data_2C9M # _model_server_result.job_id D3H-jl6yNQcGYgWC075aVA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 23:18:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2c9m # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":996}' # _entry.id 2C9M # _exptl.entry_id 2C9M _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 97.64 _cell.angle_beta 99.94 _cell.angle_gamma 95.22 _cell.entry_id 2C9M _cell.length_a 64.948 _cell.length_b 81.276 _cell.length_c 131.006 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2C9M _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,G,H 1 1 B,I,J,K,L,M 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 876 A CYS 876 1_555 A SG CYS 888 A CYS 888 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc ? metalc1 A O THR 171 A THR 171 1_564 L CA CA . B CA 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 192 A GLU 192 1_555 F CA CA . A CA 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? metalc ? metalc3 A O VAL 304 A VAL 304 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.92 ? metalc ? metalc4 A O ALA 305 A ALA 305 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc5 A O ILE 307 A ILE 307 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 309 A GLU 309 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 309 A GLU 309 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 458 A GLU 458 1_455 G CA CA . A CA 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 695 A ASP 695 1_555 G CA CA . A CA 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc10 A O LYS 712 A LYS 712 1_555 E K K . A K 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc11 A O ALA 714 A ALA 714 1_555 E K K . A K 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? metalc ? metalc12 A OE2 GLU 732 A GLU 732 1_555 E K K . A K 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.449 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASN 768 A ASN 768 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.989 ? metalc ? metalc14 A OE2 GLU 771 A GLU 771 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.573 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASN 796 A ASN 796 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? metalc ? metalc16 A OG1 THR 799 A THR 799 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 800 A ASP 800 1_555 C CA CA . A CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 800 A ASP 800 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc19 A OD2 ASP 800 A ASP 800 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.357 ? metalc ? metalc20 A OE1 GLU 908 A GLU 908 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? metalc ? metalc21 A OE2 GLU 908 A GLU 908 1_555 D CA CA . A CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.018 ? metalc ? metalc22 F CA CA . A CA 998 1_555 H CL CL . A CL 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.204 ? metalc ? metalc23 F CA CA . A CA 998 1_555 B O THR 171 B THR 171 1_546 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc24 B OE2 GLU 192 B GLU 192 1_555 L CA CA . B CA 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc25 B O VAL 304 B VAL 304 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.107 ? metalc ? metalc26 B O ALA 305 B ALA 305 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc27 B O ILE 307 B ILE 307 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? metalc ? metalc28 B OE2 GLU 309 B GLU 309 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.041 ? metalc ? metalc29 B OE1 GLU 309 B GLU 309 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.048 ? metalc ? metalc30 B O LYS 712 B LYS 712 1_555 K K K . B K 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.059 ? metalc ? metalc31 B O ALA 714 B ALA 714 1_555 K K K . B K 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.267 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASN 768 B ASN 768 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.02 ? metalc ? metalc33 B OE2 GLU 771 B GLU 771 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.302 ? metalc ? metalc34 B OD1 ASN 796 B ASN 796 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.063 ? metalc ? metalc35 B OG1 THR 799 B THR 799 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.222 ? metalc ? metalc36 B OD1 ASP 800 B ASP 800 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc37 B OD2 ASP 800 B ASP 800 1_555 I CA CA . B CA 995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.265 ? metalc ? metalc38 B OD2 ASP 800 B ASP 800 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc39 B OD1 ASP 800 B ASP 800 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc40 B OE1 GLU 908 B GLU 908 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc ? metalc41 B OE2 GLU 908 B GLU 908 1_555 J CA CA . B CA 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.151 ? metalc ? metalc42 L CA CA . B CA 998 1_555 M CL CL . B CL 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.091 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2C9M _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.015397 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.001407 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002945 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012355 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.001894 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00784 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 995 995 CA CA . D 2 CA A 1 996 996 CA CA . E 3 K A 1 997 997 K K . F 2 CA A 1 998 998 CA CA . G 2 CA A 1 999 999 CA CA . H 4 CL A 1 1000 1000 CL CL . I 2 CA B 1 995 995 CA CA . J 2 CA B 1 996 996 CA CA . K 3 K B 1 997 997 K K . L 2 CA B 1 998 998 CA CA . M 4 CL B 1 999 999 CL CL . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 7.936 _atom_site.Cartn_y 21.102 _atom_site.Cartn_z 3.778 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 39.67 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 996 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 264 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #