data_2HAP # _model_server_result.job_id PhGt43cdGfczocS3flZHzA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-29 09:58:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2hap # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":138}' # _entry.id 2HAP # _exptl.entry_id 2HAP _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2HAP _cell.length_a 92.5 _cell.length_b 92.5 _cell.length_c 86.5 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2HAP _symmetry.cell_setting tetragonal _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 E N N ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 H N N ? 4 I N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C SG CYS 10 C CYS 64 1_555 E ZN ZN . C ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc2 C SG CYS 10 C CYS 64 1_555 F ZN ZN . C ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc3 C SG CYS 13 C CYS 67 1_555 E ZN ZN . C ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc4 C SG CYS 20 C CYS 74 1_555 E ZN ZN . C ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc5 C SG CYS 27 C CYS 81 1_555 E ZN ZN . C ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc6 C SG CYS 27 C CYS 81 1_555 F ZN ZN . C ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc7 C SG CYS 30 C CYS 84 1_555 F ZN ZN . C ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc8 C SG CYS 39 C CYS 93 1_555 F ZN ZN . C ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? metalc ? metalc9 D SG CYS 10 D CYS 64 1_555 H ZN ZN . D ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc10 D SG CYS 10 D CYS 64 1_555 I ZN ZN . D ZN 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc11 D SG CYS 13 D CYS 67 1_555 H ZN ZN . D ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc12 D SG CYS 20 D CYS 74 1_555 H ZN ZN . D ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc13 D NE2 HIS 26 D HIS 80 1_555 G ZN ZN . D ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? metalc ? metalc14 D NE2 HIS 26 D HIS 80 7_556 G ZN ZN . D ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc15 D SG CYS 27 D CYS 81 1_555 H ZN ZN . D ZN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 27 D CYS 81 1_555 I ZN ZN . D ZN 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc17 D SG CYS 30 D CYS 84 1_555 I ZN ZN . D ZN 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc18 D ND1 HIS 37 D HIS 91 1_555 G ZN ZN . D ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.879 ? metalc ? metalc19 D ND1 HIS 37 D HIS 91 7_556 G ZN ZN . D ZN 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.878 ? metalc ? metalc20 D SG CYS 39 D CYS 93 1_555 I ZN ZN . D ZN 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog1 A N1 DA 1 A DA 1 1_555 B N3 DT 20 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N3 DC 2 A DC 2 1_555 B N1 DG 19 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A N4 DC 2 A DC 2 1_555 B O6 DG 19 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A O2 DC 2 A DC 2 1_555 B N2 DG 19 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N1 DG 3 A DG 3 1_555 B N3 DC 18 B DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N2 DG 3 A DG 3 1_555 B O2 DC 18 B DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A O6 DG 3 A DG 3 1_555 B N4 DC 18 B DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog8 A O2 DC 4 A DC 4 1_555 B N2 DG 17 B DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N3 DT 5 A DT 5 1_555 B N1 DA 16 B DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A O4 DT 5 A DT 5 1_555 B N6 DA 16 B DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N1 DA 6 A DA 6 1_555 B N3 DT 15 B DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N6 DA 6 A DA 6 1_555 B O4 DT 15 B DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N3 DT 7 A DT 7 1_555 B N1 DA 14 B DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O4 DT 7 A DT 7 1_555 B N6 DA 14 B DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 DT 8 A DT 8 1_555 B N1 DA 13 B DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O4 DT 8 A DT 8 1_555 B N6 DA 13 B DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog17 A N1 DA 9 A DA 9 1_555 B N3 DT 12 B DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N3 DT 10 A DT 10 1_555 B N1 DA 11 B DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O4 DT 10 A DT 10 1_555 B N6 DA 11 B DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog20 A O2 DC 11 A DC 11 1_555 B N2 DG 10 B DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N1 DG 12 A DG 12 1_555 B N3 DC 9 B DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N2 DG 12 A DG 12 1_555 B O2 DC 9 B DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A O6 DG 12 A DG 12 1_555 B N4 DC 9 B DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N3 DC 13 A DC 13 1_555 B N1 DG 8 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N4 DC 13 A DC 13 1_555 B O6 DG 8 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A O2 DC 13 A DC 13 1_555 B N2 DG 8 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N3 DT 14 A DT 14 1_555 B N1 DA 7 B DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A O4 DT 14 A DT 14 1_555 B N6 DA 7 B DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N1 DA 15 A DA 15 1_555 B N3 DT 6 B DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N6 DA 15 A DA 15 1_555 B O4 DT 6 B DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog31 A N3 DT 16 A DT 16 1_555 B N1 DA 5 B DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N3 DT 17 A DT 17 1_555 B N1 DA 4 B DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A O4 DT 17 A DT 17 1_555 B N6 DA 4 B DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A N1 DA 18 A DA 18 1_555 B N3 DT 3 B DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A N6 DA 18 A DA 18 1_555 B O4 DT 3 B DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog36 A N1 DG 19 A DG 19 1_555 B N3 DC 2 B DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N3 DT 20 A DT 20 1_555 B N1 DA 1 B DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A O4 DT 20 A DT 20 1_555 B N6 DA 1 B DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2HAP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010811 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010811 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011561 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 4 ZN C 1 136 101 ZN ZN . F 4 ZN C 1 137 102 ZN ZN . G 4 ZN D 1 136 103 ZN ZN . H 4 ZN D 1 137 104 ZN ZN . I 4 ZN D 1 138 105 ZN ZN . J 5 HOH A 1 21 4 HOH HOH . J 5 HOH A 2 22 5 HOH HOH . J 5 HOH A 3 23 12 HOH HOH . J 5 HOH A 4 24 13 HOH HOH . J 5 HOH A 5 25 14 HOH HOH . J 5 HOH A 6 26 15 HOH HOH . J 5 HOH A 7 27 24 HOH HOH . J 5 HOH A 8 28 31 HOH HOH . J 5 HOH A 9 29 32 HOH HOH . J 5 HOH A 10 30 35 HOH HOH . J 5 HOH A 11 31 36 HOH HOH . J 5 HOH A 12 32 37 HOH HOH . J 5 HOH A 13 33 41 HOH HOH . J 5 HOH A 14 34 42 HOH HOH . J 5 HOH A 15 35 43 HOH HOH . J 5 HOH A 16 36 45 HOH HOH . J 5 HOH A 17 37 52 HOH HOH . J 5 HOH A 18 38 55 HOH HOH . J 5 HOH A 19 39 57 HOH HOH . J 5 HOH A 20 40 62 HOH HOH . J 5 HOH A 21 41 63 HOH HOH . J 5 HOH A 22 42 65 HOH HOH . K 5 HOH B 1 21 19 HOH HOH . K 5 HOH B 2 22 22 HOH HOH . K 5 HOH B 3 23 27 HOH HOH . K 5 HOH B 4 24 38 HOH HOH . K 5 HOH B 5 25 40 HOH HOH . K 5 HOH B 6 26 50 HOH HOH . K 5 HOH B 7 27 58 HOH HOH . K 5 HOH B 8 28 59 HOH HOH . K 5 HOH B 9 29 64 HOH HOH . K 5 HOH B 10 30 70 HOH HOH . K 5 HOH B 11 31 74 HOH HOH . L 5 HOH C 1 138 2 HOH HOH . L 5 HOH C 2 139 3 HOH HOH . L 5 HOH C 3 140 7 HOH HOH . L 5 HOH C 4 141 8 HOH HOH . L 5 HOH C 5 142 9 HOH HOH . L 5 HOH C 6 143 11 HOH HOH . L 5 HOH C 7 144 16 HOH HOH . L 5 HOH C 8 145 17 HOH HOH . L 5 HOH C 9 146 20 HOH HOH . L 5 HOH C 10 147 21 HOH HOH . L 5 HOH C 11 148 25 HOH HOH . L 5 HOH C 12 149 28 HOH HOH . L 5 HOH C 13 150 29 HOH HOH . L 5 HOH C 14 151 33 HOH HOH . L 5 HOH C 15 152 34 HOH HOH . L 5 HOH C 16 153 46 HOH HOH . L 5 HOH C 17 154 47 HOH HOH . L 5 HOH C 18 155 48 HOH HOH . L 5 HOH C 19 156 49 HOH HOH . L 5 HOH C 20 157 56 HOH HOH . L 5 HOH C 21 158 60 HOH HOH . L 5 HOH C 22 159 61 HOH HOH . L 5 HOH C 23 160 66 HOH HOH . L 5 HOH C 24 161 73 HOH HOH . L 5 HOH C 25 162 75 HOH HOH . M 5 HOH D 1 139 6 HOH HOH . M 5 HOH D 2 140 10 HOH HOH . M 5 HOH D 3 141 18 HOH HOH . M 5 HOH D 4 142 23 HOH HOH . M 5 HOH D 5 143 26 HOH HOH . M 5 HOH D 6 144 30 HOH HOH . M 5 HOH D 7 145 39 HOH HOH . M 5 HOH D 8 146 44 HOH HOH . M 5 HOH D 9 147 51 HOH HOH . M 5 HOH D 10 148 53 HOH HOH . M 5 HOH D 11 149 54 HOH HOH . M 5 HOH D 12 150 67 HOH HOH . M 5 HOH D 13 151 68 HOH HOH . M 5 HOH D 14 152 69 HOH HOH . M 5 HOH D 15 153 71 HOH HOH . M 5 HOH D 16 154 72 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id I _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 29.373 _atom_site.Cartn_y 23.682 _atom_site.Cartn_z 50.837 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 20.54 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 138 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 265 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #