data_2A62 # _model_server_result.job_id ZCradoedvCdwEvEW8j8WxQ _model_server_result.datetime_utc '2025-04-09 10:06:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2a62 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":324}' # _entry.id 2A62 # _exptl.entry_id 2A62 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2A62 _cell.length_a 75.818 _cell.length_b 75.818 _cell.length_c 233.76 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2A62 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 91 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 8_337 -y-2,-x-2,-z+9/4 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 -151.636 -151.636 525.96 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE2 GLU 11 A GLU 11 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 11 A GLU 11 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 11 A GLU 11 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 12 A GLU 12 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 64 A ASP 64 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 66 A GLU 66 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 66 A GLU 66 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 66 A GLU 66 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 98 A ASP 98 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc10 A O ILE 99 A ILE 99 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASN 100 A ASN 100 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 101 A ASP 101 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASP 101 A ASP 101 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.272 ? metalc ? metalc14 A OD2 ASP 101 A ASP 101 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? metalc ? metalc15 A O ASN 102 A ASN 102 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc16 A ND2 ASN 102 A ASN 102 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 117 A GLU 117 1_555 F CA CA . A CA 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? metalc ? metalc18 A OE1 GLU 117 A GLU 117 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc19 A OE2 GLU 117 A GLU 117 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.366 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 132 A ASP 132 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc21 A OD2 ASP 132 A ASP 132 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? metalc ? metalc22 A OD2 ASP 134 A ASP 134 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.049 ? metalc ? metalc23 A OD2 ASP 134 A ASP 134 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.318 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 134 A ASP 134 1_555 C CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.282 ? metalc ? metalc25 A O SER 141 A SER 141 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.061 ? metalc ? metalc26 A NH2 ARG 173 A ARG 173 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc27 A OE2 GLU 174 A GLU 174 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? metalc ? metalc28 A OE1 GLU 174 A GLU 174 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.221 ? metalc ? metalc29 A OD2 ASP 187 A ASP 187 1_555 B CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.898 ? metalc ? metalc30 A O ASP 207 A ASP 207 1_555 F CA CA . A CA 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? metalc ? metalc31 A OD2 ASP 207 A ASP 207 1_555 F CA CA . A CA 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? metalc ? metalc32 A O ASP 207 A ASP 207 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.257 ? metalc ? metalc33 A OD2 ASP 207 A ASP 207 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc34 A O VAL 208 A VAL 208 1_555 F CA CA . A CA 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc35 A OD1 ASN 209 A ASN 209 1_555 E CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.881 ? metalc ? metalc36 A OD1 ASP 210 A ASP 210 1_555 F CA CA . A CA 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc37 A OD1 ASP 210 A ASP 210 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? metalc ? metalc38 A O ASN 211 A ASN 211 1_555 E CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? metalc ? metalc39 A OD2 ASP 241 A ASP 241 1_555 E CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.846 ? metalc ? metalc40 A OD1 ASP 241 A ASP 241 1_555 E CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc41 A OD2 ASP 243 A ASP 243 1_555 F CA CA . A CA 327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc42 A OD1 ASP 243 A ASP 243 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.972 ? metalc ? metalc43 A O ASN 247 A ASN 247 1_555 E CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? metalc ? metalc44 A OD1 ASN 298 A ASN 298 1_555 E CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc45 C CA CA . A CA 324 1_555 D CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.357 ? metalc ? metalc46 F CA CA . A CA 327 1_555 G CA CA . A CA 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.802 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2A62 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013189 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013189 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004278 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 323 323 CA CA . C 2 CA A 1 324 324 CA CA . D 2 CA A 1 325 325 CA CA . E 2 CA A 1 326 326 CA CA . F 2 CA A 1 327 327 CA CA . G 2 CA A 1 328 328 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -62.619 _atom_site.Cartn_y -89.8 _atom_site.Cartn_z 247.725 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 153.22 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 324 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 306 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #