data_2B03
#
_model_server_result.job_id            8oR9i7WEmVM6k3G_zuRdQA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-30 08:55:05' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2b03 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":126}' 
#
_entry.id    2B03 
#
_exptl.entry_id    2B03 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              499.704 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'TAUROCHENODEOXYCHOLIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            2B03 
_cell.length_a            69.154 
_cell.length_b            69.154 
_cell.length_c            64.407 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2B03 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        152 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 31 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D 1 1 
A,B,C,D 2 1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 6_555 -x,-x+y,-z+1/3 -0.5 -0.866025 0 -0.866025 0.5 0 0 0 -1 0 0 21.469 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             C 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 11 A CYS 11 1_555 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 27 A CYS 27 1_555 A SG CYS 124 A CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 29 A CYS 29 1_555 A SG CYS 45 A CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 44 A CYS 44 1_555 A SG CYS 105 A CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 51 A CYS 51 1_555 A SG CYS 98 A CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 61 A CYS 61 1_555 A SG CYS 91 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 84 A CYS 84 1_555 A SG CYS 96 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 71 A GLU 71 1_555 B CA CA . A CA 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 71 A GLU 71 6_555 B CA CA . A CA 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc3 A O SER 72 A SER 72 1_555 B CA CA . A CA 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc4 A O SER 72 A SER 72 6_555 B CA CA . A CA 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc5 A OE2 GLU 92 A GLU 92 1_555 B CA CA . A CA 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc6 A OE2 GLU 92 A GLU 92 6_555 B CA CA . A CA 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
#
_chem_comp.formula           'C26 H45 N O6 S' 
_chem_comp.formula_weight    499.704 
_chem_comp.id                TUD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'TAUROCHENODEOXYCHOLIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     '2-(((3ALPHA,5BETA,7ALPHA)-3,7-DIHYDROXY-24-OXOCHOLAN-24-YL)AMINO)ETHANESULFONIC ACID;TAUROCHENODEOXYCHOLATE' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 TUD sing 334 n n 
C1 C10 TUD sing 335 n n 
C1 H11 TUD sing 336 n n 
C1 H12 TUD sing 337 n n 
C2 C3 TUD sing 338 n n 
C2 H21 TUD sing 339 n n 
C2 H22 TUD sing 340 n n 
C3 O3 TUD sing 341 n n 
C3 C4 TUD sing 342 n n 
C3 H3 TUD sing 343 n n 
O3 HO3 TUD sing 344 n n 
C4 C5 TUD sing 345 n n 
C4 H41 TUD sing 346 n n 
C4 H42 TUD sing 347 n n 
C5 C6 TUD sing 348 n n 
C5 C10 TUD sing 349 n n 
C5 H5 TUD sing 350 n n 
C6 C7 TUD sing 351 n n 
C6 H61 TUD sing 352 n n 
C6 H62 TUD sing 353 n n 
C7 O7 TUD sing 354 n n 
C7 C8 TUD sing 355 n n 
C7 H7 TUD sing 356 n n 
O7 HO7 TUD sing 357 n n 
C8 C9 TUD sing 358 n n 
C8 C14 TUD sing 359 n n 
C8 H8 TUD sing 360 n n 
C9 C10 TUD sing 361 n n 
C9 C11 TUD sing 362 n n 
C9 H9 TUD sing 363 n n 
C10 C19 TUD sing 364 n n 
C11 C12 TUD sing 365 n n 
C11 H111 TUD sing 366 n n 
C11 H112 TUD sing 367 n n 
C12 C13 TUD sing 368 n n 
C12 H121 TUD sing 369 n n 
C12 H122 TUD sing 370 n n 
C13 C14 TUD sing 371 n n 
C13 C17 TUD sing 372 n n 
C13 C18 TUD sing 373 n n 
C14 C15 TUD sing 374 n n 
C14 H14 TUD sing 375 n n 
C15 C16 TUD sing 376 n n 
C15 H151 TUD sing 377 n n 
C15 H152 TUD sing 378 n n 
C16 C17 TUD sing 379 n n 
C16 H161 TUD sing 380 n n 
C16 H162 TUD sing 381 n n 
C17 C20 TUD sing 382 n n 
C17 H17 TUD sing 383 n n 
C18 H181 TUD sing 384 n n 
C18 H182 TUD sing 385 n n 
C18 H183 TUD sing 386 n n 
C19 H191 TUD sing 387 n n 
C19 H192 TUD sing 388 n n 
C19 H193 TUD sing 389 n n 
C20 C21 TUD sing 390 n n 
C20 C22 TUD sing 391 n n 
C20 H20 TUD sing 392 n n 
C21 H211 TUD sing 393 n n 
C21 H212 TUD sing 394 n n 
C21 H213 TUD sing 395 n n 
C22 C23 TUD sing 396 n n 
C22 H221 TUD sing 397 n n 
C22 H222 TUD sing 398 n n 
C23 C24 TUD sing 399 n n 
C23 H231 TUD sing 400 n n 
C23 H232 TUD sing 401 n n 
O25 C24 TUD doub 402 n n 
C24 N26 TUD sing 403 n n 
N26 C25 TUD sing 404 n n 
N26 H26 TUD sing 405 n n 
C25 C26 TUD sing 406 n n 
C25 H251 TUD sing 407 n n 
C25 H252 TUD sing 408 n n 
C26 S27 TUD sing 409 n n 
C26 H261 TUD sing 410 n n 
C26 H262 TUD sing 411 n n 
S27 O28 TUD doub 412 n n 
S27 O29 TUD doub 413 n n 
S27 O30 TUD sing 414 n n 
O30 H30 TUD sing 415 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2B03 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.01446 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.008349 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.016698 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.015526 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 CA A 1 125 70 CA CA . 
C 3 TUD A 1 126 71 TUD TUD . 
D 4 HOH A 1 127 1 HOH HOH . 
D 4 HOH A 2 128 2 HOH HOH . 
D 4 HOH A 3 129 3 HOH HOH . 
D 4 HOH A 4 130 4 HOH HOH . 
D 4 HOH A 5 131 5 HOH HOH . 
D 4 HOH A 6 132 6 HOH HOH . 
D 4 HOH A 7 133 7 HOH HOH . 
D 4 HOH A 8 134 8 HOH HOH . 
D 4 HOH A 9 135 9 HOH HOH . 
D 4 HOH A 10 136 10 HOH HOH . 
D 4 HOH A 11 137 11 HOH HOH . 
D 4 HOH A 12 138 12 HOH HOH . 
D 4 HOH A 13 139 13 HOH HOH . 
D 4 HOH A 14 140 14 HOH HOH . 
D 4 HOH A 15 141 15 HOH HOH . 
D 4 HOH A 16 142 16 HOH HOH . 
D 4 HOH A 17 143 17 HOH HOH . 
D 4 HOH A 18 144 18 HOH HOH . 
D 4 HOH A 19 145 19 HOH HOH . 
D 4 HOH A 20 146 20 HOH HOH . 
D 4 HOH A 21 147 21 HOH HOH . 
D 4 HOH A 22 148 22 HOH HOH . 
D 4 HOH A 23 149 23 HOH HOH . 
D 4 HOH A 24 150 24 HOH HOH . 
D 4 HOH A 25 151 25 HOH HOH . 
D 4 HOH A 26 152 26 HOH HOH . 
D 4 HOH A 27 153 27 HOH HOH . 
D 4 HOH A 28 154 28 HOH HOH . 
D 4 HOH A 29 155 29 HOH HOH . 
D 4 HOH A 30 156 30 HOH HOH . 
D 4 HOH A 31 157 31 HOH HOH . 
D 4 HOH A 32 158 32 HOH HOH . 
D 4 HOH A 33 159 33 HOH HOH . 
D 4 HOH A 34 160 34 HOH HOH . 
D 4 HOH A 35 161 35 HOH HOH . 
D 4 HOH A 36 162 36 HOH HOH . 
D 4 HOH A 37 163 37 HOH HOH . 
D 4 HOH A 38 164 38 HOH HOH . 
D 4 HOH A 39 165 39 HOH HOH . 
D 4 HOH A 40 166 40 HOH HOH . 
D 4 HOH A 41 167 41 HOH HOH . 
D 4 HOH A 42 168 42 HOH HOH . 
D 4 HOH A 43 169 43 HOH HOH . 
D 4 HOH A 44 170 44 HOH HOH . 
D 4 HOH A 45 171 45 HOH HOH . 
D 4 HOH A 46 172 46 HOH HOH . 
D 4 HOH A 47 173 47 HOH HOH . 
D 4 HOH A 48 174 48 HOH HOH . 
D 4 HOH A 49 175 49 HOH HOH . 
D 4 HOH A 50 176 50 HOH HOH . 
D 4 HOH A 51 177 51 HOH HOH . 
D 4 HOH A 52 178 52 HOH HOH . 
D 4 HOH A 53 179 53 HOH HOH . 
D 4 HOH A 54 180 54 HOH HOH . 
D 4 HOH A 55 181 55 HOH HOH . 
D 4 HOH A 56 182 56 HOH HOH . 
D 4 HOH A 57 183 57 HOH HOH . 
D 4 HOH A 58 184 58 HOH HOH . 
D 4 HOH A 59 185 59 HOH HOH . 
D 4 HOH A 60 186 60 HOH HOH . 
D 4 HOH A 61 187 61 HOH HOH . 
D 4 HOH A 62 188 62 HOH HOH . 
D 4 HOH A 63 189 63 HOH HOH . 
D 4 HOH A 64 190 64 HOH HOH . 
D 4 HOH A 65 191 65 HOH HOH . 
D 4 HOH A 66 192 66 HOH HOH . 
D 4 HOH A 67 193 67 HOH HOH . 
D 4 HOH A 68 194 68 HOH HOH . 
D 4 HOH A 69 195 69 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 TUD . . . C 3 -0.917 35.255 5.204 1 41.54 ? C1 TUD 126 A 1 
HETATM 2 C C2 TUD . . . C 3 -0.59 34.302 6.443 1 42.66 ? C2 TUD 126 A 1 
HETATM 3 C C3 TUD . . . C 3 0.123 35.116 7.566 1 41.99 ? C3 TUD 126 A 1 
HETATM 4 O O3 TUD . . . C 3 0.42 34.221 8.679 1 43.93 ? O3 TUD 126 A 1 
HETATM 5 C C4 TUD . . . C 3 1.462 35.77 7.05 1 42.29 ? C4 TUD 126 A 1 
HETATM 6 C C5 TUD . . . C 3 1.172 36.746 5.825 1 42.84 ? C5 TUD 126 A 1 
HETATM 7 C C6 TUD . . . C 3 2.488 37.451 5.225 1 43.09 ? C6 TUD 126 A 1 
HETATM 8 C C7 TUD . . . C 3 3.471 36.463 4.527 1 44.35 ? C7 TUD 126 A 1 
HETATM 9 O O7 TUD . . . C 3 4.14 35.517 5.432 1 45.2 ? O7 TUD 126 A 1 
HETATM 10 C C8 TUD . . . C 3 2.742 35.642 3.349 1 44.01 ? C8 TUD 126 A 1 
HETATM 11 C C9 TUD . . . C 3 1.43 34.882 3.932 1 43.01 ? C9 TUD 126 A 1 
HETATM 12 C C10 TUD . . . C 3 0.379 35.962 4.622 1 41.75 ? C10 TUD 126 A 1 
HETATM 13 C C11 TUD . . . C 3 0.742 34.046 2.691 1 43.09 ? C11 TUD 126 A 1 
HETATM 14 C C12 TUD . . . C 3 1.878 33.082 2.209 1 44.45 ? C12 TUD 126 A 1 
HETATM 15 C C13 TUD . . . C 3 3.161 33.78 1.522 1 46.59 ? C13 TUD 126 A 1 
HETATM 16 C C14 TUD . . . C 3 3.773 34.604 2.663 1 44.89 ? C14 TUD 126 A 1 
HETATM 17 C C15 TUD . . . C 3 5.073 35.243 2.008 1 46.76 ? C15 TUD 126 A 1 
HETATM 18 C C16 TUD . . . C 3 5.392 34.204 0.845 1 49.08 ? C16 TUD 126 A 1 
HETATM 19 C C17 TUD . . . C 3 4.385 32.933 1.094 1 49.61 ? C17 TUD 126 A 1 
HETATM 20 C C18 TUD . . . C 3 2.536 34.656 0.276 1 45.55 ? C18 TUD 126 A 1 
HETATM 21 C C19 TUD . . . C 3 -0.277 37.044 3.64 1 42.58 ? C19 TUD 126 A 1 
HETATM 22 C C20 TUD . . . C 3 4.247 31.94 -0.188 1 54.5 ? C20 TUD 126 A 1 
HETATM 23 C C21 TUD . . . C 3 3.033 30.987 -0.374 1 53.75 ? C21 TUD 126 A 1 
HETATM 24 C C22 TUD . . . C 3 5.536 31.008 -0.327 1 60.76 ? C22 TUD 126 A 1 
HETATM 25 C C23 TUD . . . C 3 6.619 31.074 -1.513 1 68.65 ? C23 TUD 126 A 1 
HETATM 26 O O25 TUD . . . C 3 7.607 28.892 -1.423 1 73.54 ? O25 TUD 126 A 1 
HETATM 27 C C24 TUD . . . C 3 7.107 29.868 -2.224 1 73.77 ? C24 TUD 126 A 1 
HETATM 28 N N26 TUD . . . C 3 7.082 29.721 -3.466 1 78.28 ? N26 TUD 126 A 1 
HETATM 29 C C25 TUD . . . C 3 7.582 28.508 -4.117 1 84.55 ? C25 TUD 126 A 1 
HETATM 30 C C26 TUD . . . C 3 7.243 28.427 -5.629 1 90.35 ? C26 TUD 126 A 1 
HETATM 31 S S27 TUD . . . C 3 7.671 27.294 -6.424 1 93.84 ? S27 TUD 126 A 1 
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