data_2HB5 # _model_server_result.job_id fY7l9rKYulA_r5Mmcr3kZA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 21:27:09' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2hb5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":200}' # _entry.id 2HB5 # _exptl.entry_id 2HB5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 78.21 _cell.angle_beta 69.85 _cell.angle_gamma 64.79 _cell.entry_id 2HB5 _cell.length_a 32.326 _cell.length_b 34.107 _cell.length_c 34.802 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2HB5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C LYS 75 A LYS 75 1_555 A N MSE 76 A MSE 76 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale2 A C LYS 75 A LYS 75 1_555 A N MSE 76 A MSE 76 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale3 A C MSE 76 A MSE 76 1_555 A N ALA 77 A ALA 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale4 A C ARG 143 A ARG 143 1_555 A N MSE 144 A MSE 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 A C MSE 144 A MSE 144 1_555 A N ALA 145 A ALA 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 28 A ASP 28 1_555 B MG MG . A MG 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 66 A GLU 66 1_555 B MG MG . A MG 200 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 87 A ASP 87 1_555 B MG MG . A MG 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 87 A ASP 87 1_555 B MG MG . A MG 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc5 B MG MG . A MG 200 1_555 D O HOH . A HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc6 B MG MG . A MG 200 1_555 D O HOH . A HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2HB5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.030935 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] -0.014563 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] -0.010387 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.032406 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] -0.002203 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.030678 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MG A 1 200 1 MG MG2 . C 3 SO4 A 1 201 1 SO4 SO4 . D 4 HOH A 1 202 1 HOH WAT . D 4 HOH A 2 203 2 HOH WAT . D 4 HOH A 3 204 1 HOH WAT . D 4 HOH A 4 205 2 HOH WAT . D 4 HOH A 5 206 3 HOH WAT . D 4 HOH A 6 207 4 HOH WAT . D 4 HOH A 7 208 5 HOH WAT . D 4 HOH A 8 209 6 HOH WAT . D 4 HOH A 9 210 7 HOH WAT . D 4 HOH A 10 211 8 HOH WAT . D 4 HOH A 11 212 9 HOH WAT . D 4 HOH A 12 213 10 HOH WAT . D 4 HOH A 13 214 11 HOH WAT . D 4 HOH A 14 215 12 HOH WAT . D 4 HOH A 15 216 13 HOH WAT . D 4 HOH A 16 217 14 HOH WAT . D 4 HOH A 17 218 15 HOH WAT . D 4 HOH A 18 219 16 HOH WAT . D 4 HOH A 19 220 17 HOH WAT . D 4 HOH A 20 221 18 HOH WAT . D 4 HOH A 21 222 19 HOH WAT . D 4 HOH A 22 223 20 HOH WAT . D 4 HOH A 23 224 21 HOH WAT . D 4 HOH A 24 225 22 HOH WAT . D 4 HOH A 25 226 23 HOH WAT . D 4 HOH A 26 227 24 HOH WAT . D 4 HOH A 27 228 25 HOH WAT . D 4 HOH A 28 229 26 HOH WAT . D 4 HOH A 29 230 27 HOH WAT . D 4 HOH A 30 231 28 HOH WAT . D 4 HOH A 31 232 29 HOH WAT . D 4 HOH A 32 233 30 HOH WAT . D 4 HOH A 33 234 31 HOH WAT . D 4 HOH A 34 235 32 HOH WAT . D 4 HOH A 35 236 33 HOH WAT . D 4 HOH A 36 237 34 HOH WAT . D 4 HOH A 37 238 35 HOH WAT . D 4 HOH A 38 239 36 HOH WAT . D 4 HOH A 39 240 37 HOH WAT . D 4 HOH A 40 241 38 HOH WAT . D 4 HOH A 41 242 39 HOH WAT . D 4 HOH A 42 243 40 HOH WAT . D 4 HOH A 43 244 41 HOH WAT . D 4 HOH A 44 245 42 HOH WAT . D 4 HOH A 45 246 43 HOH WAT . D 4 HOH A 46 247 44 HOH WAT . D 4 HOH A 47 248 45 HOH WAT . D 4 HOH A 48 249 46 HOH WAT . D 4 HOH A 49 250 47 HOH WAT . D 4 HOH A 50 251 48 HOH WAT . D 4 HOH A 51 252 49 HOH WAT . D 4 HOH A 52 253 50 HOH WAT . D 4 HOH A 53 254 51 HOH WAT . D 4 HOH A 54 255 52 HOH WAT . D 4 HOH A 55 256 53 HOH WAT . D 4 HOH A 56 257 54 HOH WAT . D 4 HOH A 57 258 55 HOH WAT . D 4 HOH A 58 259 56 HOH WAT . D 4 HOH A 59 260 57 HOH WAT . D 4 HOH A 60 261 58 HOH WAT . D 4 HOH A 61 262 59 HOH WAT . D 4 HOH A 62 263 60 HOH WAT . D 4 HOH A 63 264 61 HOH WAT . D 4 HOH A 64 265 62 HOH WAT . D 4 HOH A 65 266 63 HOH WAT . D 4 HOH A 66 267 64 HOH WAT . D 4 HOH A 67 268 65 HOH WAT . D 4 HOH A 68 269 66 HOH WAT . D 4 HOH A 69 270 67 HOH WAT . D 4 HOH A 70 271 68 HOH WAT . D 4 HOH A 71 272 69 HOH WAT . D 4 HOH A 72 273 70 HOH WAT . D 4 HOH A 73 274 71 HOH WAT . D 4 HOH A 74 275 72 HOH WAT . D 4 HOH A 75 276 73 HOH WAT . D 4 HOH A 76 277 74 HOH WAT . D 4 HOH A 77 278 75 HOH WAT . D 4 HOH A 78 279 76 HOH WAT . D 4 HOH A 79 280 77 HOH WAT . D 4 HOH A 80 281 78 HOH WAT . D 4 HOH A 81 282 79 HOH WAT . D 4 HOH A 82 283 80 HOH WAT . D 4 HOH A 83 284 81 HOH WAT . D 4 HOH A 84 285 82 HOH WAT . D 4 HOH A 85 286 83 HOH WAT . D 4 HOH A 86 287 84 HOH WAT . D 4 HOH A 87 288 85 HOH WAT . D 4 HOH A 88 289 86 HOH WAT . D 4 HOH A 89 290 87 HOH WAT . D 4 HOH A 90 291 88 HOH WAT . D 4 HOH A 91 292 89 HOH WAT . D 4 HOH A 92 293 90 HOH WAT . D 4 HOH A 93 294 91 HOH WAT . D 4 HOH A 94 295 92 HOH WAT . D 4 HOH A 95 296 93 HOH WAT . D 4 HOH A 96 297 94 HOH WAT . D 4 HOH A 97 298 95 HOH WAT . D 4 HOH A 98 299 96 HOH WAT . D 4 HOH A 99 300 97 HOH WAT . D 4 HOH A 100 301 98 HOH WAT . D 4 HOH A 101 302 99 HOH WAT . D 4 HOH A 102 303 100 HOH WAT . D 4 HOH A 103 304 101 HOH WAT . D 4 HOH A 104 305 102 HOH WAT . D 4 HOH A 105 306 103 HOH WAT . D 4 HOH A 106 307 104 HOH WAT . D 4 HOH A 107 308 105 HOH WAT . D 4 HOH A 108 309 106 HOH WAT . D 4 HOH A 109 310 107 HOH WAT . D 4 HOH A 110 311 108 HOH WAT . D 4 HOH A 111 312 109 HOH WAT . D 4 HOH A 112 313 110 HOH WAT . D 4 HOH A 113 314 111 HOH WAT . D 4 HOH A 114 315 112 HOH WAT . D 4 HOH A 115 316 113 HOH WAT . D 4 HOH A 116 317 114 HOH WAT . D 4 HOH A 117 318 115 HOH WAT . D 4 HOH A 118 319 116 HOH WAT . D 4 HOH A 119 320 117 HOH WAT . D 4 HOH A 120 321 118 HOH WAT . D 4 HOH A 121 322 119 HOH WAT . D 4 HOH A 122 323 120 HOH WAT . D 4 HOH A 123 324 121 HOH WAT . D 4 HOH A 124 325 122 HOH WAT . D 4 HOH A 125 326 123 HOH WAT . D 4 HOH A 126 327 124 HOH WAT . D 4 HOH A 127 328 125 HOH WAT . D 4 HOH A 128 329 126 HOH WAT . D 4 HOH A 129 330 127 HOH WAT . D 4 HOH A 130 331 128 HOH WAT . D 4 HOH A 131 332 129 HOH WAT . D 4 HOH A 132 333 130 HOH WAT . D 4 HOH A 133 334 131 HOH WAT . D 4 HOH A 134 335 132 HOH WAT . D 4 HOH A 135 336 133 HOH WAT . D 4 HOH A 136 337 134 HOH WAT . D 4 HOH A 137 338 135 HOH WAT . D 4 HOH A 138 339 136 HOH WAT . D 4 HOH A 139 340 137 HOH WAT . D 4 HOH A 140 341 138 HOH WAT . D 4 HOH A 141 342 139 HOH WAT . D 4 HOH A 142 343 140 HOH WAT . D 4 HOH A 143 344 141 HOH WAT . D 4 HOH A 144 345 142 HOH WAT . D 4 HOH A 145 346 143 HOH WAT . D 4 HOH A 146 347 144 HOH WAT . D 4 HOH A 147 348 145 HOH WAT . D 4 HOH A 148 349 146 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 17.998 _atom_site.Cartn_y -1.131 _atom_site.Cartn_z 0.915 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 26.45 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 200 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 44 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 266 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #