data_2FFL # _model_server_result.job_id ieX0U_uc883aQgDFjGjHGg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 16:04:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2ffl # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"QA","auth_seq_id":5038}' # _entry.id 2FFL # _exptl.entry_id 2FFL _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 54.938 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MANGANESE (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 39 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2FFL _cell.length_a 155.515 _cell.length_b 174.101 _cell.length_c 152.91 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2FFL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,RA 1 1 B,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,SA 2 1 C,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,TA 3 1 D,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,UA 4 1 A,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,RA 5 1 B,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,SA 5 2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 3_555 -x+1/2,y+1/2,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 77.7575 87.0505 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N ? 2 GA N N ? 2 HA N N ? 2 IA N N ? 2 JA N N ? 2 KA N N ? 2 LA N N ? 2 MA N N ? 2 NA N N ? 2 OA N N ? 2 PA N N ? 2 QA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NE2 HIS 94 A HIS 92 1_555 I MN MN . A MN 5005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 206 A HIS 204 1_555 L MN MN . A MN 5026 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 338 A GLU 336 1_555 F MN MN . A MN 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 409 A GLU 407 1_555 F MN MN . A MN 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 465 A HIS 463 2_565 EA MN MN . C MN 5019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 497 A ASP 495 1_555 K MN MN . A MN 5013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc7 A NE2 HIS 515 A HIS 513 1_555 J MN MN . A MN 5006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 651 A GLU 649 1_555 E MN MN . A MN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 655 A ASP 653 1_555 G MN MN . A MN 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 716 A ASP 714 1_555 V MN MN . B MN 5012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 722 A ASP 720 1_555 E MN MN . A MN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 725 A GLU 723 1_555 E MN MN . A MN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc13 F MN MN . A MN 5002 1_555 RA O HOH . A HOH 5039 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc ? metalc14 K MN MN . A MN 5013 1_555 B OD2 ASP 716 B ASP 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? metalc ? metalc15 B NE2 HIS 94 B HIS 92 1_555 U MN MN . B MN 5011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc16 B NE2 HIS 206 B HIS 204 1_555 W MN MN . B MN 5028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc17 B OE1 GLU 338 B GLU 336 1_555 R MN MN . B MN 5008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? metalc ? metalc18 B OE1 GLU 409 B GLU 407 1_555 R MN MN . B MN 5008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc19 B OE2 GLU 493 B GLU 491 1_555 V MN MN . B MN 5012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASP 497 B ASP 495 1_555 V MN MN . B MN 5012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc21 B OE2 GLU 651 B GLU 649 1_555 Q MN MN . B MN 5007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc22 B OD1 ASP 655 B ASP 653 1_555 S MN MN . B MN 5009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc23 B OE2 GLU 686 B GLU 684 1_555 S MN MN . B MN 5009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc24 B OD1 ASP 722 B ASP 720 1_555 Q MN MN . B MN 5007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc25 B OE1 GLU 725 B GLU 723 1_555 Q MN MN . B MN 5007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc26 R MN MN . B MN 5008 1_555 SA O HOH . B HOH 5047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc27 V MN MN . B MN 5012 1_555 D NE2 HIS 465 D HIS 463 4_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc28 C NE2 HIS 94 C HIS 92 1_555 DA MN MN . C MN 5018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc29 C NE2 HIS 206 C HIS 204 1_555 IA MN MN . C MN 5036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? metalc ? metalc30 C OE1 GLU 338 C GLU 336 1_555 AA MN MN . C MN 5015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc31 C OE1 GLU 409 C GLU 407 1_555 AA MN MN . C MN 5015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc32 C OD1 ASP 497 C ASP 495 1_555 EA MN MN . C MN 5019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc33 C OE2 GLU 651 C GLU 649 1_555 Z MN MN . C MN 5014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? metalc ? metalc34 C OD2 ASP 655 C ASP 653 1_555 BA MN MN . C MN 5016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? metalc ? metalc35 C OD1 ASP 655 C ASP 653 1_555 BA MN MN . C MN 5016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc36 C N THR 672 C THR 670 1_555 GA MN MN . C MN 5030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc37 C OD2 ASP 716 C ASP 714 1_555 FA MN MN . C MN 5025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? metalc ? metalc38 C OD1 ASP 722 C ASP 720 1_555 Z MN MN . C MN 5014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc39 C OE1 GLU 725 C GLU 723 1_555 Z MN MN . C MN 5014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc40 EA MN MN . C MN 5019 1_555 D OD2 ASP 716 D ASP 714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc41 FA MN MN . C MN 5025 1_555 D OD1 ASP 497 D ASP 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc42 D OE1 GLU 338 D GLU 336 1_555 KA MN MN . D MN 5021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc43 D OE1 GLU 409 D GLU 407 1_555 KA MN MN . D MN 5021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? metalc ? metalc44 D NE2 HIS 612 D HIS 610 1_555 PA MN MN . D MN 5035 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc45 D NE2 GLN 616 D GLN 614 1_555 PA MN MN . D MN 5035 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc46 D OE2 GLU 651 D GLU 649 1_555 JA MN MN . D MN 5020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? metalc ? metalc47 D OD2 ASP 655 D ASP 653 1_555 LA MN MN . D MN 5022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc48 D OD1 ASP 655 D ASP 653 1_555 LA MN MN . D MN 5022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? metalc ? metalc49 D OD1 ASP 722 D ASP 720 1_555 JA MN MN . D MN 5020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc50 D OE1 GLU 725 D GLU 723 1_555 JA MN MN . D MN 5020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc51 JA MN MN . D MN 5020 1_555 UA O HOH . D HOH 5045 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? # _chem_comp.formula 'Mn 2' _chem_comp.formula_weight 54.938 _chem_comp.id MN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MANGANESE (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2FFL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00643 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00574 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00654 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 MN A 1 5001 5001 MN MN . F 2 MN A 1 5002 5002 MN MN . G 2 MN A 1 5003 5003 MN MN . H 2 MN A 1 5004 5004 MN MN . I 2 MN A 1 5005 5005 MN MN . J 2 MN A 1 5006 5006 MN MN . K 2 MN A 1 5013 5013 MN MN . L 2 MN A 1 5026 5026 MN MN . M 2 MN A 1 5027 5027 MN MN . N 2 MN A 1 5029 5029 MN MN . O 2 MN A 1 5033 5033 MN MN . P 2 MN A 1 5034 5034 MN MN . Q 2 MN B 1 5007 5007 MN MN . R 2 MN B 1 5008 5008 MN MN . S 2 MN B 1 5009 5009 MN MN . T 2 MN B 1 5010 5010 MN MN . U 2 MN B 1 5011 5011 MN MN . V 2 MN B 1 5012 5012 MN MN . W 2 MN B 1 5028 5028 MN MN . X 2 MN B 1 5037 5037 MN MN . Y 2 MN B 1 5039 5039 MN MN . Z 2 MN C 1 5014 5014 MN MN . AA 2 MN C 1 5015 5015 MN MN . BA 2 MN C 1 5016 5016 MN MN . CA 2 MN C 1 5017 5017 MN MN . DA 2 MN C 1 5018 5018 MN MN . EA 2 MN C 1 5019 5019 MN MN . FA 2 MN C 1 5025 5025 MN MN . GA 2 MN C 1 5030 5030 MN MN . HA 2 MN C 1 5032 5032 MN MN . IA 2 MN C 1 5036 5036 MN MN . JA 2 MN D 1 5020 5020 MN MN . KA 2 MN D 1 5021 5021 MN MN . LA 2 MN D 1 5022 5022 MN MN . MA 2 MN D 1 5023 5023 MN MN . NA 2 MN D 1 5024 5024 MN MN . OA 2 MN D 1 5031 5031 MN MN . PA 2 MN D 1 5035 5035 MN MN . QA 2 MN D 1 5038 5038 MN MN . RA 3 HOH A 1 5035 1 HOH HOH . RA 3 HOH A 2 5036 2 HOH HOH . RA 3 HOH A 3 5037 7 HOH HOH . RA 3 HOH A 4 5038 10 HOH HOH . RA 3 HOH A 5 5039 18 HOH HOH . RA 3 HOH A 6 5040 21 HOH HOH . RA 3 HOH A 7 5041 24 HOH HOH . RA 3 HOH A 8 5042 32 HOH HOH . RA 3 HOH A 9 5043 33 HOH HOH . RA 3 HOH A 10 5044 36 HOH HOH . RA 3 HOH A 11 5045 39 HOH HOH . RA 3 HOH A 12 5046 40 HOH HOH . RA 3 HOH A 13 5047 41 HOH HOH . RA 3 HOH A 14 5048 42 HOH HOH . RA 3 HOH A 15 5049 47 HOH HOH . RA 3 HOH A 16 5050 49 HOH HOH . RA 3 HOH A 17 5051 51 HOH HOH . SA 3 HOH B 1 5040 5 HOH HOH . SA 3 HOH B 2 5041 8 HOH HOH . SA 3 HOH B 3 5042 11 HOH HOH . SA 3 HOH B 4 5043 12 HOH HOH . SA 3 HOH B 5 5044 13 HOH HOH . SA 3 HOH B 6 5045 14 HOH HOH . SA 3 HOH B 7 5046 16 HOH HOH . SA 3 HOH B 8 5047 17 HOH HOH . SA 3 HOH B 9 5048 19 HOH HOH . SA 3 HOH B 10 5049 20 HOH HOH . SA 3 HOH B 11 5050 25 HOH HOH . SA 3 HOH B 12 5051 27 HOH HOH . SA 3 HOH B 13 5052 30 HOH HOH . SA 3 HOH B 14 5053 31 HOH HOH . SA 3 HOH B 15 5054 34 HOH HOH . SA 3 HOH B 16 5055 35 HOH HOH . SA 3 HOH B 17 5056 38 HOH HOH . SA 3 HOH B 18 5057 44 HOH HOH . SA 3 HOH B 19 5058 45 HOH HOH . SA 3 HOH B 20 5059 46 HOH HOH . SA 3 HOH B 21 5060 53 HOH HOH . TA 3 HOH C 1 5037 3 HOH HOH . TA 3 HOH C 2 5038 9 HOH HOH . TA 3 HOH C 3 5039 15 HOH HOH . TA 3 HOH C 4 5040 23 HOH HOH . TA 3 HOH C 5 5041 28 HOH HOH . TA 3 HOH C 6 5042 50 HOH HOH . TA 3 HOH C 7 5043 52 HOH HOH . UA 3 HOH D 1 5039 4 HOH HOH . UA 3 HOH D 2 5040 6 HOH HOH . UA 3 HOH D 3 5041 22 HOH HOH . UA 3 HOH D 4 5042 26 HOH HOH . UA 3 HOH D 5 5043 29 HOH HOH . UA 3 HOH D 6 5044 37 HOH HOH . UA 3 HOH D 7 5045 43 HOH HOH . UA 3 HOH D 8 5046 48 HOH HOH . UA 3 HOH D 9 5047 54 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MN _atom_site.label_atom_id MN _atom_site.label_comp_id MN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id QA _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 3.712 _atom_site.Cartn_y 71.521 _atom_site.Cartn_z -33.786 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 88.04 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MN _atom_site.auth_comp_id MN _atom_site.auth_seq_id 5038 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 18 _model_server_stats.query_time_ms 256 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #