data_2H2D # _model_server_result.job_id 1YscUJls52_5LLjw1ODBRQ _model_server_result.datetime_utc '2025-03-05 23:03:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2h2d # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 2H2D # _exptl.entry_id 2H2D _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2H2D _cell.length_a 45.222 _cell.length_b 58.698 _cell.length_c 104.463 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2H2D _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B C LYS 10 B LYS 10 1_555 B N ALY 11 B ALY 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale2 B C ALY 11 B ALY 11 1_555 B N LEU 12 B LEU 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 124 A CYS 124 1_555 C ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 127 A CYS 127 1_555 C ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 C ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 151 A CYS 151 1_555 C ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2H2D _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.022113 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.017036 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009573 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 ZN A 1 1001 1001 ZN ZN . D 4 HOH A 1 1002 3 HOH WAT . D 4 HOH A 2 1003 5 HOH WAT . D 4 HOH A 3 1004 6 HOH WAT . D 4 HOH A 4 1005 7 HOH WAT . D 4 HOH A 5 1006 8 HOH WAT . D 4 HOH A 6 1007 9 HOH WAT . D 4 HOH A 7 1008 10 HOH WAT . D 4 HOH A 8 1009 11 HOH WAT . D 4 HOH A 9 1010 12 HOH WAT . D 4 HOH A 10 1011 13 HOH WAT . D 4 HOH A 11 1012 14 HOH WAT . D 4 HOH A 12 1013 15 HOH WAT . D 4 HOH A 13 1014 17 HOH WAT . D 4 HOH A 14 1015 20 HOH WAT . D 4 HOH A 15 1016 21 HOH WAT . D 4 HOH A 16 1017 22 HOH WAT . D 4 HOH A 17 1018 23 HOH WAT . D 4 HOH A 18 1019 25 HOH WAT . D 4 HOH A 19 1020 27 HOH WAT . D 4 HOH A 20 1021 28 HOH WAT . D 4 HOH A 21 1022 29 HOH WAT . D 4 HOH A 22 1023 30 HOH WAT . D 4 HOH A 23 1024 34 HOH WAT . D 4 HOH A 24 1025 35 HOH WAT . D 4 HOH A 25 1026 36 HOH WAT . D 4 HOH A 26 1027 37 HOH WAT . D 4 HOH A 27 1028 38 HOH WAT . D 4 HOH A 28 1029 41 HOH WAT . D 4 HOH A 29 1030 42 HOH WAT . D 4 HOH A 30 1031 43 HOH WAT . D 4 HOH A 31 1032 47 HOH WAT . D 4 HOH A 32 1033 48 HOH WAT . D 4 HOH A 33 1034 49 HOH WAT . D 4 HOH A 34 1035 50 HOH WAT . D 4 HOH A 35 1036 51 HOH WAT . D 4 HOH A 36 1037 52 HOH WAT . D 4 HOH A 37 1038 53 HOH WAT . D 4 HOH A 38 1039 56 HOH WAT . D 4 HOH A 39 1040 57 HOH WAT . D 4 HOH A 40 1041 59 HOH WAT . D 4 HOH A 41 1042 60 HOH WAT . D 4 HOH A 42 1043 61 HOH WAT . D 4 HOH A 43 1044 64 HOH WAT . D 4 HOH A 44 1045 68 HOH WAT . D 4 HOH A 45 1046 72 HOH WAT . D 4 HOH A 46 1047 79 HOH WAT . D 4 HOH A 47 1048 80 HOH WAT . D 4 HOH A 48 1049 83 HOH WAT . D 4 HOH A 49 1050 88 HOH WAT . D 4 HOH A 50 1051 89 HOH WAT . D 4 HOH A 51 1052 92 HOH WAT . D 4 HOH A 52 1053 94 HOH WAT . D 4 HOH A 53 1054 97 HOH WAT . D 4 HOH A 54 1055 98 HOH WAT . D 4 HOH A 55 1056 99 HOH WAT . D 4 HOH A 56 1057 101 HOH WAT . D 4 HOH A 57 1058 105 HOH WAT . D 4 HOH A 58 1059 106 HOH WAT . D 4 HOH A 59 1060 108 HOH WAT . D 4 HOH A 60 1061 109 HOH WAT . D 4 HOH A 61 1062 110 HOH WAT . D 4 HOH A 62 1063 113 HOH WAT . D 4 HOH A 63 1064 114 HOH WAT . D 4 HOH A 64 1065 115 HOH WAT . D 4 HOH A 65 1066 117 HOH WAT . D 4 HOH A 66 1067 118 HOH WAT . D 4 HOH A 67 1068 119 HOH WAT . D 4 HOH A 68 1069 121 HOH WAT . D 4 HOH A 69 1070 122 HOH WAT . D 4 HOH A 70 1071 125 HOH WAT . D 4 HOH A 71 1072 126 HOH WAT . D 4 HOH A 72 1073 130 HOH WAT . D 4 HOH A 73 1074 131 HOH WAT . D 4 HOH A 74 1075 132 HOH WAT . D 4 HOH A 75 1076 135 HOH WAT . D 4 HOH A 76 1077 136 HOH WAT . D 4 HOH A 77 1078 137 HOH WAT . D 4 HOH A 78 1079 138 HOH WAT . D 4 HOH A 79 1080 139 HOH WAT . D 4 HOH A 80 1081 140 HOH WAT . D 4 HOH A 81 1082 141 HOH WAT . D 4 HOH A 82 1083 142 HOH WAT . D 4 HOH A 83 1084 143 HOH WAT . D 4 HOH A 84 1085 144 HOH WAT . D 4 HOH A 85 1086 145 HOH WAT . D 4 HOH A 86 1087 146 HOH WAT . D 4 HOH A 87 1088 147 HOH WAT . D 4 HOH A 88 1089 148 HOH WAT . D 4 HOH A 89 1090 150 HOH WAT . D 4 HOH A 90 1091 151 HOH WAT . D 4 HOH A 91 1092 152 HOH WAT . D 4 HOH A 92 1093 153 HOH WAT . D 4 HOH A 93 1094 154 HOH WAT . D 4 HOH A 94 1095 155 HOH WAT . D 4 HOH A 95 1096 156 HOH WAT . D 4 HOH A 96 1097 158 HOH WAT . D 4 HOH A 97 1098 159 HOH WAT . D 4 HOH A 98 1099 161 HOH WAT . D 4 HOH A 99 1100 162 HOH WAT . D 4 HOH A 100 1101 163 HOH WAT . D 4 HOH A 101 1102 164 HOH WAT . D 4 HOH A 102 1103 166 HOH WAT . D 4 HOH A 103 1104 167 HOH WAT . D 4 HOH A 104 1105 168 HOH WAT . D 4 HOH A 105 1106 169 HOH WAT . D 4 HOH A 106 1107 170 HOH WAT . D 4 HOH A 107 1108 171 HOH WAT . D 4 HOH A 108 1109 172 HOH WAT . D 4 HOH A 109 1110 173 HOH WAT . D 4 HOH A 110 1111 174 HOH WAT . D 4 HOH A 111 1112 175 HOH WAT . D 4 HOH A 112 1113 176 HOH WAT . D 4 HOH A 113 1114 177 HOH WAT . D 4 HOH A 114 1115 178 HOH WAT . D 4 HOH A 115 1116 180 HOH WAT . D 4 HOH A 116 1117 181 HOH WAT . D 4 HOH A 117 1118 182 HOH WAT . D 4 HOH A 118 1119 184 HOH WAT . D 4 HOH A 119 1120 185 HOH WAT . D 4 HOH A 120 1121 186 HOH WAT . D 4 HOH A 121 1122 187 HOH WAT . D 4 HOH A 122 1123 188 HOH WAT . D 4 HOH A 123 1124 189 HOH WAT . D 4 HOH A 124 1125 190 HOH WAT . D 4 HOH A 125 1126 191 HOH WAT . D 4 HOH A 126 1127 192 HOH WAT . D 4 HOH A 127 1128 194 HOH WAT . D 4 HOH A 128 1129 195 HOH WAT . D 4 HOH A 129 1130 196 HOH WAT . D 4 HOH A 130 1131 197 HOH WAT . D 4 HOH A 131 1132 198 HOH WAT . D 4 HOH A 132 1133 200 HOH WAT . D 4 HOH A 133 1134 201 HOH WAT . D 4 HOH A 134 1135 202 HOH WAT . D 4 HOH A 135 1136 203 HOH WAT . D 4 HOH A 136 1137 204 HOH WAT . D 4 HOH A 137 1138 205 HOH WAT . D 4 HOH A 138 1139 206 HOH WAT . D 4 HOH A 139 1140 207 HOH WAT . D 4 HOH A 140 1141 208 HOH WAT . D 4 HOH A 141 1142 210 HOH WAT . D 4 HOH A 142 1143 212 HOH WAT . D 4 HOH A 143 1144 213 HOH WAT . D 4 HOH A 144 1145 214 HOH WAT . D 4 HOH A 145 1146 215 HOH WAT . D 4 HOH A 146 1147 216 HOH WAT . D 4 HOH A 147 1148 217 HOH WAT . D 4 HOH A 148 1149 218 HOH WAT . D 4 HOH A 149 1150 219 HOH WAT . D 4 HOH A 150 1151 220 HOH WAT . D 4 HOH A 151 1152 221 HOH WAT . D 4 HOH A 152 1153 222 HOH WAT . D 4 HOH A 153 1154 223 HOH WAT . D 4 HOH A 154 1155 224 HOH WAT . D 4 HOH A 155 1156 225 HOH WAT . D 4 HOH A 156 1157 226 HOH WAT . D 4 HOH A 157 1158 227 HOH WAT . D 4 HOH A 158 1159 228 HOH WAT . D 4 HOH A 159 1160 229 HOH WAT . D 4 HOH A 160 1161 230 HOH WAT . D 4 HOH A 161 1162 231 HOH WAT . D 4 HOH A 162 1163 232 HOH WAT . D 4 HOH A 163 1164 233 HOH WAT . D 4 HOH A 164 1165 234 HOH WAT . D 4 HOH A 165 1166 236 HOH WAT . D 4 HOH A 166 1167 237 HOH WAT . D 4 HOH A 167 1168 238 HOH WAT . D 4 HOH A 168 1169 239 HOH WAT . D 4 HOH A 169 1170 240 HOH WAT . E 4 HOH B 1 40 40 HOH WAT . E 4 HOH B 2 149 149 HOH WAT . E 4 HOH B 3 160 160 HOH WAT . E 4 HOH B 4 165 165 HOH WAT . E 4 HOH B 5 183 183 HOH WAT . E 4 HOH B 6 193 193 HOH WAT . E 4 HOH B 7 199 199 HOH WAT . E 4 HOH B 8 209 209 HOH WAT . E 4 HOH B 9 211 211 HOH WAT . E 4 HOH B 10 235 235 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -15.356 _atom_site.Cartn_y 38.962 _atom_site.Cartn_z 20.933 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 28.39 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 61 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #