data_2E8T
#
_model_server_result.job_id            lZX4eAB70nLj6sRO2FNNKQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 05:04:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2e8t 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":1202}' 
#
_entry.id    2E8T 
#
_exptl.entry_id    2E8T 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              398.392 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'S-[(2E,6E)-3,7,11-TRIMETHYLDODECA-2,6,10-TRIENYL] TRIHYDROGEN THIODIPHOSPHATE' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2E8T 
_cell.length_a            47.378 
_cell.length_b            116.1 
_cell.length_c            128.252 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2E8T 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 F N N 
? 4 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 80 A ASP 80 1_555 C MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 80 A ASP 80 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 84 A ASP 84 1_555 C MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 84 A ASP 84 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? 
metalc ? metalc5 K O HOH . A HOH 448 1_555 C MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc6 K O HOH . A HOH 532 1_555 C MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc7 K O HOH . A HOH 839 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? 
metalc ? metalc8 K O HOH . A HOH 840 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? 
metalc ? metalc9 F S1 FPS . A FPS 1201 1_555 C MG MG . A MG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc10 F O3B FPS . A FPS 1201 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc11 F S1 FPS . A FPS 1201 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.781 ? 
metalc ? metalc12 C MG MG . A MG 1301 1_555 D MG MG . A MG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASP 80 B ASP 80 1_555 G MG MG . B MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc14 B OD2 ASP 80 B ASP 80 1_555 H MG MG . B MG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? 
metalc ? metalc15 B OD2 ASP 84 B ASP 84 1_555 G MG MG . B MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc16 B OD2 ASP 84 B ASP 84 1_555 H MG MG . B MG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc17 L O HOH . B HOH 453 1_555 H MG MG . B MG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc18 L O HOH . B HOH 824 1_555 G MG MG . B MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc19 J O3A FPS . B FPS 1202 1_555 G MG MG . B MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc20 J O3B FPS . B FPS 1202 1_555 G MG MG . B MG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc21 J S1 FPS . B FPS 1202 1_555 H MG MG . B MG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.966 ? 
#
_chem_comp.formula           'C15 H28 O6 P2 S' 
_chem_comp.formula_weight    398.392 
_chem_comp.id                FPS 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'S-[(2E,6E)-3,7,11-TRIMETHYLDODECA-2,6,10-TRIENYL] TRIHYDROGEN THIODIPHOSPHATE' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'FARNESYL THIOPYROPHOSPHATE' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 S1 FPS sing 70 n n 
C1 C2 FPS sing 71 n n 
C1 H11 FPS sing 72 n n 
C1 H12A FPS sing 73 n n 
S1 PA FPS sing 74 n n 
C2 C3 FPS doub 75 e n 
C2 H2 FPS sing 76 n n 
C3 C4 FPS sing 77 n n 
C3 C5 FPS sing 78 n n 
C4 H41 FPS sing 79 n n 
C4 H42 FPS sing 80 n n 
C4 H43 FPS sing 81 n n 
C5 C6 FPS sing 82 n n 
C5 H51 FPS sing 83 n n 
C5 H52 FPS sing 84 n n 
C6 C7 FPS sing 85 n n 
C6 H61 FPS sing 86 n n 
C6 H62 FPS sing 87 n n 
C7 C8 FPS doub 88 e n 
C7 H7 FPS sing 89 n n 
C8 C10 FPS sing 90 n n 
C8 C9 FPS sing 91 n n 
C10 C11 FPS sing 92 n n 
C10 H101 FPS sing 93 n n 
C10 H102 FPS sing 94 n n 
C9 H91 FPS sing 95 n n 
C9 H92 FPS sing 96 n n 
C9 H93 FPS sing 97 n n 
C11 C12 FPS sing 98 n n 
C11 H111 FPS sing 99 n n 
C11 H112 FPS sing 100 n n 
C12 C13 FPS doub 101 n n 
C12 H12 FPS sing 102 n n 
C13 C14 FPS sing 103 n n 
C13 C15 FPS sing 104 n n 
C14 H141 FPS sing 105 n n 
C14 H142 FPS sing 106 n n 
C14 H143 FPS sing 107 n n 
C15 H151 FPS sing 108 n n 
C15 H152 FPS sing 109 n n 
C15 H153 FPS sing 110 n n 
PA O1A FPS doub 111 n n 
PA O2A FPS sing 112 n n 
PA O3A FPS sing 113 n n 
O2A H2A FPS sing 114 n n 
O3A PB FPS sing 115 n n 
PB O1B FPS sing 116 n n 
PB O2B FPS doub 117 n n 
PB O3B FPS sing 118 n n 
O1B H1B FPS sing 119 n n 
O3B H3B FPS sing 120 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2E8T 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.021107 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008613 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007797 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 MG A 1 1301 1301 MG MG2 . 
D 2 MG A 1 1302 1302 MG MG2 . 
E 3 IPE A 1 1001 1001 IPE IPP . 
F 4 FPS A 1 1201 1201 FPS FSP . 
G 2 MG B 1 1303 1303 MG MG2 . 
H 2 MG B 1 1304 1304 MG MG2 . 
I 3 IPE B 1 1002 1002 IPE IPP . 
J 4 FPS B 1 1202 1202 FPS FSP . 
K 5 HOH A 1 401 401 HOH WAT . 
K 5 HOH A 2 402 402 HOH WAT . 
K 5 HOH A 3 403 403 HOH WAT . 
K 5 HOH A 4 404 404 HOH WAT . 
K 5 HOH A 5 407 407 HOH WAT . 
K 5 HOH A 6 408 408 HOH WAT . 
K 5 HOH A 7 409 409 HOH WAT . 
K 5 HOH A 8 410 410 HOH WAT . 
K 5 HOH A 9 411 411 HOH WAT . 
K 5 HOH A 10 419 419 HOH WAT . 
K 5 HOH A 11 420 420 HOH WAT . 
K 5 HOH A 12 423 423 HOH WAT . 
K 5 HOH A 13 424 424 HOH WAT . 
K 5 HOH A 14 425 425 HOH WAT . 
K 5 HOH A 15 428 428 HOH WAT . 
K 5 HOH A 16 430 430 HOH WAT . 
K 5 HOH A 17 431 431 HOH WAT . 
K 5 HOH A 18 432 432 HOH WAT . 
K 5 HOH A 19 437 437 HOH WAT . 
K 5 HOH A 20 438 438 HOH WAT . 
K 5 HOH A 21 448 448 HOH WAT . 
K 5 HOH A 22 449 449 HOH WAT . 
K 5 HOH A 23 450 450 HOH WAT . 
K 5 HOH A 24 451 451 HOH WAT . 
K 5 HOH A 25 454 454 HOH WAT . 
K 5 HOH A 26 455 455 HOH WAT . 
K 5 HOH A 27 456 456 HOH WAT . 
K 5 HOH A 28 457 457 HOH WAT . 
K 5 HOH A 29 461 461 HOH WAT . 
K 5 HOH A 30 465 465 HOH WAT . 
K 5 HOH A 31 466 466 HOH WAT . 
K 5 HOH A 32 467 467 HOH WAT . 
K 5 HOH A 33 468 468 HOH WAT . 
K 5 HOH A 34 469 469 HOH WAT . 
K 5 HOH A 35 470 470 HOH WAT . 
K 5 HOH A 36 471 471 HOH WAT . 
K 5 HOH A 37 472 472 HOH WAT . 
K 5 HOH A 38 474 474 HOH WAT . 
K 5 HOH A 39 475 475 HOH WAT . 
K 5 HOH A 40 476 476 HOH WAT . 
K 5 HOH A 41 477 477 HOH WAT . 
K 5 HOH A 42 478 478 HOH WAT . 
K 5 HOH A 43 479 479 HOH WAT . 
K 5 HOH A 44 480 480 HOH WAT . 
K 5 HOH A 45 481 481 HOH WAT . 
K 5 HOH A 46 487 487 HOH WAT . 
K 5 HOH A 47 488 488 HOH WAT . 
K 5 HOH A 48 490 490 HOH WAT . 
K 5 HOH A 49 491 491 HOH WAT . 
K 5 HOH A 50 492 492 HOH WAT . 
K 5 HOH A 51 493 493 HOH WAT . 
K 5 HOH A 52 494 494 HOH WAT . 
K 5 HOH A 53 495 495 HOH WAT . 
K 5 HOH A 54 496 496 HOH WAT . 
K 5 HOH A 55 497 497 HOH WAT . 
K 5 HOH A 56 498 498 HOH WAT . 
K 5 HOH A 57 499 499 HOH WAT . 
K 5 HOH A 58 500 500 HOH WAT . 
K 5 HOH A 59 501 501 HOH WAT . 
K 5 HOH A 60 502 502 HOH WAT . 
K 5 HOH A 61 504 504 HOH WAT . 
K 5 HOH A 62 505 505 HOH WAT . 
K 5 HOH A 63 509 509 HOH WAT . 
K 5 HOH A 64 510 510 HOH WAT . 
K 5 HOH A 65 511 511 HOH WAT . 
K 5 HOH A 66 513 513 HOH WAT . 
K 5 HOH A 67 515 515 HOH WAT . 
K 5 HOH A 68 516 516 HOH WAT . 
K 5 HOH A 69 519 519 HOH WAT . 
K 5 HOH A 70 521 521 HOH WAT . 
K 5 HOH A 71 525 525 HOH WAT . 
K 5 HOH A 72 526 526 HOH WAT . 
K 5 HOH A 73 527 527 HOH WAT . 
K 5 HOH A 74 528 528 HOH WAT . 
K 5 HOH A 75 529 529 HOH WAT . 
K 5 HOH A 76 532 532 HOH WAT . 
K 5 HOH A 77 533 533 HOH WAT . 
K 5 HOH A 78 534 534 HOH WAT . 
K 5 HOH A 79 537 537 HOH WAT . 
K 5 HOH A 80 538 538 HOH WAT . 
K 5 HOH A 81 539 539 HOH WAT . 
K 5 HOH A 82 541 541 HOH WAT . 
K 5 HOH A 83 544 544 HOH WAT . 
K 5 HOH A 84 545 545 HOH WAT . 
K 5 HOH A 85 549 549 HOH WAT . 
K 5 HOH A 86 551 551 HOH WAT . 
K 5 HOH A 87 554 554 HOH WAT . 
K 5 HOH A 88 556 556 HOH WAT . 
K 5 HOH A 89 557 557 HOH WAT . 
K 5 HOH A 90 559 559 HOH WAT . 
K 5 HOH A 91 560 560 HOH WAT . 
K 5 HOH A 92 562 562 HOH WAT . 
K 5 HOH A 93 563 563 HOH WAT . 
K 5 HOH A 94 564 564 HOH WAT . 
K 5 HOH A 95 566 566 HOH WAT . 
K 5 HOH A 96 567 567 HOH WAT . 
K 5 HOH A 97 568 568 HOH WAT . 
K 5 HOH A 98 570 570 HOH WAT . 
K 5 HOH A 99 576 576 HOH WAT . 
K 5 HOH A 100 579 579 HOH WAT . 
K 5 HOH A 101 580 580 HOH WAT . 
K 5 HOH A 102 581 581 HOH WAT . 
K 5 HOH A 103 582 582 HOH WAT . 
K 5 HOH A 104 585 585 HOH WAT . 
K 5 HOH A 105 586 586 HOH WAT . 
K 5 HOH A 106 588 588 HOH WAT . 
K 5 HOH A 107 589 589 HOH WAT . 
K 5 HOH A 108 591 591 HOH WAT . 
K 5 HOH A 109 592 592 HOH WAT . 
K 5 HOH A 110 594 594 HOH WAT . 
K 5 HOH A 111 596 596 HOH WAT . 
K 5 HOH A 112 597 597 HOH WAT . 
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K 5 HOH A 116 606 606 HOH WAT . 
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