data_2FAD # _model_server_result.job_id l4GFgfdUsNLA-Pmy2gaPlA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-15 11:19:39' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2fad # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":404}' # _entry.id 2FAD # _exptl.entry_id 2FAD _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2FAD _cell.length_a 49.257 _cell.length_b 106.244 _cell.length_c 28.195 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2FAD _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,G,H,I,J,K,N 1 1 B,L,M,O 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O 3 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_665 -x+1,-y+1,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 49.257 106.244 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A OG SER 36 A SER 36 1_555 K P24 PM5 . A PM5 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.547 ? covale ? covale2 B OG SER 36 B SER 36 1_555 M P24 PM5 . B PM5 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.546 ? metalc ? metalc1 A N SER 1 A SER 1 1_555 C NA NA . A NA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc2 A O SER 1 A SER 1 1_555 C NA NA . A NA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 5 A GLU 5 1_555 D ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 21 A GLU 21 1_555 E ZN ZN . A ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 35 A ASP 35 1_555 F ZN ZN . A ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.847 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 48 A GLU 48 1_555 H ZN ZN . A ZN 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 56 A ASP 56 1_555 G ZN ZN . A ZN 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 57 A GLU 57 1_555 J ZN ZN . A ZN 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 60 A GLU 60 1_555 J ZN ZN . A ZN 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc10 A OXT ALA 77 A ALA 77 1_555 I ZN ZN . A ZN 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc11 C NA NA . A NA 401 1_555 B OD2 ASP 51 B ASP 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? metalc ? metalc12 C NA NA . A NA 401 1_555 O O HOH . B HOH 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc13 D ZN ZN . A ZN 402 1_555 B OE2 GLU 48 B GLU 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? metalc ? metalc14 D ZN ZN . A ZN 402 1_555 O O HOH . B HOH 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc ? metalc15 E ZN ZN . A ZN 403 1_555 N O HOH . A HOH 459 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? metalc ? metalc16 F ZN ZN . A ZN 404 1_555 N O HOH . A HOH 464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc17 F ZN ZN . A ZN 404 1_555 N O HOH . A HOH 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc18 G ZN ZN . A ZN 405 1_555 N O HOH . A HOH 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc19 G ZN ZN . A ZN 405 1_555 N O HOH . A HOH 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc20 H ZN ZN . A ZN 406 1_555 B OE2 GLU 5 B GLU 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc21 H ZN ZN . A ZN 406 1_555 O O HOH . B HOH 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc22 I ZN ZN . A ZN 407 1_555 N O HOH . A HOH 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? metalc ? metalc23 I ZN ZN . A ZN 407 1_555 N O HOH . A HOH 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc24 I ZN ZN . A ZN 407 1_555 N O HOH . A HOH 496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2FAD _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.020302 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009412 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.035467 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 NA A 1 401 401 NA NA . D 3 ZN A 1 402 402 ZN ZN . E 3 ZN A 1 403 403 ZN ZN . F 3 ZN A 1 404 404 ZN ZN . G 3 ZN A 1 405 405 ZN ZN . H 3 ZN A 1 406 406 ZN ZN . I 3 ZN A 1 407 407 ZN ZN . J 3 ZN A 1 408 408 ZN ZN . K 4 PM5 A 1 301 301 PM5 PM5 . L 3 ZN B 1 409 409 ZN ZN . M 4 PM5 B 1 302 302 PM5 PM5 . N 5 HOH A 1 409 4 HOH WAT . N 5 HOH A 2 410 5 HOH WAT . N 5 HOH A 3 411 6 HOH WAT . N 5 HOH A 4 412 7 HOH WAT . N 5 HOH A 5 413 8 HOH WAT . N 5 HOH A 6 414 10 HOH WAT . N 5 HOH A 7 415 12 HOH WAT . N 5 HOH A 8 416 13 HOH WAT . N 5 HOH A 9 417 14 HOH WAT . N 5 HOH A 10 418 15 HOH WAT . N 5 HOH A 11 419 16 HOH WAT . N 5 HOH A 12 420 17 HOH WAT . N 5 HOH A 13 421 18 HOH WAT . N 5 HOH A 14 422 20 HOH WAT . N 5 HOH A 15 423 21 HOH WAT . N 5 HOH A 16 424 23 HOH WAT . N 5 HOH A 17 425 24 HOH WAT . N 5 HOH A 18 426 26 HOH WAT . N 5 HOH A 19 427 27 HOH WAT . N 5 HOH A 20 428 30 HOH WAT . N 5 HOH A 21 429 32 HOH WAT . N 5 HOH A 22 430 33 HOH WAT . N 5 HOH A 23 431 34 HOH WAT . N 5 HOH A 24 432 39 HOH WAT . N 5 HOH A 25 433 41 HOH WAT . N 5 HOH A 26 434 42 HOH WAT . N 5 HOH A 27 435 43 HOH WAT . N 5 HOH A 28 436 45 HOH WAT . N 5 HOH A 29 437 46 HOH WAT . N 5 HOH A 30 438 47 HOH WAT . N 5 HOH A 31 439 48 HOH WAT . N 5 HOH A 32 440 49 HOH WAT . N 5 HOH A 33 441 50 HOH WAT . N 5 HOH A 34 442 51 HOH WAT . N 5 HOH A 35 443 52 HOH WAT . N 5 HOH A 36 444 64 HOH WAT . N 5 HOH A 37 445 65 HOH WAT . N 5 HOH A 38 446 66 HOH WAT . N 5 HOH A 39 447 67 HOH WAT . N 5 HOH A 40 448 68 HOH WAT . N 5 HOH A 41 449 69 HOH WAT . N 5 HOH A 42 450 70 HOH WAT . N 5 HOH A 43 451 72 HOH WAT . N 5 HOH A 44 452 74 HOH WAT . N 5 HOH A 45 453 75 HOH WAT . N 5 HOH A 46 454 76 HOH WAT . N 5 HOH A 47 455 77 HOH WAT . N 5 HOH A 48 456 78 HOH WAT . N 5 HOH A 49 457 79 HOH WAT . N 5 HOH A 50 458 80 HOH WAT . N 5 HOH A 51 459 81 HOH WAT . N 5 HOH A 52 460 82 HOH WAT . N 5 HOH A 53 461 87 HOH WAT . N 5 HOH A 54 462 88 HOH WAT . N 5 HOH A 55 463 89 HOH WAT . N 5 HOH A 56 464 90 HOH WAT . N 5 HOH A 57 465 92 HOH WAT . N 5 HOH A 58 466 93 HOH WAT . N 5 HOH A 59 467 94 HOH WAT . N 5 HOH A 60 468 100 HOH WAT . N 5 HOH A 61 469 101 HOH WAT . N 5 HOH A 62 470 103 HOH WAT . N 5 HOH A 63 471 104 HOH WAT . N 5 HOH A 64 472 124 HOH WAT . N 5 HOH A 65 473 129 HOH WAT . N 5 HOH A 66 474 130 HOH WAT . N 5 HOH A 67 475 131 HOH WAT . N 5 HOH A 68 476 132 HOH WAT . N 5 HOH A 69 477 133 HOH WAT . N 5 HOH A 70 478 134 HOH WAT . N 5 HOH A 71 479 135 HOH WAT . N 5 HOH A 72 480 136 HOH WAT . N 5 HOH A 73 481 137 HOH WAT . N 5 HOH A 74 482 139 HOH WAT . N 5 HOH A 75 483 140 HOH WAT . N 5 HOH A 76 484 141 HOH WAT . N 5 HOH A 77 485 142 HOH WAT . N 5 HOH A 78 486 143 HOH WAT . N 5 HOH A 79 487 144 HOH WAT . N 5 HOH A 80 488 145 HOH WAT . N 5 HOH A 81 489 146 HOH WAT . N 5 HOH A 82 490 147 HOH WAT . N 5 HOH A 83 491 148 HOH WAT . N 5 HOH A 84 492 149 HOH WAT . N 5 HOH A 85 493 151 HOH WAT . N 5 HOH A 86 494 152 HOH WAT . N 5 HOH A 87 495 153 HOH WAT . N 5 HOH A 88 496 154 HOH WAT . N 5 HOH A 89 497 159 HOH WAT . N 5 HOH A 90 498 163 HOH WAT . N 5 HOH A 91 499 166 HOH WAT . N 5 HOH A 92 500 168 HOH WAT . N 5 HOH A 93 501 170 HOH WAT . N 5 HOH A 94 502 171 HOH WAT . N 5 HOH A 95 503 172 HOH WAT . N 5 HOH A 96 504 174 HOH WAT . N 5 HOH A 97 505 187 HOH WAT . N 5 HOH A 98 506 188 HOH WAT . N 5 HOH A 99 507 189 HOH WAT . N 5 HOH A 100 508 190 HOH WAT . N 5 HOH A 101 509 191 HOH WAT . N 5 HOH A 102 510 192 HOH WAT . N 5 HOH A 103 511 198 HOH WAT . N 5 HOH A 104 512 202 HOH WAT . N 5 HOH A 105 513 208 HOH WAT . N 5 HOH A 106 514 1000 HOH WAT . N 5 HOH A 107 515 1001 HOH WAT . N 5 HOH A 108 516 1002 HOH WAT . N 5 HOH A 109 517 1003 HOH WAT . N 5 HOH A 110 518 1004 HOH WAT . N 5 HOH A 111 519 1005 HOH WAT . N 5 HOH A 112 520 1006 HOH WAT . N 5 HOH A 113 521 1007 HOH WAT . N 5 HOH A 114 522 1008 HOH WAT . N 5 HOH A 115 523 1020 HOH WAT . N 5 HOH A 116 524 1022 HOH WAT . N 5 HOH A 117 525 1031 HOH WAT . N 5 HOH A 118 526 1034 HOH WAT . N 5 HOH A 119 527 1035 HOH WAT . N 5 HOH A 120 528 1036 HOH WAT . N 5 HOH A 121 529 1037 HOH WAT . N 5 HOH A 122 530 1039 HOH WAT . O 5 HOH B 1 410 3 HOH WAT . O 5 HOH B 2 411 9 HOH WAT . O 5 HOH B 3 412 11 HOH WAT . O 5 HOH B 4 413 36 HOH WAT . O 5 HOH B 5 414 37 HOH WAT . O 5 HOH B 6 415 38 HOH WAT . O 5 HOH B 7 416 53 HOH WAT . O 5 HOH B 8 417 54 HOH WAT . O 5 HOH B 9 418 56 HOH WAT . O 5 HOH B 10 419 57 HOH WAT . O 5 HOH B 11 420 58 HOH WAT . O 5 HOH B 12 421 59 HOH WAT . O 5 HOH B 13 422 60 HOH WAT . O 5 HOH B 14 423 61 HOH WAT . O 5 HOH B 15 424 62 HOH WAT . O 5 HOH B 16 425 63 HOH WAT . O 5 HOH B 17 426 71 HOH WAT . O 5 HOH B 18 427 73 HOH WAT . O 5 HOH B 19 428 95 HOH WAT . O 5 HOH B 20 429 102 HOH WAT . O 5 HOH B 21 430 105 HOH WAT . O 5 HOH B 22 431 106 HOH WAT . O 5 HOH B 23 432 107 HOH WAT . O 5 HOH B 24 433 108 HOH WAT . O 5 HOH B 25 434 109 HOH WAT . O 5 HOH B 26 435 110 HOH WAT . O 5 HOH B 27 436 111 HOH WAT . O 5 HOH B 28 437 112 HOH WAT . O 5 HOH B 29 438 113 HOH WAT . O 5 HOH B 30 439 120 HOH WAT . O 5 HOH B 31 440 121 HOH WAT . O 5 HOH B 32 441 122 HOH WAT . O 5 HOH B 33 442 123 HOH WAT . O 5 HOH B 34 443 125 HOH WAT . O 5 HOH B 35 444 126 HOH WAT . O 5 HOH B 36 445 127 HOH WAT . O 5 HOH B 37 446 128 HOH WAT . O 5 HOH B 38 447 138 HOH WAT . O 5 HOH B 39 448 157 HOH WAT . O 5 HOH B 40 449 158 HOH WAT . O 5 HOH B 41 450 162 HOH WAT . O 5 HOH B 42 451 175 HOH WAT . O 5 HOH B 43 452 176 HOH WAT . O 5 HOH B 44 453 177 HOH WAT . O 5 HOH B 45 454 178 HOH WAT . O 5 HOH B 46 455 179 HOH WAT . O 5 HOH B 47 456 180 HOH WAT . O 5 HOH B 48 457 181 HOH WAT . O 5 HOH B 49 458 193 HOH WAT . O 5 HOH B 50 459 199 HOH WAT . O 5 HOH B 51 460 200 HOH WAT . O 5 HOH B 52 461 201 HOH WAT . O 5 HOH B 53 462 203 HOH WAT . O 5 HOH B 54 463 204 HOH WAT . O 5 HOH B 55 464 205 HOH WAT . O 5 HOH B 56 465 206 HOH WAT . O 5 HOH B 57 466 207 HOH WAT . O 5 HOH B 58 467 1023 HOH WAT . O 5 HOH B 59 468 1024 HOH WAT . O 5 HOH B 60 469 1025 HOH WAT . O 5 HOH B 61 470 1026 HOH WAT . O 5 HOH B 62 471 1027 HOH WAT . O 5 HOH B 63 472 1028 HOH WAT . O 5 HOH B 64 473 1029 HOH WAT . O 5 HOH B 65 474 1030 HOH WAT . O 5 HOH B 66 475 1032 HOH WAT . O 5 HOH B 67 476 1033 HOH WAT . O 5 HOH B 68 477 1038 HOH WAT . O 5 HOH B 69 478 1040 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 17.824 _atom_site.Cartn_y 24.236 _atom_site.Cartn_z 18.959 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 17.41 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 404 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #