data_1ZNH # _model_server_result.job_id R-tqT_PAT7BVodbT8ZX8pw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 10:22:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1znh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":401}' # _entry.id 1ZNH # _exptl.entry_id 1ZNH _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 130.228 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description OCTAN-1-OL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ZNH _cell.length_a 53.662 _cell.length_b 53.662 _cell.length_c 137.61 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ZNH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id H _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 76 A CYS 64 1_555 A SG CYS 169 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 97 A ASP 85 1_555 D CD CD . A CD 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 110 A ASP 98 1_555 E CD CD . A CD 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc ? metalc7 A ND1 HIS 116 A HIS 104 1_555 F CD CD . A CD 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 122 A ASP 110 8_675 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 122 A ASP 110 8_675 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.144 ? metalc ? metalc10 A OE1 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? metalc ? metalc11 A OE2 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc12 A NE2 HIS 153 A HIS 141 1_555 G CD CD . A CD 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.103 ? metalc ? metalc13 B CD CD . A CD 200 1_555 I O HOH . A HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc14 B CD CD . A CD 200 1_555 I O HOH . A HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc15 B CD CD . A CD 200 1_555 I O HOH . A HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc16 B CD CD . A CD 200 1_555 I O HOH . A HOH 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.937 ? metalc ? metalc17 C CD CD . A CD 201 1_555 I O HOH . A HOH 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc18 C CD CD . A CD 201 1_555 I O HOH . A HOH 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc19 C CD CD . A CD 201 1_555 I O HOH . A HOH 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc20 C CD CD . A CD 201 1_555 I O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc21 D CD CD . A CD 204 1_555 I O HOH . A HOH 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc ? metalc22 E CD CD . A CD 205 1_555 I O HOH . A HOH 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc23 I O HOH . A HOH 211 8_665 F CD CD . A CD 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? metalc ? metalc24 I O HOH . A HOH 211 8_665 G CD CD . A CD 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc ? metalc25 I O HOH . A HOH 212 1_555 F CD CD . A CD 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? metalc ? metalc26 I O HOH . A HOH 212 1_555 G CD CD . A CD 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? metalc ? metalc27 I O HOH . A HOH 316 1_555 G CD CD . A CD 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc28 I O HOH . A HOH 414 1_555 F CD CD . A CD 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? # _chem_comp.formula 'C8 H18 O' _chem_comp.formula_weight 130.228 _chem_comp.id OC9 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name OCTAN-1-OL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag CAA CAC OC9 sing 237 n n CAA HAA1 OC9 sing 238 n n CAA HAA2 OC9 sing 239 n n CAA HAA3 OC9 sing 240 n n CAC CAE OC9 sing 241 n n CAC HAC1 OC9 sing 242 n n CAC HAC2 OC9 sing 243 n n CAE CAG OC9 sing 244 n n CAE HAE1 OC9 sing 245 n n CAE HAE2 OC9 sing 246 n n CAG CAI OC9 sing 247 n n CAG HAG1 OC9 sing 248 n n CAG HAG2 OC9 sing 249 n n CAI CAH OC9 sing 250 n n CAI HAI1 OC9 sing 251 n n CAI HAI2 OC9 sing 252 n n CAH CAF OC9 sing 253 n n CAH HAH1 OC9 sing 254 n n CAH HAH2 OC9 sing 255 n n CAF CAD OC9 sing 256 n n CAF HAF1 OC9 sing 257 n n CAF HAF2 OC9 sing 258 n n CAD OAB OC9 sing 259 n n CAD HAD1 OC9 sing 260 n n CAD HAD2 OC9 sing 261 n n OAB HAB OC9 sing 262 n n # _atom_sites.entry_id 1ZNH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018635 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.018635 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007267 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CD A 1 200 200 CD CD . C 2 CD A 1 201 201 CD CD . D 2 CD A 1 204 204 CD CD . E 2 CD A 1 205 205 CD CD . F 2 CD A 1 415 415 CD CD . G 2 CD A 1 416 416 CD CD . H 3 OC9 A 1 401 401 OC9 OCT . I 4 HOH A 1 206 206 HOH WAT . I 4 HOH A 2 208 208 HOH WAT . I 4 HOH A 3 209 209 HOH WAT . I 4 HOH A 4 210 210 HOH WAT . I 4 HOH A 5 211 211 HOH WAT . I 4 HOH A 6 212 212 HOH WAT . I 4 HOH A 7 213 213 HOH WAT . I 4 HOH A 8 214 214 HOH WAT . I 4 HOH A 9 215 215 HOH WAT . I 4 HOH A 10 216 216 HOH WAT . I 4 HOH A 11 217 217 HOH WAT . I 4 HOH A 12 218 218 HOH WAT . I 4 HOH A 13 219 219 HOH WAT . I 4 HOH A 14 220 220 HOH WAT . I 4 HOH A 15 221 221 HOH WAT . I 4 HOH A 16 222 222 HOH WAT . I 4 HOH A 17 223 223 HOH WAT . I 4 HOH A 18 224 224 HOH WAT . I 4 HOH A 19 225 225 HOH WAT . I 4 HOH A 20 226 226 HOH WAT . I 4 HOH A 21 227 227 HOH WAT . I 4 HOH A 22 228 228 HOH WAT . I 4 HOH A 23 229 229 HOH WAT . I 4 HOH A 24 230 230 HOH WAT . I 4 HOH A 25 231 231 HOH WAT . I 4 HOH A 26 232 232 HOH WAT . I 4 HOH A 27 234 234 HOH WAT . I 4 HOH A 28 235 235 HOH WAT . I 4 HOH A 29 236 236 HOH WAT . I 4 HOH A 30 237 237 HOH WAT . I 4 HOH A 31 239 239 HOH WAT . I 4 HOH A 32 240 240 HOH WAT . I 4 HOH A 33 241 241 HOH WAT . I 4 HOH A 34 242 242 HOH WAT . I 4 HOH A 35 243 243 HOH WAT . I 4 HOH A 36 244 244 HOH WAT . I 4 HOH A 37 245 245 HOH WAT . I 4 HOH A 38 246 246 HOH WAT . I 4 HOH A 39 247 247 HOH WAT . I 4 HOH A 40 248 248 HOH WAT . I 4 HOH A 41 249 249 HOH WAT . I 4 HOH A 42 250 250 HOH WAT . I 4 HOH A 43 251 251 HOH WAT . I 4 HOH A 44 253 253 HOH WAT . I 4 HOH A 45 254 254 HOH WAT . I 4 HOH A 46 255 255 HOH WAT . I 4 HOH A 47 256 256 HOH WAT . I 4 HOH A 48 257 257 HOH WAT . I 4 HOH A 49 258 258 HOH WAT . I 4 HOH A 50 259 259 HOH WAT . I 4 HOH A 51 260 260 HOH WAT . I 4 HOH A 52 261 261 HOH WAT . I 4 HOH A 53 262 262 HOH WAT . I 4 HOH A 54 263 263 HOH WAT . I 4 HOH A 55 264 264 HOH WAT . I 4 HOH A 56 265 265 HOH WAT . I 4 HOH A 57 266 266 HOH WAT . I 4 HOH A 58 267 267 HOH WAT . I 4 HOH A 59 268 268 HOH WAT . I 4 HOH A 60 269 269 HOH WAT . I 4 HOH A 61 270 270 HOH WAT . I 4 HOH A 62 271 271 HOH WAT . I 4 HOH A 63 272 272 HOH WAT . I 4 HOH A 64 273 273 HOH WAT . I 4 HOH A 65 274 274 HOH WAT . I 4 HOH A 66 275 275 HOH WAT . I 4 HOH A 67 276 276 HOH WAT . I 4 HOH A 68 277 277 HOH WAT . I 4 HOH A 69 278 278 HOH WAT . I 4 HOH A 70 279 279 HOH WAT . I 4 HOH A 71 280 280 HOH WAT . I 4 HOH A 72 281 281 HOH WAT . I 4 HOH A 73 282 282 HOH WAT . I 4 HOH A 74 283 283 HOH WAT . I 4 HOH A 75 284 284 HOH WAT . I 4 HOH A 76 285 285 HOH WAT . I 4 HOH A 77 286 286 HOH WAT . I 4 HOH A 78 287 287 HOH WAT . I 4 HOH A 79 288 288 HOH WAT . I 4 HOH A 80 289 289 HOH WAT . I 4 HOH A 81 290 290 HOH WAT . I 4 HOH A 82 291 291 HOH WAT . I 4 HOH A 83 292 292 HOH WAT . I 4 HOH A 84 293 293 HOH WAT . I 4 HOH A 85 294 294 HOH WAT . I 4 HOH A 86 295 295 HOH WAT . I 4 HOH A 87 296 296 HOH WAT . I 4 HOH A 88 297 297 HOH WAT . I 4 HOH A 89 298 298 HOH WAT . I 4 HOH A 90 299 299 HOH WAT . I 4 HOH A 91 300 300 HOH WAT . I 4 HOH A 92 301 301 HOH WAT . I 4 HOH A 93 302 302 HOH WAT . I 4 HOH A 94 303 303 HOH WAT . I 4 HOH A 95 304 304 HOH WAT . I 4 HOH A 96 305 305 HOH WAT . I 4 HOH A 97 306 306 HOH WAT . I 4 HOH A 98 307 307 HOH WAT . I 4 HOH A 99 308 308 HOH WAT . I 4 HOH A 100 309 309 HOH WAT . I 4 HOH A 101 310 310 HOH WAT . I 4 HOH A 102 311 311 HOH WAT . I 4 HOH A 103 312 312 HOH WAT . I 4 HOH A 104 313 313 HOH WAT . I 4 HOH A 105 314 314 HOH WAT . I 4 HOH A 106 316 316 HOH WAT . I 4 HOH A 107 317 317 HOH WAT . I 4 HOH A 108 318 318 HOH WAT . I 4 HOH A 109 319 319 HOH WAT . I 4 HOH A 110 320 320 HOH WAT . I 4 HOH A 111 321 321 HOH WAT . I 4 HOH A 112 322 322 HOH WAT . I 4 HOH A 113 323 323 HOH WAT . I 4 HOH A 114 324 324 HOH WAT . I 4 HOH A 115 325 325 HOH WAT . I 4 HOH A 116 326 326 HOH WAT . I 4 HOH A 117 327 327 HOH WAT . I 4 HOH A 118 328 328 HOH WAT . I 4 HOH A 119 329 329 HOH WAT . I 4 HOH A 120 330 330 HOH WAT . I 4 HOH A 121 331 331 HOH WAT . I 4 HOH A 122 332 332 HOH WAT . I 4 HOH A 123 333 333 HOH WAT . I 4 HOH A 124 334 334 HOH WAT . I 4 HOH A 125 335 335 HOH WAT . I 4 HOH A 126 336 336 HOH WAT . I 4 HOH A 127 337 337 HOH WAT . I 4 HOH A 128 338 338 HOH WAT . I 4 HOH A 129 339 339 HOH WAT . I 4 HOH A 130 340 340 HOH WAT . I 4 HOH A 131 341 341 HOH WAT . I 4 HOH A 132 342 342 HOH WAT . I 4 HOH A 133 343 343 HOH WAT . I 4 HOH A 134 344 344 HOH WAT . I 4 HOH A 135 345 345 HOH WAT . I 4 HOH A 136 346 346 HOH WAT . I 4 HOH A 137 347 347 HOH WAT . I 4 HOH A 138 348 348 HOH WAT . I 4 HOH A 139 349 349 HOH WAT . I 4 HOH A 140 350 350 HOH WAT . I 4 HOH A 141 351 351 HOH WAT . I 4 HOH A 142 352 352 HOH WAT . I 4 HOH A 143 353 353 HOH WAT . I 4 HOH A 144 354 354 HOH WAT . I 4 HOH A 145 355 355 HOH WAT . I 4 HOH A 146 356 356 HOH WAT . I 4 HOH A 147 357 357 HOH WAT . I 4 HOH A 148 358 358 HOH WAT . I 4 HOH A 149 359 359 HOH WAT . I 4 HOH A 150 360 360 HOH WAT . I 4 HOH A 151 361 361 HOH WAT . I 4 HOH A 152 362 362 HOH WAT . I 4 HOH A 153 364 364 HOH WAT . I 4 HOH A 154 365 365 HOH WAT . I 4 HOH A 155 366 366 HOH WAT . I 4 HOH A 156 367 367 HOH WAT . I 4 HOH A 157 368 368 HOH WAT . I 4 HOH A 158 369 369 HOH WAT . I 4 HOH A 159 370 370 HOH WAT . I 4 HOH A 160 371 371 HOH WAT . I 4 HOH A 161 372 372 HOH WAT . I 4 HOH A 162 373 373 HOH WAT . I 4 HOH A 163 374 374 HOH WAT . I 4 HOH A 164 375 375 HOH WAT . I 4 HOH A 165 376 376 HOH WAT . I 4 HOH A 166 402 402 HOH WAT . I 4 HOH A 167 403 403 HOH WAT . I 4 HOH A 168 404 404 HOH WAT . I 4 HOH A 169 405 405 HOH WAT . I 4 HOH A 170 406 406 HOH WAT . I 4 HOH A 171 407 407 HOH WAT . I 4 HOH A 172 408 408 HOH WAT . I 4 HOH A 173 413 413 HOH WAT . I 4 HOH A 174 414 414 HOH WAT . I 4 HOH A 175 417 417 HOH WAT . I 4 HOH A 176 515 515 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C CAA OC9 . . . H 3 46.282 28.033 41.552 1 27.66 ? CAA OC9 401 A 1 HETATM 2 C CAC OC9 . . . H 3 47.34 26.932 41.653 1 27.5 ? CAC OC9 401 A 1 HETATM 3 C CAE OC9 . . . H 3 47.034 25.79 40.681 1 26.21 ? CAE OC9 401 A 1 HETATM 4 C CAG OC9 . . . H 3 47.813 24.524 41.045 1 24.42 ? CAG OC9 401 A 1 HETATM 5 C CAI OC9 . . . H 3 49.293 24.587 40.664 1 23.88 ? CAI OC9 401 A 1 HETATM 6 C CAH OC9 . . . H 3 50.045 23.408 41.282 1 23.35 ? CAH OC9 401 A 1 HETATM 7 C CAF OC9 . . . H 3 51.436 23.241 40.663 1 25.93 ? CAF OC9 401 A 1 HETATM 8 C CAD OC9 . . . H 3 52.373 22.445 41.575 1 30.77 ? CAD OC9 401 A 1 HETATM 9 O OAB OC9 . . . H 3 51.774 21.217 41.99 1 29.46 ? OAB OC9 401 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 5 _model_server_stats.parse_time_ms 5 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 9 #