data_1ZOD
#
_model_server_result.job_id            fwKBCS9VoUdtWkEf11WjSQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 08:25:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1zod 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":434}' 
#
_entry.id    1ZOD 
#
_exptl.entry_id    1ZOD 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              132.905 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            1ZOD 
_cell.length_a            150.524 
_cell.length_b            150.524 
_cell.length_c            84.859 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1ZOD 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        181 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 64 2 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
PISA,PQS tetrameric 4 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F 1 1 
A,B,C,D,E,F 2 1,2,3,4 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 4_665 -x+1,-y+1,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 75.262 130.357608 0 
3 'crystal symmetry operation' 7_555 y,x,-z+1/3 -0.5 0.866025 0 0.866025 0.5 0 0 0 -1 0 0 28.286333 
4 'crystal symmetry operation' 10_665 -y+1,-x+1,-z+1/3 0.5 -0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 -1 75.262 130.357608 28.286333 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A NZ LYS 272 A LYS 272 1_555 E C4A PLP . A PLP 437 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.258 ? 
metalc ? metalc1 A O LEU 78 A LEU 78 1_555 B CS CS . A CS 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? 
metalc ? metalc2 A N SER 80 A SER 80 1_555 B CS CS . A CS 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.888 ? 
metalc ? metalc3 A OG SER 80 A SER 80 1_555 B CS CS . A CS 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? 
metalc ? metalc4 A O ALA 95 A ALA 95 1_555 C NA NA . A NA 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc5 A OG1 THR 98 A THR 98 1_555 C NA NA . A NA 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? 
metalc ? metalc6 A O THR 98 A THR 98 1_555 C NA NA . A NA 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc7 A O PRO 99 A PRO 99 1_555 C NA NA . A NA 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? 
metalc ? metalc8 A O LEU 102 A LEU 102 1_555 C NA NA . A NA 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc9 A O THR 303 A THR 303 1_555 B CS CS . A CS 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? 
metalc ? metalc10 A O VAL 305 A VAL 305 1_555 B CS CS . A CS 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 307 A ASP 307 1_555 B CS CS . A CS 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? 
metalc ? metalc12 B CS CS . A CS 434 1_555 F O HOH . A HOH 479 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? 
metalc ? metalc13 C NA NA . A NA 435 1_555 F O HOH . A HOH 469 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cs 1' 
_chem_comp.formula_weight    132.905 
_chem_comp.id                CS 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1ZOD 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006643 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.003836 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007671 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.011784 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 CS A 1 434 434 CS CS . 
C 3 NA A 1 435 435 NA NA . 
D 4 MES A 1 436 436 MES MES . 
E 5 PLP A 1 437 437 PLP PLP . 
F 6 HOH A 1 438 438 HOH WAT . 
F 6 HOH A 2 439 439 HOH WAT . 
F 6 HOH A 3 440 440 HOH WAT . 
F 6 HOH A 4 441 441 HOH WAT . 
F 6 HOH A 5 442 442 HOH WAT . 
F 6 HOH A 6 443 443 HOH WAT . 
F 6 HOH A 7 444 444 HOH WAT . 
F 6 HOH A 8 445 445 HOH WAT . 
F 6 HOH A 9 446 446 HOH WAT . 
F 6 HOH A 10 447 447 HOH WAT . 
F 6 HOH A 11 448 448 HOH WAT . 
F 6 HOH A 12 449 449 HOH WAT . 
F 6 HOH A 13 450 450 HOH WAT . 
F 6 HOH A 14 451 451 HOH WAT . 
F 6 HOH A 15 452 452 HOH WAT . 
F 6 HOH A 16 453 453 HOH WAT . 
F 6 HOH A 17 454 454 HOH WAT . 
F 6 HOH A 18 455 455 HOH WAT . 
F 6 HOH A 19 456 456 HOH WAT . 
F 6 HOH A 20 457 457 HOH WAT . 
F 6 HOH A 21 458 458 HOH WAT . 
F 6 HOH A 22 459 459 HOH WAT . 
F 6 HOH A 23 460 460 HOH WAT . 
F 6 HOH A 24 461 461 HOH WAT . 
F 6 HOH A 25 462 462 HOH WAT . 
F 6 HOH A 26 463 463 HOH WAT . 
F 6 HOH A 27 464 464 HOH WAT . 
F 6 HOH A 28 465 465 HOH WAT . 
F 6 HOH A 29 466 466 HOH WAT . 
F 6 HOH A 30 467 467 HOH WAT . 
F 6 HOH A 31 468 468 HOH WAT . 
F 6 HOH A 32 469 469 HOH WAT . 
F 6 HOH A 33 470 470 HOH WAT . 
F 6 HOH A 34 471 471 HOH WAT . 
F 6 HOH A 35 472 472 HOH WAT . 
F 6 HOH A 36 473 473 HOH WAT . 
F 6 HOH A 37 474 474 HOH WAT . 
F 6 HOH A 38 475 475 HOH WAT . 
F 6 HOH A 39 476 476 HOH WAT . 
F 6 HOH A 40 477 477 HOH WAT . 
F 6 HOH A 41 478 478 HOH WAT . 
F 6 HOH A 42 479 479 HOH WAT . 
F 6 HOH A 43 480 480 HOH WAT . 
F 6 HOH A 44 481 481 HOH WAT . 
F 6 HOH A 45 482 482 HOH WAT . 
F 6 HOH A 46 483 483 HOH WAT . 
F 6 HOH A 47 484 484 HOH WAT . 
F 6 HOH A 48 485 485 HOH WAT . 
F 6 HOH A 49 486 486 HOH WAT . 
F 6 HOH A 50 487 487 HOH WAT . 
F 6 HOH A 51 488 488 HOH WAT . 
F 6 HOH A 52 489 489 HOH WAT . 
F 6 HOH A 53 490 490 HOH WAT . 
F 6 HOH A 54 491 491 HOH WAT . 
F 6 HOH A 55 492 492 HOH WAT . 
F 6 HOH A 56 493 493 HOH WAT . 
F 6 HOH A 57 494 494 HOH WAT . 
F 6 HOH A 58 495 495 HOH WAT . 
F 6 HOH A 59 496 496 HOH WAT . 
F 6 HOH A 60 497 497 HOH WAT . 
F 6 HOH A 61 498 498 HOH WAT . 
F 6 HOH A 62 499 499 HOH WAT . 
F 6 HOH A 63 500 500 HOH WAT . 
F 6 HOH A 64 501 501 HOH WAT . 
F 6 HOH A 65 502 502 HOH WAT . 
F 6 HOH A 66 503 503 HOH WAT . 
F 6 HOH A 67 504 504 HOH WAT . 
F 6 HOH A 68 505 505 HOH WAT . 
F 6 HOH A 69 506 506 HOH WAT . 
F 6 HOH A 70 507 507 HOH WAT . 
F 6 HOH A 71 508 508 HOH WAT . 
F 6 HOH A 72 509 509 HOH WAT . 
F 6 HOH A 73 510 510 HOH WAT . 
F 6 HOH A 74 511 511 HOH WAT . 
F 6 HOH A 75 512 512 HOH WAT . 
F 6 HOH A 76 513 513 HOH WAT . 
F 6 HOH A 77 514 514 HOH WAT . 
F 6 HOH A 78 515 515 HOH WAT . 
F 6 HOH A 79 516 516 HOH WAT . 
F 6 HOH A 80 517 517 HOH WAT . 
F 6 HOH A 81 518 518 HOH WAT . 
F 6 HOH A 82 519 519 HOH WAT . 
F 6 HOH A 83 520 520 HOH WAT . 
F 6 HOH A 84 521 521 HOH WAT . 
F 6 HOH A 85 522 522 HOH WAT . 
F 6 HOH A 86 523 523 HOH WAT . 
F 6 HOH A 87 524 524 HOH WAT . 
F 6 HOH A 88 525 525 HOH WAT . 
F 6 HOH A 89 526 526 HOH WAT . 
F 6 HOH A 90 527 527 HOH WAT . 
F 6 HOH A 91 528 528 HOH WAT . 
F 6 HOH A 92 529 529 HOH WAT . 
F 6 HOH A 93 530 530 HOH WAT . 
F 6 HOH A 94 531 531 HOH WAT . 
F 6 HOH A 95 532 532 HOH WAT . 
F 6 HOH A 96 533 533 HOH WAT . 
F 6 HOH A 97 534 534 HOH WAT . 
F 6 HOH A 98 535 535 HOH WAT . 
F 6 HOH A 99 536 536 HOH WAT . 
F 6 HOH A 100 537 537 HOH WAT . 
F 6 HOH A 101 538 538 HOH WAT . 
F 6 HOH A 102 539 539 HOH WAT . 
F 6 HOH A 103 540 540 HOH WAT . 
F 6 HOH A 104 541 541 HOH WAT . 
F 6 HOH A 105 542 542 HOH WAT . 
F 6 HOH A 106 543 543 HOH WAT . 
F 6 HOH A 107 544 544 HOH WAT . 
F 6 HOH A 108 545 545 HOH WAT . 
F 6 HOH A 109 546 546 HOH WAT . 
F 6 HOH A 110 547 547 HOH WAT . 
F 6 HOH A 111 548 548 HOH WAT . 
F 6 HOH A 112 549 549 HOH WAT . 
F 6 HOH A 113 550 550 HOH WAT . 
F 6 HOH A 114 551 551 HOH WAT . 
F 6 HOH A 115 552 552 HOH WAT . 
F 6 HOH A 116 553 553 HOH WAT . 
F 6 HOH A 117 554 554 HOH WAT . 
F 6 HOH A 118 555 555 HOH WAT . 
F 6 HOH A 119 556 556 HOH WAT . 
F 6 HOH A 120 557 557 HOH WAT . 
F 6 HOH A 121 558 558 HOH WAT . 
F 6 HOH A 122 559 559 HOH WAT . 
F 6 HOH A 123 560 560 HOH WAT . 
F 6 HOH A 124 561 561 HOH WAT . 
F 6 HOH A 125 562 562 HOH WAT . 
F 6 HOH A 126 563 563 HOH WAT . 
F 6 HOH A 127 564 564 HOH WAT . 
F 6 HOH A 128 565 565 HOH WAT . 
F 6 HOH A 129 566 566 HOH WAT . 
F 6 HOH A 130 567 567 HOH WAT . 
F 6 HOH A 131 568 568 HOH WAT . 
F 6 HOH A 132 569 569 HOH WAT . 
F 6 HOH A 133 570 570 HOH WAT . 
F 6 HOH A 134 571 571 HOH WAT . 
F 6 HOH A 135 572 572 HOH WAT . 
F 6 HOH A 136 573 573 HOH WAT . 
F 6 HOH A 137 574 574 HOH WAT . 
F 6 HOH A 138 575 575 HOH WAT . 
F 6 HOH A 139 576 576 HOH WAT . 
F 6 HOH A 140 577 577 HOH WAT . 
F 6 HOH A 141 578 578 HOH WAT . 
F 6 HOH A 142 579 579 HOH WAT . 
F 6 HOH A 143 580 580 HOH WAT . 
F 6 HOH A 144 581 581 HOH WAT . 
F 6 HOH A 145 582 582 HOH WAT . 
F 6 HOH A 146 583 583 HOH WAT . 
F 6 HOH A 147 584 584 HOH WAT . 
F 6 HOH A 148 585 585 HOH WAT . 
F 6 HOH A 149 586 586 HOH WAT . 
F 6 HOH A 150 587 587 HOH WAT . 
F 6 HOH A 151 588 588 HOH WAT . 
F 6 HOH A 152 589 589 HOH WAT . 
F 6 HOH A 153 590 590 HOH WAT . 
F 6 HOH A 154 591 591 HOH WAT . 
F 6 HOH A 155 592 592 HOH WAT . 
F 6 HOH A 156 593 593 HOH WAT . 
F 6 HOH A 157 594 594 HOH WAT . 
F 6 HOH A 158 595 595 HOH WAT . 
F 6 HOH A 159 596 596 HOH WAT . 
F 6 HOH A 160 597 597 HOH WAT . 
F 6 HOH A 161 598 598 HOH WAT . 
F 6 HOH A 162 599 599 HOH WAT . 
F 6 HOH A 163 600 600 HOH WAT . 
F 6 HOH A 164 601 601 HOH WAT . 
F 6 HOH A 165 602 602 HOH WAT . 
F 6 HOH A 166 603 603 HOH WAT . 
F 6 HOH A 167 604 604 HOH WAT . 
F 6 HOH A 168 605 605 HOH WAT . 
F 6 HOH A 169 606 606 HOH WAT . 
F 6 HOH A 170 607 607 HOH WAT . 
F 6 HOH A 171 608 608 HOH WAT . 
F 6 HOH A 172 609 609 HOH WAT . 
F 6 HOH A 173 610 610 HOH WAT . 
F 6 HOH A 174 611 611 HOH WAT . 
F 6 HOH A 175 612 612 HOH WAT . 
F 6 HOH A 176 613 613 HOH WAT . 
F 6 HOH A 177 614 614 HOH WAT . 
F 6 HOH A 178 615 615 HOH WAT . 
F 6 HOH A 179 616 616 HOH WAT . 
F 6 HOH A 180 617 617 HOH WAT . 
F 6 HOH A 181 618 618 HOH WAT . 
F 6 HOH A 182 619 619 HOH WAT . 
F 6 HOH A 183 620 620 HOH WAT . 
F 6 HOH A 184 621 621 HOH WAT . 
F 6 HOH A 185 622 622 HOH WAT . 
F 6 HOH A 186 623 623 HOH WAT . 
F 6 HOH A 187 624 624 HOH WAT . 
F 6 HOH A 188 625 625 HOH WAT . 
F 6 HOH A 189 626 626 HOH WAT . 
F 6 HOH A 190 627 627 HOH WAT . 
F 6 HOH A 191 628 628 HOH WAT . 
F 6 HOH A 192 629 629 HOH WAT . 
F 6 HOH A 193 630 630 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CS 
_atom_site.label_atom_id         CS 
_atom_site.label_comp_id         CS 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         B 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               28.433 
_atom_site.Cartn_y               35.031 
_atom_site.Cartn_z               5.273 
_atom_site.occupancy             0.68 
_atom_site.B_iso_or_equiv        33.56 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CS 
_atom_site.auth_comp_id          CS 
_atom_site.auth_seq_id           434 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    11 
_model_server_stats.query_time_ms           316 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           1 
#