data_2HEN
#
_model_server_result.job_id            m9etzNNWFX1boN4Fpk6GjA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-10 17:21:22' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2hen 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":402}' 
#
_entry.id    2HEN 
#
_exptl.entry_id    2HEN 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              427.201 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.18 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2HEN 
_cell.length_a            60.798 
_cell.length_b            98.304 
_cell.length_c            114.168 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2HEN 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,M 1 1 
B,G,H,N 2 1 
C,I,J,O 3 1 
D,K,L,P 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 M O HOH . A HOH 61 1_555 E MG MG . A MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? 
metalc ? metalc2 F O2A ADP . A ADP 400 1_555 E MG MG . A MG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? 
metalc ? metalc3 H O2A ADP . B ADP 401 1_555 G MG MG . B MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc4 H O3B ADP . B ADP 401 1_555 G MG MG . B MG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? 
metalc ? metalc5 G MG MG . B MG 405 1_555 B OD1 ASN 139 B ASN 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? 
metalc ? metalc6 G MG MG . B MG 405 1_555 B OD2 ASP 152 B ASP 772 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? 
metalc ? metalc7 J O3B ADP . C ADP 402 1_555 I MG MG . C MG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? 
metalc ? metalc8 J O2A ADP . C ADP 402 1_555 I MG MG . C MG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc9 I MG MG . C MG 406 1_555 C OD1 ASN 139 C ASN 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.038 ? 
metalc ? metalc10 L O2A ADP . D ADP 403 1_555 K MG MG . D MG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? 
metalc ? metalc11 L O3B ADP . D ADP 403 1_555 K MG MG . D MG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? 
metalc ? metalc12 K MG MG . D MG 407 1_555 D OD1 ASN 139 D ASN 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? 
metalc ? metalc13 K MG MG . D MG 407 1_555 D OD2 ASP 152 D ASP 772 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H15 N5 O10 P2' 
_chem_comp.formula_weight    427.201 
_chem_comp.id                ADP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PB O1B ADP doub 1 n n 
PB O2B ADP sing 2 n n 
PB O3B ADP sing 3 n n 
PB O3A ADP sing 4 n n 
O2B HOB2 ADP sing 5 n n 
O3B HOB3 ADP sing 6 n n 
PA O1A ADP doub 7 n n 
PA O2A ADP sing 8 n n 
PA O3A ADP sing 9 n n 
PA O5' ADP sing 10 n n 
O2A HOA2 ADP sing 11 n n 
O5' C5' ADP sing 12 n n 
C5' C4' ADP sing 13 n n 
C5' "H5'1" ADP sing 14 n n 
C5' "H5'2" ADP sing 15 n n 
C4' O4' ADP sing 16 n n 
C4' C3' ADP sing 17 n n 
C4' H4' ADP sing 18 n n 
O4' C1' ADP sing 19 n n 
C3' O3' ADP sing 20 n n 
C3' C2' ADP sing 21 n n 
C3' H3' ADP sing 22 n n 
O3' HO3' ADP sing 23 n n 
C2' O2' ADP sing 24 n n 
C2' C1' ADP sing 25 n n 
C2' H2' ADP sing 26 n n 
O2' HO2' ADP sing 27 n n 
C1' N9 ADP sing 28 n n 
C1' H1' ADP sing 29 n n 
N9 C8 ADP sing 30 n y 
N9 C4 ADP sing 31 n y 
C8 N7 ADP doub 32 n y 
C8 H8 ADP sing 33 n n 
N7 C5 ADP sing 34 n y 
C5 C6 ADP sing 35 n y 
C5 C4 ADP doub 36 n y 
C6 N6 ADP sing 37 n n 
C6 N1 ADP doub 38 n y 
N6 HN61 ADP sing 39 n n 
N6 HN62 ADP sing 40 n n 
N1 C2 ADP sing 41 n y 
C2 N3 ADP doub 42 n y 
C2 H2 ADP sing 43 n n 
N3 C4 ADP sing 44 n y 
#
_atom_sites.entry_id                     2HEN 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016448 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000051 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010173 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008759 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 MG A 1 404 404 MG MG . 
F 3 ADP A 1 400 400 ADP ADP . 
G 2 MG B 1 405 405 MG MG . 
H 3 ADP B 1 401 401 ADP ADP . 
I 2 MG C 1 406 406 MG MG . 
J 3 ADP C 1 402 402 ADP ADP . 
K 2 MG D 1 407 407 MG MG . 
L 3 ADP D 1 403 403 ADP ADP . 
M 4 HOH A 1 2 2 HOH WAT . 
M 4 HOH A 2 3 3 HOH WAT . 
M 4 HOH A 3 36 36 HOH WAT . 
M 4 HOH A 4 40 40 HOH WAT . 
M 4 HOH A 5 61 61 HOH WAT . 
M 4 HOH A 6 66 66 HOH WAT . 
M 4 HOH A 7 67 67 HOH WAT . 
M 4 HOH A 8 91 91 HOH WAT . 
M 4 HOH A 9 92 92 HOH WAT . 
M 4 HOH A 10 93 93 HOH WAT . 
M 4 HOH A 11 94 94 HOH WAT . 
M 4 HOH A 12 95 95 HOH WAT . 
M 4 HOH A 13 96 96 HOH WAT . 
M 4 HOH A 14 97 97 HOH WAT . 
M 4 HOH A 15 98 98 HOH WAT . 
M 4 HOH A 16 99 99 HOH WAT . 
M 4 HOH A 17 100 100 HOH WAT . 
M 4 HOH A 18 101 101 HOH WAT . 
M 4 HOH A 19 102 102 HOH WAT . 
M 4 HOH A 20 103 103 HOH WAT . 
M 4 HOH A 21 104 104 HOH WAT . 
M 4 HOH A 22 105 105 HOH WAT . 
M 4 HOH A 23 106 106 HOH WAT . 
M 4 HOH A 24 107 107 HOH WAT . 
M 4 HOH A 25 108 108 HOH WAT . 
M 4 HOH A 26 109 109 HOH WAT . 
M 4 HOH A 27 110 110 HOH WAT . 
M 4 HOH A 28 111 111 HOH WAT . 
M 4 HOH A 29 112 112 HOH WAT . 
M 4 HOH A 30 113 113 HOH WAT . 
M 4 HOH A 31 114 114 HOH WAT . 
M 4 HOH A 32 115 115 HOH WAT . 
M 4 HOH A 33 116 116 HOH WAT . 
M 4 HOH A 34 117 117 HOH WAT . 
M 4 HOH A 35 118 118 HOH WAT . 
M 4 HOH A 36 119 119 HOH WAT . 
M 4 HOH A 37 120 120 HOH WAT . 
M 4 HOH A 38 121 121 HOH WAT . 
M 4 HOH A 39 122 122 HOH WAT . 
M 4 HOH A 40 123 123 HOH WAT . 
M 4 HOH A 41 124 124 HOH WAT . 
M 4 HOH A 42 125 125 HOH WAT . 
M 4 HOH A 43 126 126 HOH WAT . 
M 4 HOH A 44 127 127 HOH WAT . 
M 4 HOH A 45 128 128 HOH WAT . 
M 4 HOH A 46 129 129 HOH WAT . 
M 4 HOH A 47 130 130 HOH WAT . 
M 4 HOH A 48 131 131 HOH WAT . 
M 4 HOH A 49 132 132 HOH WAT . 
M 4 HOH A 50 133 133 HOH WAT . 
M 4 HOH A 51 134 134 HOH WAT . 
M 4 HOH A 52 135 135 HOH WAT . 
M 4 HOH A 53 136 136 HOH WAT . 
M 4 HOH A 54 137 137 HOH WAT . 
M 4 HOH A 55 138 138 HOH WAT . 
M 4 HOH A 56 139 139 HOH WAT . 
M 4 HOH A 57 140 140 HOH WAT . 
M 4 HOH A 58 141 141 HOH WAT . 
M 4 HOH A 59 142 142 HOH WAT . 
M 4 HOH A 60 143 143 HOH WAT . 
M 4 HOH A 61 144 144 HOH WAT . 
M 4 HOH A 62 145 145 HOH WAT . 
M 4 HOH A 63 146 146 HOH WAT . 
M 4 HOH A 64 147 147 HOH WAT . 
M 4 HOH A 65 148 148 HOH WAT . 
M 4 HOH A 66 149 149 HOH WAT . 
M 4 HOH A 67 150 150 HOH WAT . 
M 4 HOH A 68 151 151 HOH WAT . 
M 4 HOH A 69 152 152 HOH WAT . 
M 4 HOH A 70 153 153 HOH WAT . 
M 4 HOH A 71 154 154 HOH WAT . 
M 4 HOH A 72 155 155 HOH WAT . 
M 4 HOH A 73 156 156 HOH WAT . 
M 4 HOH A 74 157 157 HOH WAT . 
M 4 HOH A 75 158 158 HOH WAT . 
M 4 HOH A 76 159 159 HOH WAT . 
M 4 HOH A 77 160 160 HOH WAT . 
M 4 HOH A 78 161 161 HOH WAT . 
M 4 HOH A 79 162 162 HOH WAT . 
M 4 HOH A 80 163 163 HOH WAT . 
M 4 HOH A 81 164 164 HOH WAT . 
M 4 HOH A 82 165 165 HOH WAT . 
M 4 HOH A 83 166 166 HOH WAT . 
M 4 HOH A 84 167 167 HOH WAT . 
M 4 HOH A 85 168 168 HOH WAT . 
M 4 HOH A 86 169 169 HOH WAT . 
M 4 HOH A 87 170 170 HOH WAT . 
M 4 HOH A 88 172 172 HOH WAT . 
M 4 HOH A 89 173 173 HOH WAT . 
M 4 HOH A 90 174 174 HOH WAT . 
M 4 HOH A 91 175 175 HOH WAT . 
M 4 HOH A 92 258 258 HOH WAT . 
M 4 HOH A 93 292 292 HOH WAT . 
M 4 HOH A 94 293 293 HOH WAT . 
M 4 HOH A 95 294 294 HOH WAT . 
M 4 HOH A 96 295 295 HOH WAT . 
M 4 HOH A 97 296 296 HOH WAT . 
M 4 HOH A 98 297 297 HOH WAT . 
M 4 HOH A 99 298 298 HOH WAT . 
M 4 HOH A 100 301 301 HOH WAT . 
N 4 HOH B 1 19 19 HOH WAT . 
N 4 HOH B 2 25 25 HOH WAT . 
N 4 HOH B 3 35 35 HOH WAT . 
N 4 HOH B 4 42 42 HOH WAT . 
N 4 HOH B 5 43 43 HOH WAT . 
N 4 HOH B 6 44 44 HOH WAT . 
N 4 HOH B 7 45 45 HOH WAT . 
N 4 HOH B 8 46 46 HOH WAT . 
N 4 HOH B 9 47 47 HOH WAT . 
N 4 HOH B 10 48 48 HOH WAT . 
N 4 HOH B 11 49 49 HOH WAT . 
N 4 HOH B 12 50 50 HOH WAT . 
N 4 HOH B 13 51 51 HOH WAT . 
N 4 HOH B 14 52 52 HOH WAT . 
N 4 HOH B 15 53 53 HOH WAT . 
N 4 HOH B 16 54 54 HOH WAT . 
N 4 HOH B 17 55 55 HOH WAT . 
N 4 HOH B 18 56 56 HOH WAT . 
N 4 HOH B 19 57 57 HOH WAT . 
N 4 HOH B 20 58 58 HOH WAT . 
N 4 HOH B 21 59 59 HOH WAT . 
N 4 HOH B 22 60 60 HOH WAT . 
N 4 HOH B 23 62 62 HOH WAT . 
N 4 HOH B 24 63 63 HOH WAT . 
N 4 HOH B 25 64 64 HOH WAT . 
N 4 HOH B 26 65 65 HOH WAT . 
N 4 HOH B 27 68 68 HOH WAT . 
N 4 HOH B 28 69 69 HOH WAT . 
N 4 HOH B 29 70 70 HOH WAT . 
N 4 HOH B 30 71 71 HOH WAT . 
N 4 HOH B 31 72 72 HOH WAT . 
N 4 HOH B 32 73 73 HOH WAT . 
N 4 HOH B 33 171 171 HOH WAT . 
N 4 HOH B 34 176 176 HOH WAT . 
N 4 HOH B 35 177 177 HOH WAT . 
N 4 HOH B 36 178 178 HOH WAT . 
N 4 HOH B 37 179 179 HOH WAT . 
N 4 HOH B 38 180 180 HOH WAT . 
N 4 HOH B 39 181 181 HOH WAT . 
N 4 HOH B 40 182 182 HOH WAT . 
N 4 HOH B 41 183 183 HOH WAT . 
N 4 HOH B 42 184 184 HOH WAT . 
N 4 HOH B 43 185 185 HOH WAT . 
N 4 HOH B 44 186 186 HOH WAT . 
N 4 HOH B 45 187 187 HOH WAT . 
N 4 HOH B 46 188 188 HOH WAT . 
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N 4 HOH B 48 190 190 HOH WAT . 
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