_555 A N MLY 136 A MLY 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale24 A C MLY 136 A MLY 131 1_555 A N THR 137 A THR 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale25 A C LEU 144 A LEU 139 1_555 A N MLY 145 A MLY 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale26 A C MLY 145 A MLY 140 1_555 A N CYS 146 A CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale27 A C CYS 153 A CYS 148 1_555 A N MLY 154 A MLY 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale28 A C MLY 154 A MLY 149 1_555 A N ASN 155 A ASN 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale29 A C TYR 160 A TYR 155 1_555 A N MLY 161 A MLY 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale30 A C MLY 161 A MLY 156 1_555 A N CYS 162 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale31 A C ASP 171 A ASP 166 1_555 A N MLY 172 A MLY 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale32 A C MLY 172 A MLY 167 1_555 A N GLU 173 A GLU 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale33 A C GLU 173 A GLU 168 1_555 A N MLY 174 A MLY 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale34 A C MLY 174 A MLY 169 1_555 A N ASN 175 A ASN 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale35 B C CYS 13 B CYS 8 1_555 B N MLY 14 B MLY 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale36 B C MLY 14 B MLY 9 1_555 B N ASN 15 B ASN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale37 B C PHE 25 B PHE 20 1_555 B N MLY 26 B MLY 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale38 B C MLY 26 B MLY 21 1_555 B N CYS 27 B CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale39 B C GLU 43 B GLU 38 1_555 B N MLY 44 B MLY 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale40 B C MLY 44 B MLY 39 1_555 B N ASN 45 B ASN 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale41 B C CYS 47 B CYS 42 1_555 B N MLY 48 B MLY 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale42 B C MLY 48 B MLY 43 1_555 B N MLY 49 B MLY 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale43 B C MLY 49 B MLY 44 1_555 B N GLU 50 B GLU 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale44 B C GLY 53 B GLY 48 1_555 B N MLY 54 B MLY 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale45 B C MLY 54 B MLY 49 1_555 B N ALA 55 B ALA 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale46 B C TYR 74 B TYR 69 1_555 B N MLY 75 B MLY 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale47 B C MLY 75 B MLY 70 1_555 B N CYS 76 B CYS 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale48 B C LEU 84 B LEU 79 1_555 B N MLY 85 B MLY 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale49 B C MLY 85 B MLY 80 1_555 B N GLU 86 B GLU 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASP 87 B ASP 82 1_555 J YB YB . B YB 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc8 B OD2 ASP 87 B ASP 82 1_555 J YB YB . B YB 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc9 B OD2 ASP 92 B ASP 87 1_555 K YB YB . B YB 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? covale ? covale50 B C TYR 96 B TYR 91 1_555 B N MLY 97 B MLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale51 B C MLY 97 B MLY 92 1_555 B N ASN 98 B ASN 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale52 B C GLY 123 B GLY 118 1_555 B N MLY 124 B MLY 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale53 B C MLY 124 B MLY 119 1_555 B N VAL 125 B VAL 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale54 B C GLU 131 B GLU 126 1_555 B N MLY 132 B MLY 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale55 B C MLY 132 B MLY 127 1_555 B N MLY 133 B MLY 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale56 B C MLY 133 B MLY 128 1_555 B N CYS 134 B CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale57 B C THR 135 B THR 130 1_555 B N MLY 136 B MLY 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale58 B C MLY 136 B MLY 131 1_555 B N THR 137 B THR 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale59 B C LEU 144 B LEU 139 1_555 B N MLY 145 B MLY 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale60 B C MLY 145 B MLY 140 1_555 B N CYS 146 B CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale61 B C CYS 153 B CYS 148 1_555 B N MLY 154 B MLY 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale62 B C MLY 154 B MLY 149 1_555 B N ASN 155 B ASN 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale63 B C TYR 160 B TYR 155 1_555 B N MLY 161 B MLY 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale64 B C MLY 161 B MLY 156 1_555 B N CYS 162 B CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale65 B C ASP 171 B ASP 166 1_555 B N MLY 172 B MLY 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale66 B C MLY 172 B MLY 167 1_555 B N GLU 173 B GLU 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale67 B C GLU 173 B GLU 168 1_555 B N MLY 174 B MLY 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale68 B C MLY 174 B MLY 169 1_555 B N ASN 175 B ASN 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? metalc ? metalc10 D YB YB . A YB 183 1_555 L O HOH . A HOH 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc11 J YB YB . B YB 182 1_555 M O HOH . B HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 43 A GLU 38 1_555 D YB YB . A YB 183 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc13 A OE2 GLU 43 A GLU 38 1_555 D YB YB . A YB 183 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc14 A OE1 GLU 80 A GLU 75 1_555 F YB YB . A YB 185 2_646 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc15 A OE1 GLU 80 A GLU 75 1_555 E YB YB . A YB 184 2_646 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.482 ? metalc ? metalc16 A OE2 GLU 80 A GLU 75 1_555 E YB YB . A YB 184 2_646 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 101 A GLU 96 1_555 I YB YB . A YB 188 2_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? metalc ? metalc18 A OE2 GLU 101 A GLU 96 1_555 I YB YB . A YB 188 2_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc19 A OE1 GLU 173 A GLU 168 1_555 C YB YB . A YB 182 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc20 A OE2 GLU 173 A GLU 168 1_555 C YB YB . A YB 182 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc21 B OE1 GLU 43 B GLU 38 1_555 J YB YB . B YB 182 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc22 B OE2 GLU 43 B GLU 38 1_555 J YB YB . B YB 182 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc23 B OE1 GLU 112 B GLU 107 1_555 C YB YB . A YB 182 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc24 B OE2 GLU 112 B GLU 107 1_555 C YB YB . A YB 182 2_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc25 B OD1 ASP 130 B ASP 125 1_555 J YB YB . B YB 182 2_645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? metalc ? metalc26 B OE2 GLU 131 B GLU 126 1_555 J YB YB . B YB 182 2_645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc27 B OE1 GLU 139 B GLU 134 1_555 G YB YB . A YB 186 2_645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc ? metalc28 B OE2 GLU 139 B GLU 134 1_555 G YB YB . A YB 186 2_645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.238 ? metalc ? metalc29 B OE2 GLU 139 B GLU 134 1_555 E YB YB . A YB 184 2_645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc30 B OE2 GLU 166 B GLU 161 1_555 E YB YB . A YB 184 1_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.464 ? metalc ? metalc31 B OE2 GLU 166 B GLU 161 1_555 H YB YB . A YB 187 1_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc ? metalc32 B OE2 GLU 166 B GLU 161 1_555 G YB YB . A YB 186 1_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc ? metalc33 B OE1 GLU 173 B GLU 168 1_555 H YB YB . A YB 187 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc34 B OE1 GLU 173 B GLU 168 1_555 E YB YB . A YB 184 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? metalc ? metalc35 B OE2 GLU 173 B GLU 168 1_555 E YB YB . A YB 184 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? # _chem_comp.formula 'Yb 3' _chem_comp.formula_weight 173.04 _chem_comp.id YB _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'YTTERBIUM (III) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1Z1Y _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.017494 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.004087 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.022883 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.015642 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 YB A 1 182 101 YB YB . D 2 YB A 1 183 102 YB YB . E 2 YB A 1 184 104 YB YB . F 2 YB A 1 185 105 YB YB . G 2 YB A 1 186 106 YB YB . H 2 YB A 1 187 107 YB YB . I 2 YB A 1 188 108 YB YB . J 2 YB B 1 182 103 YB YB . K 2 YB B 1 183 109 YB YB . L 3 HOH A 1 189 1 HOH HOH . L 3 HOH A 2 190 2 HOH HOH . L 3 HOH A 3 191 3 HOH HOH . L 3 HOH A 4 192 7 HOH HOH . L 3 HOH A 5 193 8 HOH HOH . L 3 HOH A 6 194 9 HOH HOH . L 3 HOH A 7 195 10 HOH HOH . L 3 HOH A 8 196 11 HOH HOH . L 3 HOH A 9 197 12 HOH HOH . L 3 HOH A 10 198 16 HOH HOH . L 3 HOH A 11 199 19 HOH HOH . L 3 HOH A 12 200 20 HOH HOH . L 3 HOH A 13 201 21 HOH HOH . L 3 HOH A 14 202 23 HOH HOH . L 3 HOH A 15 203 24 HOH HOH . L 3 HOH A 16 204 25 HOH HOH . L 3 HOH A 17 205 27 HOH HOH . L 3 HOH A 18 206 29 HOH HOH . L 3 HOH A 19 207 30 HOH HOH . L 3 HOH A 20 208 31 HOH HOH . L 3 HOH A 21 209 33 HOH HOH . L 3 HOH A 22 210 34 HOH HOH . L 3 HOH A 23 211 35 HOH HOH . L 3 HOH A 24 212 40 HOH HOH . L 3 HOH A 25 213 43 HOH HOH . L 3 HOH A 26 214 44 HOH HOH . L 3 HOH A 27 215 46 HOH HOH . L 3 HOH A 28 216 48 HOH HOH . L 3 HOH A 29 217 49 HOH HOH . L 3 HOH A 30 218 50 HOH HOH . L 3 HOH A 31 219 51 HOH HOH . L 3 HOH A 32 220 52 HOH HOH . L 3 HOH A 33 221 53 HOH HOH . L 3 HOH A 34 222 54 HOH HOH . L 3 HOH A 35 223 55 HOH HOH . L 3 HOH A 36 224 57 HOH HOH . L 3 HOH A 37 225 60 HOH HOH . L 3 HOH A 38 226 61 HOH HOH . L 3 HOH A 39 227 62 HOH HOH . L 3 HOH A 40 228 63 HOH HOH . L 3 HOH A 41 229 66 HOH HOH . L 3 HOH A 42 230 67 HOH HOH . L 3 HOH A 43 231 71 HOH HOH . L 3 HOH A 44 232 73 HOH HOH . L 3 HOH A 45 233 75 HOH HOH . L 3 HOH A 46 234 76 HOH HOH . L 3 HOH A 47 235 78 HOH HOH . L 3 HOH A 48 236 79 HOH HOH . L 3 HOH A 49 237 83 HOH HOH . L 3 HOH A 50 238 84 HOH HOH . L 3 HOH A 51 239 85 HOH HOH . L 3 HOH A 52 240 86 HOH HOH . L 3 HOH A 53 241 87 HOH HOH . L 3 HOH A 54 242 88 HOH HOH . M 3 HOH B 1 184 4 HOH HOH . M 3 HOH B 2 185 5 HOH HOH . M 3 HOH B 3 186 6 HOH HOH . M 3 HOH B 4 187 13 HOH HOH . M 3 HOH B 5 188 14 HOH HOH . M 3 HOH B 6 189 15 HOH HOH . M 3 HOH B 7 190 17 HOH HOH . M 3 HOH B 8 191 18 HOH HOH . M 3 HOH B 9 192 22 HOH HOH . M 3 HOH B 10 193 26 HOH HOH . M 3 HOH B 11 194 28 HOH HOH . M 3 HOH B 12 195 32 HOH HOH . M 3 HOH B 13 196 36 HOH HOH . M 3 HOH B 14 197 37 HOH HOH . M 3 HOH B 15 198 38 HOH HOH . M 3 HOH B 16 199 39 HOH HOH . M 3 HOH B 17 200 41 HOH HOH . M 3 HOH B 18 201 42 HOH HOH . M 3 HOH B 19 202 45 HOH HOH . M 3 HOH B 20 203 47 HOH HOH . M 3 HOH B 21 204 56 HOH HOH . M 3 HOH B 22 205 58 HOH HOH . M 3 HOH B 23 206 59 HOH HOH . M 3 HOH B 24 207 64 HOH HOH . M 3 HOH B 25 208 65 HOH HOH . M 3 HOH B 26 209 68 HOH HOH . M 3 HOH B 27 210 69 HOH HOH . M 3 HOH B 28 211 70 HOH HOH . M 3 HOH B 29 212 72 HOH HOH . M 3 HOH B 30 213 74 HOH HOH . M 3 HOH B 31 214 77 HOH HOH . M 3 HOH B 32 215 80 HOH HOH . M 3 HOH B 33 216 81 HOH HOH . M 3 HOH B 34 217 82 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol YB _atom_site.label_atom_id YB _atom_site.label_comp_id YB _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 24.957 _atom_site.Cartn_y 21.577 _atom_site.Cartn_z 29.581 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 62.9 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id YB _atom_site.auth_comp_id YB _atom_site.auth_seq_id 187 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 306 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #