data_2H6F
#
_model_server_result.job_id            JT-3ZYOweVnTHYRUM5eKqA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 21:25:56' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2h6f 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":2010}' 
#
_entry.id    2H6F 
#
_exptl.entry_id    2H6F 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              206.367 
_entity.id                          7 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            FARNESYL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            2H6F 
_cell.length_a            178.572 
_cell.length_b            178.572 
_cell.length_c            64.66 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2H6F 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        169 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      7 
_struct_asym.id                             K 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_pdbx_entity_branch.entity_id    4 
_pdbx_entity_branch.type         oligosaccharide 
#
_pdbx_entity_branch_link.link_id                     1 
_pdbx_entity_branch_link.details                     ? 
_pdbx_entity_branch_link.entity_id                   4 
_pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1    1 
_pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2    2 
_pdbx_entity_branch_link.comp_id_1                   GLC 
_pdbx_entity_branch_link.comp_id_2                   FRU 
_pdbx_entity_branch_link.atom_id_1                   C1 
_pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1           O1 
_pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1        . 
_pdbx_entity_branch_link.atom_id_2                   O2 
_pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2           HO2 
_pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2        . 
_pdbx_entity_branch_link.value_order                 sing 
#
loop_
_pdbx_branch_scheme.entity_id
_pdbx_branch_scheme.hetero
_pdbx_branch_scheme.asym_id
_pdbx_branch_scheme.mon_id
_pdbx_branch_scheme.num
_pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id
_pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_branch_scheme.auth_asym_id
_pdbx_branch_scheme.auth_seq_num
_pdbx_branch_scheme.auth_mon_id
4 n D GLC 1 C 1 GLC S 3010 SUC 
4 n D FRU 2 C 2 FRU S 3010 SUC 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 C SG CYS 8 P CYS 2006 1_555 K C1 FAR . P FAR 2010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? 
covale ? covale2 D C1 GLC . C GLC 1 1_555 D O2 FRU . C FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 sing 
metalc ? metalc1 B OD1 ASP 297 B ASP 797 1_555 H ZN ZN . B ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc2 B OD2 ASP 297 B ASP 797 1_555 H ZN ZN . B ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
metalc ? metalc3 B SG CYS 299 B CYS 799 1_555 H ZN ZN . B ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc4 B NE2 HIS 362 B HIS 862 1_555 H ZN ZN . B ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
metalc ? metalc5 H ZN ZN . B ZN 1001 1_555 C SG CYS 8 P CYS 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? 
#
_chem_comp.formula           'C15 H26' 
_chem_comp.formula_weight    206.367 
_chem_comp.id                FAR 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              FARNESYL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 FAR sing 90 n n 
C1 H11 FAR sing 91 n n 
C1 H12A FAR sing 92 n n 
C1 H13 FAR sing 93 n n 
C2 C3 FAR doub 94 e n 
C2 H2 FAR sing 95 n n 
C3 C5 FAR sing 96 n n 
C3 C4 FAR sing 97 n n 
C5 C6 FAR sing 98 n n 
C5 H51 FAR sing 99 n n 
C5 H52 FAR sing 100 n n 
C6 C7 FAR sing 101 n n 
C6 H61 FAR sing 102 n n 
C6 H62 FAR sing 103 n n 
C7 C8 FAR doub 104 e n 
C7 H7 FAR sing 105 n n 
C8 C9 FAR sing 106 n n 
C8 C10 FAR sing 107 n n 
C9 C11 FAR sing 108 n n 
C9 H91 FAR sing 109 n n 
C9 H92 FAR sing 110 n n 
C11 C12 FAR sing 111 n n 
C11 H111 FAR sing 112 n n 
C11 H112 FAR sing 113 n n 
C12 C13 FAR doub 114 n n 
C12 H12 FAR sing 115 n n 
C13 C14 FAR sing 116 n n 
C13 C15 FAR sing 117 n n 
C14 H141 FAR sing 118 n n 
C14 H142 FAR sing 119 n n 
C14 H143 FAR sing 120 n n 
C15 H151 FAR sing 121 n n 
C15 H152 FAR sing 122 n n 
C15 H153 FAR sing 123 n n 
C4 H41 FAR sing 124 n n 
C4 H42 FAR sing 125 n n 
C4 H43 FAR sing 126 n n 
C10 H101 FAR sing 127 n n 
C10 H102 FAR sing 128 n n 
C10 H103 FAR sing 129 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2H6F 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.0056 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.003233 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006466 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.015466 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 5 ACY A 1 3001 3001 ACY ACY . 
F 5 ACY A 1 3002 3002 ACY ACY . 
G 5 ACY A 1 3004 3004 ACY ACY . 
H 6 ZN B 1 1001 1001 ZN ZN2 . 
I 5 ACY B 1 3003 3003 ACY ACY . 
J 5 ACY B 1 3005 3005 ACY ACY . 
K 7 FAR P 1 2010 2006 FAR FCS . 
L 8 HOH A 1 1004 1004 HOH WAT . 
L 8 HOH A 2 1007 1007 HOH WAT . 
L 8 HOH A 3 1008 1008 HOH WAT . 
L 8 HOH A 4 1011 1011 HOH WAT . 
L 8 HOH A 5 1016 1016 HOH WAT . 
L 8 HOH A 6 1020 1020 HOH WAT . 
L 8 HOH A 7 1021 1021 HOH WAT . 
L 8 HOH A 8 1022 1022 HOH WAT . 
L 8 HOH A 9 1025 1025 HOH WAT . 
L 8 HOH A 10 1027 1027 HOH WAT . 
L 8 HOH A 11 1028 1028 HOH WAT . 
L 8 HOH A 12 1031 1031 HOH WAT . 
L 8 HOH A 13 1033 1033 HOH WAT . 
L 8 HOH A 14 1034 1034 HOH WAT . 
L 8 HOH A 15 1035 1035 HOH WAT . 
L 8 HOH A 16 1036 1036 HOH WAT . 
L 8 HOH A 17 1037 1037 HOH WAT . 
L 8 HOH A 18 1039 1039 HOH WAT . 
L 8 HOH A 19 1040 1040 HOH WAT . 
L 8 HOH A 20 1041 1041 HOH WAT . 
L 8 HOH A 21 1044 1044 HOH WAT . 
L 8 HOH A 22 1046 1046 HOH WAT . 
L 8 HOH A 23 1047 1047 HOH WAT . 
L 8 HOH A 24 1048 1048 HOH WAT . 
L 8 HOH A 25 1054 1054 HOH WAT . 
L 8 HOH A 26 1057 1057 HOH WAT . 
L 8 HOH A 27 1063 1063 HOH WAT . 
L 8 HOH A 28 1065 1065 HOH WAT . 
L 8 HOH A 29 1066 1066 HOH WAT . 
L 8 HOH A 30 1067 1067 HOH WAT . 
L 8 HOH A 31 1069 1069 HOH WAT . 
L 8 HOH A 32 1070 1070 HOH WAT . 
L 8 HOH A 33 1077 1077 HOH WAT . 
L 8 HOH A 34 1083 1083 HOH WAT . 
L 8 HOH A 35 1084 1084 HOH WAT . 
L 8 HOH A 36 1085 1085 HOH WAT . 
L 8 HOH A 37 1087 1087 HOH WAT . 
L 8 HOH A 38 1092 1092 HOH WAT . 
L 8 HOH A 39 1096 1096 HOH WAT . 
L 8 HOH A 40 1099 1099 HOH WAT . 
L 8 HOH A 41 1101 1101 HOH WAT . 
L 8 HOH A 42 1105 1105 HOH WAT . 
L 8 HOH A 43 1106 1106 HOH WAT . 
L 8 HOH A 44 1107 1107 HOH WAT . 
L 8 HOH A 45 1110 1110 HOH WAT . 
L 8 HOH A 46 1112 1112 HOH WAT . 
L 8 HOH A 47 1113 1113 HOH WAT . 
L 8 HOH A 48 1115 1115 HOH WAT . 
L 8 HOH A 49 1117 1117 HOH WAT . 
L 8 HOH A 50 1123 1123 HOH WAT . 
L 8 HOH A 51 1124 1124 HOH WAT . 
L 8 HOH A 52 1131 1131 HOH WAT . 
L 8 HOH A 53 1138 1138 HOH WAT . 
L 8 HOH A 54 1142 1142 HOH WAT . 
L 8 HOH A 55 1143 1143 HOH WAT . 
L 8 HOH A 56 1149 1149 HOH WAT . 
L 8 HOH A 57 1150 1150 HOH WAT . 
L 8 HOH A 58 1153 1153 HOH WAT . 
L 8 HOH A 59 1160 1160 HOH WAT . 
L 8 HOH A 60 1161 1161 HOH WAT . 
L 8 HOH A 61 1162 1162 HOH WAT . 
L 8 HOH A 62 1171 1171 HOH WAT . 
L 8 HOH A 63 1173 1173 HOH WAT . 
L 8 HOH A 64 1174 1174 HOH WAT . 
L 8 HOH A 65 1177 1177 HOH WAT . 
L 8 HOH A 66 1180 1180 HOH WAT . 
L 8 HOH A 67 1181 1181 HOH WAT . 
L 8 HOH A 68 1182 1182 HOH WAT . 
L 8 HOH A 69 1188 1188 HOH WAT . 
L 8 HOH A 70 1193 1193 HOH WAT . 
L 8 HOH A 71 1194 1194 HOH WAT . 
L 8 HOH A 72 1196 1196 HOH WAT . 
L 8 HOH A 73 1202 1202 HOH WAT . 
L 8 HOH A 74 1204 1204 HOH WAT . 
L 8 HOH A 75 1205 1205 HOH WAT . 
L 8 HOH A 76 1208 1208 HOH WAT . 
L 8 HOH A 77 1211 1211 HOH WAT . 
L 8 HOH A 78 1213 1213 HOH WAT . 
L 8 HOH A 79 1217 1217 HOH WAT . 
L 8 HOH A 80 1224 1224 HOH WAT . 
L 8 HOH A 81 1228 1228 HOH WAT . 
L 8 HOH A 82 1230 1230 HOH WAT . 
L 8 HOH A 83 1233 1233 HOH WAT . 
L 8 HOH A 84 1242 1242 HOH WAT . 
L 8 HOH A 85 1243 1243 HOH WAT . 
L 8 HOH A 86 1244 1244 HOH WAT . 
L 8 HOH A 87 1245 1245 HOH WAT . 
L 8 HOH A 88 1248 1248 HOH WAT . 
L 8 HOH A 89 1250 1250 HOH WAT . 
L 8 HOH A 90 1251 1251 HOH WAT . 
L 8 HOH A 91 1254 1254 HOH WAT . 
L 8 HOH A 92 1256 1256 HOH WAT . 
L 8 HOH A 93 1258 1258 HOH WAT . 
L 8 HOH A 94 1265 1265 HOH WAT . 
L 8 HOH A 95 1267 1267 HOH WAT . 
L 8 HOH A 96 1272 1272 HOH WAT . 
L 8 HOH A 97 1276 1276 HOH WAT . 
L 8 HOH A 98 1286 1286 HOH WAT . 
L 8 HOH A 99 1292 1292 HOH WAT . 
L 8 HOH A 100 1293 1293 HOH WAT . 
L 8 HOH A 101 1296 1296 HOH WAT . 
L 8 HOH A 102 1297 1297 HOH WAT . 
L 8 HOH A 103 1303 1303 HOH WAT . 
L 8 HOH A 104 1310 1310 HOH WAT . 
L 8 HOH A 105 1313 1313 HOH WAT . 
L 8 HOH A 106 1315 1315 HOH WAT . 
L 8 HOH A 107 1318 1318 HOH WAT . 
L 8 HOH A 108 1325 1325 HOH WAT . 
L 8 HOH A 109 1329 1329 HOH WAT . 
L 8 HOH A 110 1330 1330 HOH WAT . 
L 8 HOH A 111 1331 1331 HOH WAT . 
L 8 HOH A 112 1333 1333 HOH WAT . 
L 8 HOH A 113 1334 1334 HOH WAT . 
L 8 HOH A 114 1335 1335 HOH WAT . 
L 8 HOH A 115 1336 1336 HOH WAT . 
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