data_1ZND # _model_server_result.job_id WYIBkLN90mMLCWlHgMo9rA _model_server_result.datetime_utc '2025-01-10 12:39:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1znd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":200}' # _entry.id 1ZND # _exptl.entry_id 1ZND _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 112.411 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CADMIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ZND _cell.length_a 53.511 _cell.length_b 53.511 _cell.length_c 136.974 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ZND _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 76 A CYS 64 1_555 A SG CYS 169 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 122 A ASP 110 8_675 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc8 B CD CD . A CD 200 1_555 F O HOH . A HOH 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc9 B CD CD . A CD 200 1_555 F O HOH . A HOH 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc10 B CD CD . A CD 200 1_555 F O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc11 C CD CD . A CD 201 1_555 F O HOH . A HOH 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc12 C CD CD . A CD 201 1_555 F O HOH . A HOH 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? # _chem_comp.formula 'Cd 2' _chem_comp.formula_weight 112.411 _chem_comp.id CD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CADMIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1ZND _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018688 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.018688 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007301 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CD A 1 200 200 CD CD . C 2 CD A 1 201 201 CD CD . D 3 PE9 A 1 202 1 PE9 PEN . E 3 PE9 A 1 203 2 PE9 PEN . F 4 HOH A 1 204 202 HOH WAT . F 4 HOH A 2 205 203 HOH WAT . F 4 HOH A 3 206 204 HOH WAT . F 4 HOH A 4 207 205 HOH WAT . F 4 HOH A 5 208 206 HOH WAT . F 4 HOH A 6 209 207 HOH WAT . F 4 HOH A 7 210 208 HOH WAT . F 4 HOH A 8 211 209 HOH WAT . F 4 HOH A 9 212 210 HOH WAT . F 4 HOH A 10 213 211 HOH WAT . F 4 HOH A 11 214 212 HOH WAT . F 4 HOH A 12 215 213 HOH WAT . F 4 HOH A 13 216 214 HOH WAT . F 4 HOH A 14 217 215 HOH WAT . F 4 HOH A 15 218 216 HOH WAT . F 4 HOH A 16 219 217 HOH WAT . F 4 HOH A 17 220 218 HOH WAT . F 4 HOH A 18 221 219 HOH WAT . F 4 HOH A 19 222 220 HOH WAT . F 4 HOH A 20 223 222 HOH WAT . F 4 HOH A 21 224 223 HOH WAT . F 4 HOH A 22 225 224 HOH WAT . F 4 HOH A 23 226 225 HOH WAT . F 4 HOH A 24 227 226 HOH WAT . F 4 HOH A 25 228 227 HOH WAT . F 4 HOH A 26 229 228 HOH WAT . F 4 HOH A 27 230 229 HOH WAT . F 4 HOH A 28 231 230 HOH WAT . F 4 HOH A 29 232 231 HOH WAT . F 4 HOH A 30 233 232 HOH WAT . F 4 HOH A 31 234 233 HOH WAT . F 4 HOH A 32 235 234 HOH WAT . F 4 HOH A 33 236 235 HOH WAT . F 4 HOH A 34 237 236 HOH WAT . F 4 HOH A 35 238 237 HOH WAT . F 4 HOH A 36 239 238 HOH WAT . F 4 HOH A 37 240 239 HOH WAT . F 4 HOH A 38 241 240 HOH WAT . F 4 HOH A 39 242 241 HOH WAT . F 4 HOH A 40 243 242 HOH WAT . F 4 HOH A 41 244 243 HOH WAT . F 4 HOH A 42 245 244 HOH WAT . F 4 HOH A 43 246 245 HOH WAT . F 4 HOH A 44 247 246 HOH WAT . F 4 HOH A 45 248 247 HOH WAT . F 4 HOH A 46 249 248 HOH WAT . F 4 HOH A 47 250 249 HOH WAT . F 4 HOH A 48 251 250 HOH WAT . F 4 HOH A 49 252 251 HOH WAT . F 4 HOH A 50 253 252 HOH WAT . F 4 HOH A 51 254 253 HOH WAT . F 4 HOH A 52 255 254 HOH WAT . F 4 HOH A 53 256 255 HOH WAT . F 4 HOH A 54 257 256 HOH WAT . F 4 HOH A 55 258 257 HOH WAT . F 4 HOH A 56 259 258 HOH WAT . F 4 HOH A 57 260 259 HOH WAT . F 4 HOH A 58 261 260 HOH WAT . F 4 HOH A 59 262 261 HOH WAT . F 4 HOH A 60 263 262 HOH WAT . F 4 HOH A 61 264 263 HOH WAT . F 4 HOH A 62 265 264 HOH WAT . F 4 HOH A 63 266 265 HOH WAT . F 4 HOH A 64 267 266 HOH WAT . F 4 HOH A 65 268 267 HOH WAT . F 4 HOH A 66 269 268 HOH WAT . F 4 HOH A 67 270 269 HOH WAT . F 4 HOH A 68 271 270 HOH WAT . F 4 HOH A 69 272 271 HOH WAT . F 4 HOH A 70 273 272 HOH WAT . F 4 HOH A 71 274 273 HOH WAT . F 4 HOH A 72 275 274 HOH WAT . F 4 HOH A 73 276 275 HOH WAT . F 4 HOH A 74 277 276 HOH WAT . F 4 HOH A 75 278 277 HOH WAT . F 4 HOH A 76 279 278 HOH WAT . F 4 HOH A 77 280 279 HOH WAT . F 4 HOH A 78 281 280 HOH WAT . F 4 HOH A 79 282 281 HOH WAT . F 4 HOH A 80 283 282 HOH WAT . F 4 HOH A 81 284 283 HOH WAT . F 4 HOH A 82 285 284 HOH WAT . F 4 HOH A 83 286 285 HOH WAT . F 4 HOH A 84 287 286 HOH WAT . F 4 HOH A 85 288 287 HOH WAT . F 4 HOH A 86 289 288 HOH WAT . F 4 HOH A 87 290 289 HOH WAT . F 4 HOH A 88 291 290 HOH WAT . F 4 HOH A 89 292 291 HOH WAT . F 4 HOH A 90 293 292 HOH WAT . F 4 HOH A 91 294 293 HOH WAT . F 4 HOH A 92 295 294 HOH WAT . F 4 HOH A 93 296 295 HOH WAT . F 4 HOH A 94 297 296 HOH WAT . F 4 HOH A 95 298 297 HOH WAT . F 4 HOH A 96 299 298 HOH WAT . F 4 HOH A 97 300 299 HOH WAT . F 4 HOH A 98 301 300 HOH WAT . F 4 HOH A 99 302 301 HOH WAT . F 4 HOH A 100 303 302 HOH WAT . F 4 HOH A 101 304 303 HOH WAT . F 4 HOH A 102 305 304 HOH WAT . F 4 HOH A 103 306 305 HOH WAT . F 4 HOH A 104 307 306 HOH WAT . F 4 HOH A 105 308 307 HOH WAT . F 4 HOH A 106 309 308 HOH WAT . F 4 HOH A 107 310 309 HOH WAT . F 4 HOH A 108 311 310 HOH WAT . F 4 HOH A 109 312 311 HOH WAT . F 4 HOH A 110 313 312 HOH WAT . F 4 HOH A 111 314 313 HOH WAT . F 4 HOH A 112 315 314 HOH WAT . F 4 HOH A 113 316 315 HOH WAT . F 4 HOH A 114 317 316 HOH WAT . F 4 HOH A 115 318 317 HOH WAT . F 4 HOH A 116 319 318 HOH WAT . F 4 HOH A 117 320 319 HOH WAT . F 4 HOH A 118 321 320 HOH WAT . F 4 HOH A 119 322 321 HOH WAT . F 4 HOH A 120 323 322 HOH WAT . F 4 HOH A 121 324 323 HOH WAT . F 4 HOH A 122 325 324 HOH WAT . F 4 HOH A 123 326 325 HOH WAT . F 4 HOH A 124 327 326 HOH WAT . F 4 HOH A 125 328 327 HOH WAT . F 4 HOH A 126 329 328 HOH WAT . F 4 HOH A 127 330 329 HOH WAT . F 4 HOH A 128 331 330 HOH WAT . F 4 HOH A 129 332 331 HOH WAT . F 4 HOH A 130 333 332 HOH WAT . F 4 HOH A 131 334 333 HOH WAT . F 4 HOH A 132 335 334 HOH WAT . F 4 HOH A 133 336 335 HOH WAT . F 4 HOH A 134 337 336 HOH WAT . F 4 HOH A 135 338 337 HOH WAT . F 4 HOH A 136 339 338 HOH WAT . F 4 HOH A 137 340 339 HOH WAT . F 4 HOH A 138 341 340 HOH WAT . F 4 HOH A 139 342 342 HOH WAT . F 4 HOH A 140 343 343 HOH WAT . F 4 HOH A 141 344 344 HOH WAT . F 4 HOH A 142 345 345 HOH WAT . F 4 HOH A 143 346 346 HOH WAT . F 4 HOH A 144 347 347 HOH WAT . F 4 HOH A 145 348 348 HOH WAT . F 4 HOH A 146 349 349 HOH WAT . F 4 HOH A 147 350 350 HOH WAT . F 4 HOH A 148 351 351 HOH WAT . F 4 HOH A 149 352 352 HOH WAT . F 4 HOH A 150 353 353 HOH WAT . F 4 HOH A 151 354 354 HOH WAT . F 4 HOH A 152 355 355 HOH WAT . F 4 HOH A 153 356 356 HOH WAT . F 4 HOH A 154 357 357 HOH WAT . F 4 HOH A 155 358 358 HOH WAT . F 4 HOH A 156 359 359 HOH WAT . F 4 HOH A 157 360 360 HOH WAT . F 4 HOH A 158 361 361 HOH WAT . F 4 HOH A 159 362 362 HOH WAT . F 4 HOH A 160 363 363 HOH WAT . F 4 HOH A 161 364 364 HOH WAT . F 4 HOH A 162 365 365 HOH WAT . F 4 HOH A 163 366 366 HOH WAT . F 4 HOH A 164 367 367 HOH WAT . F 4 HOH A 165 368 368 HOH WAT . F 4 HOH A 166 369 369 HOH WAT . F 4 HOH A 167 370 370 HOH WAT . F 4 HOH A 168 371 371 HOH WAT . F 4 HOH A 169 372 372 HOH WAT . F 4 HOH A 170 373 373 HOH WAT . F 4 HOH A 171 374 374 HOH WAT . F 4 HOH A 172 375 375 HOH WAT . F 4 HOH A 173 376 376 HOH WAT . F 4 HOH A 174 377 377 HOH WAT . F 4 HOH A 175 378 378 HOH WAT . F 4 HOH A 176 379 379 HOH WAT . F 4 HOH A 177 380 380 HOH WAT . F 4 HOH A 178 381 381 HOH WAT . F 4 HOH A 179 382 382 HOH WAT . F 4 HOH A 180 383 383 HOH WAT . F 4 HOH A 181 384 384 HOH WAT . F 4 HOH A 182 385 385 HOH WAT . F 4 HOH A 183 386 386 HOH WAT . F 4 HOH A 184 387 387 HOH WAT . F 4 HOH A 185 388 388 HOH WAT . F 4 HOH A 186 389 389 HOH WAT . F 4 HOH A 187 390 390 HOH WAT . F 4 HOH A 188 391 391 HOH WAT . F 4 HOH A 189 392 392 HOH WAT . F 4 HOH A 190 393 393 HOH WAT . F 4 HOH A 191 394 394 HOH WAT . F 4 HOH A 192 395 395 HOH WAT . F 4 HOH A 193 396 396 HOH WAT . F 4 HOH A 194 397 397 HOH WAT . F 4 HOH A 195 398 398 HOH WAT . F 4 HOH A 196 399 399 HOH WAT . F 4 HOH A 197 400 400 HOH WAT . F 4 HOH A 198 401 401 HOH WAT . F 4 HOH A 199 402 402 HOH WAT . F 4 HOH A 200 403 403 HOH WAT . F 4 HOH A 201 404 404 HOH WAT . F 4 HOH A 202 405 405 HOH WAT . F 4 HOH A 203 406 406 HOH WAT . F 4 HOH A 204 407 407 HOH WAT . F 4 HOH A 205 408 408 HOH WAT . F 4 HOH A 206 409 409 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CD _atom_site.label_atom_id CD _atom_site.label_comp_id CD _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 33.672 _atom_site.Cartn_y 6.202 _atom_site.Cartn_z 45.346 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 13.31 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CD _atom_site.auth_comp_id CD _atom_site.auth_seq_id 200 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 52 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 286 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #