data_1ZNG # _model_server_result.job_id 40RZIuKXsq4u6u4x6wZAJA _model_server_result.datetime_utc '2025-01-25 11:20:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1zng # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":201}' # _entry.id 1ZNG # _exptl.entry_id 1ZNG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 112.411 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CADMIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ZNG _cell.length_a 53.607 _cell.length_b 53.607 _cell.length_c 137.381 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ZNG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 76 A CYS 64 1_555 A SG CYS 169 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 122 A ASP 110 8_675 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc8 B CD CD . A CD 200 1_555 E O HOH . A HOH 436 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc9 B CD CD . A CD 200 1_555 E O HOH . A HOH 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc10 B CD CD . A CD 200 1_555 E O HOH . A HOH 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc11 C CD CD . A CD 201 1_555 E O HOH . A HOH 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc12 C CD CD . A CD 201 1_555 E O HOH . A HOH 440 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? # _chem_comp.formula 'Cd 2' _chem_comp.formula_weight 112.411 _chem_comp.id CD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CADMIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1ZNG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018654 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.018654 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007279 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CD A 1 200 200 CD CD . C 2 CD A 1 201 201 CD CD . D 3 HE4 A 1 202 1 HE4 HEP . E 4 HOH A 1 203 202 HOH WAT . E 4 HOH A 2 204 203 HOH WAT . E 4 HOH A 3 205 204 HOH WAT . E 4 HOH A 4 206 205 HOH WAT . E 4 HOH A 5 207 206 HOH WAT . E 4 HOH A 6 208 207 HOH WAT . E 4 HOH A 7 209 208 HOH WAT . E 4 HOH A 8 210 209 HOH WAT . E 4 HOH A 9 211 210 HOH WAT . E 4 HOH A 10 212 211 HOH WAT . E 4 HOH A 11 213 212 HOH WAT . E 4 HOH A 12 214 213 HOH WAT . E 4 HOH A 13 215 214 HOH WAT . E 4 HOH A 14 216 215 HOH WAT . E 4 HOH A 15 217 216 HOH WAT . E 4 HOH A 16 218 217 HOH WAT . E 4 HOH A 17 219 218 HOH WAT . E 4 HOH A 18 220 219 HOH WAT . E 4 HOH A 19 221 220 HOH WAT . E 4 HOH A 20 222 221 HOH WAT . E 4 HOH A 21 223 222 HOH WAT . E 4 HOH A 22 224 223 HOH WAT . E 4 HOH A 23 225 224 HOH WAT . E 4 HOH A 24 226 225 HOH WAT . E 4 HOH A 25 227 226 HOH WAT . E 4 HOH A 26 228 227 HOH WAT . E 4 HOH A 27 229 228 HOH WAT . E 4 HOH A 28 230 229 HOH WAT . E 4 HOH A 29 231 230 HOH WAT . E 4 HOH A 30 232 231 HOH WAT . E 4 HOH A 31 233 232 HOH WAT . E 4 HOH A 32 234 233 HOH WAT . E 4 HOH A 33 235 234 HOH WAT . E 4 HOH A 34 236 235 HOH WAT . E 4 HOH A 35 237 236 HOH WAT . E 4 HOH A 36 238 237 HOH WAT . E 4 HOH A 37 239 238 HOH WAT . E 4 HOH A 38 240 239 HOH WAT . E 4 HOH A 39 241 240 HOH WAT . E 4 HOH A 40 242 241 HOH WAT . E 4 HOH A 41 243 242 HOH WAT . E 4 HOH A 42 244 243 HOH WAT . E 4 HOH A 43 245 244 HOH WAT . E 4 HOH A 44 246 245 HOH WAT . E 4 HOH A 45 247 246 HOH WAT . E 4 HOH A 46 248 247 HOH WAT . E 4 HOH A 47 249 248 HOH WAT . E 4 HOH A 48 250 249 HOH WAT . E 4 HOH A 49 251 250 HOH WAT . E 4 HOH A 50 252 251 HOH WAT . E 4 HOH A 51 253 252 HOH WAT . E 4 HOH A 52 254 253 HOH WAT . E 4 HOH A 53 255 254 HOH WAT . E 4 HOH A 54 256 255 HOH WAT . E 4 HOH A 55 257 256 HOH WAT . E 4 HOH A 56 258 257 HOH WAT . E 4 HOH A 57 259 258 HOH WAT . E 4 HOH A 58 260 259 HOH WAT . E 4 HOH A 59 261 260 HOH WAT . E 4 HOH A 60 262 261 HOH WAT . E 4 HOH A 61 263 262 HOH WAT . E 4 HOH A 62 264 263 HOH WAT . E 4 HOH A 63 265 264 HOH WAT . E 4 HOH A 64 266 265 HOH WAT . E 4 HOH A 65 267 266 HOH WAT . E 4 HOH A 66 268 267 HOH WAT . E 4 HOH A 67 269 268 HOH WAT . E 4 HOH A 68 270 269 HOH WAT . E 4 HOH A 69 271 270 HOH WAT . E 4 HOH A 70 272 271 HOH WAT . E 4 HOH A 71 273 272 HOH WAT . E 4 HOH A 72 274 273 HOH WAT . E 4 HOH A 73 275 274 HOH WAT . E 4 HOH A 74 276 275 HOH WAT . E 4 HOH A 75 277 276 HOH WAT . E 4 HOH A 76 278 278 HOH WAT . E 4 HOH A 77 279 279 HOH WAT . E 4 HOH A 78 280 280 HOH WAT . E 4 HOH A 79 281 281 HOH WAT . E 4 HOH A 80 282 282 HOH WAT . E 4 HOH A 81 283 283 HOH WAT . E 4 HOH A 82 284 284 HOH WAT . E 4 HOH A 83 285 285 HOH WAT . E 4 HOH A 84 286 286 HOH WAT . E 4 HOH A 85 287 287 HOH WAT . E 4 HOH A 86 288 288 HOH WAT . E 4 HOH A 87 289 289 HOH WAT . E 4 HOH A 88 290 290 HOH WAT . E 4 HOH A 89 291 291 HOH WAT . E 4 HOH A 90 292 292 HOH WAT . E 4 HOH A 91 293 293 HOH WAT . E 4 HOH A 92 294 294 HOH WAT . E 4 HOH A 93 295 295 HOH WAT . E 4 HOH A 94 296 296 HOH WAT . E 4 HOH A 95 297 297 HOH WAT . E 4 HOH A 96 298 298 HOH WAT . E 4 HOH A 97 299 299 HOH WAT . E 4 HOH A 98 300 300 HOH WAT . E 4 HOH A 99 301 301 HOH WAT . E 4 HOH A 100 302 302 HOH WAT . E 4 HOH A 101 303 303 HOH WAT . E 4 HOH A 102 304 304 HOH WAT . E 4 HOH A 103 305 305 HOH WAT . E 4 HOH A 104 306 307 HOH WAT . E 4 HOH A 105 307 308 HOH WAT . E 4 HOH A 106 308 309 HOH WAT . E 4 HOH A 107 309 310 HOH WAT . E 4 HOH A 108 310 311 HOH WAT . E 4 HOH A 109 311 312 HOH WAT . E 4 HOH A 110 312 313 HOH WAT . E 4 HOH A 111 313 314 HOH WAT . E 4 HOH A 112 314 315 HOH WAT . E 4 HOH A 113 315 316 HOH WAT . E 4 HOH A 114 316 317 HOH WAT . E 4 HOH A 115 317 318 HOH WAT . E 4 HOH A 116 318 319 HOH WAT . E 4 HOH A 117 319 320 HOH WAT . E 4 HOH A 118 320 321 HOH WAT . E 4 HOH A 119 321 322 HOH WAT . E 4 HOH A 120 322 323 HOH WAT . E 4 HOH A 121 323 324 HOH WAT . E 4 HOH A 122 324 325 HOH WAT . E 4 HOH A 123 325 326 HOH WAT . E 4 HOH A 124 326 327 HOH WAT . E 4 HOH A 125 327 328 HOH WAT . E 4 HOH A 126 328 329 HOH WAT . E 4 HOH A 127 329 330 HOH WAT . E 4 HOH A 128 330 331 HOH WAT . E 4 HOH A 129 331 332 HOH WAT . E 4 HOH A 130 332 333 HOH WAT . E 4 HOH A 131 333 334 HOH WAT . E 4 HOH A 132 334 335 HOH WAT . E 4 HOH A 133 335 336 HOH WAT . E 4 HOH A 134 336 337 HOH WAT . E 4 HOH A 135 337 338 HOH WAT . E 4 HOH A 136 338 339 HOH WAT . E 4 HOH A 137 339 340 HOH WAT . E 4 HOH A 138 340 341 HOH WAT . E 4 HOH A 139 341 342 HOH WAT . E 4 HOH A 140 342 343 HOH WAT . E 4 HOH A 141 343 344 HOH WAT . E 4 HOH A 142 344 345 HOH WAT . E 4 HOH A 143 345 346 HOH WAT . E 4 HOH A 144 346 347 HOH WAT . E 4 HOH A 145 347 348 HOH WAT . E 4 HOH A 146 348 349 HOH WAT . E 4 HOH A 147 349 350 HOH WAT . E 4 HOH A 148 350 351 HOH WAT . E 4 HOH A 149 351 352 HOH WAT . E 4 HOH A 150 352 353 HOH WAT . E 4 HOH A 151 353 354 HOH WAT . E 4 HOH A 152 354 355 HOH WAT . E 4 HOH A 153 355 356 HOH WAT . E 4 HOH A 154 356 357 HOH WAT . E 4 HOH A 155 357 358 HOH WAT . E 4 HOH A 156 358 359 HOH WAT . E 4 HOH A 157 359 361 HOH WAT . E 4 HOH A 158 360 362 HOH WAT . E 4 HOH A 159 361 363 HOH WAT . E 4 HOH A 160 362 364 HOH WAT . E 4 HOH A 161 363 365 HOH WAT . E 4 HOH A 162 364 366 HOH WAT . E 4 HOH A 163 365 367 HOH WAT . E 4 HOH A 164 366 368 HOH WAT . E 4 HOH A 165 367 369 HOH WAT . E 4 HOH A 166 368 370 HOH WAT . E 4 HOH A 167 369 371 HOH WAT . E 4 HOH A 168 370 372 HOH WAT . E 4 HOH A 169 371 373 HOH WAT . E 4 HOH A 170 372 374 HOH WAT . E 4 HOH A 171 373 375 HOH WAT . E 4 HOH A 172 374 376 HOH WAT . E 4 HOH A 173 375 377 HOH WAT . E 4 HOH A 174 376 379 HOH WAT . E 4 HOH A 175 377 380 HOH WAT . E 4 HOH A 176 378 381 HOH WAT . E 4 HOH A 177 379 382 HOH WAT . E 4 HOH A 178 380 383 HOH WAT . E 4 HOH A 179 381 384 HOH WAT . E 4 HOH A 180 382 385 HOH WAT . E 4 HOH A 181 383 386 HOH WAT . E 4 HOH A 182 384 387 HOH WAT . E 4 HOH A 183 385 388 HOH WAT . E 4 HOH A 184 386 389 HOH WAT . E 4 HOH A 185 387 390 HOH WAT . E 4 HOH A 186 388 391 HOH WAT . E 4 HOH A 187 389 392 HOH WAT . E 4 HOH A 188 390 393 HOH WAT . E 4 HOH A 189 391 394 HOH WAT . E 4 HOH A 190 392 395 HOH WAT . E 4 HOH A 191 393 396 HOH WAT . E 4 HOH A 192 394 397 HOH WAT . E 4 HOH A 193 395 398 HOH WAT . E 4 HOH A 194 396 399 HOH WAT . E 4 HOH A 195 397 400 HOH WAT . E 4 HOH A 196 398 401 HOH WAT . E 4 HOH A 197 399 402 HOH WAT . E 4 HOH A 198 400 403 HOH WAT . E 4 HOH A 199 401 404 HOH WAT . E 4 HOH A 200 402 405 HOH WAT . E 4 HOH A 201 403 406 HOH WAT . E 4 HOH A 202 404 407 HOH WAT . E 4 HOH A 203 405 408 HOH WAT . E 4 HOH A 204 406 409 HOH WAT . E 4 HOH A 205 407 410 HOH WAT . E 4 HOH A 206 408 411 HOH WAT . E 4 HOH A 207 409 412 HOH WAT . E 4 HOH A 208 410 413 HOH WAT . E 4 HOH A 209 411 414 HOH WAT . E 4 HOH A 210 412 415 HOH WAT . E 4 HOH A 211 413 416 HOH WAT . E 4 HOH A 212 414 417 HOH WAT . E 4 HOH A 213 415 418 HOH WAT . E 4 HOH A 214 416 419 HOH WAT . E 4 HOH A 215 417 420 HOH WAT . E 4 HOH A 216 418 421 HOH WAT . E 4 HOH A 217 419 422 HOH WAT . E 4 HOH A 218 420 423 HOH WAT . E 4 HOH A 219 421 424 HOH WAT . E 4 HOH A 220 422 425 HOH WAT . E 4 HOH A 221 423 426 HOH WAT . E 4 HOH A 222 424 427 HOH WAT . E 4 HOH A 223 425 428 HOH WAT . E 4 HOH A 224 426 429 HOH WAT . E 4 HOH A 225 427 430 HOH WAT . E 4 HOH A 226 428 431 HOH WAT . E 4 HOH A 227 429 432 HOH WAT . E 4 HOH A 228 430 433 HOH WAT . E 4 HOH A 229 431 435 HOH WAT . E 4 HOH A 230 432 436 HOH WAT . E 4 HOH A 231 433 437 HOH WAT . E 4 HOH A 232 434 438 HOH WAT . E 4 HOH A 233 435 439 HOH WAT . E 4 HOH A 234 436 440 HOH WAT . E 4 HOH A 235 437 441 HOH WAT . E 4 HOH A 236 438 442 HOH WAT . E 4 HOH A 237 439 443 HOH WAT . E 4 HOH A 238 440 444 HOH WAT . E 4 HOH A 239 441 445 HOH WAT . E 4 HOH A 240 442 446 HOH WAT . E 4 HOH A 241 443 447 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CD _atom_site.label_atom_id CD _atom_site.label_comp_id CD _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 36.697 _atom_site.Cartn_y 44.103 _atom_site.Cartn_z 40.805 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 22.39 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CD _atom_site.auth_comp_id CD _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 37 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 310 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 1 #