data_1ZGN # _model_server_result.job_id dP7f8PSmaeDU30PcGPJADQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 15:32:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1zgn # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":2223}' # _entry.id 1ZGN # _exptl.entry_id 1ZGN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 30.006 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'NITRIC OXIDE' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 97.632 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ZGN _cell.length_a 76.219 _cell.length_b 89.759 _cell.length_c 68.713 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ZGN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 F N N ? 5 G N N ? 5 K N N ? 5 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OH TYR 7 A TYR 7 1_555 C FE FE . A FE 1222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc2 E SG2 GSH . A GSH 1221 1_555 C FE FE . A FE 1222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc3 C FE FE . A FE 1222 1_555 F N NO . A NO 1223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc4 C FE FE . A FE 1222 1_555 G N NO . A NO 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc5 B OH TYR 7 B TYR 7 1_555 H FE FE . B FE 2222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? metalc ? metalc6 J SG2 GSH . B GSH 2221 1_555 H FE FE . B FE 2222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc7 H FE FE . B FE 2222 1_555 K N NO . B NO 2223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc8 H FE FE . B FE 2222 1_555 L N NO . B NO 2224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? # _chem_comp.formula 'N O' _chem_comp.formula_weight 30.006 _chem_comp.id NO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'NITRIC OXIDE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'Nitrogen monoxide' # _chem_comp_bond.atom_id_1 N _chem_comp_bond.atom_id_2 O _chem_comp_bond.comp_id NO _chem_comp_bond.value_order doub _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 298 _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config n _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag n # _atom_sites.entry_id 1ZGN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01312 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001758 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011141 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014683 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 FE A 1 1222 222 FE FE3 . D 3 MES A 1 1220 220 MES MES . E 4 GSH A 1 1221 221 GSH GSH . F 5 NO A 1 1223 223 NO NO . G 5 NO A 1 1224 224 NO NO . H 2 FE B 1 2222 222 FE FE3 . I 3 MES B 1 2220 220 MES MES . J 4 GSH B 1 2221 221 GSH GSH . K 5 NO B 1 2223 223 NO NO . L 5 NO B 1 2224 224 NO NO . M 6 HOH A 1 1225 5 HOH WAT . M 6 HOH A 2 1226 6 HOH WAT . M 6 HOH A 3 1227 10 HOH WAT . M 6 HOH A 4 1228 13 HOH WAT . M 6 HOH A 5 1229 14 HOH WAT . M 6 HOH A 6 1230 16 HOH WAT . M 6 HOH A 7 1231 18 HOH WAT . M 6 HOH A 8 1232 19 HOH WAT . M 6 HOH A 9 1233 20 HOH WAT . M 6 HOH A 10 1234 21 HOH WAT . M 6 HOH A 11 1235 22 HOH WAT . M 6 HOH A 12 1236 25 HOH WAT . M 6 HOH A 13 1237 28 HOH WAT . M 6 HOH A 14 1238 29 HOH WAT . M 6 HOH A 15 1239 32 HOH WAT . M 6 HOH A 16 1240 36 HOH WAT . M 6 HOH A 17 1241 38 HOH WAT . M 6 HOH A 18 1242 39 HOH WAT . M 6 HOH A 19 1243 40 HOH WAT . M 6 HOH A 20 1244 46 HOH WAT . M 6 HOH A 21 1245 47 HOH WAT . M 6 HOH A 22 1246 48 HOH WAT . M 6 HOH A 23 1247 49 HOH WAT . M 6 HOH A 24 1248 50 HOH WAT . M 6 HOH A 25 1249 52 HOH WAT . M 6 HOH A 26 1250 57 HOH WAT . M 6 HOH A 27 1251 65 HOH WAT . M 6 HOH A 28 1252 66 HOH WAT . M 6 HOH A 29 1253 72 HOH WAT . M 6 HOH A 30 1254 73 HOH WAT . M 6 HOH A 31 1255 76 HOH WAT . M 6 HOH A 32 1256 77 HOH WAT . M 6 HOH A 33 1257 78 HOH WAT . M 6 HOH A 34 1258 82 HOH WAT . M 6 HOH A 35 1259 84 HOH WAT . M 6 HOH A 36 1260 91 HOH WAT . M 6 HOH A 37 1261 92 HOH WAT . M 6 HOH A 38 1262 93 HOH WAT . M 6 HOH A 39 1263 99 HOH WAT . M 6 HOH A 40 1264 100 HOH WAT . M 6 HOH A 41 1265 103 HOH WAT . M 6 HOH A 42 1266 104 HOH WAT . M 6 HOH A 43 1267 105 HOH WAT . M 6 HOH A 44 1268 107 HOH WAT . M 6 HOH A 45 1269 108 HOH WAT . M 6 HOH A 46 1270 110 HOH WAT . M 6 HOH A 47 1271 111 HOH WAT . M 6 HOH A 48 1272 115 HOH WAT . M 6 HOH A 49 1273 116 HOH WAT . M 6 HOH A 50 1274 118 HOH WAT . M 6 HOH A 51 1275 121 HOH WAT . M 6 HOH A 52 1276 123 HOH WAT . M 6 HOH A 53 1277 126 HOH WAT . M 6 HOH A 54 1278 127 HOH WAT . M 6 HOH A 55 1279 128 HOH WAT . M 6 HOH A 56 1280 129 HOH WAT . M 6 HOH A 57 1281 130 HOH WAT . M 6 HOH A 58 1282 131 HOH WAT . M 6 HOH A 59 1283 132 HOH WAT . M 6 HOH A 60 1284 136 HOH WAT . M 6 HOH A 61 1285 137 HOH WAT . M 6 HOH A 62 1286 138 HOH WAT . M 6 HOH A 63 1287 140 HOH WAT . M 6 HOH A 64 1288 143 HOH WAT . M 6 HOH A 65 1289 145 HOH WAT . M 6 HOH A 66 1290 149 HOH WAT . M 6 HOH A 67 1291 150 HOH WAT . M 6 HOH A 68 1292 152 HOH WAT . M 6 HOH A 69 1293 156 HOH WAT . M 6 HOH A 70 1294 157 HOH WAT . M 6 HOH A 71 1295 159 HOH WAT . M 6 HOH A 72 1296 160 HOH WAT . M 6 HOH A 73 1297 161 HOH WAT . M 6 HOH A 74 1298 162 HOH WAT . M 6 HOH A 75 1299 163 HOH WAT . M 6 HOH A 76 1300 165 HOH WAT . M 6 HOH A 77 1301 167 HOH WAT . M 6 HOH A 78 1302 168 HOH WAT . M 6 HOH A 79 1303 172 HOH WAT . M 6 HOH A 80 1304 173 HOH WAT . M 6 HOH A 81 1305 174 HOH WAT . M 6 HOH A 82 1306 179 HOH WAT . M 6 HOH A 83 1307 180 HOH WAT . M 6 HOH A 84 1308 185 HOH WAT . M 6 HOH A 85 1309 187 HOH WAT . M 6 HOH A 86 1310 188 HOH WAT . M 6 HOH A 87 1311 190 HOH WAT . M 6 HOH A 88 1312 191 HOH WAT . M 6 HOH A 89 1313 194 HOH WAT . M 6 HOH A 90 1314 195 HOH WAT . M 6 HOH A 91 1315 201 HOH WAT . M 6 HOH A 92 1316 209 HOH WAT . M 6 HOH A 93 1317 211 HOH WAT . M 6 HOH A 94 1318 213 HOH WAT . M 6 HOH A 95 1319 218 HOH WAT . M 6 HOH A 96 1320 219 HOH WAT . M 6 HOH A 97 1321 221 HOH WAT . M 6 HOH A 98 1322 228 HOH WAT . M 6 HOH A 99 1323 230 HOH WAT . M 6 HOH A 100 1324 233 HOH WAT . M 6 HOH A 101 1325 234 HOH WAT . M 6 HOH A 102 1326 235 HOH WAT . M 6 HOH A 103 1327 238 HOH WAT . M 6 HOH A 104 1328 240 HOH WAT . M 6 HOH A 105 1329 244 HOH WAT . M 6 HOH A 106 1330 245 HOH WAT . M 6 HOH A 107 1331 246 HOH WAT . M 6 HOH A 108 1332 250 HOH WAT . M 6 HOH A 109 1333 252 HOH WAT . M 6 HOH A 110 1334 253 HOH WAT . M 6 HOH A 111 1335 256 HOH WAT . M 6 HOH A 112 1336 258 HOH WAT . M 6 HOH A 113 1337 260 HOH WAT . M 6 HOH A 114 1338 263 HOH WAT . N 6 HOH B 1 2225 1 HOH WAT . N 6 HOH B 2 2226 3 HOH WAT . N 6 HOH B 3 2227 4 HOH WAT . N 6 HOH B 4 2228 7 HOH WAT . N 6 HOH B 5 2229 8 HOH WAT . N 6 HOH B 6 2230 9 HOH WAT . N 6 HOH B 7 2231 11 HOH WAT . N 6 HOH B 8 2232 12 HOH WAT . N 6 HOH B 9 2233 15 HOH WAT . N 6 HOH B 10 2234 17 HOH WAT . N 6 HOH B 11 2235 23 HOH WAT . N 6 HOH B 12 2236 24 HOH WAT . N 6 HOH B 13 2237 26 HOH WAT . N 6 HOH B 14 2238 30 HOH WAT . N 6 HOH B 15 2239 31 HOH WAT . N 6 HOH B 16 2240 33 HOH WAT . N 6 HOH B 17 2241 34 HOH WAT . N 6 HOH B 18 2242 35 HOH WAT . N 6 HOH B 19 2243 37 HOH WAT . N 6 HOH B 20 2244 41 HOH WAT . N 6 HOH B 21 2245 42 HOH WAT . N 6 HOH B 22 2246 44 HOH WAT . N 6 HOH B 23 2247 45 HOH WAT . N 6 HOH B 24 2248 51 HOH WAT . N 6 HOH B 25 2249 53 HOH WAT . N 6 HOH B 26 2250 54 HOH WAT . N 6 HOH B 27 2251 55 HOH WAT . N 6 HOH B 28 2252 56 HOH WAT . N 6 HOH B 29 2253 58 HOH WAT . N 6 HOH B 30 2254 59 HOH WAT . N 6 HOH B 31 2255 60 HOH WAT . N 6 HOH B 32 2256 61 HOH WAT . N 6 HOH B 33 2257 62 HOH WAT . N 6 HOH B 34 2258 63 HOH WAT . N 6 HOH B 35 2259 64 HOH WAT . N 6 HOH B 36 2260 67 HOH WAT . N 6 HOH B 37 2261 68 HOH WAT . N 6 HOH B 38 2262 69 HOH WAT . N 6 HOH B 39 2263 70 HOH WAT . N 6 HOH B 40 2264 71 HOH WAT . N 6 HOH B 41 2265 74 HOH WAT . N 6 HOH B 42 2266 75 HOH WAT . N 6 HOH B 43 2267 79 HOH WAT . N 6 HOH B 44 2268 80 HOH WAT . N 6 HOH B 45 2269 81 HOH WAT . N 6 HOH B 46 2270 83 HOH WAT . N 6 HOH B 47 2271 85 HOH WAT . N 6 HOH B 48 2272 86 HOH WAT . N 6 HOH B 49 2273 87 HOH WAT . N 6 HOH B 50 2274 88 HOH WAT . N 6 HOH B 51 2275 89 HOH WAT . N 6 HOH B 52 2276 94 HOH WAT . N 6 HOH B 53 2277 95 HOH WAT . N 6 HOH B 54 2278 96 HOH WAT . N 6 HOH B 55 2279 97 HOH WAT . N 6 HOH B 56 2280 98 HOH WAT . N 6 HOH B 57 2281 101 HOH WAT . N 6 HOH B 58 2282 102 HOH WAT . N 6 HOH B 59 2283 106 HOH WAT . N 6 HOH B 60 2284 109 HOH WAT . N 6 HOH B 61 2285 112 HOH WAT . N 6 HOH B 62 2286 113 HOH WAT . N 6 HOH B 63 2287 114 HOH WAT . N 6 HOH B 64 2288 117 HOH WAT . N 6 HOH B 65 2289 119 HOH WAT . N 6 HOH B 66 2290 120 HOH WAT . N 6 HOH B 67 2291 124 HOH WAT . N 6 HOH B 68 2292 133 HOH WAT . N 6 HOH B 69 2293 134 HOH WAT . N 6 HOH B 70 2294 135 HOH WAT . N 6 HOH B 71 2295 139 HOH WAT . N 6 HOH B 72 2296 144 HOH WAT . N 6 HOH B 73 2297 146 HOH WAT . N 6 HOH B 74 2298 147 HOH WAT . N 6 HOH B 75 2299 148 HOH WAT . N 6 HOH B 76 2300 151 HOH WAT . N 6 HOH B 77 2301 153 HOH WAT . N 6 HOH B 78 2302 154 HOH WAT . N 6 HOH B 79 2303 158 HOH WAT . N 6 HOH B 80 2304 164 HOH WAT . N 6 HOH B 81 2305 166 HOH WAT . N 6 HOH B 82 2306 169 HOH WAT . N 6 HOH B 83 2307 170 HOH WAT . N 6 HOH B 84 2308 175 HOH WAT . N 6 HOH B 85 2309 176 HOH WAT . N 6 HOH B 86 2310 177 HOH WAT . N 6 HOH B 87 2311 178 HOH WAT . N 6 HOH B 88 2312 181 HOH WAT . N 6 HOH B 89 2313 182 HOH WAT . N 6 HOH B 90 2314 183 HOH WAT . N 6 HOH B 91 2315 184 HOH WAT . N 6 HOH B 92 2316 186 HOH WAT . N 6 HOH B 93 2317 193 HOH WAT . N 6 HOH B 94 2318 198 HOH WAT . N 6 HOH B 95 2319 199 HOH WAT . N 6 HOH B 96 2320 200 HOH WAT . N 6 HOH B 97 2321 202 HOH WAT . N 6 HOH B 98 2322 203 HOH WAT . N 6 HOH B 99 2323 204 HOH WAT . N 6 HOH B 100 2324 205 HOH WAT . N 6 HOH B 101 2325 206 HOH WAT . N 6 HOH B 102 2326 208 HOH WAT . N 6 HOH B 103 2327 210 HOH WAT . N 6 HOH B 104 2328 212 HOH WAT . N 6 HOH B 105 2329 214 HOH WAT . N 6 HOH B 106 2330 215 HOH WAT . N 6 HOH B 107 2331 216 HOH WAT . N 6 HOH B 108 2332 217 HOH WAT . N 6 HOH B 109 2333 222 HOH WAT . N 6 HOH B 110 2334 223 HOH WAT . N 6 HOH B 111 2335 224 HOH WAT . N 6 HOH B 112 2336 226 HOH WAT . N 6 HOH B 113 2337 227 HOH WAT . N 6 HOH B 114 2338 229 HOH WAT . N 6 HOH B 115 2339 231 HOH WAT . N 6 HOH B 116 2340 232 HOH WAT . N 6 HOH B 117 2341 236 HOH WAT . N 6 HOH B 118 2342 237 HOH WAT . N 6 HOH B 119 2343 242 HOH WAT . N 6 HOH B 120 2344 247 HOH WAT . N 6 HOH B 121 2345 248 HOH WAT . N 6 HOH B 122 2346 249 HOH WAT . N 6 HOH B 123 2347 254 HOH WAT . N 6 HOH B 124 2348 255 HOH WAT . N 6 HOH B 125 2349 257 HOH WAT . N 6 HOH B 126 2350 259 HOH WAT . N 6 HOH B 127 2351 261 HOH WAT . N 6 HOH B 128 2352 264 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N NO . . . K 5 12.569 20.789 8.399 0.41 16.37 ? N NO 2223 B 1 HETATM 2 O O NO . . . K 5 11.419 20.988 9.206 0.41 15.99 ? O NO 2223 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 269 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 2 #