data_1ZNL # _model_server_result.job_id LOyBmIuUnhjjVOkUFycj7A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 13:53:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1znl # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":203}' # _entry.id 1ZNL # _exptl.entry_id 1ZNL _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 112.411 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CADMIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ZNL _cell.length_a 53.718 _cell.length_b 53.718 _cell.length_c 137.51 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ZNL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 76 A CYS 64 1_555 A SG CYS 169 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 25 A GLU 13 1_555 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 30 A GLU 18 5_645 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 116 A HIS 104 1_555 D CD CD . A CD 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 122 A ASP 110 8_675 C CD CD . A CD 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 151 A GLU 139 1_555 B CD CD . A CD 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc9 A NE2 HIS 153 A HIS 141 1_555 E CD CD . A CD 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc10 B CD CD . A CD 200 1_555 G O HOH . A HOH 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc11 B CD CD . A CD 200 1_555 G O HOH . A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc12 B CD CD . A CD 200 1_555 G O HOH . A HOH 437 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc13 C CD CD . A CD 201 1_555 G O HOH . A HOH 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc14 C CD CD . A CD 201 1_555 G O HOH . A HOH 372 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc15 C CD CD . A CD 201 1_555 G O HOH . A HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.899 ? metalc ? metalc16 C CD CD . A CD 201 1_555 G O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc17 D CD CD . A CD 202 1_555 G O HOH . A HOH 212 8_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc18 D CD CD . A CD 202 1_555 G O HOH . A HOH 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc19 D CD CD . A CD 202 1_555 G O HOH . A HOH 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc20 D CD CD . A CD 202 1_555 G O HOH . A HOH 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? metalc ? metalc21 E CD CD . A CD 203 1_555 G O HOH . A HOH 212 8_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc22 E CD CD . A CD 203 1_555 G O HOH . A HOH 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? metalc ? metalc23 E CD CD . A CD 203 1_555 G O HOH . A HOH 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc24 E CD CD . A CD 203 1_555 G O HOH . A HOH 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? # _chem_comp.formula 'Cd 2' _chem_comp.formula_weight 112.411 _chem_comp.id CD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CADMIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1ZNL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018616 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.018616 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007272 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CD A 1 200 200 CD CD . C 2 CD A 1 201 201 CD CD . D 2 CD A 1 202 202 CD CD . E 2 CD A 1 203 203 CD CD . F 3 DE1 A 1 400 400 DE1 DRG . G 4 HOH A 1 204 204 HOH WAT . G 4 HOH A 2 205 205 HOH WAT . G 4 HOH A 3 206 206 HOH WAT . G 4 HOH A 4 207 207 HOH WAT . G 4 HOH A 5 208 208 HOH WAT . G 4 HOH A 6 209 209 HOH WAT . G 4 HOH A 7 210 210 HOH WAT . G 4 HOH A 8 211 211 HOH WAT . G 4 HOH A 9 212 212 HOH WAT . G 4 HOH A 10 213 213 HOH WAT . G 4 HOH A 11 214 214 HOH WAT . G 4 HOH A 12 215 215 HOH WAT . G 4 HOH A 13 216 216 HOH WAT . G 4 HOH A 14 217 217 HOH WAT . G 4 HOH A 15 218 218 HOH WAT . G 4 HOH A 16 219 219 HOH WAT . G 4 HOH A 17 220 220 HOH WAT . G 4 HOH A 18 221 221 HOH WAT . G 4 HOH A 19 222 222 HOH WAT . G 4 HOH A 20 223 223 HOH WAT . G 4 HOH A 21 224 224 HOH WAT . G 4 HOH A 22 225 225 HOH WAT . G 4 HOH A 23 226 226 HOH WAT . G 4 HOH A 24 229 229 HOH WAT . G 4 HOH A 25 230 230 HOH WAT . G 4 HOH A 26 231 231 HOH WAT . G 4 HOH A 27 232 232 HOH WAT . G 4 HOH A 28 233 233 HOH WAT . G 4 HOH A 29 234 234 HOH WAT . G 4 HOH A 30 235 235 HOH WAT . G 4 HOH A 31 236 236 HOH WAT . G 4 HOH A 32 237 237 HOH WAT . G 4 HOH A 33 238 238 HOH WAT . G 4 HOH A 34 239 239 HOH WAT . G 4 HOH A 35 240 240 HOH WAT . G 4 HOH A 36 241 241 HOH WAT . G 4 HOH A 37 242 242 HOH WAT . G 4 HOH A 38 243 243 HOH WAT . G 4 HOH A 39 244 244 HOH WAT . G 4 HOH A 40 245 245 HOH WAT . G 4 HOH A 41 246 246 HOH WAT . G 4 HOH A 42 247 247 HOH WAT . G 4 HOH A 43 248 248 HOH WAT . G 4 HOH A 44 249 249 HOH WAT . G 4 HOH A 45 250 250 HOH WAT . G 4 HOH A 46 251 251 HOH WAT . G 4 HOH A 47 252 252 HOH WAT . G 4 HOH A 48 253 253 HOH WAT . G 4 HOH A 49 254 254 HOH WAT . G 4 HOH A 50 255 255 HOH WAT . G 4 HOH A 51 256 256 HOH WAT . G 4 HOH A 52 257 257 HOH WAT . G 4 HOH A 53 258 258 HOH WAT . G 4 HOH A 54 259 259 HOH WAT . G 4 HOH A 55 260 260 HOH WAT . G 4 HOH A 56 261 261 HOH WAT . G 4 HOH A 57 262 262 HOH WAT . G 4 HOH A 58 263 263 HOH WAT . G 4 HOH A 59 264 264 HOH WAT . G 4 HOH A 60 265 265 HOH WAT . G 4 HOH A 61 266 266 HOH WAT . G 4 HOH A 62 267 267 HOH WAT . G 4 HOH A 63 268 268 HOH WAT . G 4 HOH A 64 269 269 HOH WAT . G 4 HOH A 65 270 270 HOH WAT . G 4 HOH A 66 271 271 HOH WAT . G 4 HOH A 67 272 272 HOH WAT . G 4 HOH A 68 273 273 HOH WAT . G 4 HOH A 69 274 274 HOH WAT . G 4 HOH A 70 275 275 HOH WAT . G 4 HOH A 71 276 276 HOH WAT . G 4 HOH A 72 277 277 HOH WAT . G 4 HOH A 73 278 278 HOH WAT . G 4 HOH A 74 279 279 HOH WAT . G 4 HOH A 75 280 280 HOH WAT . G 4 HOH A 76 281 281 HOH WAT . G 4 HOH A 77 282 282 HOH WAT . G 4 HOH A 78 283 283 HOH WAT . G 4 HOH A 79 284 284 HOH WAT . G 4 HOH A 80 285 285 HOH WAT . G 4 HOH A 81 286 286 HOH WAT . G 4 HOH A 82 287 287 HOH WAT . G 4 HOH A 83 289 289 HOH WAT . G 4 HOH A 84 290 290 HOH WAT . G 4 HOH A 85 291 291 HOH WAT . G 4 HOH A 86 292 292 HOH WAT . G 4 HOH A 87 293 293 HOH WAT . G 4 HOH A 88 294 294 HOH WAT . G 4 HOH A 89 295 295 HOH WAT . G 4 HOH A 90 296 296 HOH WAT . G 4 HOH A 91 297 297 HOH WAT . G 4 HOH A 92 298 298 HOH WAT . G 4 HOH A 93 299 299 HOH WAT . G 4 HOH A 94 300 300 HOH WAT . G 4 HOH A 95 301 301 HOH WAT . G 4 HOH A 96 302 302 HOH WAT . G 4 HOH A 97 303 303 HOH WAT . G 4 HOH A 98 304 304 HOH WAT . G 4 HOH A 99 305 305 HOH WAT . G 4 HOH A 100 306 306 HOH WAT . G 4 HOH A 101 307 307 HOH WAT . G 4 HOH A 102 308 308 HOH WAT . G 4 HOH A 103 309 309 HOH WAT . G 4 HOH A 104 310 310 HOH WAT . G 4 HOH A 105 311 311 HOH WAT . G 4 HOH A 106 312 312 HOH WAT . G 4 HOH A 107 313 313 HOH WAT . G 4 HOH A 108 314 314 HOH WAT . G 4 HOH A 109 315 315 HOH WAT . G 4 HOH A 110 316 316 HOH WAT . G 4 HOH A 111 317 317 HOH WAT . G 4 HOH A 112 318 318 HOH WAT . G 4 HOH A 113 319 319 HOH WAT . G 4 HOH A 114 320 320 HOH WAT . G 4 HOH A 115 321 321 HOH WAT . G 4 HOH A 116 322 322 HOH WAT . G 4 HOH A 117 323 323 HOH WAT . G 4 HOH A 118 324 324 HOH WAT . G 4 HOH A 119 325 325 HOH WAT . G 4 HOH A 120 326 326 HOH WAT . G 4 HOH A 121 327 327 HOH WAT . G 4 HOH A 122 328 328 HOH WAT . G 4 HOH A 123 329 329 HOH WAT . G 4 HOH A 124 330 330 HOH WAT . G 4 HOH A 125 331 331 HOH WAT . G 4 HOH A 126 332 332 HOH WAT . G 4 HOH A 127 333 333 HOH WAT . G 4 HOH A 128 334 334 HOH WAT . G 4 HOH A 129 335 335 HOH WAT . G 4 HOH A 130 336 336 HOH WAT . G 4 HOH A 131 337 337 HOH WAT . G 4 HOH A 132 338 338 HOH WAT . G 4 HOH A 133 339 339 HOH WAT . G 4 HOH A 134 340 340 HOH WAT . G 4 HOH A 135 341 341 HOH WAT . G 4 HOH A 136 342 342 HOH WAT . G 4 HOH A 137 343 343 HOH WAT . G 4 HOH A 138 344 344 HOH WAT . G 4 HOH A 139 345 345 HOH WAT . G 4 HOH A 140 346 346 HOH WAT . G 4 HOH A 141 347 347 HOH WAT . G 4 HOH A 142 348 348 HOH WAT . G 4 HOH A 143 349 349 HOH WAT . G 4 HOH A 144 350 350 HOH WAT . G 4 HOH A 145 351 351 HOH WAT . G 4 HOH A 146 352 352 HOH WAT . G 4 HOH A 147 353 353 HOH WAT . G 4 HOH A 148 354 354 HOH WAT . G 4 HOH A 149 355 355 HOH WAT . G 4 HOH A 150 356 356 HOH WAT . G 4 HOH A 151 357 357 HOH WAT . G 4 HOH A 152 358 358 HOH WAT . G 4 HOH A 153 359 359 HOH WAT . G 4 HOH A 154 360 360 HOH WAT . G 4 HOH A 155 361 361 HOH WAT . G 4 HOH A 156 362 362 HOH WAT . G 4 HOH A 157 363 363 HOH WAT . G 4 HOH A 158 364 364 HOH WAT . G 4 HOH A 159 365 365 HOH WAT . G 4 HOH A 160 366 366 HOH WAT . G 4 HOH A 161 367 367 HOH WAT . G 4 HOH A 162 368 368 HOH WAT . G 4 HOH A 163 369 369 HOH WAT . G 4 HOH A 164 370 370 HOH WAT . G 4 HOH A 165 371 371 HOH WAT . G 4 HOH A 166 372 372 HOH WAT . G 4 HOH A 167 373 373 HOH WAT . G 4 HOH A 168 374 374 HOH WAT . G 4 HOH A 169 375 375 HOH WAT . G 4 HOH A 170 376 376 HOH WAT . G 4 HOH A 171 377 377 HOH WAT . G 4 HOH A 172 378 378 HOH WAT . G 4 HOH A 173 379 379 HOH WAT . G 4 HOH A 174 380 380 HOH WAT . G 4 HOH A 175 381 381 HOH WAT . G 4 HOH A 176 382 382 HOH WAT . G 4 HOH A 177 383 383 HOH WAT . G 4 HOH A 178 384 384 HOH WAT . G 4 HOH A 179 385 385 HOH WAT . G 4 HOH A 180 386 386 HOH WAT . G 4 HOH A 181 387 387 HOH WAT . G 4 HOH A 182 388 388 HOH WAT . G 4 HOH A 183 389 389 HOH WAT . G 4 HOH A 184 390 390 HOH WAT . G 4 HOH A 185 401 401 HOH WAT . G 4 HOH A 186 402 402 HOH WAT . G 4 HOH A 187 405 405 HOH WAT . G 4 HOH A 188 406 406 HOH WAT . G 4 HOH A 189 407 407 HOH WAT . G 4 HOH A 190 408 408 HOH WAT . G 4 HOH A 191 409 409 HOH WAT . G 4 HOH A 192 410 410 HOH WAT . G 4 HOH A 193 411 411 HOH WAT . G 4 HOH A 194 412 412 HOH WAT . G 4 HOH A 195 413 413 HOH WAT . G 4 HOH A 196 414 414 HOH WAT . G 4 HOH A 197 415 415 HOH WAT . G 4 HOH A 198 416 416 HOH WAT . G 4 HOH A 199 417 417 HOH WAT . G 4 HOH A 200 418 418 HOH WAT . G 4 HOH A 201 419 419 HOH WAT . G 4 HOH A 202 420 420 HOH WAT . G 4 HOH A 203 421 421 HOH WAT . G 4 HOH A 204 422 422 HOH WAT . G 4 HOH A 205 423 423 HOH WAT . G 4 HOH A 206 424 424 HOH WAT . G 4 HOH A 207 425 425 HOH WAT . G 4 HOH A 208 426 426 HOH WAT . G 4 HOH A 209 427 427 HOH WAT . G 4 HOH A 210 428 428 HOH WAT . G 4 HOH A 211 429 429 HOH WAT . G 4 HOH A 212 430 430 HOH WAT . G 4 HOH A 213 431 431 HOH WAT . G 4 HOH A 214 432 432 HOH WAT . G 4 HOH A 215 433 433 HOH WAT . G 4 HOH A 216 434 434 HOH WAT . G 4 HOH A 217 435 435 HOH WAT . G 4 HOH A 218 436 436 HOH WAT . G 4 HOH A 219 437 437 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CD _atom_site.label_atom_id CD _atom_site.label_comp_id CD _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 37.324 _atom_site.Cartn_y 18.257 _atom_site.Cartn_z 35.366 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 42.78 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CD _atom_site.auth_comp_id CD _atom_site.auth_seq_id 203 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 338 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #