data_2HFE # _model_server_result.job_id ti3z0KdaTBtcWK7vfsyKKw _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 02:09:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2hfe # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":203}' # _entry.id 2HFE # _exptl.entry_id 2HFE _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 85.468 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'RUBIDIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2HFE _cell.length_a 156.142 _cell.length_b 156.142 _cell.length_c 75.794 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2HFE _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 79 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 4' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_775 -x+2,-y+2,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 312.284 312.284 0 3 'crystal symmetry operation' 3_755 -y+2,x,z 0 -1 0 1 0 0 0 0 1 312.284 0 0 4 'crystal symmetry operation' 4_575 y,-x+2,z 0 1 0 -1 0 0 0 0 1 0 312.284 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 D N N ? 4 E N N ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 96 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 145 A CYS 145 1_555 A SG CYS 200 A CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 23 B CYS 23 1_555 B SG CYS 88 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 134 B CYS 134 1_555 B SG CYS 194 B CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? covale ? covale1 C C TYR 57 C TYR 78 1_555 C O2 GOA 58 C GOA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale2 C C GOA 58 C GOA 79 1_555 C N ASP 59 C ASP 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? metalc ? metalc1 C O THR 54 C THR 75 1_555 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.135 ? metalc ? metalc2 C O THR 54 C THR 75 3_755 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.138 ? metalc ? metalc3 C O THR 54 C THR 75 2_775 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.14 ? metalc ? metalc4 C O THR 54 C THR 75 4_575 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.137 ? metalc ? metalc5 C OG1 THR 54 C THR 75 1_555 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.965 ? metalc ? metalc6 C O THR 54 C THR 75 1_555 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.249 ? metalc ? metalc7 C OG1 THR 54 C THR 75 3_755 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? metalc ? metalc8 C O THR 54 C THR 75 2_775 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.254 ? metalc ? metalc9 C O THR 54 C THR 75 4_575 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.251 ? metalc ? metalc10 C OG1 THR 54 C THR 75 2_775 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.97 ? metalc ? metalc11 C OG1 THR 54 C THR 75 4_575 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc ? metalc12 C O THR 54 C THR 75 3_755 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.252 ? metalc ? metalc13 C O VAL 55 C VAL 76 1_555 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.404 ? metalc ? metalc14 C O VAL 55 C VAL 76 3_755 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.406 ? metalc ? metalc15 C O VAL 55 C VAL 76 2_775 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.409 ? metalc ? metalc16 C O VAL 55 C VAL 76 4_575 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.407 ? metalc ? metalc17 C O VAL 55 C VAL 76 1_555 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.21 ? metalc ? metalc18 C O VAL 55 C VAL 76 3_755 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.211 ? metalc ? metalc19 C O VAL 55 C VAL 76 2_775 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.214 ? metalc ? metalc20 C O VAL 55 C VAL 76 4_575 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.213 ? metalc ? metalc21 C O GLY 56 C GLY 77 1_555 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.049 ? metalc ? metalc22 C O GLY 56 C GLY 77 3_755 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.052 ? metalc ? metalc23 C O GLY 56 C GLY 77 2_775 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc24 C O GLY 56 C GLY 77 4_575 E RB RB . C RB 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.051 ? metalc ? metalc25 C O TYR 57 C TYR 78 1_555 D RB RB . C RB 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.128 ? metalc ? metalc26 C O TYR 57 C TYR 78 3_755 D RB RB . C RB 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.13 ? metalc ? metalc27 C O TYR 57 C TYR 78 2_775 D RB RB . C RB 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.133 ? metalc ? metalc28 C O TYR 57 C TYR 78 4_575 D RB RB . C RB 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.132 ? metalc ? metalc29 D RB RB . C RB 201 1_555 L O HOH . C HOH 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.608 ? metalc ? metalc30 D RB RB . C RB 201 1_555 L O HOH . C HOH 316 4_575 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.608 ? metalc ? metalc31 D RB RB . C RB 201 1_555 L O HOH . C HOH 316 2_775 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.61 ? metalc ? metalc32 D RB RB . C RB 201 1_555 L O HOH . C HOH 316 3_755 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.61 ? metalc ? metalc33 E RB RB . C RB 202 1_555 F RB RB . C RB 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.48 ? metalc ? metalc34 E RB RB . C RB 202 1_555 F RB RB . C RB 203 2_775 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.48 ? metalc ? metalc35 E RB RB . C RB 202 1_555 F RB RB . C RB 203 3_755 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.48 ? metalc ? metalc36 E RB RB . C RB 202 1_555 F RB RB . C RB 203 4_575 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.48 ? metalc ? metalc37 F RB RB . C RB 203 1_555 G RB RB . C RB 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.57 ? metalc ? metalc38 F RB RB . C RB 203 1_555 G RB RB . C RB 204 2_775 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.57 ? metalc ? metalc39 F RB RB . C RB 203 1_555 G RB RB . C RB 204 3_755 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.57 ? metalc ? metalc40 F RB RB . C RB 203 1_555 G RB RB . C RB 204 4_575 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.57 ? metalc ? metalc41 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.898 ? metalc ? metalc42 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 317 3_755 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.9 ? metalc ? metalc43 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 317 2_775 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.903 ? metalc ? metalc44 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 317 4_575 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.901 ? metalc ? metalc45 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.395 ? metalc ? metalc46 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 318 2_775 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.399 ? metalc ? metalc47 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 318 4_575 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.397 ? metalc ? metalc48 H RB RB . C RB 205 1_555 L O HOH . C HOH 318 3_755 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.397 ? # _chem_comp.formula 'Rb 1' _chem_comp.formula_weight 85.468 _chem_comp.id RB _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'RUBIDIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2HFE _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006404 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006404 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013194 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 RB C 1 201 201 RB RB . E 4 RB C 1 202 202 RB RB . F 4 RB C 1 203 203 RB RB . G 4 RB C 1 204 204 RB RB . H 4 RB C 1 205 205 RB RB . I 5 B3H C 1 206 301 B3H B3H . J 6 HOH A 1 301 72 HOH HOH . J 6 HOH A 2 302 39 HOH HOH . J 6 HOH A 3 303 79 HOH HOH . J 6 HOH A 4 304 61 HOH HOH . J 6 HOH A 5 305 70 HOH HOH . J 6 HOH A 6 306 57 HOH HOH . J 6 HOH A 7 307 81 HOH HOH . J 6 HOH A 8 308 46 HOH HOH . J 6 HOH A 9 309 16 HOH HOH . J 6 HOH A 10 310 96 HOH HOH . J 6 HOH A 11 311 36 HOH HOH . J 6 HOH A 12 312 8 HOH HOH . J 6 HOH A 13 313 6 HOH HOH . J 6 HOH A 14 314 99 HOH HOH . J 6 HOH A 15 315 87 HOH HOH . J 6 HOH A 16 316 89 HOH HOH . J 6 HOH A 17 317 49 HOH HOH . J 6 HOH A 18 318 20 HOH HOH . J 6 HOH A 19 319 130 HOH HOH . J 6 HOH A 20 320 104 HOH HOH . J 6 HOH A 21 321 86 HOH HOH . J 6 HOH A 22 322 111 HOH HOH . J 6 HOH A 23 323 123 HOH HOH . J 6 HOH A 24 324 98 HOH HOH . J 6 HOH A 25 325 78 HOH HOH . J 6 HOH A 26 326 33 HOH HOH . J 6 HOH A 27 327 69 HOH HOH . J 6 HOH A 28 328 121 HOH HOH . J 6 HOH A 29 329 129 HOH HOH . J 6 HOH A 30 330 68 HOH HOH . K 6 HOH B 1 301 107 HOH HOH . K 6 HOH B 2 302 109 HOH HOH . K 6 HOH B 3 303 55 HOH HOH . K 6 HOH B 4 304 51 HOH HOH . K 6 HOH B 5 305 52 HOH HOH . K 6 HOH B 6 306 100 HOH HOH . K 6 HOH B 7 307 113 HOH HOH . K 6 HOH B 8 308 53 HOH HOH . K 6 HOH B 9 309 28 HOH HOH . K 6 HOH B 10 310 17 HOH HOH . K 6 HOH B 11 311 38 HOH HOH . K 6 HOH B 12 312 31 HOH HOH . K 6 HOH B 13 313 26 HOH HOH . K 6 HOH B 14 314 11 HOH HOH . K 6 HOH B 15 315 45 HOH HOH . K 6 HOH B 16 316 44 HOH HOH . K 6 HOH B 17 317 43 HOH HOH . K 6 HOH B 18 318 106 HOH HOH . K 6 HOH B 19 319 91 HOH HOH . K 6 HOH B 20 320 48 HOH HOH . K 6 HOH B 21 321 56 HOH HOH . K 6 HOH B 22 322 18 HOH HOH . K 6 HOH B 23 323 58 HOH HOH . K 6 HOH B 24 324 9 HOH HOH . K 6 HOH B 25 325 24 HOH HOH . K 6 HOH B 26 326 27 HOH HOH . K 6 HOH B 27 327 2 HOH HOH . K 6 HOH B 28 328 4 HOH HOH . K 6 HOH B 29 329 84 HOH HOH . K 6 HOH B 30 330 13 HOH HOH . K 6 HOH B 31 331 5 HOH HOH . K 6 HOH B 32 332 64 HOH HOH . K 6 HOH B 33 333 37 HOH HOH . K 6 HOH B 34 334 85 HOH HOH . K 6 HOH B 35 335 71 HOH HOH . K 6 HOH B 36 336 19 HOH HOH . K 6 HOH B 37 337 25 HOH HOH . K 6 HOH B 38 338 23 HOH HOH . K 6 HOH B 39 339 41 HOH HOH . K 6 HOH B 40 340 59 HOH HOH . K 6 HOH B 41 341 119 HOH HOH . K 6 HOH B 42 342 66 HOH HOH . K 6 HOH B 43 343 83 HOH HOH . K 6 HOH B 44 344 110 HOH HOH . K 6 HOH B 45 345 127 HOH HOH . K 6 HOH B 46 346 126 HOH HOH . K 6 HOH B 47 347 118 HOH HOH . K 6 HOH B 48 348 54 HOH HOH . K 6 HOH B 49 349 50 HOH HOH . K 6 HOH B 50 350 128 HOH HOH . K 6 HOH B 51 351 67 HOH HOH . K 6 HOH B 52 352 29 HOH HOH . L 6 HOH C 1 301 32 HOH HOH . L 6 HOH C 2 302 94 HOH HOH . L 6 HOH C 3 303 14 HOH HOH . L 6 HOH C 4 304 1 HOH HOH . L 6 HOH C 5 305 12 HOH HOH . L 6 HOH C 6 306 3 HOH HOH . L 6 HOH C 7 307 15 HOH HOH . L 6 HOH C 8 308 47 HOH HOH . L 6 HOH C 9 309 101 HOH HOH . L 6 HOH C 10 310 65 HOH HOH . L 6 HOH C 11 311 30 HOH HOH . L 6 HOH C 12 312 90 HOH HOH . L 6 HOH C 13 313 22 HOH HOH . L 6 HOH C 14 314 62 HOH HOH . L 6 HOH C 15 315 40 HOH HOH . L 6 HOH C 16 316 133 HOH HOH . L 6 HOH C 17 317 132 HOH HOH . L 6 HOH C 18 318 131 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol RB _atom_site.label_atom_id RB _atom_site.label_comp_id RB _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 156.14 _atom_site.Cartn_y 156.14 _atom_site.Cartn_z -36.974 _atom_site.occupancy 0.25 _atom_site.B_iso_or_equiv 29.37 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id RB _atom_site.auth_comp_id RB _atom_site.auth_seq_id 203 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 107 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #