data_2DCB
#
_model_server_result.job_id            u6aTGq7gXTNtr7LslYgthA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-21 14:48:13' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2dcb 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":801}' 
#
_entry.id    2DCB 
#
_exptl.entry_id    2DCB 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              94.971 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'PHOSPHATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2DCB 
_cell.length_a            72.44 
_cell.length_b            72.44 
_cell.length_c            140 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2DCB 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 14 A CYS 14 1_555 A SG CYS 43 A CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 26 A CYS 26 1_555 A SG CYS 71 A CYS 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 62 A CYS 62 1_555 A SG CYS 128 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 63 A CYS 63 1_555 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 100 A CYS 100 1_555 A SG CYS 132 A CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 108 A CYS 108 1_555 A SG CYS 119 A CYS 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 A SG CYS 252 A CYS 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
covale ? covale1 A SG CYS 29 A CYS 29 1_555 C C3 76V . A 76V 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.807 ? 
#
_chem_comp.formula           'O4 P -3' 
_chem_comp.formula_weight    94.971 
_chem_comp.id                PO4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'PHOSPHATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
P O1 PO4 doub 330 n n 
P O2 PO4 sing 331 n n 
P O3 PO4 sing 332 n n 
P O4 PO4 sing 333 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2DCB 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.013805 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013805 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007143 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 PO4 A 1 801 801 PO4 PO4 . 
C 3 76V A 1 760 760 76V 76V . 
D 4 GOL A 1 500 500 GOL GOL . 
E 5 HOH A 1 802 1 HOH WAT . 
E 5 HOH A 2 803 2 HOH WAT . 
E 5 HOH A 3 804 3 HOH WAT . 
E 5 HOH A 4 805 4 HOH WAT . 
E 5 HOH A 5 806 5 HOH WAT . 
E 5 HOH A 6 807 6 HOH WAT . 
E 5 HOH A 7 808 7 HOH WAT . 
E 5 HOH A 8 809 8 HOH WAT . 
E 5 HOH A 9 810 9 HOH WAT . 
E 5 HOH A 10 811 10 HOH WAT . 
E 5 HOH A 11 812 11 HOH WAT . 
E 5 HOH A 12 813 12 HOH WAT . 
E 5 HOH A 13 814 13 HOH WAT . 
E 5 HOH A 14 815 14 HOH WAT . 
E 5 HOH A 15 816 16 HOH WAT . 
E 5 HOH A 16 817 17 HOH WAT . 
E 5 HOH A 17 818 18 HOH WAT . 
E 5 HOH A 18 819 19 HOH WAT . 
E 5 HOH A 19 820 20 HOH WAT . 
E 5 HOH A 20 821 21 HOH WAT . 
E 5 HOH A 21 822 22 HOH WAT . 
E 5 HOH A 22 823 23 HOH WAT . 
E 5 HOH A 23 824 24 HOH WAT . 
E 5 HOH A 24 825 25 HOH WAT . 
E 5 HOH A 25 826 26 HOH WAT . 
E 5 HOH A 26 827 27 HOH WAT . 
E 5 HOH A 27 828 28 HOH WAT . 
E 5 HOH A 28 829 29 HOH WAT . 
E 5 HOH A 29 830 30 HOH WAT . 
E 5 HOH A 30 831 32 HOH WAT . 
E 5 HOH A 31 832 33 HOH WAT . 
E 5 HOH A 32 833 34 HOH WAT . 
E 5 HOH A 33 834 35 HOH WAT . 
E 5 HOH A 34 835 36 HOH WAT . 
E 5 HOH A 35 836 37 HOH WAT . 
E 5 HOH A 36 837 39 HOH WAT . 
E 5 HOH A 37 838 40 HOH WAT . 
E 5 HOH A 38 839 41 HOH WAT . 
E 5 HOH A 39 840 42 HOH WAT . 
E 5 HOH A 40 841 43 HOH WAT . 
E 5 HOH A 41 842 44 HOH WAT . 
E 5 HOH A 42 843 45 HOH WAT . 
E 5 HOH A 43 844 46 HOH WAT . 
E 5 HOH A 44 845 47 HOH WAT . 
E 5 HOH A 45 846 48 HOH WAT . 
E 5 HOH A 46 847 49 HOH WAT . 
E 5 HOH A 47 848 50 HOH WAT . 
E 5 HOH A 48 849 51 HOH WAT . 
E 5 HOH A 49 850 52 HOH WAT . 
E 5 HOH A 50 851 53 HOH WAT . 
E 5 HOH A 51 852 54 HOH WAT . 
E 5 HOH A 52 853 55 HOH WAT . 
E 5 HOH A 53 854 56 HOH WAT . 
E 5 HOH A 54 855 57 HOH WAT . 
E 5 HOH A 55 856 58 HOH WAT . 
E 5 HOH A 56 857 59 HOH WAT . 
E 5 HOH A 57 858 60 HOH WAT . 
E 5 HOH A 58 859 62 HOH WAT . 
E 5 HOH A 59 860 63 HOH WAT . 
E 5 HOH A 60 861 64 HOH WAT . 
E 5 HOH A 61 862 65 HOH WAT . 
E 5 HOH A 62 863 67 HOH WAT . 
E 5 HOH A 63 864 68 HOH WAT . 
E 5 HOH A 64 865 69 HOH WAT . 
E 5 HOH A 65 866 70 HOH WAT . 
E 5 HOH A 66 867 71 HOH WAT . 
E 5 HOH A 67 868 72 HOH WAT . 
E 5 HOH A 68 869 73 HOH WAT . 
E 5 HOH A 69 870 75 HOH WAT . 
E 5 HOH A 70 871 76 HOH WAT . 
E 5 HOH A 71 872 77 HOH WAT . 
E 5 HOH A 72 873 78 HOH WAT . 
E 5 HOH A 73 874 79 HOH WAT . 
E 5 HOH A 74 875 80 HOH WAT . 
E 5 HOH A 75 876 82 HOH WAT . 
E 5 HOH A 76 877 83 HOH WAT . 
E 5 HOH A 77 878 84 HOH WAT . 
E 5 HOH A 78 879 85 HOH WAT . 
E 5 HOH A 79 880 86 HOH WAT . 
E 5 HOH A 80 881 87 HOH WAT . 
E 5 HOH A 81 882 88 HOH WAT . 
E 5 HOH A 82 883 89 HOH WAT . 
E 5 HOH A 83 884 90 HOH WAT . 
E 5 HOH A 84 885 91 HOH WAT . 
E 5 HOH A 85 886 92 HOH WAT . 
E 5 HOH A 86 887 94 HOH WAT . 
E 5 HOH A 87 888 95 HOH WAT . 
E 5 HOH A 88 889 96 HOH WAT . 
E 5 HOH A 89 890 97 HOH WAT . 
E 5 HOH A 90 891 98 HOH WAT . 
E 5 HOH A 91 892 99 HOH WAT . 
E 5 HOH A 92 893 100 HOH WAT . 
E 5 HOH A 93 894 101 HOH WAT . 
E 5 HOH A 94 895 102 HOH WAT . 
E 5 HOH A 95 896 103 HOH WAT . 
E 5 HOH A 96 897 104 HOH WAT . 
E 5 HOH A 97 898 105 HOH WAT . 
E 5 HOH A 98 899 107 HOH WAT . 
E 5 HOH A 99 900 108 HOH WAT . 
E 5 HOH A 100 901 109 HOH WAT . 
E 5 HOH A 101 902 110 HOH WAT . 
E 5 HOH A 102 903 111 HOH WAT . 
E 5 HOH A 103 904 112 HOH WAT . 
E 5 HOH A 104 905 113 HOH WAT . 
E 5 HOH A 105 906 114 HOH WAT . 
E 5 HOH A 106 907 115 HOH WAT . 
E 5 HOH A 107 908 116 HOH WAT . 
E 5 HOH A 108 909 117 HOH WAT . 
E 5 HOH A 109 910 118 HOH WAT . 
E 5 HOH A 110 911 119 HOH WAT . 
E 5 HOH A 111 912 120 HOH WAT . 
E 5 HOH A 112 913 121 HOH WAT . 
E 5 HOH A 113 914 122 HOH WAT . 
E 5 HOH A 114 915 123 HOH WAT . 
E 5 HOH A 115 916 124 HOH WAT . 
E 5 HOH A 116 917 127 HOH WAT . 
E 5 HOH A 117 918 129 HOH WAT . 
E 5 HOH A 118 919 130 HOH WAT . 
E 5 HOH A 119 920 131 HOH WAT . 
E 5 HOH A 120 921 132 HOH WAT . 
E 5 HOH A 121 922 135 HOH WAT . 
E 5 HOH A 122 923 136 HOH WAT . 
E 5 HOH A 123 924 137 HOH WAT . 
E 5 HOH A 124 925 138 HOH WAT . 
E 5 HOH A 125 926 139 HOH WAT . 
E 5 HOH A 126 927 140 HOH WAT . 
E 5 HOH A 127 928 141 HOH WAT . 
E 5 HOH A 128 929 142 HOH WAT . 
E 5 HOH A 129 930 143 HOH WAT . 
E 5 HOH A 130 931 144 HOH WAT . 
E 5 HOH A 131 932 145 HOH WAT . 
E 5 HOH A 132 933 146 HOH WAT . 
E 5 HOH A 133 934 147 HOH WAT . 
E 5 HOH A 134 935 148 HOH WAT . 
E 5 HOH A 135 936 149 HOH WAT . 
E 5 HOH A 136 937 150 HOH WAT . 
E 5 HOH A 137 938 151 HOH WAT . 
E 5 HOH A 138 939 154 HOH WAT . 
E 5 HOH A 139 940 155 HOH WAT . 
E 5 HOH A 140 941 161 HOH WAT . 
E 5 HOH A 141 942 163 HOH WAT . 
E 5 HOH A 142 943 164 HOH WAT . 
E 5 HOH A 143 944 166 HOH WAT . 
E 5 HOH A 144 945 167 HOH WAT . 
E 5 HOH A 145 946 168 HOH WAT . 
E 5 HOH A 146 947 173 HOH WAT . 
E 5 HOH A 147 948 174 HOH WAT . 
E 5 HOH A 148 949 185 HOH WAT . 
E 5 HOH A 149 950 186 HOH WAT . 
E 5 HOH A 150 951 188 HOH WAT . 
E 5 HOH A 151 952 189 HOH WAT . 
E 5 HOH A 152 953 192 HOH WAT . 
E 5 HOH A 153 954 193 HOH WAT . 
E 5 HOH A 154 955 195 HOH WAT . 
E 5 HOH A 155 956 196 HOH WAT . 
E 5 HOH A 156 957 198 HOH WAT . 
E 5 HOH A 157 958 201 HOH WAT . 
E 5 HOH A 158 959 203 HOH WAT . 
E 5 HOH A 159 960 204 HOH WAT . 
E 5 HOH A 160 961 205 HOH WAT . 
E 5 HOH A 161 962 207 HOH WAT . 
E 5 HOH A 162 963 208 HOH WAT . 
E 5 HOH A 163 964 210 HOH WAT . 
E 5 HOH A 164 965 212 HOH WAT . 
E 5 HOH A 165 966 213 HOH WAT . 
E 5 HOH A 166 967 215 HOH WAT . 
E 5 HOH A 167 968 219 HOH WAT . 
E 5 HOH A 168 969 220 HOH WAT . 
E 5 HOH A 169 970 222 HOH WAT . 
E 5 HOH A 170 971 223 HOH WAT . 
E 5 HOH A 171 972 224 HOH WAT . 
E 5 HOH A 172 973 225 HOH WAT . 
E 5 HOH A 173 974 227 HOH WAT . 
E 5 HOH A 174 975 228 HOH WAT . 
E 5 HOH A 175 976 230 HOH WAT . 
E 5 HOH A 176 977 231 HOH WAT . 
E 5 HOH A 177 978 232 HOH WAT . 
E 5 HOH A 178 979 233 HOH WAT . 
E 5 HOH A 179 980 234 HOH WAT . 
E 5 HOH A 180 981 235 HOH WAT . 
E 5 HOH A 181 982 236 HOH WAT . 
E 5 HOH A 182 983 237 HOH WAT . 
E 5 HOH A 183 984 238 HOH WAT . 
E 5 HOH A 184 985 240 HOH WAT . 
E 5 HOH A 185 986 241 HOH WAT . 
E 5 HOH A 186 987 243 HOH WAT . 
E 5 HOH A 187 988 244 HOH WAT . 
E 5 HOH A 188 989 245 HOH WAT . 
E 5 HOH A 189 990 249 HOH WAT . 
E 5 HOH A 190 991 250 HOH WAT . 
E 5 HOH A 191 992 251 HOH WAT . 
E 5 HOH A 192 993 253 HOH WAT . 
E 5 HOH A 193 994 254 HOH WAT . 
E 5 HOH A 194 995 257 HOH WAT . 
E 5 HOH A 195 996 258 HOH WAT . 
E 5 HOH A 196 997 259 HOH WAT . 
E 5 HOH A 197 998 264 HOH WAT . 
E 5 HOH A 198 999 265 HOH WAT . 
E 5 HOH A 199 1000 266 HOH WAT . 
E 5 HOH A 200 1001 267 HOH WAT . 
E 5 HOH A 201 1002 269 HOH WAT . 
E 5 HOH A 202 1003 272 HOH WAT . 
E 5 HOH A 203 1004 273 HOH WAT . 
E 5 HOH A 204 1005 274 HOH WAT . 
E 5 HOH A 205 1006 277 HOH WAT . 
E 5 HOH A 206 1007 280 HOH WAT . 
E 5 HOH A 207 1008 283 HOH WAT . 
E 5 HOH A 208 1009 284 HOH WAT . 
E 5 HOH A 209 1010 286 HOH WAT . 
E 5 HOH A 210 1011 287 HOH WAT . 
E 5 HOH A 211 1012 289 HOH WAT . 
E 5 HOH A 212 1013 292 HOH WAT . 
E 5 HOH A 213 1014 293 HOH WAT . 
E 5 HOH A 214 1015 294 HOH WAT . 
E 5 HOH A 215 1016 295 HOH WAT . 
E 5 HOH A 216 1017 296 HOH WAT . 
E 5 HOH A 217 1018 297 HOH WAT . 
E 5 HOH A 218 1019 300 HOH WAT . 
E 5 HOH A 219 1020 301 HOH WAT . 
E 5 HOH A 220 1021 302 HOH WAT . 
E 5 HOH A 221 1022 303 HOH WAT . 
E 5 HOH A 222 1023 305 HOH WAT . 
E 5 HOH A 223 1024 306 HOH WAT . 
E 5 HOH A 224 1025 307 HOH WAT . 
E 5 HOH A 225 1026 308 HOH WAT . 
E 5 HOH A 226 1027 312 HOH WAT . 
E 5 HOH A 227 1028 313 HOH WAT . 
E 5 HOH A 228 1029 314 HOH WAT . 
E 5 HOH A 229 1030 315 HOH WAT . 
E 5 HOH A 230 1031 319 HOH WAT . 
E 5 HOH A 231 1032 320 HOH WAT . 
E 5 HOH A 232 1033 321 HOH WAT . 
E 5 HOH A 233 1034 323 HOH WAT . 
E 5 HOH A 234 1035 324 HOH WAT . 
E 5 HOH A 235 1036 325 HOH WAT . 
E 5 HOH A 236 1037 327 HOH WAT . 
E 5 HOH A 237 1038 328 HOH WAT . 
E 5 HOH A 238 1039 329 HOH WAT . 
E 5 HOH A 239 1040 330 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P P PO4 . . . B 2 17.006 50.66 -2.565 1 28.49 ? P PO4 801 A 1 
HETATM 2 O O1 PO4 . . . B 2 18.452 50.782 -2.886 1 25.62 ? O1 PO4 801 A 1 
HETATM 3 O O2 PO4 . . . B 2 16.724 51.361 -1.283 1 29.79 ? O2 PO4 801 A 1 
HETATM 4 O O3 PO4 . . . B 2 16.198 51.274 -3.653 1 26.72 ? O3 PO4 801 A 1 
HETATM 5 O O4 PO4 . . . B 2 16.647 49.22 -2.434 1 26.74 ? O4 PO4 801 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              78 
_model_server_stats.parse_time_ms           7 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           274 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           5 
#