data_2B5U # _model_server_result.job_id 1Gaf1onEGRKB9E3hq3PtSw _model_server_result.datetime_utc '2025-02-05 10:57:57' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2b5u # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":602}' # _entry.id 2B5U # _exptl.entry_id 2B5U _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 192.124 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CITRIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 112.98 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2B5U _cell.length_a 66.73 _cell.length_b 192.916 _cell.length_c 85.385 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2B5U _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,E,G,H 1 1 C,D,F,I,J 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N # _chem_comp.formula 'C6 H8 O7' _chem_comp.formula_weight 192.124 _chem_comp.id CIT _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CITRIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 CIT doub 70 n n C1 O2 CIT sing 71 n n C1 C2 CIT sing 72 n n O2 HO2 CIT sing 73 n n C2 C3 CIT sing 74 n n C2 H21 CIT sing 75 n n C2 H22 CIT sing 76 n n C3 O7 CIT sing 77 n n C3 C4 CIT sing 78 n n C3 C6 CIT sing 79 n n O7 HO7 CIT sing 80 n n C4 C5 CIT sing 81 n n C4 H41 CIT sing 82 n n C4 H42 CIT sing 83 n n C5 O3 CIT doub 84 n n C5 O4 CIT sing 85 n n O4 HO4 CIT sing 86 n n C6 O5 CIT doub 87 n n C6 O6 CIT sing 88 n n O6 HO6 CIT sing 89 n n # _atom_sites.entry_id 2B5U _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014986 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.006355 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005184 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012721 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 CIT A 1 602 602 CIT CIT . F 3 CIT C 1 601 601 CIT CIT . G 4 HOH A 1 603 5 HOH WAT . G 4 HOH A 2 604 6 HOH WAT . G 4 HOH A 3 605 8 HOH WAT . G 4 HOH A 4 606 9 HOH WAT . G 4 HOH A 5 607 11 HOH WAT . G 4 HOH A 6 608 13 HOH WAT . G 4 HOH A 7 609 18 HOH WAT . G 4 HOH A 8 610 21 HOH WAT . G 4 HOH A 9 611 22 HOH WAT . G 4 HOH A 10 612 24 HOH WAT . G 4 HOH A 11 613 25 HOH WAT . G 4 HOH A 12 614 26 HOH WAT . G 4 HOH A 13 615 28 HOH WAT . G 4 HOH A 14 616 31 HOH WAT . G 4 HOH A 15 617 32 HOH WAT . G 4 HOH A 16 618 34 HOH WAT . G 4 HOH A 17 619 35 HOH WAT . G 4 HOH A 18 620 37 HOH WAT . G 4 HOH A 19 621 38 HOH WAT . G 4 HOH A 20 622 42 HOH WAT . G 4 HOH A 21 623 44 HOH WAT . G 4 HOH A 22 624 45 HOH WAT . G 4 HOH A 23 625 46 HOH WAT . G 4 HOH A 24 626 53 HOH WAT . G 4 HOH A 25 627 57 HOH WAT . G 4 HOH A 26 628 58 HOH WAT . G 4 HOH A 27 629 60 HOH WAT . G 4 HOH A 28 630 64 HOH WAT . G 4 HOH A 29 631 66 HOH WAT . G 4 HOH A 30 632 71 HOH WAT . G 4 HOH A 31 633 73 HOH WAT . G 4 HOH A 32 634 74 HOH WAT . G 4 HOH A 33 635 75 HOH WAT . G 4 HOH A 34 636 79 HOH WAT . G 4 HOH A 35 637 80 HOH WAT . G 4 HOH A 36 638 84 HOH WAT . G 4 HOH A 37 639 86 HOH WAT . G 4 HOH A 38 640 88 HOH WAT . G 4 HOH A 39 641 89 HOH WAT . G 4 HOH A 40 642 92 HOH WAT . G 4 HOH A 41 643 93 HOH WAT . G 4 HOH A 42 644 94 HOH WAT . G 4 HOH A 43 645 96 HOH WAT . G 4 HOH A 44 646 97 HOH WAT . G 4 HOH A 45 647 101 HOH WAT . G 4 HOH A 46 648 102 HOH WAT . G 4 HOH A 47 649 107 HOH WAT . G 4 HOH A 48 650 108 HOH WAT . G 4 HOH A 49 651 111 HOH WAT . G 4 HOH A 50 652 112 HOH WAT . G 4 HOH A 51 653 113 HOH WAT . G 4 HOH A 52 654 115 HOH WAT . G 4 HOH A 53 655 117 HOH WAT . G 4 HOH A 54 656 118 HOH WAT . G 4 HOH A 55 657 122 HOH WAT . G 4 HOH A 56 658 123 HOH WAT . G 4 HOH A 57 659 124 HOH WAT . G 4 HOH A 58 660 125 HOH WAT . G 4 HOH A 59 661 128 HOH WAT . G 4 HOH A 60 662 130 HOH WAT . G 4 HOH A 61 663 131 HOH WAT . G 4 HOH A 62 664 132 HOH WAT . G 4 HOH A 63 665 134 HOH WAT . G 4 HOH A 64 666 135 HOH WAT . G 4 HOH A 65 667 136 HOH WAT . G 4 HOH A 66 668 138 HOH WAT . G 4 HOH A 67 669 153 HOH WAT . G 4 HOH A 68 670 154 HOH WAT . G 4 HOH A 69 671 155 HOH WAT . G 4 HOH A 70 672 156 HOH WAT . G 4 HOH A 71 673 157 HOH WAT . G 4 HOH A 72 674 158 HOH WAT . G 4 HOH A 73 675 159 HOH WAT . G 4 HOH A 74 676 160 HOH WAT . G 4 HOH A 75 677 162 HOH WAT . G 4 HOH A 76 678 163 HOH WAT . G 4 HOH A 77 679 164 HOH WAT . G 4 HOH A 78 680 165 HOH WAT . G 4 HOH A 79 681 166 HOH WAT . G 4 HOH A 80 682 169 HOH WAT . G 4 HOH A 81 683 170 HOH WAT . G 4 HOH A 82 684 171 HOH WAT . G 4 HOH A 83 685 175 HOH WAT . G 4 HOH A 84 686 176 HOH WAT . G 4 HOH A 85 687 177 HOH WAT . G 4 HOH A 86 688 178 HOH WAT . G 4 HOH A 87 689 179 HOH WAT . G 4 HOH A 88 690 180 HOH WAT . G 4 HOH A 89 691 181 HOH WAT . G 4 HOH A 90 692 191 HOH WAT . G 4 HOH A 91 693 192 HOH WAT . G 4 HOH A 92 694 193 HOH WAT . G 4 HOH A 93 695 194 HOH WAT . G 4 HOH A 94 696 195 HOH WAT . G 4 HOH A 95 697 196 HOH WAT . G 4 HOH A 96 698 197 HOH WAT . G 4 HOH A 97 699 201 HOH WAT . G 4 HOH A 98 700 202 HOH WAT . G 4 HOH A 99 701 204 HOH WAT . G 4 HOH A 100 702 208 HOH WAT . G 4 HOH A 101 703 209 HOH WAT . G 4 HOH A 102 704 210 HOH WAT . G 4 HOH A 103 705 211 HOH WAT . G 4 HOH A 104 706 212 HOH WAT . G 4 HOH A 105 707 213 HOH WAT . G 4 HOH A 106 708 214 HOH WAT . G 4 HOH A 107 709 215 HOH WAT . G 4 HOH A 108 710 216 HOH WAT . G 4 HOH A 109 711 217 HOH WAT . G 4 HOH A 110 712 218 HOH WAT . G 4 HOH A 111 713 219 HOH WAT . G 4 HOH A 112 714 220 HOH WAT . H 4 HOH B 1 85 2 HOH WAT . H 4 HOH B 2 86 14 HOH WAT . H 4 HOH B 3 87 20 HOH WAT . H 4 HOH B 4 88 48 HOH WAT . H 4 HOH B 5 89 51 HOH WAT . H 4 HOH B 6 90 55 HOH WAT . H 4 HOH B 7 91 56 HOH WAT . H 4 HOH B 8 92 61 HOH WAT . H 4 HOH B 9 93 62 HOH WAT . H 4 HOH B 10 94 63 HOH WAT . H 4 HOH B 11 95 70 HOH WAT . H 4 HOH B 12 96 81 HOH WAT . H 4 HOH B 13 97 85 HOH WAT . H 4 HOH B 14 98 87 HOH WAT . H 4 HOH B 15 99 105 HOH WAT . H 4 HOH B 16 100 127 HOH WAT . H 4 HOH B 17 101 139 HOH WAT . H 4 HOH B 18 102 161 HOH WAT . H 4 HOH B 19 103 198 HOH WAT . H 4 HOH B 20 104 199 HOH WAT . H 4 HOH B 21 105 205 HOH WAT . H 4 HOH B 22 106 206 HOH WAT . H 4 HOH B 23 107 207 HOH WAT . I 4 HOH C 1 602 1 HOH WAT . I 4 HOH C 2 603 3 HOH WAT . I 4 HOH C 3 604 4 HOH WAT . I 4 HOH C 4 605 10 HOH WAT . I 4 HOH C 5 606 12 HOH WAT . I 4 HOH C 6 607 15 HOH WAT . I 4 HOH C 7 608 16 HOH WAT . I 4 HOH C 8 609 17 HOH WAT . I 4 HOH C 9 610 19 HOH WAT . I 4 HOH C 10 611 23 HOH WAT . I 4 HOH C 11 612 27 HOH WAT . I 4 HOH C 12 613 30 HOH WAT . I 4 HOH C 13 614 33 HOH WAT . I 4 HOH C 14 615 36 HOH WAT . I 4 HOH C 15 616 39 HOH WAT . I 4 HOH C 16 617 40 HOH WAT . I 4 HOH C 17 618 41 HOH WAT . I 4 HOH C 18 619 43 HOH WAT . I 4 HOH C 19 620 47 HOH WAT . I 4 HOH C 20 621 49 HOH WAT . I 4 HOH C 21 622 50 HOH WAT . I 4 HOH C 22 623 52 HOH WAT . I 4 HOH C 23 624 54 HOH WAT . I 4 HOH C 24 625 59 HOH WAT . I 4 HOH C 25 626 65 HOH WAT . I 4 HOH C 26 627 67 HOH WAT . I 4 HOH C 27 628 68 HOH WAT . I 4 HOH C 28 629 69 HOH WAT . I 4 HOH C 29 630 72 HOH WAT . I 4 HOH C 30 631 77 HOH WAT . I 4 HOH C 31 632 83 HOH WAT . I 4 HOH C 32 633 91 HOH WAT . I 4 HOH C 33 634 95 HOH WAT . I 4 HOH C 34 635 98 HOH WAT . I 4 HOH C 35 636 99 HOH WAT . I 4 HOH C 36 637 100 HOH WAT . I 4 HOH C 37 638 103 HOH WAT . I 4 HOH C 38 639 104 HOH WAT . I 4 HOH C 39 640 106 HOH WAT . I 4 HOH C 40 641 109 HOH WAT . I 4 HOH C 41 642 110 HOH WAT . I 4 HOH C 42 643 119 HOH WAT . I 4 HOH C 43 644 120 HOH WAT . I 4 HOH C 44 645 121 HOH WAT . I 4 HOH C 45 646 126 HOH WAT . I 4 HOH C 46 647 129 HOH WAT . I 4 HOH C 47 648 137 HOH WAT . I 4 HOH C 48 649 140 HOH WAT . I 4 HOH C 49 650 141 HOH WAT . I 4 HOH C 50 651 143 HOH WAT . I 4 HOH C 51 652 146 HOH WAT . I 4 HOH C 52 653 147 HOH WAT . I 4 HOH C 53 654 150 HOH WAT . I 4 HOH C 54 655 152 HOH WAT . I 4 HOH C 55 656 167 HOH WAT . I 4 HOH C 56 657 168 HOH WAT . I 4 HOH C 57 658 172 HOH WAT . I 4 HOH C 58 659 173 HOH WAT . I 4 HOH C 59 660 174 HOH WAT . I 4 HOH C 60 661 182 HOH WAT . I 4 HOH C 61 662 183 HOH WAT . I 4 HOH C 62 663 184 HOH WAT . I 4 HOH C 63 664 185 HOH WAT . I 4 HOH C 64 665 186 HOH WAT . I 4 HOH C 65 666 187 HOH WAT . I 4 HOH C 66 667 188 HOH WAT . I 4 HOH C 67 668 189 HOH WAT . I 4 HOH C 68 669 190 HOH WAT . I 4 HOH C 69 670 200 HOH WAT . I 4 HOH C 70 671 203 HOH WAT . J 4 HOH D 1 85 7 HOH WAT . J 4 HOH D 2 86 29 HOH WAT . J 4 HOH D 3 87 76 HOH WAT . J 4 HOH D 4 88 78 HOH WAT . J 4 HOH D 5 89 82 HOH WAT . J 4 HOH D 6 90 90 HOH WAT . J 4 HOH D 7 91 114 HOH WAT . J 4 HOH D 8 92 133 HOH WAT . J 4 HOH D 9 93 142 HOH WAT . J 4 HOH D 10 94 144 HOH WAT . J 4 HOH D 11 95 145 HOH WAT . J 4 HOH D 12 96 148 HOH WAT . J 4 HOH D 13 97 149 HOH WAT . J 4 HOH D 14 98 151 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 CIT . . . E 3 18.187 143.564 46.336 1 140.88 ? C1 CIT 602 A 1 HETATM 2 O O1 CIT . . . E 3 17.862 142.626 45.551 1 140.51 ? O1 CIT 602 A 1 HETATM 3 O O2 CIT . . . E 3 19.392 143.667 46.739 1 140.48 ? O2 CIT 602 A 1 HETATM 4 C C2 CIT . . . E 3 17.15 144.589 46.818 1 141.18 ? C2 CIT 602 A 1 HETATM 5 C C3 CIT . . . E 3 15.641 144.463 46.324 1 141.34 ? C3 CIT 602 A 1 HETATM 6 O O7 CIT . . . E 3 15.488 144.456 44.897 1 141.32 ? O7 CIT 602 A 1 HETATM 7 C C4 CIT . . . E 3 14.794 145.635 46.961 1 140.62 ? C4 CIT 602 A 1 HETATM 8 C C5 CIT . . . E 3 15.33 146.993 46.479 1 139.91 ? C5 CIT 602 A 1 HETATM 9 O O3 CIT . . . E 3 15.094 147.387 45.306 1 139.75 ? O3 CIT 602 A 1 HETATM 10 O O4 CIT . . . E 3 16.007 147.726 47.25 1 139.2 ? O4 CIT 602 A 1 HETATM 11 C C6 CIT . . . E 3 15.017 143.167 46.854 1 141.91 ? C6 CIT 602 A 1 HETATM 12 O O5 CIT . . . E 3 13.828 142.944 46.535 1 142.25 ? O5 CIT 602 A 1 HETATM 13 O O6 CIT . . . E 3 15.21 143.046 48.102 1 142.41 ? O6 CIT 602 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 13 #