data_2F2P # _model_server_result.job_id LKAsHQOdYso55QjqvWpGtw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 15:53:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2f2p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1003}' # _entry.id 2F2P # _exptl.entry_id 2F2P _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 2F2P _cell.length_a 139.549 _cell.length_b 139.549 _cell.length_c 45.592 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2F2P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 150 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 3 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 6_555 -x,-x+y,-z -0.5 -0.866025 0 -0.866025 0.5 0 0 0 -1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 21 A ASP 20 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 23 A ASP 22 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.97 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 23 A ASP 22 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 25 A ASP 24 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 25 A ASP 24 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.208 ? metalc ? metalc6 A O THR 27 A THR 26 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 32 A GLU 31 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 32 A GLU 31 1_555 C CA CA . A CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 57 A ASP 56 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 59 A ASP 58 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.074 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 59 A ASP 58 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.933 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASN 61 A ASN 60 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.939 ? metalc ? metalc13 A ND2 ASN 61 A ASN 60 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.242 ? metalc ? metalc14 A O THR 63 A THR 62 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc15 A OE2 GLU 68 A GLU 67 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc16 A OE1 GLU 68 A GLU 67 1_555 D CA CA . A CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 94 A ASP 93 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 96 A ASP 95 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? metalc ? metalc19 A OD2 ASP 96 A ASP 95 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? metalc ? metalc20 A ND2 ASN 98 A ASN 97 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc21 A O TYR 100 A TYR 99 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc22 A OE1 GLU 105 A GLU 104 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc23 A OE2 GLU 105 A GLU 104 1_555 E CA CA . A CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.758 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 130 A ASP 129 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc25 A OD2 ASP 132 A ASP 131 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.227 ? metalc ? metalc26 A OD1 ASP 132 A ASP 131 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? metalc ? metalc27 A OD2 ASP 134 A ASP 133 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.116 ? metalc ? metalc28 A OD1 ASP 134 A ASP 133 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? metalc ? metalc29 A O GLN 136 A GLN 135 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc30 A OE2 GLU 141 A GLU 140 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc ? metalc31 A OE1 GLU 141 A GLU 140 1_555 F CA CA . A CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.12 ? metalc ? metalc32 B OD2 ASP 21 B ASP 20 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 23 B ASP 22 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc34 B OD2 ASP 25 B ASP 24 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 25 B ASP 24 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc ? metalc36 B O THR 27 B THR 26 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc37 B OE1 GLU 32 B GLU 31 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc38 B OE2 GLU 32 B GLU 31 1_555 G CA CA . B CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? metalc ? metalc39 B OD2 ASP 57 B ASP 56 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc ? metalc40 B OD1 ASP 59 B ASP 58 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? metalc ? metalc41 B OD2 ASP 59 B ASP 58 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? metalc ? metalc42 B OD1 ASN 61 B ASN 60 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? metalc ? metalc43 B ND2 ASN 61 B ASN 60 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.206 ? metalc ? metalc44 B O THR 63 B THR 62 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc45 B OE1 GLU 68 B GLU 67 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.781 ? metalc ? metalc46 B OE2 GLU 68 B GLU 67 1_555 H CA CA . B CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc47 B OD2 ASP 94 B ASP 93 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc ? metalc48 B OD1 ASP 96 B ASP 95 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc49 B OD2 ASP 96 B ASP 95 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.185 ? metalc ? metalc50 B ND2 ASN 98 B ASN 97 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc51 B OD1 ASN 98 B ASN 97 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.219 ? metalc ? metalc52 B O TYR 100 B TYR 99 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc53 B OE2 GLU 105 B GLU 104 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc54 B OE1 GLU 105 B GLU 104 1_555 I CA CA . B CA 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc55 B OD1 ASP 130 B ASP 129 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc56 B OD2 ASP 132 B ASP 131 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc57 B OD1 ASP 132 B ASP 131 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? metalc ? metalc58 B OD1 ASP 134 B ASP 133 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc59 B O GLN 136 B GLN 135 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? metalc ? metalc60 B OE1 GLU 141 B GLU 140 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? metalc ? metalc61 B OE2 GLU 141 B GLU 140 1_555 J CA CA . B CA 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2F2P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007166 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004137 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008275 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.021934 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 1001 1001 CA CA . D 2 CA A 1 1002 1002 CA CA . E 2 CA A 1 1003 1003 CA CA . F 2 CA A 1 1004 1004 CA CA . G 2 CA B 1 1001 1001 CA CA . H 2 CA B 1 1002 1002 CA CA . I 2 CA B 1 1003 1003 CA CA . J 2 CA B 1 1004 1004 CA CA . K 3 HOH A 1 1005 5 HOH HOH . K 3 HOH A 2 1006 6 HOH HOH . K 3 HOH A 3 1007 7 HOH HOH . K 3 HOH A 4 1008 13 HOH HOH . K 3 HOH A 5 1009 15 HOH HOH . K 3 HOH A 6 1010 18 HOH HOH . K 3 HOH A 7 1011 19 HOH HOH . K 3 HOH A 8 1012 20 HOH HOH . K 3 HOH A 9 1013 23 HOH HOH . K 3 HOH A 10 1014 26 HOH HOH . K 3 HOH A 11 1015 29 HOH HOH . K 3 HOH A 12 1016 30 HOH HOH . K 3 HOH A 13 1017 32 HOH HOH . L 3 HOH B 1 1005 1 HOH HOH . L 3 HOH B 2 1006 2 HOH HOH . L 3 HOH B 3 1007 3 HOH HOH . L 3 HOH B 4 1008 8 HOH HOH . L 3 HOH B 5 1009 10 HOH HOH . L 3 HOH B 6 1010 11 HOH HOH . L 3 HOH B 7 1011 12 HOH HOH . L 3 HOH B 8 1012 14 HOH HOH . L 3 HOH B 9 1013 16 HOH HOH . L 3 HOH B 10 1014 17 HOH HOH . L 3 HOH B 11 1015 21 HOH HOH . L 3 HOH B 12 1016 22 HOH HOH . L 3 HOH B 13 1017 24 HOH HOH . L 3 HOH B 14 1018 25 HOH HOH . L 3 HOH B 15 1019 27 HOH HOH . L 3 HOH B 16 1020 31 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -54.124 _atom_site.Cartn_y 32.515 _atom_site.Cartn_z 18.299 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 40.26 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1003 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #