data_2B8O
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_model_server_result.job_id            baofD5q1joxfT-5Q09wHxg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-19 10:18:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":505}' 
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_entry.id    2B8O 
#
_exptl.entry_id    2B8O 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          7 
_entity.src_method                  syn 
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_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            2B8O 
_cell.length_a            70.28 
_cell.length_b            81.11 
_cell.length_c            126.86 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2B8O 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 7 H N N 
? 7 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 17 L CYS 17 1_555 A SG CYS 22 L CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 50 L CYS 50 1_555 A SG CYS 61 L CYS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 55 L CYS 55 1_555 A SG CYS 70 L CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 72 L CYS 72 1_555 A SG CYS 81 L CYS 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 91 L CYS 91 1_555 A SG CYS 102 L CYS 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 98 L CYS 98 1_555 A SG CYS 112 L CYS 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 114 L CYS 114 1_555 A SG CYS 127 L CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf8 A SG CYS 135 L CYS 135 1_555 B SG CYS 110 H CYS 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf9 B SG CYS 7 H CYS 22 1_555 B SG CYS 12 H CYS 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
disulf ? disulf10 B SG CYS 26 H CYS 42 1_555 B SG CYS 42 H CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf11 B SG CYS 158 H CYS 168 1_555 B SG CYS 177 H CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
disulf ? disulf12 B SG CYS 188 H CYS 191 1_555 B SG CYS 216 H CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
disulf ? disulf13 C SG CYS 44 T CYS 49 1_555 C SG CYS 52 T CYS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf14 C SG CYS 181 T CYS 186 1_555 C SG CYS 204 T CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
covale ? covale1 A C LEU 5 L LEU 5 1_555 A N CGU 6 L CGU 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale2 A C CGU 6 L CGU 6 1_555 A N CGU 7 L CGU 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale3 A C CGU 7 L CGU 7 1_555 A N LEU 8 L LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale4 A C LEU 13 L LEU 13 1_555 A N CGU 14 L CGU 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale5 A C CGU 14 L CGU 14 1_555 A N ARG 15 L ARG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale6 A C ARG 15 L ARG 15 1_555 A N CGU 16 L CGU 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale7 A C CGU 16 L CGU 16 1_555 A N CYS 17 L CYS 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale8 A C LYS 18 L LYS 18 1_555 A N CGU 19 L CGU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale9 A C CGU 19 L CGU 19 1_555 A N CGU 20 L CGU 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale10 A C CGU 20 L CGU 20 1_555 A N GLN 21 L GLN 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale11 A C PHE 24 L PHE 24 1_555 A N CGU 25 L CGU 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale12 A C CGU 25 L CGU 25 1_555 A N CGU 26 L CGU 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale13 A C CGU 26 L CGU 26 1_555 A N ALA 27 L ALA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale14 A C ARG 28 L ARG 28 1_555 A N CGU 29 L CGU 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale15 A C CGU 29 L CGU 29 1_555 A N ILE 30 L ILE 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale16 A C ALA 34 L ALA 34 1_555 A N CGU 35 L CGU 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale17 A C CGU 35 L CGU 35 1_555 A N ARG 36 L ARG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale18 A OG SER 52 L SER 52 1_555 D C1 GLC . L GLC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale19 A OG SER 60 L SER 60 1_555 E C1 FUC . L FUC 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
metalc ? metalc1 A OE21 CGU 6 L CGU 6 1_555 J CA CA . L CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? 
metalc ? metalc2 A OE12 CGU 6 L CGU 6 1_555 J CA CA . L CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.173 ? 
metalc ? metalc3 A OE11 CGU 7 L CGU 7 1_555 I CA CA . L CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? 
metalc ? metalc4 A OE22 CGU 14 L CGU 14 1_555 K MG MG . L MG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.821 ? 
metalc ? metalc5 A OE21 CGU 14 L CGU 14 1_555 K MG MG . L MG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? 
metalc ? metalc6 A OE11 CGU 14 L CGU 14 1_555 K MG MG . L MG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc7 A OE11 CGU 16 L CGU 16 1_555 H MG MG . L MG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.9 ? 
metalc ? metalc8 A OE21 CGU 16 L CGU 16 1_555 H MG MG . L MG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.86 ? 
metalc ? metalc9 A OE12 CGU 16 L CGU 16 1_555 I CA CA . L CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc10 A OE11 CGU 16 L CGU 16 1_555 I CA CA . L CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? 
metalc ? metalc11 A OE22 CGU 19 L CGU 19 1_555 K MG MG . L MG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.857 ? 
metalc ? metalc12 A OE21 CGU 19 L CGU 19 1_555 K MG MG . L MG 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc13 A OE11 CGU 25 L CGU 25 1_555 F CA CA . L CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.382 ? 
metalc ? metalc14 A OE22 CGU 26 L CGU 26 1_555 H MG MG . L MG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
metalc ? metalc15 A OE12 CGU 26 L CGU 26 1_555 H MG MG . L MG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.816 ? 
metalc ? metalc16 A OE11 CGU 26 L CGU 26 1_555 H MG MG . L MG 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? 
metalc ? metalc17 A OE11 CGU 29 L CGU 29 1_555 F CA CA . L CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? 
metalc ? metalc18 A OE12 CGU 29 L CGU 29 1_555 F CA CA . L CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.299 ? 
metalc ? metalc19 A OE12 CGU 29 L CGU 29 1_555 G CA CA . L CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.875 ? 
metalc ? metalc20 A OD2 ASP 46 L ASP 46 1_555 L CA CA . L CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? 
metalc ? metalc21 A O GLY 47 L GLY 47 1_555 L CA CA . L CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? 
metalc ? metalc22 A OE1 GLN 49 L GLN 49 1_555 L CA CA . L CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? 
metalc ? metalc23 A OD2 ASP 63 L ASP 63 1_555 L CA CA . L CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc24 A OD1 ASP 63 L ASP 63 1_555 L CA CA . L CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? 
metalc ? metalc25 A O GLN 64 L GLN 64 1_555 L CA CA . L CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? 
metalc ? metalc26 F CA CA . L CA 503 1_555 U O HOH . L HOH 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc27 G CA CA . L CA 504 1_555 U O HOH . L HOH 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.187 ? 
metalc ? metalc28 I CA CA . L CA 506 1_555 U O HOH . L HOH 535 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? 
metalc ? metalc29 L CA CA . L CA 509 1_555 U O HOH . L HOH 551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? 
metalc ? metalc30 B NZ LYS 9 H LYS 24 1_555 Q ZN ZN . H ZN 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc31 B OE2 GLU 58 H GLU 70 1_555 N CA CA . H CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc32 B O ASP 60 H ASP 72 1_555 N CA CA . H CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc33 B O GLU 63 H GLU 75 1_555 N CA CA . H CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.973 ? 
metalc ? metalc34 B OE2 GLU 68 H GLU 80 1_555 N CA CA . H CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc35 B O TYR 180 H TYR 184 1_555 O NA NA . H NA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? 
metalc ? metalc36 B O THR 218 H THR 221 1_555 O NA NA . H NA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? 
metalc ? metalc37 B O HIS 221 H HIS 224 1_555 O NA NA . H NA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc38 O NA NA . H NA 511 1_555 V O HOH . H HOH 574 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.844 ? 
metalc ? metalc39 Q ZN ZN . H ZN 513 1_555 V O HOH . H HOH 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2B8O 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014229 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012329 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007883 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 4 GLC L 1 501 501 GLC GLC . 
E 5 FUC L 1 502 502 FUC FUC . 
F 6 CA L 1 503 503 CA CA . 
G 6 CA L 1 504 504 CA CA . 
H 7 MG L 1 505 505 MG MG . 
I 6 CA L 1 506 506 CA CA . 
J 6 CA L 1 507 507 CA CA . 
K 7 MG L 1 508 508 MG MG . 
L 6 CA L 1 509 509 CA CA . 
M 8 0GJ H 1 1 1 0GJ GLU . 
N 6 CA H 1 510 510 CA CA . 
O 9 NA H 1 511 511 NA NA . 
P 10 ZN H 1 512 512 ZN ZN . 
Q 10 ZN H 1 513 513 ZN ZN . 
R 11 CL H 1 514 514 CL CL . 
S 11 CL H 1 515 515 CL CL . 
T 11 CL T 1 516 516 CL CL . 
U 12 HOH L 1 510 3 HOH HOH . 
U 12 HOH L 2 511 13 HOH HOH . 
U 12 HOH L 3 512 16 HOH HOH . 
U 12 HOH L 4 513 26 HOH HOH . 
U 12 HOH L 5 514 28 HOH HOH . 
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