data_2HNF # _model_server_result.job_id QO4SxK8Ft8-8PguvOQk_ig _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 03:15:41' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2hnf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":301}' # _entry.id 2HNF # _exptl.entry_id 2HNF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 2HNF _cell.length_a 59.96 _cell.length_b 59.96 _cell.length_c 148.45 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2HNF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 178 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 61 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 119 A CYS 215 1_555 A SG CYS 123 A CYS 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 42 A ASP 138 1_555 B CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 66 A ASP 162 1_555 E CA CA . A CA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.113 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 75 A GLU 171 1_555 B CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 75 A GLU 171 1_555 B CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 79 A GLU 175 1_555 C CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 79 A GLU 175 1_555 C CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 79 A GLU 175 11_555 C CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc ? metalc8 A OE1 GLN 104 A GLN 200 6_555 B CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc9 A O SER 132 A SER 228 1_555 D CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc10 A OG SER 132 A SER 228 1_555 D CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? metalc ? metalc11 B CA CA . A CA 301 1_555 F O HOH . A HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.272 ? metalc ? metalc12 B CA CA . A CA 301 1_555 F O HOH . A HOH 405 9_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.325 ? metalc ? metalc13 B CA CA . A CA 301 1_555 F O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc14 B CA CA . A CA 301 1_555 F O HOH . A HOH 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? metalc ? metalc15 C CA CA . A CA 302 1_555 F O HOH . A HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc16 C CA CA . A CA 302 1_555 F O HOH . A HOH 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc17 C CA CA . A CA 302 1_555 F O HOH . A HOH 409 11_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc18 C CA CA . A CA 302 1_555 F O HOH . A HOH 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? metalc ? metalc19 D CA CA . A CA 303 1_555 F O HOH . A HOH 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc ? metalc20 D CA CA . A CA 303 1_555 F O HOH . A HOH 421 10_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.965 ? metalc ? metalc21 D CA CA . A CA 303 1_555 F O HOH . A HOH 450 10_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc22 D CA CA . A CA 303 1_555 F O HOH . A HOH 455 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc ? metalc23 D CA CA . A CA 303 1_555 F O HOH . A HOH 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc24 E CA CA . A CA 304 1_555 F O HOH . A HOH 479 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.292 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2HNF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016678 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.009629 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.019258 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006736 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 301 301 CA CA2 . C 2 CA A 1 302 302 CA CA2 . D 2 CA A 1 303 303 CA CA2 . E 2 CA A 1 304 304 CA CA2 . F 3 HOH A 1 401 401 HOH WAT . F 3 HOH A 2 402 402 HOH WAT . F 3 HOH A 3 403 403 HOH WAT . F 3 HOH A 4 404 404 HOH WAT . F 3 HOH A 5 405 405 HOH WAT . F 3 HOH A 6 406 406 HOH WAT . F 3 HOH A 7 407 407 HOH WAT . F 3 HOH A 8 408 408 HOH WAT . F 3 HOH A 9 409 409 HOH WAT . F 3 HOH A 10 410 410 HOH WAT . F 3 HOH A 11 411 411 HOH WAT . F 3 HOH A 12 412 412 HOH WAT . F 3 HOH A 13 413 413 HOH WAT . F 3 HOH A 14 414 414 HOH WAT . F 3 HOH A 15 415 415 HOH WAT . F 3 HOH A 16 416 416 HOH WAT . F 3 HOH A 17 417 417 HOH WAT . F 3 HOH A 18 418 418 HOH WAT . F 3 HOH A 19 419 419 HOH WAT . F 3 HOH A 20 420 420 HOH WAT . F 3 HOH A 21 421 421 HOH WAT . F 3 HOH A 22 422 422 HOH WAT . F 3 HOH A 23 423 423 HOH WAT . F 3 HOH A 24 424 424 HOH WAT . F 3 HOH A 25 425 425 HOH WAT . F 3 HOH A 26 426 426 HOH WAT . F 3 HOH A 27 427 427 HOH WAT . F 3 HOH A 28 428 428 HOH WAT . F 3 HOH A 29 429 429 HOH WAT . F 3 HOH A 30 430 430 HOH WAT . F 3 HOH A 31 431 431 HOH WAT . F 3 HOH A 32 432 432 HOH WAT . F 3 HOH A 33 433 433 HOH WAT . F 3 HOH A 34 434 434 HOH WAT . F 3 HOH A 35 435 435 HOH WAT . F 3 HOH A 36 436 436 HOH WAT . F 3 HOH A 37 437 437 HOH WAT . F 3 HOH A 38 438 438 HOH WAT . F 3 HOH A 39 439 439 HOH WAT . F 3 HOH A 40 440 440 HOH WAT . F 3 HOH A 41 441 441 HOH WAT . F 3 HOH A 42 442 442 HOH WAT . F 3 HOH A 43 443 443 HOH WAT . F 3 HOH A 44 444 444 HOH WAT . F 3 HOH A 45 445 445 HOH WAT . F 3 HOH A 46 446 446 HOH WAT . F 3 HOH A 47 447 447 HOH WAT . F 3 HOH A 48 448 448 HOH WAT . F 3 HOH A 49 449 449 HOH WAT . F 3 HOH A 50 450 450 HOH WAT . F 3 HOH A 51 451 451 HOH WAT . F 3 HOH A 52 452 452 HOH WAT . F 3 HOH A 53 453 453 HOH WAT . F 3 HOH A 54 454 454 HOH WAT . F 3 HOH A 55 455 455 HOH WAT . F 3 HOH A 56 456 456 HOH WAT . F 3 HOH A 57 457 457 HOH WAT . F 3 HOH A 58 458 458 HOH WAT . F 3 HOH A 59 459 459 HOH WAT . F 3 HOH A 60 460 460 HOH WAT . F 3 HOH A 61 461 461 HOH WAT . F 3 HOH A 62 462 462 HOH WAT . F 3 HOH A 63 463 463 HOH WAT . F 3 HOH A 64 464 464 HOH WAT . F 3 HOH A 65 465 465 HOH WAT . F 3 HOH A 66 466 466 HOH WAT . F 3 HOH A 67 467 467 HOH WAT . F 3 HOH A 68 468 468 HOH WAT . F 3 HOH A 69 469 469 HOH WAT . F 3 HOH A 70 470 470 HOH WAT . F 3 HOH A 71 471 471 HOH WAT . F 3 HOH A 72 472 472 HOH WAT . F 3 HOH A 73 473 473 HOH WAT . F 3 HOH A 74 474 474 HOH WAT . F 3 HOH A 75 475 475 HOH WAT . F 3 HOH A 76 476 476 HOH WAT . F 3 HOH A 77 477 477 HOH WAT . F 3 HOH A 78 478 478 HOH WAT . F 3 HOH A 79 479 479 HOH WAT . F 3 HOH A 80 480 480 HOH WAT . F 3 HOH A 81 481 481 HOH WAT . F 3 HOH A 82 482 482 HOH WAT . F 3 HOH A 83 483 483 HOH WAT . F 3 HOH A 84 484 484 HOH WAT . F 3 HOH A 85 485 485 HOH WAT . F 3 HOH A 86 486 486 HOH WAT . F 3 HOH A 87 487 487 HOH WAT . F 3 HOH A 88 488 488 HOH WAT . F 3 HOH A 89 489 489 HOH WAT . F 3 HOH A 90 490 490 HOH WAT . F 3 HOH A 91 491 491 HOH WAT . F 3 HOH A 92 492 492 HOH WAT . F 3 HOH A 93 493 493 HOH WAT . F 3 HOH A 94 494 494 HOH WAT . F 3 HOH A 95 495 495 HOH WAT . F 3 HOH A 96 496 496 HOH WAT . F 3 HOH A 97 497 497 HOH WAT . F 3 HOH A 98 498 498 HOH WAT . F 3 HOH A 99 499 499 HOH WAT . F 3 HOH A 100 500 500 HOH WAT . F 3 HOH A 101 501 501 HOH WAT . F 3 HOH A 102 502 502 HOH WAT . F 3 HOH A 103 503 503 HOH WAT . F 3 HOH A 104 504 504 HOH WAT . F 3 HOH A 105 505 505 HOH WAT . F 3 HOH A 106 506 506 HOH WAT . F 3 HOH A 107 507 507 HOH WAT . F 3 HOH A 108 508 508 HOH WAT . F 3 HOH A 109 509 509 HOH WAT . F 3 HOH A 110 510 510 HOH WAT . F 3 HOH A 111 511 511 HOH WAT . F 3 HOH A 112 512 512 HOH WAT . F 3 HOH A 113 513 513 HOH WAT . F 3 HOH A 114 514 514 HOH WAT . F 3 HOH A 115 515 515 HOH WAT . F 3 HOH A 116 516 516 HOH WAT . F 3 HOH A 117 517 517 HOH WAT . F 3 HOH A 118 518 518 HOH WAT . F 3 HOH A 119 519 519 HOH WAT . F 3 HOH A 120 520 520 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -7.879 _atom_site.Cartn_y 17.858 _atom_site.Cartn_z 51.575 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 28.17 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 301 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #