data_2HK1
#
_model_server_result.job_id            DIUPI9zIG6s3HlxSfnAgNw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-23 08:17:54' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2hk1 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1300}' 
#
_entry.id    2HK1 
#
_exptl.entry_id    2HK1 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              180.156 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  man 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            D-fructose 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2HK1 
_cell.length_a            103.9 
_cell.length_b            113.5 
_cell.length_c            133.8 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2HK1 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 G N N 
? 2 I N N 
? 2 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C MSE 21 A MSE 1 1_555 A N LYS 22 A LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale2 A C VAL 200 A VAL 180 1_555 A N MSE 201 A MSE 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale3 A C MSE 201 A MSE 181 1_555 A N LEU 202 A LEU 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale4 A C HIS 206 A HIS 186 1_555 A N MSE 207 A MSE 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale5 A C MSE 207 A MSE 187 1_555 A N ASN 208 A ASN 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale6 A C ARG 242 A ARG 222 1_555 A N MSE 243 A MSE 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale7 A C MSE 243 A MSE 223 1_555 A N PRO 244 A PRO 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? 
covale ? covale8 A C ILE 262 A ILE 242 1_555 A N MSE 263 A MSE 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale9 A C MSE 263 A MSE 243 1_555 A N GLU 264 A GLU 244 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale10 A C LYS 291 A LYS 271 1_555 A N MSE 292 A MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale11 A C MSE 292 A MSE 272 1_555 A N ASP 293 A ASP 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale12 B C MSE 21 B MSE 1 1_555 B N LYS 22 B LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale13 B C VAL 200 B VAL 180 1_555 B N MSE 201 B MSE 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale14 B C MSE 201 B MSE 181 1_555 B N LEU 202 B LEU 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale15 B C HIS 206 B HIS 186 1_555 B N MSE 207 B MSE 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale16 B C MSE 207 B MSE 187 1_555 B N ASN 208 B ASN 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale17 B C ARG 242 B ARG 222 1_555 B N MSE 243 B MSE 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? 
covale ? covale18 B C MSE 243 B MSE 223 1_555 B N PRO 244 B PRO 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale19 B C ILE 262 B ILE 242 1_555 B N MSE 263 B MSE 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale20 B C MSE 263 B MSE 243 1_555 B N GLU 264 B GLU 244 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale21 B C LYS 291 B LYS 271 1_555 B N MSE 292 B MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale22 B C MSE 292 B MSE 272 1_555 B N ASP 293 B ASP 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale23 C C MSE 21 C MSE 1 1_555 C N LYS 22 C LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale24 C C VAL 200 C VAL 180 1_555 C N MSE 201 C MSE 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale25 C C MSE 201 C MSE 181 1_555 C N LEU 202 C LEU 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale26 C C HIS 206 C HIS 186 1_555 C N MSE 207 C MSE 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.314 ? 
covale ? covale27 C C MSE 207 C MSE 187 1_555 C N ASN 208 C ASN 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale28 C C ARG 242 C ARG 222 1_555 C N MSE 243 C MSE 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale29 C C MSE 243 C MSE 223 1_555 C N PRO 244 C PRO 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale30 C C ILE 262 C ILE 242 1_555 C N MSE 263 C MSE 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale31 C C MSE 263 C MSE 243 1_555 C N GLU 264 C GLU 244 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? 
covale ? covale32 C C LYS 291 C LYS 271 1_555 C N MSE 292 C MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale33 C C MSE 292 C MSE 272 1_555 C N ASP 293 C ASP 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale34 D C MSE 21 D MSE 1 1_555 D N LYS 22 D LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale35 D C VAL 200 D VAL 180 1_555 D N MSE 201 D MSE 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale36 D C MSE 201 D MSE 181 1_555 D N LEU 202 D LEU 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale37 D C HIS 206 D HIS 186 1_555 D N MSE 207 D MSE 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale38 D C MSE 207 D MSE 187 1_555 D N ASN 208 D ASN 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale39 D C ARG 242 D ARG 222 1_555 D N MSE 243 D MSE 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale40 D C MSE 243 D MSE 223 1_555 D N PRO 244 D PRO 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
covale ? covale41 D C ILE 262 D ILE 242 1_555 D N MSE 263 D MSE 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale42 D C MSE 263 D MSE 243 1_555 D N GLU 264 D GLU 244 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale43 D C LYS 291 D LYS 271 1_555 D N MSE 292 D MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale44 D C MSE 292 D MSE 272 1_555 D N ASP 293 D ASP 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 170 A GLU 150 1_555 F MN MN . A MN 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 203 A ASP 183 1_555 F MN MN . A MN 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc3 A ND1 HIS 229 A HIS 209 1_555 F MN MN . A MN 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? 
metalc ? metalc4 A OE1 GLU 264 A GLU 244 1_555 F MN MN . A MN 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc5 F MN MN . A MN 1004 1_555 E O2 FUD . A FUD 1300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc6 F MN MN . A MN 1004 1_555 E O3 FUD . A FUD 1300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 170 B GLU 150 1_555 H MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 203 B ASP 183 1_555 H MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? 
metalc ? metalc9 B ND1 HIS 229 B HIS 209 1_555 H MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc10 B OE1 GLU 264 B GLU 244 1_555 H MN MN . B MN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc11 H MN MN . B MN 1002 1_555 G O2 FUD . B FUD 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc12 H MN MN . B MN 1002 1_555 G O3 FUD . B FUD 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc13 C OE2 GLU 170 C GLU 150 1_555 J MN MN . C MN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? 
metalc ? metalc14 C OD2 ASP 203 C ASP 183 1_555 J MN MN . C MN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
metalc ? metalc15 C ND1 HIS 229 C HIS 209 1_555 J MN MN . C MN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc16 C OE1 GLU 264 C GLU 244 1_555 J MN MN . C MN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? 
metalc ? metalc17 J MN MN . C MN 1003 1_555 I O2 FUD . C FUD 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc18 J MN MN . C MN 1003 1_555 I O3 FUD . C FUD 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc19 D OE2 GLU 170 D GLU 150 1_555 L MN MN . D MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc20 D OD2 ASP 203 D ASP 183 1_555 L MN MN . D MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc21 D ND1 HIS 229 D HIS 209 1_555 L MN MN . D MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc22 D OE1 GLU 264 D GLU 244 1_555 L MN MN . D MN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc23 L MN MN . D MN 1001 1_555 K O2 FUD . D FUD 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc24 L MN MN . D MN 1001 1_555 K O3 FUD . D FUD 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H12 O6' 
_chem_comp.formula_weight    180.156 
_chem_comp.id                FUD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              D-fructose 
_chem_comp.type              d-saccharide 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 FUD sing 83 n n 
C1 O1 FUD sing 84 n n 
C2 C3 FUD sing 85 n n 
C2 O2 FUD doub 86 n n 
C3 C4 FUD sing 87 n n 
C3 O3 FUD sing 88 n n 
C4 C5 FUD sing 89 n n 
C4 O4 FUD sing 90 n n 
C5 C6 FUD sing 91 n n 
C5 O5 FUD sing 92 n n 
C6 O6 FUD sing 93 n n 
C1 H11 FUD sing 94 n n 
C1 H12 FUD sing 95 n n 
C3 H3 FUD sing 96 n n 
C4 H4 FUD sing 97 n n 
C5 H5 FUD sing 98 n n 
C6 H61 FUD sing 99 n n 
C6 H62 FUD sing 100 n n 
O1 HO1 FUD sing 101 n n 
O3 HO3 FUD sing 102 n n 
O4 HO4 FUD sing 103 n n 
O5 HO5 FUD sing 104 n n 
O6 HO6 FUD sing 105 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2HK1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009625 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008811 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007474 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 FUD A 1 1300 1300 FUD FUD . 
F 3 MN A 1 1004 1004 MN MN . 
G 2 FUD B 1 1301 1301 FUD FUD . 
H 3 MN B 1 1002 1002 MN MN . 
I 2 FUD C 1 1302 1302 FUD FUD . 
J 3 MN C 1 1003 1003 MN MN . 
K 2 FUD D 1 1303 1303 FUD FUD . 
L 3 MN D 1 1001 1001 MN MN . 
M 4 HOH A 1 1301 1301 HOH HOH . 
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M 4 HOH A 3 1303 1303 HOH HOH . 
M 4 HOH A 4 1304 1304 HOH HOH . 
M 4 HOH A 5 1305 1305 HOH HOH . 
M 4 HOH A 6 1306 1306 HOH HOH . 
M 4 HOH A 7 1307 1307 HOH HOH . 
M 4 HOH A 8 1308 1308 HOH HOH . 
M 4 HOH A 9 1309 1309 HOH HOH . 
M 4 HOH A 10 1310 1310 HOH HOH . 
M 4 HOH A 11 1311 1311 HOH HOH . 
M 4 HOH A 12 1312 1312 HOH HOH . 
M 4 HOH A 13 1313 1313 HOH HOH . 
M 4 HOH A 14 1314 1314 HOH HOH . 
M 4 HOH A 15 1315 1315 HOH HOH . 
M 4 HOH A 16 1316 1316 HOH HOH . 
M 4 HOH A 17 1317 1317 HOH HOH . 
M 4 HOH A 18 1318 1318 HOH HOH . 
M 4 HOH A 19 1319 1319 HOH HOH . 
M 4 HOH A 20 1320 1320 HOH HOH . 
M 4 HOH A 21 1321 1321 HOH HOH . 
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M 4 HOH A 24 1324 1324 HOH HOH . 
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O 4 HOH C 76 1378 1378 HOH HOH . 
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P 4 HOH D 5 1308 1308 HOH HOH . 
P 4 HOH D 6 1309 1309 HOH HOH . 
P 4 HOH D 7 1310 1310 HOH HOH . 
P 4 HOH D 8 1311 1311 HOH HOH . 
P 4 HOH D 9 1312 1312 HOH HOH . 
P 4 HOH D 10 1313 1313 HOH HOH . 
P 4 HOH D 11 1314 1314 HOH HOH . 
P 4 HOH D 12 1315 1315 HOH HOH . 
P 4 HOH D 13 1316 1316 HOH HOH . 
P 4 HOH D 14 1317 1317 HOH HOH . 
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P 4 HOH D 16 1319 1319 HOH HOH . 
P 4 HOH D 17 1320 1320 HOH HOH . 
P 4 HOH D 18 1321 1321 HOH HOH . 
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