data_2HLD
#
_model_server_result.job_id            9a_HgsBaLJ-BYguIVx5ObA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-25 02:00:20' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2hld 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":600}' 
#
_entry.id    2HLD 
#
_exptl.entry_id    2HLD 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              506.196 
_entity.id                          7 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    15 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          101.67 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2HLD 
_cell.length_a            111.524 
_cell.length_b            294.132 
_cell.length_c            190.432 
_cell.Z_PDB               18 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2HLD 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA nonameric 9 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA nonameric 9 author_and_software_defined_assembly 2 
? nonameric 9 author_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB 1 1 
J,K,L,M,N,O,P,Q,R,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB 2 1 
S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,VB,WB,XB,YB 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 7 CA N N 
? 7 EA N N 
? 7 GA N N 
? 7 IA N N 
? 7 KA N N 
? 7 MA N N 
? 7 OA N N 
? 7 QA N N 
? 7 SA N N 
? 7 VA N N 
? 7 XA N N 
? 7 ZA N N 
? 7 BB N N 
? 7 DB N N 
? 7 FB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG1 THR 178 A THR 178 1_555 BA MG MG . A MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc2 CA O2G ANP . A ANP 600 1_555 BA MG MG . A MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc3 CA O2B ANP . A ANP 600 1_555 BA MG MG . A MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc4 B OG1 THR 178 B THR 178 1_555 DA MG MG . B MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? 
metalc ? metalc5 EA O2B ANP . B ANP 600 1_555 DA MG MG . B MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? 
metalc ? metalc6 EA O2G ANP . B ANP 600 1_555 DA MG MG . B MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
metalc ? metalc7 C OG1 THR 178 C THR 178 1_555 FA MG MG . C MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc8 GA O2B ANP . C ANP 600 1_555 FA MG MG . C MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc9 GA O2G ANP . C ANP 600 1_555 FA MG MG . C MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
metalc ? metalc10 D OG1 THR 164 D THR 164 1_555 HA MG MG . D MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? 
metalc ? metalc11 IA O2G ANP . D ANP 600 1_555 HA MG MG . D MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? 
metalc ? metalc12 IA O2B ANP . D ANP 600 1_555 HA MG MG . D MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? 
metalc ? metalc13 F OG1 THR 164 F THR 164 1_555 JA MG MG . F MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? 
metalc ? metalc14 KA O2G ANP . F ANP 600 1_555 JA MG MG . F MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? 
metalc ? metalc15 KA O2B ANP . F ANP 600 1_555 JA MG MG . F MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc16 J OG1 THR 178 J THR 178 1_555 LA MG MG . J MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc17 MA O2B ANP . J ANP 600 1_555 LA MG MG . J MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
metalc ? metalc18 MA O2G ANP . J ANP 600 1_555 LA MG MG . J MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? 
metalc ? metalc19 K OG1 THR 178 K THR 178 1_555 NA MG MG . K MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc20 OA O2G ANP . K ANP 600 1_555 NA MG MG . K MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? 
metalc ? metalc21 OA O2B ANP . K ANP 600 1_555 NA MG MG . K MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
metalc ? metalc22 OA O2A ANP . K ANP 600 1_555 NA MG MG . K MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? 
metalc ? metalc23 L OG1 THR 178 L THR 178 1_555 PA MG MG . L MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.875 ? 
metalc ? metalc24 QA O2G ANP . L ANP 600 1_555 PA MG MG . L MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? 
metalc ? metalc25 QA O2B ANP . L ANP 600 1_555 PA MG MG . L MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc26 M OG1 THR 164 M THR 164 1_555 RA MG MG . M MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.906 ? 
metalc ? metalc27 SA O2G ANP . M ANP 600 1_555 RA MG MG . M MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? 
metalc ? metalc28 SA O2B ANP . M ANP 600 1_555 RA MG MG . M MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc29 O OG1 THR 164 O THR 164 1_555 UA MG MG . O MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? 
metalc ? metalc30 VA O2G ANP . O ANP 600 1_555 UA MG MG . O MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
metalc ? metalc31 VA O2B ANP . O ANP 600 1_555 UA MG MG . O MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc32 S OG1 THR 178 S THR 178 1_555 WA MG MG . S MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc33 XA O2B ANP . S ANP 600 1_555 WA MG MG . S MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc34 XA O2G ANP . S ANP 600 1_555 WA MG MG . S MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc35 T OG1 THR 178 T THR 178 1_555 YA MG MG . T MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? 
metalc ? metalc36 ZA O2A ANP . T ANP 600 1_555 YA MG MG . T MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? 
metalc ? metalc37 ZA O2B ANP . T ANP 600 1_555 YA MG MG . T MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc38 ZA O2G ANP . T ANP 600 1_555 YA MG MG . T MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc39 U OG1 THR 178 U THR 178 1_555 AB MG MG . U MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc40 BB O2G ANP . U ANP 600 1_555 AB MG MG . U MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? 
metalc ? metalc41 BB O2B ANP . U ANP 600 1_555 AB MG MG . U MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.889 ? 
metalc ? metalc42 V OG1 THR 164 V THR 164 1_555 CB MG MG . V MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? 
metalc ? metalc43 DB O2B ANP . V ANP 600 1_555 CB MG MG . V MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? 
metalc ? metalc44 DB O2G ANP . V ANP 600 1_555 CB MG MG . V MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? 
metalc ? metalc45 X OG1 THR 164 X THR 164 1_555 EB MG MG . X MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc46 X OE1 GLU 189 X GLU 189 1_555 EB MG MG . X MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc47 X NH1 ARG 190 X ARG 190 1_555 EB MG MG . X MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? 
metalc ? metalc48 FB O2G ANP . X ANP 600 1_555 EB MG MG . X MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.943 ? 
metalc ? metalc49 FB O2B ANP . X ANP 600 1_555 EB MG MG . X MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.86 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H17 N6 O12 P3' 
_chem_comp.formula_weight    506.196 
_chem_comp.id                ANP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G ANP doub 13 n n 
PG O2G ANP sing 14 n n 
PG O3G ANP sing 15 n n 
PG N3B ANP sing 16 n n 
O2G HOG2 ANP sing 17 n n 
O3G HOG3 ANP sing 18 n n 
PB O1B ANP doub 19 n n 
PB O2B ANP sing 20 n n 
PB N3B ANP sing 21 n n 
PB O3A ANP sing 22 n n 
O2B HOB2 ANP sing 23 n n 
N3B HNB1 ANP sing 24 n n 
PA O1A ANP doub 25 n n 
PA O2A ANP sing 26 n n 
PA O3A ANP sing 27 n n 
PA O5' ANP sing 28 n n 
O2A HOA2 ANP sing 29 n n 
O5' C5' ANP sing 30 n n 
C5' C4' ANP sing 31 n n 
C5' "H5'1" ANP sing 32 n n 
C5' "H5'2" ANP sing 33 n n 
C4' O4' ANP sing 34 n n 
C4' C3' ANP sing 35 n n 
C4' H4' ANP sing 36 n n 
O4' C1' ANP sing 37 n n 
C3' O3' ANP sing 38 n n 
C3' C2' ANP sing 39 n n 
C3' H3' ANP sing 40 n n 
O3' HO3' ANP sing 41 n n 
C2' O2' ANP sing 42 n n 
C2' C1' ANP sing 43 n n 
C2' H2' ANP sing 44 n n 
O2' HO2' ANP sing 45 n n 
C1' N9 ANP sing 46 n n 
C1' H1' ANP sing 47 n n 
N9 C8 ANP sing 48 n y 
N9 C4 ANP sing 49 n y 
C8 N7 ANP doub 50 n y 
C8 H8 ANP sing 51 n n 
N7 C5 ANP sing 52 n y 
C5 C6 ANP sing 53 n y 
C5 C4 ANP doub 54 n y 
C6 N6 ANP sing 55 n n 
C6 N1 ANP doub 56 n y 
N6 HN61 ANP sing 57 n n 
N6 HN62 ANP sing 58 n n 
N1 C2 ANP sing 59 n y 
C2 N3 ANP doub 60 n y 
C2 H2 ANP sing 61 n n 
N3 C4 ANP sing 62 n y 
#
_atom_sites.entry_id                     2HLD 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008967 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001851 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.0034 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005362 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
BA 6 MG A 1 700 700 MG MG . 
CA 7 ANP A 1 600 600 ANP ANP . 
DA 6 MG B 1 700 700 MG MG . 
EA 7 ANP B 1 600 600 ANP ANP . 
FA 6 MG C 1 700 700 MG MG . 
GA 7 ANP C 1 600 600 ANP ANP . 
HA 6 MG D 1 700 700 MG MG . 
IA 7 ANP D 1 600 600 ANP ANP . 
JA 6 MG F 1 700 700 MG MG . 
KA 7 ANP F 1 600 600 ANP ANP . 
LA 6 MG J 1 700 700 MG MG . 
MA 7 ANP J 1 600 600 ANP ANP . 
NA 6 MG K 1 700 700 MG MG . 
OA 7 ANP K 1 600 600 ANP ANP . 
PA 6 MG L 1 700 700 MG MG . 
QA 7 ANP L 1 600 600 ANP ANP . 
RA 6 MG M 1 700 700 MG MG . 
SA 7 ANP M 1 600 600 ANP ANP . 
TA 8 PO4 N 1 800 800 PO4 PO4 . 
UA 6 MG O 1 700 700 MG MG . 
VA 7 ANP O 1 600 600 ANP ANP . 
WA 6 MG S 1 700 700 MG MG . 
XA 7 ANP S 1 600 600 ANP ANP . 
YA 6 MG T 1 700 700 MG MG . 
ZA 7 ANP T 1 600 600 ANP ANP . 
AB 6 MG U 1 700 700 MG MG . 
BB 7 ANP U 1 600 600 ANP ANP . 
CB 6 MG V 1 700 700 MG MG . 
DB 7 ANP V 1 600 600 ANP ANP . 
EB 6 MG X 1 700 700 MG MG . 
FB 7 ANP X 1 600 600 ANP ANP . 
GB 9 HOH A 1 801 801 HOH HOH . 
GB 9 HOH A 2 802 802 HOH HOH . 
GB 9 HOH A 3 803 803 HOH HOH . 
GB 9 HOH A 4 804 804 HOH HOH . 
GB 9 HOH A 5 805 805 HOH HOH . 
GB 9 HOH A 6 806 806 HOH HOH . 
GB 9 HOH A 7 807 807 HOH HOH . 
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