data_2HU0 # _model_server_result.job_id qYwdPktoznPC0HXF9ipnqg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 03:52:20' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2hu0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":800}' # _entry.id 2HU0 # _exptl.entry_id 2HU0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 284.351 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '(3R,4R,5S)-4-(acetylamino)-5-amino-3-(pentan-3-yloxy)cyclohex-1-ene-1-carboxylic acid' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2HU0 _cell.length_a 198.083 _cell.length_b 200.576 _cell.length_c 210.417 _cell.Z_PDB 64 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2HU0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I 1 1 E,F,G,H 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id I _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 10 A CYS 92 1_555 A SG CYS 335 A CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 42 A CYS 124 1_555 A SG CYS 47 A CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 102 A CYS 183 1_555 A SG CYS 149 A CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 151 A CYS 232 1_555 A SG CYS 156 A CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 197 A CYS 278 1_555 A SG CYS 210 A CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 199 A CYS 280 1_555 A SG CYS 208 A CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 236 A CYS 318 1_555 A SG CYS 253 A CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 339 A CYS 421 1_555 A SG CYS 364 A CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 10 B CYS 92 1_555 B SG CYS 335 B CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 42 B CYS 124 1_555 B SG CYS 47 B CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 102 B CYS 183 1_555 B SG CYS 149 B CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 151 B CYS 232 1_555 B SG CYS 156 B CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 197 B CYS 278 1_555 B SG CYS 210 B CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 199 B CYS 280 1_555 B SG CYS 208 B CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 236 B CYS 318 1_555 B SG CYS 253 B CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 339 B CYS 421 1_555 B SG CYS 364 B CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? disulf ? disulf17 C SG CYS 10 C CYS 92 1_555 C SG CYS 335 C CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf18 C SG CYS 42 C CYS 124 1_555 C SG CYS 47 C CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf19 C SG CYS 102 C CYS 183 1_555 C SG CYS 149 C CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf20 C SG CYS 151 C CYS 232 1_555 C SG CYS 156 C CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf21 C SG CYS 197 C CYS 278 1_555 C SG CYS 210 C CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? disulf ? disulf22 C SG CYS 199 C CYS 280 1_555 C SG CYS 208 C CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf23 C SG CYS 236 C CYS 318 1_555 C SG CYS 253 C CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? disulf ? disulf24 C SG CYS 339 C CYS 421 1_555 C SG CYS 364 C CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? disulf ? disulf25 D SG CYS 10 D CYS 92 1_555 D SG CYS 335 D CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf26 D SG CYS 42 D CYS 124 1_555 D SG CYS 47 D CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? disulf ? disulf27 D SG CYS 102 D CYS 183 1_555 D SG CYS 149 D CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf28 D SG CYS 151 D CYS 232 1_555 D SG CYS 156 D CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf29 D SG CYS 197 D CYS 278 1_555 D SG CYS 210 D CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? disulf ? disulf30 D SG CYS 199 D CYS 280 1_555 D SG CYS 208 D CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? disulf ? disulf31 D SG CYS 236 D CYS 318 1_555 D SG CYS 253 D CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? disulf ? disulf32 D SG CYS 339 D CYS 421 1_555 D SG CYS 364 D CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? disulf ? disulf33 E SG CYS 10 E CYS 92 1_555 E SG CYS 335 E CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? disulf ? disulf34 E SG CYS 42 E CYS 124 1_555 E SG CYS 47 E CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? disulf ? disulf35 E SG CYS 102 E CYS 183 1_555 E SG CYS 149 E CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? disulf ? disulf36 E SG CYS 151 E CYS 232 1_555 E SG CYS 156 E CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf37 E SG CYS 197 E CYS 278 1_555 E SG CYS 210 E CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf38 E SG CYS 199 E CYS 280 1_555 E SG CYS 208 E CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf39 E SG CYS 236 E CYS 318 1_555 E SG CYS 253 E CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? disulf ? disulf40 E SG CYS 339 E CYS 421 1_555 E SG CYS 364 E CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? disulf ? disulf41 F SG CYS 10 F CYS 92 1_555 F SG CYS 335 F CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? disulf ? disulf42 F SG CYS 42 F CYS 124 1_555 F SG CYS 47 F CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? disulf ? disulf43 F SG CYS 102 F CYS 183 1_555 F SG CYS 149 F CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf44 F SG CYS 151 F CYS 232 1_555 F SG CYS 156 F CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf45 F SG CYS 197 F CYS 278 1_555 F SG CYS 210 F CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? disulf ? disulf46 F SG CYS 199 F CYS 280 1_555 F SG CYS 208 F CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? disulf ? disulf47 F SG CYS 236 F CYS 318 1_555 F SG CYS 253 F CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? disulf ? disulf48 F SG CYS 339 F CYS 421 1_555 F SG CYS 364 F CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? disulf ? disulf49 G SG CYS 10 G CYS 92 1_555 G SG CYS 335 G CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf50 G SG CYS 42 G CYS 124 1_555 G SG CYS 47 G CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf51 G SG CYS 102 G CYS 183 1_555 G SG CYS 149 G CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf52 G SG CYS 151 G CYS 232 1_555 G SG CYS 156 G CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf53 G SG CYS 197 G CYS 278 1_555 G SG CYS 210 G CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? disulf ? disulf54 G SG CYS 199 G CYS 280 1_555 G SG CYS 208 G CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? disulf ? disulf55 G SG CYS 236 G CYS 318 1_555 G SG CYS 253 G CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf56 G SG CYS 339 G CYS 421 1_555 G SG CYS 364 G CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? disulf ? disulf57 H SG CYS 10 H CYS 92 1_555 H SG CYS 335 H CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf58 H SG CYS 42 H CYS 124 1_555 H SG CYS 47 H CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? disulf ? disulf59 H SG CYS 102 H CYS 183 1_555 H SG CYS 149 H CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf60 H SG CYS 151 H CYS 232 1_555 H SG CYS 156 H CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf61 H SG CYS 197 H CYS 278 1_555 H SG CYS 210 H CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? disulf ? disulf62 H SG CYS 199 H CYS 280 1_555 H SG CYS 208 H CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf63 H SG CYS 236 H CYS 318 1_555 H SG CYS 253 H CYS 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf64 H SG CYS 339 H CYS 421 1_555 H SG CYS 364 H CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? # _chem_comp.formula 'C14 H24 N2 O4' _chem_comp.formula_weight 284.351 _chem_comp.id G39 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '(3R,4R,5S)-4-(acetylamino)-5-amino-3-(pentan-3-yloxy)cyclohex-1-ene-1-carboxylic acid' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'Oseltamivir carboxylate' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1A G39 doub 83 n n C1 O1B G39 sing 84 n n C1 C2 G39 sing 85 n n O1B HO1 G39 sing 86 n n C2 C3 G39 sing 87 n n C2 C7 G39 doub 88 n n C3 C4 G39 sing 89 n n C3 H31 G39 sing 90 n n C3 H32 G39 sing 91 n n C4 C5 G39 sing 92 n n C4 N4 G39 sing 93 n n C4 H4 G39 sing 94 n n C5 N5 G39 sing 95 n n C5 C6 G39 sing 96 n n C5 H5 G39 sing 97 n n N5 C10 G39 sing 98 n n N5 HN5 G39 sing 99 n n C10 O10 G39 doub 100 n n C10 C11 G39 sing 101 n n C11 H111 G39 sing 102 n n C11 H112 G39 sing 103 n n C11 H113 G39 sing 104 n n C6 C7 G39 sing 105 n n C6 O7 G39 sing 106 n n C6 H6 G39 sing 107 n n C7 H7 G39 sing 108 n n O7 C8 G39 sing 109 n n C8 C9 G39 sing 110 n n C8 C81 G39 sing 111 n n C8 H8 G39 sing 112 n n C9 C91 G39 sing 113 n n C9 H91 G39 sing 114 n n C9 H92 G39 sing 115 n n C81 C82 G39 sing 116 n n C81 H811 G39 sing 117 n n C81 H812 G39 sing 118 n n C82 H821 G39 sing 119 n n C82 H822 G39 sing 120 n n C82 H823 G39 sing 121 n n C91 H911 G39 sing 122 n n C91 H912 G39 sing 123 n n C91 H913 G39 sing 124 n n N4 HN41 G39 sing 125 n n N4 HN42 G39 sing 126 n n # _atom_sites.entry_id 2HU0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005048 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004986 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004752 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id I _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 2 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id G39 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id B _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 800 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 800 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id G39 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id G39 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 G39 . . . I 2 4.743 19.968 110.259 1 57.71 ? C1 G39 800 B 1 HETATM 2 O O1A G39 . . . I 2 5.101 18.92 110.881 1 57.99 ? O1A G39 800 B 1 HETATM 3 O O1B G39 . . . I 2 5.503 20.977 110.19 1 55.26 ? O1B G39 800 B 1 HETATM 4 C C2 G39 . . . I 2 3.407 20.012 109.602 1 57.73 ? C2 G39 800 B 1 HETATM 5 C C3 G39 . . . I 2 2.604 21.319 109.399 1 58.05 ? C3 G39 800 B 1 HETATM 6 C C4 G39 . . . I 2 1.717 21.297 108.121 1 57.32 ? C4 G39 800 B 1 HETATM 7 C C5 G39 . . . I 2 0.84 20.03 108.096 1 56.74 ? C5 G39 800 B 1 HETATM 8 N N5 G39 . . . I 2 -0.086 20.058 106.959 1 53.31 ? N5 G39 800 B 1 HETATM 9 C C10 G39 . . . I 2 -1.323 19.588 107.042 1 49.31 ? C10 G39 800 B 1 HETATM 10 O O10 G39 . . . I 2 -1.978 19.614 108.055 1 49.05 ? O10 G39 800 B 1 HETATM 11 C C11 G39 . . . I 2 -1.88 19.019 105.799 1 47.94 ? C11 G39 800 B 1 HETATM 12 C C6 G39 . . . I 2 1.78 18.785 108.079 1 57.74 ? C6 G39 800 B 1 HETATM 13 C C7 G39 . . . I 2 2.866 18.849 109.165 1 58.06 ? C7 G39 800 B 1 HETATM 14 O O7 G39 . . . I 2 1.094 17.525 108.178 1 56.45 ? O7 G39 800 B 1 HETATM 15 C C8 G39 . . . I 2 1.296 16.733 107.018 1 53.98 ? C8 G39 800 B 1 HETATM 16 C C9 G39 . . . I 2 2.715 16.182 107.082 1 52.58 ? C9 G39 800 B 1 HETATM 17 C C81 G39 . . . I 2 0.235 15.62 107.014 1 54.71 ? C81 G39 800 B 1 HETATM 18 C C82 G39 . . . I 2 -1.127 15.984 107.603 1 55.07 ? C82 G39 800 B 1 HETATM 19 C C91 G39 . . . I 2 2.885 15.309 108.314 1 53.91 ? C91 G39 800 B 1 HETATM 20 N N4 G39 . . . I 2 0.941 22.52 107.879 1 57.22 ? N4 G39 800 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 21 _model_server_stats.query_time_ms 286 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 20 #