data_2DTD # _model_server_result.job_id HBBmr4tckSRailFowTwfXA _model_server_result.datetime_utc '2025-03-31 22:00:17' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2dtd # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":266}' # _entry.id 2DTD # _exptl.entry_id 2DTD _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 2DTD _cell.length_a 81.83 _cell.length_b 81.83 _cell.length_c 138.509 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2DTD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 5_555 x-y,-y,-z+1/3 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 0 46.169667 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 174 A CYS 173 1_555 A SG CYS 239 A CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 174 B CYS 173 1_555 B SG CYS 239 B CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 290 n n S O2 SO4 doub 291 n n S O3 SO4 sing 292 n n S O4 SO4 sing 293 n n # _atom_sites.entry_id 2DTD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01222 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.007055 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014111 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00722 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 SO4 A 1 264 261 SO4 SO4 . D 2 SO4 A 1 265 263 SO4 SO4 . E 2 SO4 A 1 266 265 SO4 SO4 . F 2 SO4 B 1 264 262 SO4 SO4 . G 2 SO4 B 1 265 264 SO4 SO4 . H 3 HOH A 1 301 301 HOH WAT . H 3 HOH A 2 304 304 HOH WAT . H 3 HOH A 3 305 305 HOH WAT . H 3 HOH A 4 307 307 HOH WAT . H 3 HOH A 5 308 308 HOH WAT . H 3 HOH A 6 309 309 HOH WAT . H 3 HOH A 7 310 310 HOH WAT . H 3 HOH A 8 311 311 HOH WAT . H 3 HOH A 9 313 313 HOH WAT . H 3 HOH A 10 314 314 HOH WAT . H 3 HOH A 11 315 315 HOH WAT . H 3 HOH A 12 316 316 HOH WAT . H 3 HOH A 13 319 319 HOH WAT . H 3 HOH A 14 323 323 HOH WAT . H 3 HOH A 15 324 324 HOH WAT . H 3 HOH A 16 328 328 HOH WAT . H 3 HOH A 17 329 329 HOH WAT . H 3 HOH A 18 330 330 HOH WAT . H 3 HOH A 19 332 332 HOH WAT . H 3 HOH A 20 333 333 HOH WAT . H 3 HOH A 21 339 339 HOH WAT . H 3 HOH A 22 340 340 HOH WAT . H 3 HOH A 23 341 341 HOH WAT . H 3 HOH A 24 344 344 HOH WAT . H 3 HOH A 25 346 346 HOH WAT . H 3 HOH A 26 347 347 HOH WAT . H 3 HOH A 27 349 349 HOH WAT . H 3 HOH A 28 350 350 HOH WAT . H 3 HOH A 29 353 353 HOH WAT . H 3 HOH A 30 354 354 HOH WAT . H 3 HOH A 31 355 355 HOH WAT . H 3 HOH A 32 356 356 HOH WAT . H 3 HOH A 33 358 358 HOH WAT . H 3 HOH A 34 359 359 HOH WAT . H 3 HOH A 35 360 360 HOH WAT . H 3 HOH A 36 362 362 HOH WAT . H 3 HOH A 37 364 364 HOH WAT . H 3 HOH A 38 365 365 HOH WAT . H 3 HOH A 39 367 367 HOH WAT . H 3 HOH A 40 368 368 HOH WAT . H 3 HOH A 41 369 369 HOH WAT . H 3 HOH A 42 371 371 HOH WAT . H 3 HOH A 43 376 376 HOH WAT . H 3 HOH A 44 377 377 HOH WAT . H 3 HOH A 45 382 382 HOH WAT . H 3 HOH A 46 383 383 HOH WAT . H 3 HOH A 47 384 384 HOH WAT . H 3 HOH A 48 386 386 HOH WAT . H 3 HOH A 49 387 387 HOH WAT . H 3 HOH A 50 388 388 HOH WAT . H 3 HOH A 51 389 389 HOH WAT . H 3 HOH A 52 390 390 HOH WAT . H 3 HOH A 53 391 391 HOH WAT . H 3 HOH A 54 392 392 HOH WAT . H 3 HOH A 55 393 393 HOH WAT . H 3 HOH A 56 395 395 HOH WAT . H 3 HOH A 57 398 398 HOH WAT . H 3 HOH A 58 399 399 HOH WAT . H 3 HOH A 59 403 403 HOH WAT . H 3 HOH A 60 406 406 HOH WAT . H 3 HOH A 61 407 407 HOH WAT . H 3 HOH A 62 408 408 HOH WAT . H 3 HOH A 63 409 409 HOH WAT . H 3 HOH A 64 412 412 HOH WAT . H 3 HOH A 65 416 416 HOH WAT . H 3 HOH A 66 419 419 HOH WAT . H 3 HOH A 67 420 420 HOH WAT . H 3 HOH A 68 424 424 HOH WAT . H 3 HOH A 69 425 425 HOH WAT . H 3 HOH A 70 428 428 HOH WAT . H 3 HOH A 71 429 429 HOH WAT . H 3 HOH A 72 432 432 HOH WAT . H 3 HOH A 73 434 434 HOH WAT . H 3 HOH A 74 436 436 HOH WAT . H 3 HOH A 75 437 437 HOH WAT . H 3 HOH A 76 438 438 HOH WAT . H 3 HOH A 77 439 439 HOH WAT . H 3 HOH A 78 440 440 HOH WAT . H 3 HOH A 79 441 441 HOH WAT . H 3 HOH A 80 442 442 HOH WAT . H 3 HOH A 81 445 445 HOH WAT . H 3 HOH A 82 449 449 HOH WAT . H 3 HOH A 83 450 450 HOH WAT . H 3 HOH A 84 451 451 HOH WAT . H 3 HOH A 85 452 452 HOH WAT . H 3 HOH A 86 455 455 HOH WAT . H 3 HOH A 87 457 457 HOH WAT . H 3 HOH A 88 462 462 HOH WAT . H 3 HOH A 89 463 463 HOH WAT . H 3 HOH A 90 465 465 HOH WAT . H 3 HOH A 91 468 468 HOH WAT . H 3 HOH A 92 470 470 HOH WAT . H 3 HOH A 93 471 471 HOH WAT . H 3 HOH A 94 472 472 HOH WAT . H 3 HOH A 95 475 475 HOH WAT . H 3 HOH A 96 477 477 HOH WAT . H 3 HOH A 97 479 479 HOH WAT . H 3 HOH A 98 480 480 HOH WAT . H 3 HOH A 99 481 481 HOH WAT . H 3 HOH A 100 482 482 HOH WAT . H 3 HOH A 101 484 484 HOH WAT . H 3 HOH A 102 487 487 HOH WAT . H 3 HOH A 103 488 488 HOH WAT . H 3 HOH A 104 489 489 HOH WAT . H 3 HOH A 105 490 490 HOH WAT . H 3 HOH A 106 492 492 HOH WAT . H 3 HOH A 107 494 494 HOH WAT . H 3 HOH A 108 497 497 HOH WAT . H 3 HOH A 109 499 499 HOH WAT . H 3 HOH A 110 500 500 HOH WAT . H 3 HOH A 111 503 503 HOH WAT . H 3 HOH A 112 504 504 HOH WAT . H 3 HOH A 113 509 509 HOH WAT . H 3 HOH A 114 513 513 HOH WAT . H 3 HOH A 115 515 515 HOH WAT . H 3 HOH A 116 516 516 HOH WAT . H 3 HOH A 117 522 522 HOH WAT . H 3 HOH A 118 523 523 HOH WAT . H 3 HOH A 119 524 524 HOH WAT . H 3 HOH A 120 525 525 HOH WAT . H 3 HOH A 121 526 526 HOH WAT . H 3 HOH A 122 527 527 HOH WAT . H 3 HOH A 123 528 528 HOH WAT . H 3 HOH A 124 529 529 HOH WAT . H 3 HOH A 125 530 530 HOH WAT . H 3 HOH A 126 531 531 HOH WAT . H 3 HOH A 127 532 532 HOH WAT . H 3 HOH A 128 533 533 HOH WAT . H 3 HOH A 129 534 534 HOH WAT . H 3 HOH A 130 535 535 HOH WAT . H 3 HOH A 131 536 536 HOH WAT . H 3 HOH A 132 537 537 HOH WAT . H 3 HOH A 133 538 538 HOH WAT . H 3 HOH A 134 539 539 HOH WAT . I 3 HOH B 1 302 302 HOH WAT . I 3 HOH B 2 303 303 HOH WAT . I 3 HOH B 3 306 306 HOH WAT . I 3 HOH B 4 312 312 HOH WAT . I 3 HOH B 5 317 317 HOH WAT . I 3 HOH B 6 318 318 HOH WAT . I 3 HOH B 7 320 320 HOH WAT . I 3 HOH B 8 321 321 HOH WAT . I 3 HOH B 9 322 322 HOH WAT . I 3 HOH B 10 325 325 HOH WAT . I 3 HOH B 11 326 326 HOH WAT . I 3 HOH B 12 327 327 HOH WAT . I 3 HOH B 13 331 331 HOH WAT . I 3 HOH B 14 334 334 HOH WAT . I 3 HOH B 15 335 335 HOH WAT . I 3 HOH B 16 336 336 HOH WAT . I 3 HOH B 17 337 337 HOH WAT . I 3 HOH B 18 338 338 HOH WAT . I 3 HOH B 19 342 342 HOH WAT . I 3 HOH B 20 343 343 HOH WAT . I 3 HOH B 21 345 345 HOH WAT . I 3 HOH B 22 348 348 HOH WAT . I 3 HOH B 23 351 351 HOH WAT . I 3 HOH B 24 352 352 HOH WAT . I 3 HOH B 25 357 357 HOH WAT . I 3 HOH B 26 361 361 HOH WAT . I 3 HOH B 27 363 363 HOH WAT . I 3 HOH B 28 366 366 HOH WAT . I 3 HOH B 29 370 370 HOH WAT . I 3 HOH B 30 372 372 HOH WAT . I 3 HOH B 31 373 373 HOH WAT . I 3 HOH B 32 374 374 HOH WAT . I 3 HOH B 33 375 375 HOH WAT . I 3 HOH B 34 378 378 HOH WAT . I 3 HOH B 35 379 379 HOH WAT . I 3 HOH B 36 380 380 HOH WAT . I 3 HOH B 37 381 381 HOH WAT . I 3 HOH B 38 385 385 HOH WAT . I 3 HOH B 39 394 394 HOH WAT . I 3 HOH B 40 396 396 HOH WAT . I 3 HOH B 41 397 397 HOH WAT . I 3 HOH B 42 400 400 HOH WAT . I 3 HOH B 43 401 401 HOH WAT . I 3 HOH B 44 402 402 HOH WAT . I 3 HOH B 45 404 404 HOH WAT . I 3 HOH B 46 405 405 HOH WAT . I 3 HOH B 47 410 410 HOH WAT . I 3 HOH B 48 411 411 HOH WAT . I 3 HOH B 49 413 413 HOH WAT . I 3 HOH B 50 414 414 HOH WAT . I 3 HOH B 51 415 415 HOH WAT . I 3 HOH B 52 417 417 HOH WAT . I 3 HOH B 53 418 418 HOH WAT . I 3 HOH B 54 421 421 HOH WAT . I 3 HOH B 55 422 422 HOH WAT . I 3 HOH B 56 423 423 HOH WAT . I 3 HOH B 57 426 426 HOH WAT . I 3 HOH B 58 427 427 HOH WAT . I 3 HOH B 59 430 430 HOH WAT . I 3 HOH B 60 431 431 HOH WAT . I 3 HOH B 61 433 433 HOH WAT . I 3 HOH B 62 435 435 HOH WAT . I 3 HOH B 63 443 443 HOH WAT . I 3 HOH B 64 444 444 HOH WAT . I 3 HOH B 65 446 446 HOH WAT . I 3 HOH B 66 447 447 HOH WAT . I 3 HOH B 67 448 448 HOH WAT . I 3 HOH B 68 453 453 HOH WAT . I 3 HOH B 69 454 454 HOH WAT . I 3 HOH B 70 456 456 HOH WAT . I 3 HOH B 71 458 458 HOH WAT . I 3 HOH B 72 459 459 HOH WAT . I 3 HOH B 73 460 460 HOH WAT . I 3 HOH B 74 461 461 HOH WAT . I 3 HOH B 75 464 464 HOH WAT . I 3 HOH B 76 466 466 HOH WAT . I 3 HOH B 77 467 467 HOH WAT . I 3 HOH B 78 469 469 HOH WAT . I 3 HOH B 79 473 473 HOH WAT . I 3 HOH B 80 474 474 HOH WAT . I 3 HOH B 81 476 476 HOH WAT . I 3 HOH B 82 478 478 HOH WAT . I 3 HOH B 83 483 483 HOH WAT . I 3 HOH B 84 485 485 HOH WAT . I 3 HOH B 85 486 486 HOH WAT . I 3 HOH B 86 491 491 HOH WAT . I 3 HOH B 87 493 493 HOH WAT . I 3 HOH B 88 495 495 HOH WAT . I 3 HOH B 89 496 496 HOH WAT . I 3 HOH B 90 498 498 HOH WAT . I 3 HOH B 91 501 501 HOH WAT . I 3 HOH B 92 502 502 HOH WAT . I 3 HOH B 93 505 505 HOH WAT . I 3 HOH B 94 506 506 HOH WAT . I 3 HOH B 95 507 507 HOH WAT . I 3 HOH B 96 508 508 HOH WAT . I 3 HOH B 97 510 510 HOH WAT . I 3 HOH B 98 511 511 HOH WAT . I 3 HOH B 99 512 512 HOH WAT . I 3 HOH B 100 514 514 HOH WAT . I 3 HOH B 101 517 517 HOH WAT . I 3 HOH B 102 518 518 HOH WAT . I 3 HOH B 103 519 519 HOH WAT . I 3 HOH B 104 520 520 HOH WAT . I 3 HOH B 105 521 521 HOH WAT . I 3 HOH B 106 540 540 HOH WAT . I 3 HOH B 107 541 541 HOH WAT . I 3 HOH B 108 542 542 HOH WAT . I 3 HOH B 109 543 543 HOH WAT . I 3 HOH B 110 544 544 HOH WAT . I 3 HOH B 111 545 545 HOH WAT . I 3 HOH B 112 546 546 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . E 2 30.31 -29.626 20.159 1 71.21 ? S SO4 266 A 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . E 2 30.813 -28.566 19.257 1 70.47 ? O1 SO4 266 A 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . E 2 29.471 -30.566 19.387 1 68.05 ? O2 SO4 266 A 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . E 2 31.456 -30.332 20.767 1 69.49 ? O3 SO4 266 A 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . E 2 29.496 -29.027 21.235 1 70.84 ? O4 SO4 266 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 232 _model_server_stats.encode_time_ms 17 _model_server_stats.element_count 5 #