data_2AZ1 # _model_server_result.job_id ak4dmE19dhyfQ7Z_Zw495A _model_server_result.datetime_utc '2024-12-30 17:19:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2az1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":203}' # _entry.id 2AZ1 # _exptl.entry_id 2AZ1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2AZ1 _cell.length_a 69.28 _cell.length_b 108.7 _cell.length_c 119.65 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2AZ1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O HIS 72 A HIS 52 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 75 A GLU 55 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc3 G CA CA . A CA 203 1_555 L O HOH . A HOH 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc4 C OD2 ASP 65 C ASP 45 2_674 K CA CA . D CA 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc5 C OE1 GLU 67 C GLU 47 2_674 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc6 C O ALA 154 C ALA 134 1_555 H CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? metalc ? metalc7 C O PHE 157 C PHE 137 1_555 H CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc8 C OD1 ASP 158 C ASP 138 1_555 H CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASP 158 C ASP 138 1_555 I CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? metalc ? metalc10 C OD2 ASP 158 C ASP 138 1_555 I CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc ? metalc11 H CA CA . C CA 201 1_555 D OE1 GLU 67 D GLU 47 2_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc12 H CA CA . C CA 201 1_555 D OE2 GLU 67 D GLU 47 2_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc13 I CA CA . C CA 204 1_555 D OD2 ASP 65 D ASP 45 2_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc ? metalc14 I CA CA . C CA 204 1_555 D OE1 GLU 67 D GLU 47 2_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc ? metalc15 I CA CA . C CA 204 1_555 O O HOH . D HOH 213 2_675 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc16 D O ALA 154 D ALA 134 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc17 D O PHE 157 D PHE 137 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 158 D ASP 138 1_555 J CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc19 D OD1 ASP 158 D ASP 138 1_555 K CA CA . D CA 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.945 ? metalc ? metalc20 D OD2 ASP 158 D ASP 138 1_555 K CA CA . D CA 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc21 J CA CA . D CA 202 1_555 O O HOH . D HOH 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2AZ1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014434 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.0092 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008358 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 2 CA A 1 203 3 CA CA . H 2 CA C 1 201 1 CA CA . I 2 CA C 1 204 4 CA CA . J 2 CA D 1 202 1 CA CA . K 2 CA D 1 205 5 CA CA . L 3 HOH A 1 204 1 HOH WAT . L 3 HOH A 2 205 2 HOH WAT . L 3 HOH A 3 206 3 HOH WAT . L 3 HOH A 4 207 4 HOH WAT . L 3 HOH A 5 208 5 HOH WAT . L 3 HOH A 6 209 6 HOH WAT . L 3 HOH A 7 210 7 HOH WAT . L 3 HOH A 8 211 10 HOH WAT . L 3 HOH A 9 212 11 HOH WAT . L 3 HOH A 10 213 32 HOH WAT . L 3 HOH A 11 214 51 HOH WAT . L 3 HOH A 12 215 87 HOH WAT . L 3 HOH A 13 216 88 HOH WAT . L 3 HOH A 14 217 91 HOH WAT . L 3 HOH A 15 218 96 HOH WAT . L 3 HOH A 16 219 98 HOH WAT . L 3 HOH A 17 220 99 HOH WAT . L 3 HOH A 18 221 101 HOH WAT . L 3 HOH A 19 222 104 HOH WAT . M 3 HOH B 1 162 13 HOH WAT . M 3 HOH B 2 163 14 HOH WAT . M 3 HOH B 3 164 15 HOH WAT . M 3 HOH B 4 165 16 HOH WAT . M 3 HOH B 5 166 17 HOH WAT . M 3 HOH B 6 167 60 HOH WAT . M 3 HOH B 7 168 61 HOH WAT . M 3 HOH B 8 169 62 HOH WAT . M 3 HOH B 9 170 78 HOH WAT . M 3 HOH B 10 171 80 HOH WAT . M 3 HOH B 11 172 81 HOH WAT . M 3 HOH B 12 173 100 HOH WAT . M 3 HOH B 13 174 102 HOH WAT . N 3 HOH C 1 205 12 HOH WAT . N 3 HOH C 2 206 18 HOH WAT . N 3 HOH C 3 207 19 HOH WAT . N 3 HOH C 4 208 20 HOH WAT . N 3 HOH C 5 209 21 HOH WAT . N 3 HOH C 6 210 22 HOH WAT . N 3 HOH C 7 211 23 HOH WAT . N 3 HOH C 8 212 24 HOH WAT . N 3 HOH C 9 213 25 HOH WAT . N 3 HOH C 10 214 26 HOH WAT . N 3 HOH C 11 215 27 HOH WAT . N 3 HOH C 12 216 28 HOH WAT . N 3 HOH C 13 217 29 HOH WAT . N 3 HOH C 14 218 30 HOH WAT . N 3 HOH C 15 219 31 HOH WAT . N 3 HOH C 16 220 33 HOH WAT . N 3 HOH C 17 221 35 HOH WAT . N 3 HOH C 18 222 67 HOH WAT . N 3 HOH C 19 223 79 HOH WAT . N 3 HOH C 20 224 82 HOH WAT . N 3 HOH C 21 225 83 HOH WAT . N 3 HOH C 22 226 95 HOH WAT . N 3 HOH C 23 227 97 HOH WAT . N 3 HOH C 24 228 103 HOH WAT . O 3 HOH D 1 206 8 HOH WAT . O 3 HOH D 2 207 9 HOH WAT . O 3 HOH D 3 208 36 HOH WAT . O 3 HOH D 4 209 37 HOH WAT . O 3 HOH D 5 210 39 HOH WAT . O 3 HOH D 6 211 40 HOH WAT . O 3 HOH D 7 212 41 HOH WAT . O 3 HOH D 8 213 42 HOH WAT . O 3 HOH D 9 214 43 HOH WAT . O 3 HOH D 10 215 44 HOH WAT . O 3 HOH D 11 216 45 HOH WAT . O 3 HOH D 12 217 46 HOH WAT . O 3 HOH D 13 218 47 HOH WAT . O 3 HOH D 14 219 49 HOH WAT . O 3 HOH D 15 220 50 HOH WAT . O 3 HOH D 16 221 52 HOH WAT . O 3 HOH D 17 222 86 HOH WAT . O 3 HOH D 18 223 89 HOH WAT . O 3 HOH D 19 224 90 HOH WAT . O 3 HOH D 20 225 105 HOH WAT . P 3 HOH E 1 162 48 HOH WAT . P 3 HOH E 2 163 53 HOH WAT . P 3 HOH E 3 164 54 HOH WAT . P 3 HOH E 4 165 55 HOH WAT . P 3 HOH E 5 166 56 HOH WAT . P 3 HOH E 6 167 57 HOH WAT . P 3 HOH E 7 168 58 HOH WAT . P 3 HOH E 8 169 59 HOH WAT . P 3 HOH E 9 170 63 HOH WAT . P 3 HOH E 10 171 73 HOH WAT . P 3 HOH E 11 172 92 HOH WAT . Q 3 HOH F 1 162 34 HOH WAT . Q 3 HOH F 2 163 38 HOH WAT . Q 3 HOH F 3 164 64 HOH WAT . Q 3 HOH F 4 165 65 HOH WAT . Q 3 HOH F 5 166 66 HOH WAT . Q 3 HOH F 6 167 68 HOH WAT . Q 3 HOH F 7 168 69 HOH WAT . Q 3 HOH F 8 169 70 HOH WAT . Q 3 HOH F 9 170 71 HOH WAT . Q 3 HOH F 10 171 72 HOH WAT . Q 3 HOH F 11 172 74 HOH WAT . Q 3 HOH F 12 173 75 HOH WAT . Q 3 HOH F 13 174 76 HOH WAT . Q 3 HOH F 14 175 77 HOH WAT . Q 3 HOH F 15 176 84 HOH WAT . Q 3 HOH F 16 177 85 HOH WAT . Q 3 HOH F 17 178 93 HOH WAT . Q 3 HOH F 18 179 94 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 37.035 _atom_site.Cartn_y 87.198 _atom_site.Cartn_z -8.728 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 71.07 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 203 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 67 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 8 _model_server_stats.query_time_ms 498 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #