data_2HDB # _model_server_result.job_id APH5CfeZ3hIrlRIDgLbpHA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-22 03:10:29' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2hdb # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":403}' # _entry.id 2HDB # _exptl.entry_id 2HDB _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2HDB _cell.length_a 105.31 _cell.length_b 109.69 _cell.length_c 141.85 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2HDB _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N ? 2 F N N # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 315 n n S O2 SO4 doub 316 n n S O3 SO4 sing 317 n n S O4 SO4 sing 318 n n # _atom_sites.entry_id 2HDB _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009496 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009117 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00705 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 SO4 A 1 401 401 SO4 SO4 . D 3 MES A 1 501 501 MES MES . E 2 SO4 B 1 402 402 SO4 SO4 . F 2 SO4 B 1 403 403 SO4 SO4 . G 3 MES B 1 502 502 MES MES . H 4 HOH A 1 502 1 HOH WAT . H 4 HOH A 2 503 4 HOH WAT . H 4 HOH A 3 504 6 HOH WAT . H 4 HOH A 4 505 8 HOH WAT . H 4 HOH A 5 506 11 HOH WAT . H 4 HOH A 6 507 12 HOH WAT . H 4 HOH A 7 508 15 HOH WAT . H 4 HOH A 8 509 18 HOH WAT . H 4 HOH A 9 510 24 HOH WAT . H 4 HOH A 10 511 25 HOH WAT . H 4 HOH A 11 512 26 HOH WAT . H 4 HOH A 12 513 27 HOH WAT . H 4 HOH A 13 514 28 HOH WAT . H 4 HOH A 14 515 29 HOH WAT . H 4 HOH A 15 516 30 HOH WAT . H 4 HOH A 16 517 40 HOH WAT . H 4 HOH A 17 518 41 HOH WAT . H 4 HOH A 18 519 44 HOH WAT . H 4 HOH A 19 520 45 HOH WAT . H 4 HOH A 20 521 46 HOH WAT . H 4 HOH A 21 522 47 HOH WAT . H 4 HOH A 22 523 48 HOH WAT . H 4 HOH A 23 524 49 HOH WAT . H 4 HOH A 24 525 50 HOH WAT . H 4 HOH A 25 526 52 HOH WAT . H 4 HOH A 26 527 54 HOH WAT . H 4 HOH A 27 528 55 HOH WAT . H 4 HOH A 28 529 56 HOH WAT . H 4 HOH A 29 530 59 HOH WAT . H 4 HOH A 30 531 62 HOH WAT . H 4 HOH A 31 532 64 HOH WAT . H 4 HOH A 32 533 65 HOH WAT . H 4 HOH A 33 534 66 HOH WAT . H 4 HOH A 34 535 70 HOH WAT . H 4 HOH A 35 536 71 HOH WAT . H 4 HOH A 36 537 72 HOH WAT . H 4 HOH A 37 538 73 HOH WAT . H 4 HOH A 38 539 74 HOH WAT . H 4 HOH A 39 540 75 HOH WAT . H 4 HOH A 40 541 76 HOH WAT . H 4 HOH A 41 542 77 HOH WAT . H 4 HOH A 42 543 78 HOH WAT . H 4 HOH A 43 544 79 HOH WAT . H 4 HOH A 44 545 80 HOH WAT . H 4 HOH A 45 546 81 HOH WAT . H 4 HOH A 46 547 82 HOH WAT . H 4 HOH A 47 548 88 HOH WAT . H 4 HOH A 48 549 89 HOH WAT . H 4 HOH A 49 550 90 HOH WAT . H 4 HOH A 50 551 91 HOH WAT . H 4 HOH A 51 552 92 HOH WAT . H 4 HOH A 52 553 93 HOH WAT . H 4 HOH A 53 554 94 HOH WAT . H 4 HOH A 54 555 95 HOH WAT . H 4 HOH A 55 556 96 HOH WAT . H 4 HOH A 56 557 97 HOH WAT . H 4 HOH A 57 558 99 HOH WAT . H 4 HOH A 58 559 100 HOH WAT . H 4 HOH A 59 560 106 HOH WAT . H 4 HOH A 60 561 107 HOH WAT . H 4 HOH A 61 562 108 HOH WAT . H 4 HOH A 62 563 109 HOH WAT . H 4 HOH A 63 564 110 HOH WAT . H 4 HOH A 64 565 111 HOH WAT . H 4 HOH A 65 566 112 HOH WAT . H 4 HOH A 66 567 114 HOH WAT . H 4 HOH A 67 568 116 HOH WAT . H 4 HOH A 68 569 117 HOH WAT . H 4 HOH A 69 570 119 HOH WAT . H 4 HOH A 70 571 120 HOH WAT . H 4 HOH A 71 572 121 HOH WAT . H 4 HOH A 72 573 122 HOH WAT . H 4 HOH A 73 574 123 HOH WAT . H 4 HOH A 74 575 124 HOH WAT . H 4 HOH A 75 576 125 HOH WAT . H 4 HOH A 76 577 126 HOH WAT . H 4 HOH A 77 578 127 HOH WAT . H 4 HOH A 78 579 128 HOH WAT . H 4 HOH A 79 580 129 HOH WAT . H 4 HOH A 80 581 130 HOH WAT . H 4 HOH A 81 582 131 HOH WAT . H 4 HOH A 82 583 132 HOH WAT . H 4 HOH A 83 584 140 HOH WAT . H 4 HOH A 84 585 158 HOH WAT . H 4 HOH A 85 586 159 HOH WAT . H 4 HOH A 86 587 162 HOH WAT . H 4 HOH A 87 588 164 HOH WAT . H 4 HOH A 88 589 168 HOH WAT . H 4 HOH A 89 590 174 HOH WAT . H 4 HOH A 90 591 176 HOH WAT . H 4 HOH A 91 592 178 HOH WAT . H 4 HOH A 92 593 179 HOH WAT . H 4 HOH A 93 594 184 HOH WAT . H 4 HOH A 94 595 186 HOH WAT . H 4 HOH A 95 596 190 HOH WAT . H 4 HOH A 96 597 191 HOH WAT . H 4 HOH A 97 598 194 HOH WAT . H 4 HOH A 98 599 195 HOH WAT . H 4 HOH A 99 600 196 HOH WAT . H 4 HOH A 100 601 201 HOH WAT . H 4 HOH A 101 602 202 HOH WAT . H 4 HOH A 102 603 203 HOH WAT . H 4 HOH A 103 604 207 HOH WAT . H 4 HOH A 104 605 209 HOH WAT . H 4 HOH A 105 606 212 HOH WAT . H 4 HOH A 106 607 213 HOH WAT . H 4 HOH A 107 608 214 HOH WAT . H 4 HOH A 108 609 219 HOH WAT . H 4 HOH A 109 610 220 HOH WAT . H 4 HOH A 110 611 221 HOH WAT . H 4 HOH A 111 612 222 HOH WAT . H 4 HOH A 112 613 223 HOH WAT . H 4 HOH A 113 614 224 HOH WAT . H 4 HOH A 114 615 226 HOH WAT . H 4 HOH A 115 616 227 HOH WAT . H 4 HOH A 116 617 228 HOH WAT . H 4 HOH A 117 618 229 HOH WAT . H 4 HOH A 118 619 234 HOH WAT . H 4 HOH A 119 620 237 HOH WAT . H 4 HOH A 120 621 240 HOH WAT . H 4 HOH A 121 622 242 HOH WAT . H 4 HOH A 122 623 243 HOH WAT . H 4 HOH A 123 624 244 HOH WAT . H 4 HOH A 124 625 245 HOH WAT . H 4 HOH A 125 626 246 HOH WAT . H 4 HOH A 126 627 254 HOH WAT . H 4 HOH A 127 628 255 HOH WAT . H 4 HOH A 128 629 256 HOH WAT . H 4 HOH A 129 630 257 HOH WAT . H 4 HOH A 130 631 258 HOH WAT . H 4 HOH A 131 632 259 HOH WAT . H 4 HOH A 132 633 262 HOH WAT . H 4 HOH A 133 634 268 HOH WAT . H 4 HOH A 134 635 269 HOH WAT . H 4 HOH A 135 636 271 HOH WAT . H 4 HOH A 136 637 272 HOH WAT . H 4 HOH A 137 638 276 HOH WAT . H 4 HOH A 138 639 278 HOH WAT . H 4 HOH A 139 640 279 HOH WAT . H 4 HOH A 140 641 281 HOH WAT . H 4 HOH A 141 642 283 HOH WAT . H 4 HOH A 142 643 284 HOH WAT . H 4 HOH A 143 644 285 HOH WAT . H 4 HOH A 144 645 286 HOH WAT . H 4 HOH A 145 646 287 HOH WAT . H 4 HOH A 146 647 289 HOH WAT . H 4 HOH A 147 648 290 HOH WAT . H 4 HOH A 148 649 291 HOH WAT . H 4 HOH A 149 650 293 HOH WAT . H 4 HOH A 150 651 294 HOH WAT . H 4 HOH A 151 652 297 HOH WAT . H 4 HOH A 152 653 307 HOH WAT . H 4 HOH A 153 654 311 HOH WAT . H 4 HOH A 154 655 312 HOH WAT . H 4 HOH A 155 656 313 HOH WAT . H 4 HOH A 156 657 314 HOH WAT . H 4 HOH A 157 658 317 HOH WAT . H 4 HOH A 158 659 318 HOH WAT . H 4 HOH A 159 660 319 HOH WAT . H 4 HOH A 160 661 320 HOH WAT . H 4 HOH A 161 662 321 HOH WAT . H 4 HOH A 162 663 322 HOH WAT . H 4 HOH A 163 664 323 HOH WAT . H 4 HOH A 164 665 324 HOH WAT . H 4 HOH A 165 666 327 HOH WAT . H 4 HOH A 166 667 328 HOH WAT . I 4 HOH B 1 503 2 HOH WAT . I 4 HOH B 2 504 3 HOH WAT . I 4 HOH B 3 505 5 HOH WAT . I 4 HOH B 4 506 7 HOH WAT . I 4 HOH B 5 507 9 HOH WAT . I 4 HOH B 6 508 10 HOH WAT . I 4 HOH B 7 509 13 HOH WAT . I 4 HOH B 8 510 14 HOH WAT . I 4 HOH B 9 511 16 HOH WAT . I 4 HOH B 10 512 17 HOH WAT . I 4 HOH B 11 513 19 HOH WAT . I 4 HOH B 12 514 20 HOH WAT . I 4 HOH B 13 515 21 HOH WAT . I 4 HOH B 14 516 22 HOH WAT . I 4 HOH B 15 517 23 HOH WAT . I 4 HOH B 16 518 31 HOH WAT . I 4 HOH B 17 519 32 HOH WAT . I 4 HOH B 18 520 33 HOH WAT . I 4 HOH B 19 521 34 HOH WAT . I 4 HOH B 20 522 35 HOH WAT . I 4 HOH B 21 523 36 HOH WAT . I 4 HOH B 22 524 37 HOH WAT . I 4 HOH B 23 525 38 HOH WAT . I 4 HOH B 24 526 39 HOH WAT . I 4 HOH B 25 527 42 HOH WAT . I 4 HOH B 26 528 43 HOH WAT . I 4 HOH B 27 529 51 HOH WAT . I 4 HOH B 28 530 53 HOH WAT . I 4 HOH B 29 531 57 HOH WAT . I 4 HOH B 30 532 58 HOH WAT . I 4 HOH B 31 533 60 HOH WAT . I 4 HOH B 32 534 61 HOH WAT . I 4 HOH B 33 535 63 HOH WAT . I 4 HOH B 34 536 67 HOH WAT . I 4 HOH B 35 537 68 HOH WAT . I 4 HOH B 36 538 69 HOH WAT . I 4 HOH B 37 539 83 HOH WAT . I 4 HOH B 38 540 84 HOH WAT . I 4 HOH B 39 541 85 HOH WAT . I 4 HOH B 40 542 86 HOH WAT . I 4 HOH B 41 543 87 HOH WAT . I 4 HOH B 42 544 98 HOH WAT . I 4 HOH B 43 545 101 HOH WAT . I 4 HOH B 44 546 102 HOH WAT . I 4 HOH B 45 547 103 HOH WAT . I 4 HOH B 46 548 104 HOH WAT . I 4 HOH B 47 549 105 HOH WAT . I 4 HOH B 48 550 113 HOH WAT . I 4 HOH B 49 551 115 HOH WAT . I 4 HOH B 50 552 118 HOH WAT . I 4 HOH B 51 553 133 HOH WAT . I 4 HOH B 52 554 134 HOH WAT . I 4 HOH B 53 555 135 HOH WAT . I 4 HOH B 54 556 136 HOH WAT . I 4 HOH B 55 557 137 HOH WAT . I 4 HOH B 56 558 138 HOH WAT . I 4 HOH B 57 559 139 HOH WAT . I 4 HOH B 58 560 141 HOH WAT . I 4 HOH B 59 561 142 HOH WAT . I 4 HOH B 60 562 143 HOH WAT . I 4 HOH B 61 563 144 HOH WAT . I 4 HOH B 62 564 145 HOH WAT . I 4 HOH B 63 565 146 HOH WAT . I 4 HOH B 64 566 147 HOH WAT . I 4 HOH B 65 567 148 HOH WAT . I 4 HOH B 66 568 149 HOH WAT . I 4 HOH B 67 569 150 HOH WAT . I 4 HOH B 68 570 151 HOH WAT . I 4 HOH B 69 571 152 HOH WAT . I 4 HOH B 70 572 153 HOH WAT . I 4 HOH B 71 573 154 HOH WAT . I 4 HOH B 72 574 155 HOH WAT . I 4 HOH B 73 575 156 HOH WAT . I 4 HOH B 74 576 157 HOH WAT . I 4 HOH B 75 577 160 HOH WAT . I 4 HOH B 76 578 161 HOH WAT . I 4 HOH B 77 579 163 HOH WAT . I 4 HOH B 78 580 165 HOH WAT . I 4 HOH B 79 581 166 HOH WAT . I 4 HOH B 80 582 167 HOH WAT . I 4 HOH B 81 583 169 HOH WAT . I 4 HOH B 82 584 170 HOH WAT . I 4 HOH B 83 585 171 HOH WAT . I 4 HOH B 84 586 172 HOH WAT . I 4 HOH B 85 587 173 HOH WAT . I 4 HOH B 86 588 175 HOH WAT . I 4 HOH B 87 589 177 HOH WAT . I 4 HOH B 88 590 180 HOH WAT . I 4 HOH B 89 591 181 HOH WAT . I 4 HOH B 90 592 182 HOH WAT . I 4 HOH B 91 593 183 HOH WAT . I 4 HOH B 92 594 185 HOH WAT . I 4 HOH B 93 595 187 HOH WAT . I 4 HOH B 94 596 188 HOH WAT . I 4 HOH B 95 597 189 HOH WAT . I 4 HOH B 96 598 192 HOH WAT . I 4 HOH B 97 599 193 HOH WAT . I 4 HOH B 98 600 197 HOH WAT . I 4 HOH B 99 601 198 HOH WAT . I 4 HOH B 100 602 199 HOH WAT . I 4 HOH B 101 603 200 HOH WAT . I 4 HOH B 102 604 204 HOH WAT . I 4 HOH B 103 605 205 HOH WAT . I 4 HOH B 104 606 206 HOH WAT . I 4 HOH B 105 607 208 HOH WAT . I 4 HOH B 106 608 210 HOH WAT . I 4 HOH B 107 609 211 HOH WAT . I 4 HOH B 108 610 215 HOH WAT . I 4 HOH B 109 611 216 HOH WAT . I 4 HOH B 110 612 217 HOH WAT . I 4 HOH B 111 613 218 HOH WAT . I 4 HOH B 112 614 225 HOH WAT . I 4 HOH B 113 615 230 HOH WAT . I 4 HOH B 114 616 231 HOH WAT . I 4 HOH B 115 617 232 HOH WAT . I 4 HOH B 116 618 233 HOH WAT . I 4 HOH B 117 619 235 HOH WAT . I 4 HOH B 118 620 236 HOH WAT . I 4 HOH B 119 621 238 HOH WAT . I 4 HOH B 120 622 239 HOH WAT . I 4 HOH B 121 623 241 HOH WAT . I 4 HOH B 122 624 247 HOH WAT . I 4 HOH B 123 625 248 HOH WAT . I 4 HOH B 124 626 249 HOH WAT . I 4 HOH B 125 627 250 HOH WAT . I 4 HOH B 126 628 251 HOH WAT . I 4 HOH B 127 629 252 HOH WAT . I 4 HOH B 128 630 253 HOH WAT . I 4 HOH B 129 631 260 HOH WAT . I 4 HOH B 130 632 261 HOH WAT . I 4 HOH B 131 633 263 HOH WAT . I 4 HOH B 132 634 264 HOH WAT . I 4 HOH B 133 635 265 HOH WAT . I 4 HOH B 134 636 266 HOH WAT . I 4 HOH B 135 637 267 HOH WAT . I 4 HOH B 136 638 270 HOH WAT . I 4 HOH B 137 639 273 HOH WAT . I 4 HOH B 138 640 274 HOH WAT . I 4 HOH B 139 641 275 HOH WAT . I 4 HOH B 140 642 277 HOH WAT . I 4 HOH B 141 643 280 HOH WAT . I 4 HOH B 142 644 282 HOH WAT . I 4 HOH B 143 645 288 HOH WAT . I 4 HOH B 144 646 292 HOH WAT . I 4 HOH B 145 647 295 HOH WAT . I 4 HOH B 146 648 296 HOH WAT . I 4 HOH B 147 649 298 HOH WAT . I 4 HOH B 148 650 299 HOH WAT . I 4 HOH B 149 651 300 HOH WAT . I 4 HOH B 150 652 301 HOH WAT . I 4 HOH B 151 653 302 HOH WAT . I 4 HOH B 152 654 303 HOH WAT . I 4 HOH B 153 655 304 HOH WAT . I 4 HOH B 154 656 305 HOH WAT . I 4 HOH B 155 657 306 HOH WAT . I 4 HOH B 156 658 308 HOH WAT . I 4 HOH B 157 659 309 HOH WAT . I 4 HOH B 158 660 310 HOH WAT . I 4 HOH B 159 661 315 HOH WAT . I 4 HOH B 160 662 329 HOH WAT . I 4 HOH B 161 663 330 HOH WAT . I 4 HOH B 162 664 331 HOH WAT . I 4 HOH B 163 665 332 HOH WAT . I 4 HOH B 164 666 333 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . F 2 30.076 8.495 7.211 0.5 30.7 ? S SO4 403 B 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . F 2 30.99 8.936 6.153 0.5 30.12 ? O1 SO4 403 B 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . F 2 30.203 7.048 7.396 0.5 30.01 ? O2 SO4 403 B 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . F 2 30.409 9.181 8.465 0.5 30.33 ? O3 SO4 403 B 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . F 2 28.694 8.813 6.83 0.5 30.91 ? O4 SO4 403 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 5 #