data_1Z3S # _model_server_result.job_id Tamv9bHP7h3jV7RTOdLqnA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-18 11:34:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1z3s # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":497}' # _entry.id 1Z3S # _exptl.entry_id 1Z3S _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 93.43 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1Z3S _cell.length_a 74.19 _cell.length_b 136.448 _cell.length_c 47.732 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1Z3S _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E 1 1 B,D,F 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 5 A CYS 284 1_555 A SG CYS 34 A CYS 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 154 A CYS 433 1_555 A SG CYS 156 A CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 158 A CYS 437 1_555 A SG CYS 171 A CYS 450 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 5 B CYS 284 1_555 B SG CYS 34 B CYS 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 154 B CYS 433 1_555 B SG CYS 156 B CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 158 B CYS 437 1_555 B SG CYS 171 B CYS 450 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 150 A ASP 429 1_555 C CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 150 A ASP 429 1_555 C CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 152 A ASP 431 1_555 C CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.379 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 152 A ASP 431 1_555 C CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc5 A O CYS 154 A CYS 433 1_555 C CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc6 A O CYS 156 A CYS 435 1_555 C CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc7 B OD2 ASP 150 B ASP 429 1_555 D CA CA . B CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc8 B OD1 ASP 150 B ASP 429 1_555 D CA CA . B CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc9 B OD1 ASP 152 B ASP 431 1_555 D CA CA . B CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc10 B O CYS 154 B CYS 433 1_555 D CA CA . B CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc11 B O CYS 156 B CYS 435 1_555 D CA CA . B CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1Z3S _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013479 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000808 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007329 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.020988 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 497 301 CA CA . D 2 CA B 1 497 302 CA CA . E 3 HOH A 1 1 1 HOH WAT . E 3 HOH A 2 3 3 HOH WAT . E 3 HOH A 3 5 5 HOH WAT . E 3 HOH A 4 6 6 HOH WAT . E 3 HOH A 5 7 7 HOH WAT . E 3 HOH A 6 8 8 HOH WAT . E 3 HOH A 7 9 9 HOH WAT . E 3 HOH A 8 12 12 HOH WAT . E 3 HOH A 9 13 13 HOH WAT . E 3 HOH A 10 14 14 HOH WAT . E 3 HOH A 11 15 15 HOH WAT . E 3 HOH A 12 18 18 HOH WAT . E 3 HOH A 13 19 19 HOH WAT . E 3 HOH A 14 24 24 HOH WAT . E 3 HOH A 15 26 26 HOH WAT . E 3 HOH A 16 27 27 HOH WAT . E 3 HOH A 17 29 29 HOH WAT . E 3 HOH A 18 31 31 HOH WAT . E 3 HOH A 19 33 33 HOH WAT . E 3 HOH A 20 35 35 HOH WAT . E 3 HOH A 21 36 36 HOH WAT . E 3 HOH A 22 37 37 HOH WAT . E 3 HOH A 23 38 38 HOH WAT . E 3 HOH A 24 43 43 HOH WAT . E 3 HOH A 25 45 45 HOH WAT . E 3 HOH A 26 48 48 HOH WAT . E 3 HOH A 27 49 49 HOH WAT . E 3 HOH A 28 50 50 HOH WAT . E 3 HOH A 29 51 51 HOH WAT . E 3 HOH A 30 57 57 HOH WAT . E 3 HOH A 31 60 60 HOH WAT . E 3 HOH A 32 61 61 HOH WAT . E 3 HOH A 33 62 62 HOH WAT . E 3 HOH A 34 63 63 HOH WAT . E 3 HOH A 35 65 65 HOH WAT . E 3 HOH A 36 66 66 HOH WAT . E 3 HOH A 37 67 67 HOH WAT . E 3 HOH A 38 70 70 HOH WAT . E 3 HOH A 39 71 71 HOH WAT . E 3 HOH A 40 74 74 HOH WAT . E 3 HOH A 41 76 76 HOH WAT . E 3 HOH A 42 79 79 HOH WAT . E 3 HOH A 43 82 82 HOH WAT . E 3 HOH A 44 83 83 HOH WAT . E 3 HOH A 45 84 84 HOH WAT . E 3 HOH A 46 85 85 HOH WAT . E 3 HOH A 47 86 86 HOH WAT . E 3 HOH A 48 87 87 HOH WAT . E 3 HOH A 49 88 88 HOH WAT . E 3 HOH A 50 94 94 HOH WAT . E 3 HOH A 51 100 100 HOH WAT . E 3 HOH A 52 101 101 HOH WAT . E 3 HOH A 53 106 106 HOH WAT . E 3 HOH A 54 107 107 HOH WAT . E 3 HOH A 55 108 108 HOH WAT . E 3 HOH A 56 111 111 HOH WAT . E 3 HOH A 57 112 112 HOH WAT . E 3 HOH A 58 113 113 HOH WAT . E 3 HOH A 59 114 114 HOH WAT . E 3 HOH A 60 115 115 HOH WAT . E 3 HOH A 61 116 116 HOH WAT . E 3 HOH A 62 117 117 HOH WAT . E 3 HOH A 63 119 119 HOH WAT . E 3 HOH A 64 120 120 HOH WAT . E 3 HOH A 65 122 122 HOH WAT . E 3 HOH A 66 123 123 HOH WAT . E 3 HOH A 67 125 125 HOH WAT . E 3 HOH A 68 127 127 HOH WAT . E 3 HOH A 69 128 128 HOH WAT . E 3 HOH A 70 130 130 HOH WAT . E 3 HOH A 71 139 139 HOH WAT . E 3 HOH A 72 140 140 HOH WAT . E 3 HOH A 73 142 142 HOH WAT . E 3 HOH A 74 143 143 HOH WAT . E 3 HOH A 75 144 144 HOH WAT . E 3 HOH A 76 145 145 HOH WAT . E 3 HOH A 77 146 146 HOH WAT . E 3 HOH A 78 147 147 HOH WAT . E 3 HOH A 79 148 148 HOH WAT . E 3 HOH A 80 149 149 HOH WAT . E 3 HOH A 81 152 152 HOH WAT . E 3 HOH A 82 159 159 HOH WAT . E 3 HOH A 83 160 160 HOH WAT . E 3 HOH A 84 162 162 HOH WAT . E 3 HOH A 85 163 163 HOH WAT . E 3 HOH A 86 167 167 HOH WAT . E 3 HOH A 87 168 168 HOH WAT . E 3 HOH A 88 169 169 HOH WAT . E 3 HOH A 89 171 171 HOH WAT . E 3 HOH A 90 172 172 HOH WAT . E 3 HOH A 91 174 174 HOH WAT . E 3 HOH A 92 177 177 HOH WAT . E 3 HOH A 93 179 179 HOH WAT . E 3 HOH A 94 182 182 HOH WAT . E 3 HOH A 95 186 186 HOH WAT . E 3 HOH A 96 188 188 HOH WAT . E 3 HOH A 97 189 189 HOH WAT . E 3 HOH A 98 190 190 HOH WAT . E 3 HOH A 99 191 191 HOH WAT . E 3 HOH A 100 193 193 HOH WAT . E 3 HOH A 101 196 196 HOH WAT . E 3 HOH A 102 198 198 HOH WAT . E 3 HOH A 103 199 199 HOH WAT . E 3 HOH A 104 200 200 HOH WAT . E 3 HOH A 105 203 203 HOH WAT . E 3 HOH A 106 205 205 HOH WAT . E 3 HOH A 107 206 206 HOH WAT . E 3 HOH A 108 207 207 HOH WAT . E 3 HOH A 109 208 208 HOH WAT . E 3 HOH A 110 209 209 HOH WAT . E 3 HOH A 111 210 210 HOH WAT . E 3 HOH A 112 211 211 HOH WAT . E 3 HOH A 113 216 216 HOH WAT . F 3 HOH B 1 2 2 HOH WAT . F 3 HOH B 2 4 4 HOH WAT . F 3 HOH B 3 10 10 HOH WAT . F 3 HOH B 4 11 11 HOH WAT . F 3 HOH B 5 16 16 HOH WAT . F 3 HOH B 6 17 17 HOH WAT . F 3 HOH B 7 20 20 HOH WAT . F 3 HOH B 8 21 21 HOH WAT . F 3 HOH B 9 22 22 HOH WAT . F 3 HOH B 10 23 23 HOH WAT . F 3 HOH B 11 25 25 HOH WAT . F 3 HOH B 12 28 28 HOH WAT . F 3 HOH B 13 30 30 HOH WAT . F 3 HOH B 14 32 32 HOH WAT . F 3 HOH B 15 34 34 HOH WAT . F 3 HOH B 16 39 39 HOH WAT . F 3 HOH B 17 40 40 HOH WAT . F 3 HOH B 18 41 41 HOH WAT . F 3 HOH B 19 42 42 HOH WAT . F 3 HOH B 20 44 44 HOH WAT . F 3 HOH B 21 46 46 HOH WAT . F 3 HOH B 22 47 47 HOH WAT . F 3 HOH B 23 52 52 HOH WAT . F 3 HOH B 24 53 53 HOH WAT . F 3 HOH B 25 54 54 HOH WAT . F 3 HOH B 26 55 55 HOH WAT . F 3 HOH B 27 56 56 HOH WAT . F 3 HOH B 28 58 58 HOH WAT . F 3 HOH B 29 59 59 HOH WAT . F 3 HOH B 30 64 64 HOH WAT . F 3 HOH B 31 68 68 HOH WAT . F 3 HOH B 32 69 69 HOH WAT . F 3 HOH B 33 72 72 HOH WAT . F 3 HOH B 34 73 73 HOH WAT . F 3 HOH B 35 75 75 HOH WAT . F 3 HOH B 36 77 77 HOH WAT . F 3 HOH B 37 78 78 HOH WAT . F 3 HOH B 38 80 80 HOH WAT . F 3 HOH B 39 81 81 HOH WAT . F 3 HOH B 40 89 89 HOH WAT . F 3 HOH B 41 90 90 HOH WAT . F 3 HOH B 42 91 91 HOH WAT . F 3 HOH B 43 92 92 HOH WAT . F 3 HOH B 44 93 93 HOH WAT . F 3 HOH B 45 95 95 HOH WAT . F 3 HOH B 46 96 96 HOH WAT . F 3 HOH B 47 97 97 HOH WAT . F 3 HOH B 48 98 98 HOH WAT . F 3 HOH B 49 99 99 HOH WAT . F 3 HOH B 50 102 102 HOH WAT . F 3 HOH B 51 103 103 HOH WAT . F 3 HOH B 52 104 104 HOH WAT . F 3 HOH B 53 105 105 HOH WAT . F 3 HOH B 54 109 109 HOH WAT . F 3 HOH B 55 110 110 HOH WAT . F 3 HOH B 56 118 118 HOH WAT . F 3 HOH B 57 121 121 HOH WAT . F 3 HOH B 58 124 124 HOH WAT . F 3 HOH B 59 126 126 HOH WAT . F 3 HOH B 60 129 129 HOH WAT . F 3 HOH B 61 131 131 HOH WAT . F 3 HOH B 62 132 132 HOH WAT . F 3 HOH B 63 133 133 HOH WAT . F 3 HOH B 64 134 134 HOH WAT . F 3 HOH B 65 135 135 HOH WAT . F 3 HOH B 66 136 136 HOH WAT . F 3 HOH B 67 137 137 HOH WAT . F 3 HOH B 68 138 138 HOH WAT . F 3 HOH B 69 141 141 HOH WAT . F 3 HOH B 70 150 150 HOH WAT . F 3 HOH B 71 151 151 HOH WAT . F 3 HOH B 72 153 153 HOH WAT . F 3 HOH B 73 154 154 HOH WAT . F 3 HOH B 74 155 155 HOH WAT . F 3 HOH B 75 156 156 HOH WAT . F 3 HOH B 76 157 157 HOH WAT . F 3 HOH B 77 158 158 HOH WAT . F 3 HOH B 78 161 161 HOH WAT . F 3 HOH B 79 164 164 HOH WAT . F 3 HOH B 80 165 165 HOH WAT . F 3 HOH B 81 166 166 HOH WAT . F 3 HOH B 82 170 170 HOH WAT . F 3 HOH B 83 173 173 HOH WAT . F 3 HOH B 84 175 175 HOH WAT . F 3 HOH B 85 176 176 HOH WAT . F 3 HOH B 86 178 178 HOH WAT . F 3 HOH B 87 180 180 HOH WAT . F 3 HOH B 88 181 181 HOH WAT . F 3 HOH B 89 183 183 HOH WAT . F 3 HOH B 90 184 184 HOH WAT . F 3 HOH B 91 185 185 HOH WAT . F 3 HOH B 92 187 187 HOH WAT . F 3 HOH B 93 192 192 HOH WAT . F 3 HOH B 94 194 194 HOH WAT . F 3 HOH B 95 195 195 HOH WAT . F 3 HOH B 96 197 197 HOH WAT . F 3 HOH B 97 201 201 HOH WAT . F 3 HOH B 98 202 202 HOH WAT . F 3 HOH B 99 204 204 HOH WAT . F 3 HOH B 100 212 212 HOH WAT . F 3 HOH B 101 213 213 HOH WAT . F 3 HOH B 102 214 214 HOH WAT . F 3 HOH B 103 215 215 HOH WAT . F 3 HOH B 104 217 217 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 17.212 _atom_site.Cartn_y 81.309 _atom_site.Cartn_z 21.713 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 36.77 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 497 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 441 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #