data_2H2K # _model_server_result.job_id zS6xTozX78gwI2krjbGsfg _model_server_result.datetime_utc '2025-04-21 15:59:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2h2k # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":302}' # _entry.id 2H2K # _exptl.entry_id 2H2K _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2H2K _cell.length_a 40.196 _cell.length_b 60.665 _cell.length_c 78.536 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2H2K _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O ALA 32 A ALA 24 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc2 A O GLU 35 A GLU 27 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc3 A O ARG 37 A ARG 29 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc4 A O SER 40 A SER 32 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 45 A GLU 37 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 45 A GLU 37 1_555 C CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 72 A ASP 64 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 74 A ASN 66 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 76 A ASP 68 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc10 A O GLU 78 A GLU 70 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 83 A GLU 75 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc12 A OE2 GLU 83 A GLU 75 1_555 D CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc13 B O ALA 32 B ALA 24 1_555 E CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc14 B O GLU 35 B GLU 27 1_555 E CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? metalc ? metalc15 B O ARG 37 B ARG 29 1_555 E CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc16 B O SER 40 B SER 32 1_555 E CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc17 B OE1 GLU 45 B GLU 37 1_555 E CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc18 B OE2 GLU 45 B GLU 37 1_555 E CA CA . B CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc19 B OD1 ASP 72 B ASP 64 1_555 F CA CA . B CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASN 74 B ASN 66 1_555 F CA CA . B CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc21 B OD1 ASP 76 B ASP 68 1_555 F CA CA . B CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc22 B O GLU 78 B GLU 70 1_555 F CA CA . B CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc23 B OE1 GLU 83 B GLU 75 1_555 F CA CA . B CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc24 B OE2 GLU 83 B GLU 75 1_555 F CA CA . B CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2H2K _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.024878 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016484 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012733 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 301 301 CA CA2 . D 2 CA A 1 302 302 CA CA2 . E 2 CA B 1 303 303 CA CA2 . F 2 CA B 1 304 304 CA CA2 . G 3 HOH A 1 101 101 HOH WAT . G 3 HOH A 2 102 102 HOH WAT . G 3 HOH A 3 108 108 HOH WAT . G 3 HOH A 4 109 109 HOH WAT . G 3 HOH A 5 110 110 HOH WAT . G 3 HOH A 6 112 112 HOH WAT . G 3 HOH A 7 114 114 HOH WAT . G 3 HOH A 8 117 117 HOH WAT . G 3 HOH A 9 118 118 HOH WAT . G 3 HOH A 10 121 121 HOH WAT . G 3 HOH A 11 122 122 HOH WAT . G 3 HOH A 12 123 123 HOH WAT . G 3 HOH A 13 124 124 HOH WAT . G 3 HOH A 14 125 125 HOH WAT . G 3 HOH A 15 126 126 HOH WAT . G 3 HOH A 16 128 128 HOH WAT . G 3 HOH A 17 130 130 HOH WAT . G 3 HOH A 18 132 132 HOH WAT . G 3 HOH A 19 136 136 HOH WAT . G 3 HOH A 20 137 137 HOH WAT . G 3 HOH A 21 141 141 HOH WAT . G 3 HOH A 22 144 144 HOH WAT . G 3 HOH A 23 147 147 HOH WAT . G 3 HOH A 24 148 148 HOH WAT . G 3 HOH A 25 149 149 HOH WAT . G 3 HOH A 26 152 152 HOH WAT . G 3 HOH A 27 153 153 HOH WAT . G 3 HOH A 28 159 159 HOH WAT . G 3 HOH A 29 162 162 HOH WAT . G 3 HOH A 30 164 164 HOH WAT . G 3 HOH A 31 165 165 HOH WAT . G 3 HOH A 32 171 171 HOH WAT . G 3 HOH A 33 173 173 HOH WAT . G 3 HOH A 34 174 174 HOH WAT . G 3 HOH A 35 178 178 HOH WAT . G 3 HOH A 36 180 180 HOH WAT . G 3 HOH A 37 182 182 HOH WAT . G 3 HOH A 38 183 183 HOH WAT . G 3 HOH A 39 186 186 HOH WAT . G 3 HOH A 40 187 187 HOH WAT . G 3 HOH A 41 188 188 HOH WAT . G 3 HOH A 42 190 190 HOH WAT . G 3 HOH A 43 191 191 HOH WAT . G 3 HOH A 44 193 193 HOH WAT . G 3 HOH A 45 195 195 HOH WAT . G 3 HOH A 46 197 197 HOH WAT . G 3 HOH A 47 198 198 HOH WAT . G 3 HOH A 48 202 202 HOH WAT . G 3 HOH A 49 203 203 HOH WAT . G 3 HOH A 50 204 204 HOH WAT . G 3 HOH A 51 205 205 HOH WAT . G 3 HOH A 52 208 208 HOH WAT . G 3 HOH A 53 209 209 HOH WAT . G 3 HOH A 54 211 211 HOH WAT . G 3 HOH A 55 212 212 HOH WAT . G 3 HOH A 56 213 213 HOH WAT . G 3 HOH A 57 215 215 HOH WAT . G 3 HOH A 58 218 218 HOH WAT . G 3 HOH A 59 220 220 HOH WAT . H 3 HOH B 1 103 103 HOH WAT . H 3 HOH B 2 104 104 HOH WAT . H 3 HOH B 3 105 105 HOH WAT . H 3 HOH B 4 106 106 HOH WAT . H 3 HOH B 5 107 107 HOH WAT . H 3 HOH B 6 111 111 HOH WAT . H 3 HOH B 7 113 113 HOH WAT . H 3 HOH B 8 115 115 HOH WAT . H 3 HOH B 9 116 116 HOH WAT . H 3 HOH B 10 119 119 HOH WAT . H 3 HOH B 11 120 120 HOH WAT . H 3 HOH B 12 127 127 HOH WAT . H 3 HOH B 13 129 129 HOH WAT . H 3 HOH B 14 131 131 HOH WAT . H 3 HOH B 15 133 133 HOH WAT . H 3 HOH B 16 134 134 HOH WAT . H 3 HOH B 17 135 135 HOH WAT . H 3 HOH B 18 138 138 HOH WAT . H 3 HOH B 19 139 139 HOH WAT . H 3 HOH B 20 140 140 HOH WAT . H 3 HOH B 21 142 142 HOH WAT . H 3 HOH B 22 143 143 HOH WAT . H 3 HOH B 23 145 145 HOH WAT . H 3 HOH B 24 146 146 HOH WAT . H 3 HOH B 25 150 150 HOH WAT . H 3 HOH B 26 151 151 HOH WAT . H 3 HOH B 27 154 154 HOH WAT . H 3 HOH B 28 155 155 HOH WAT . H 3 HOH B 29 156 156 HOH WAT . H 3 HOH B 30 157 157 HOH WAT . H 3 HOH B 31 158 158 HOH WAT . H 3 HOH B 32 160 160 HOH WAT . H 3 HOH B 33 161 161 HOH WAT . H 3 HOH B 34 163 163 HOH WAT . H 3 HOH B 35 166 166 HOH WAT . H 3 HOH B 36 167 167 HOH WAT . H 3 HOH B 37 168 168 HOH WAT . H 3 HOH B 38 169 169 HOH WAT . H 3 HOH B 39 170 170 HOH WAT . H 3 HOH B 40 172 172 HOH WAT . H 3 HOH B 41 175 175 HOH WAT . H 3 HOH B 42 176 176 HOH WAT . H 3 HOH B 43 177 177 HOH WAT . H 3 HOH B 44 179 179 HOH WAT . H 3 HOH B 45 181 181 HOH WAT . H 3 HOH B 46 184 184 HOH WAT . H 3 HOH B 47 185 185 HOH WAT . H 3 HOH B 48 189 189 HOH WAT . H 3 HOH B 49 192 192 HOH WAT . H 3 HOH B 50 194 194 HOH WAT . H 3 HOH B 51 196 196 HOH WAT . H 3 HOH B 52 199 199 HOH WAT . H 3 HOH B 53 200 200 HOH WAT . H 3 HOH B 54 201 201 HOH WAT . H 3 HOH B 55 206 206 HOH WAT . H 3 HOH B 56 207 207 HOH WAT . H 3 HOH B 57 210 210 HOH WAT . H 3 HOH B 58 214 214 HOH WAT . H 3 HOH B 59 216 216 HOH WAT . H 3 HOH B 60 217 217 HOH WAT . H 3 HOH B 61 219 219 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 33.07 _atom_site.Cartn_y 27.688 _atom_site.Cartn_z 33.972 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 17.87 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 302 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 317 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #