data_2I5P # _model_server_result.job_id jA39uITempL4zE9uATUg9Q _model_server_result.datetime_utc '2024-12-02 01:29:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2i5p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1952}' # _entry.id 2I5P # _exptl.entry_id 2I5P _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 180.156 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description alpha-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2I5P _cell.length_a 70.9 _cell.length_b 70.9 _cell.length_c 358.4 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2I5P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N # _chem_comp.formula 'C6 H12 O6' _chem_comp.formula_weight 180.156 _chem_comp.id GLC _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name alpha-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, alpha linking' _chem_comp.pdbx_synonyms alpha-D-glucose;D-glucose;glucose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 GLC sing 92 n n C1 O1 GLC sing 93 n n C1 O5 GLC sing 94 n n C1 H1 GLC sing 95 n n C2 C3 GLC sing 96 n n C2 O2 GLC sing 97 n n C2 H2 GLC sing 98 n n C3 C4 GLC sing 99 n n C3 O3 GLC sing 100 n n C3 H3 GLC sing 101 n n C4 C5 GLC sing 102 n n C4 O4 GLC sing 103 n n C4 H4 GLC sing 104 n n C5 C6 GLC sing 105 n n C5 O5 GLC sing 106 n n C5 H5 GLC sing 107 n n C6 O6 GLC sing 108 n n C6 H61 GLC sing 109 n n C6 H62 GLC sing 110 n n O1 HO1 GLC sing 111 n n O2 HO2 GLC sing 112 n n O3 HO3 GLC sing 113 n n O4 HO4 GLC sing 114 n n O6 HO6 GLC sing 115 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version GLC DGlcpa 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 GLC a-D-glucopyranose 'COMMON NAME' GMML 1 GLC a-D-Glcp 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 GLC Glc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 2I5P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014104 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014104 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00279 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 GLC O 1 1952 1952 GLC GLC . D 3 BME O 1 1023 1023 BME BME . E 2 GLC P 1 1953 1953 GLC GLC . F 3 BME P 1 1024 1024 BME BME . G 4 HOH O 1 2000 2000 HOH WAT . G 4 HOH O 2 2001 2001 HOH WAT . G 4 HOH O 3 2002 2002 HOH WAT . G 4 HOH O 4 2004 2004 HOH WAT . G 4 HOH O 5 2005 2005 HOH WAT . G 4 HOH O 6 2006 2006 HOH WAT . G 4 HOH O 7 2010 2010 HOH WAT . G 4 HOH O 8 2011 2011 HOH WAT . G 4 HOH O 9 2012 2012 HOH WAT . G 4 HOH O 10 2014 2014 HOH WAT . G 4 HOH O 11 2015 2015 HOH WAT . G 4 HOH O 12 2016 2016 HOH WAT . G 4 HOH O 13 2017 2017 HOH WAT . G 4 HOH O 14 2018 2018 HOH WAT . G 4 HOH O 15 2019 2019 HOH WAT . G 4 HOH O 16 2020 2020 HOH WAT . G 4 HOH O 17 2021 2021 HOH WAT . G 4 HOH O 18 2022 2022 HOH WAT . G 4 HOH O 19 2023 2023 HOH WAT . G 4 HOH O 20 2024 2024 HOH WAT . G 4 HOH O 21 2025 2025 HOH WAT . G 4 HOH O 22 2026 2026 HOH WAT . G 4 HOH O 23 2027 2027 HOH WAT . G 4 HOH O 24 2028 2028 HOH WAT . G 4 HOH O 25 2029 2029 HOH WAT . G 4 HOH O 26 2031 2031 HOH WAT . G 4 HOH O 27 2032 2032 HOH WAT . G 4 HOH O 28 2033 2033 HOH WAT . G 4 HOH O 29 2034 2034 HOH WAT . G 4 HOH O 30 2035 2035 HOH WAT . G 4 HOH O 31 2036 2036 HOH WAT . G 4 HOH O 32 2038 2038 HOH WAT . G 4 HOH O 33 2039 2039 HOH WAT . G 4 HOH O 34 2041 2041 HOH WAT . G 4 HOH O 35 2042 2042 HOH WAT . G 4 HOH O 36 2043 2043 HOH WAT . G 4 HOH O 37 2044 2044 HOH WAT . G 4 HOH O 38 2045 2045 HOH WAT . G 4 HOH O 39 2046 2046 HOH WAT . G 4 HOH O 40 2048 2048 HOH WAT . G 4 HOH O 41 2073 2073 HOH WAT . G 4 HOH O 42 2083 2083 HOH WAT . G 4 HOH O 43 2084 2084 HOH WAT . G 4 HOH O 44 2085 2085 HOH WAT . G 4 HOH O 45 2086 2086 HOH WAT . G 4 HOH O 46 2087 2087 HOH WAT . G 4 HOH O 47 2088 2088 HOH WAT . G 4 HOH O 48 2089 2089 HOH WAT . G 4 HOH O 49 2090 2090 HOH WAT . G 4 HOH O 50 2093 2093 HOH WAT . G 4 HOH O 51 2094 2094 HOH WAT . G 4 HOH O 52 2095 2095 HOH WAT . G 4 HOH O 53 2096 2096 HOH WAT . G 4 HOH O 54 2097 2097 HOH WAT . G 4 HOH O 55 2098 2098 HOH WAT . G 4 HOH O 56 2099 2099 HOH WAT . G 4 HOH O 57 2100 2100 HOH WAT . G 4 HOH O 58 2101 2101 HOH WAT . G 4 HOH O 59 2102 2102 HOH WAT . G 4 HOH O 60 2103 2103 HOH WAT . G 4 HOH O 61 2104 2104 HOH WAT . G 4 HOH O 62 2107 2107 HOH WAT . G 4 HOH O 63 2109 2109 HOH WAT . G 4 HOH O 64 2110 2110 HOH WAT . G 4 HOH O 65 2111 2111 HOH WAT . G 4 HOH O 66 2112 2112 HOH WAT . G 4 HOH O 67 2114 2114 HOH WAT . G 4 HOH O 68 2115 2115 HOH WAT . G 4 HOH O 69 2116 2116 HOH WAT . G 4 HOH O 70 2117 2117 HOH WAT . G 4 HOH O 71 2118 2118 HOH WAT . G 4 HOH O 72 2119 2119 HOH WAT . G 4 HOH O 73 2120 2120 HOH WAT . G 4 HOH O 74 2121 2121 HOH WAT . G 4 HOH O 75 2122 2122 HOH WAT . G 4 HOH O 76 2139 2139 HOH WAT . G 4 HOH O 77 2140 2140 HOH WAT . G 4 HOH O 78 2141 2141 HOH WAT . G 4 HOH O 79 2142 2142 HOH WAT . G 4 HOH O 80 2143 2143 HOH WAT . G 4 HOH O 81 2144 2144 HOH WAT . G 4 HOH O 82 2145 2145 HOH WAT . G 4 HOH O 83 2157 2157 HOH WAT . G 4 HOH O 84 2158 2158 HOH WAT . G 4 HOH O 85 2159 2159 HOH WAT . G 4 HOH O 86 2160 2160 HOH WAT . G 4 HOH O 87 2161 2161 HOH WAT . G 4 HOH O 88 2162 2162 HOH WAT . G 4 HOH O 89 2163 2163 HOH WAT . G 4 HOH O 90 2164 2164 HOH WAT . G 4 HOH O 91 2165 2165 HOH WAT . G 4 HOH O 92 2166 2166 HOH WAT . G 4 HOH O 93 2167 2167 HOH WAT . G 4 HOH O 94 2168 2168 HOH WAT . G 4 HOH O 95 2170 2170 HOH WAT . G 4 HOH O 96 2171 2171 HOH WAT . G 4 HOH O 97 2173 2173 HOH WAT . G 4 HOH O 98 2174 2174 HOH WAT . G 4 HOH O 99 2176 2176 HOH WAT . G 4 HOH O 100 2178 2178 HOH WAT . G 4 HOH O 101 2179 2179 HOH WAT . G 4 HOH O 102 2180 2180 HOH WAT . G 4 HOH O 103 2181 2181 HOH WAT . G 4 HOH O 104 2182 2182 HOH WAT . G 4 HOH O 105 2183 2183 HOH WAT . G 4 HOH O 106 2184 2184 HOH WAT . G 4 HOH O 107 2185 2185 HOH WAT . G 4 HOH O 108 2186 2186 HOH WAT . G 4 HOH O 109 2187 2187 HOH WAT . G 4 HOH O 110 2210 2210 HOH WAT . G 4 HOH O 111 2211 2211 HOH WAT . G 4 HOH O 112 2214 2214 HOH WAT . G 4 HOH O 113 2215 2215 HOH WAT . G 4 HOH O 114 2216 2216 HOH WAT . G 4 HOH O 115 2217 2217 HOH WAT . G 4 HOH O 116 2218 2218 HOH WAT . G 4 HOH O 117 2219 2219 HOH WAT . G 4 HOH O 118 2220 2220 HOH WAT . G 4 HOH O 119 2221 2221 HOH WAT . G 4 HOH O 120 2222 2222 HOH WAT . G 4 HOH O 121 2223 2223 HOH WAT . G 4 HOH O 122 2224 2224 HOH WAT . G 4 HOH O 123 2225 2225 HOH WAT . G 4 HOH O 124 2226 2226 HOH WAT . G 4 HOH O 125 2227 2227 HOH WAT . G 4 HOH O 126 2228 2228 HOH WAT . G 4 HOH O 127 2229 2229 HOH WAT . G 4 HOH O 128 2230 2230 HOH WAT . G 4 HOH O 129 2231 2231 HOH WAT . G 4 HOH O 130 2232 2232 HOH WAT . G 4 HOH O 131 2233 2233 HOH WAT . G 4 HOH O 132 2234 2234 HOH WAT . G 4 HOH O 133 2249 2249 HOH WAT . H 4 HOH P 1 2003 2003 HOH WAT . H 4 HOH P 2 2007 2007 HOH WAT . H 4 HOH P 3 2008 2008 HOH WAT . H 4 HOH P 4 2030 2030 HOH WAT . H 4 HOH P 5 2037 2037 HOH WAT . H 4 HOH P 6 2049 2049 HOH WAT . H 4 HOH P 7 2051 2051 HOH WAT . H 4 HOH P 8 2052 2052 HOH WAT . H 4 HOH P 9 2053 2053 HOH WAT . H 4 HOH P 10 2054 2054 HOH WAT . H 4 HOH P 11 2055 2055 HOH WAT . H 4 HOH P 12 2056 2056 HOH WAT . H 4 HOH P 13 2057 2057 HOH WAT . H 4 HOH P 14 2058 2058 HOH WAT . H 4 HOH P 15 2059 2059 HOH WAT . H 4 HOH P 16 2060 2060 HOH WAT . H 4 HOH P 17 2061 2061 HOH WAT . H 4 HOH P 18 2062 2062 HOH WAT . H 4 HOH P 19 2063 2063 HOH WAT . H 4 HOH P 20 2064 2064 HOH WAT . H 4 HOH P 21 2065 2065 HOH WAT . H 4 HOH P 22 2066 2066 HOH WAT . H 4 HOH P 23 2067 2067 HOH WAT . H 4 HOH P 24 2068 2068 HOH WAT . H 4 HOH P 25 2069 2069 HOH WAT . H 4 HOH P 26 2071 2071 HOH WAT . H 4 HOH P 27 2072 2072 HOH WAT . H 4 HOH P 28 2074 2074 HOH WAT . H 4 HOH P 29 2075 2075 HOH WAT . H 4 HOH P 30 2076 2076 HOH WAT . H 4 HOH P 31 2077 2077 HOH WAT . H 4 HOH P 32 2078 2078 HOH WAT . H 4 HOH P 33 2079 2079 HOH WAT . H 4 HOH P 34 2080 2080 HOH WAT . H 4 HOH P 35 2081 2081 HOH WAT . H 4 HOH P 36 2082 2082 HOH WAT . H 4 HOH P 37 2108 2108 HOH WAT . H 4 HOH P 38 2113 2113 HOH WAT . H 4 HOH P 39 2123 2123 HOH WAT . H 4 HOH P 40 2126 2126 HOH WAT . H 4 HOH P 41 2127 2127 HOH WAT . H 4 HOH P 42 2128 2128 HOH WAT . H 4 HOH P 43 2129 2129 HOH WAT . H 4 HOH P 44 2130 2130 HOH WAT . H 4 HOH P 45 2131 2131 HOH WAT . H 4 HOH P 46 2132 2132 HOH WAT . H 4 HOH P 47 2133 2133 HOH WAT . H 4 HOH P 48 2134 2134 HOH WAT . H 4 HOH P 49 2135 2135 HOH WAT . H 4 HOH P 50 2136 2136 HOH WAT . H 4 HOH P 51 2137 2137 HOH WAT . H 4 HOH P 52 2138 2138 HOH WAT . H 4 HOH P 53 2146 2146 HOH WAT . H 4 HOH P 54 2147 2147 HOH WAT . H 4 HOH P 55 2148 2148 HOH WAT . H 4 HOH P 56 2149 2149 HOH WAT . H 4 HOH P 57 2150 2150 HOH WAT . H 4 HOH P 58 2151 2151 HOH WAT . H 4 HOH P 59 2152 2152 HOH WAT . H 4 HOH P 60 2153 2153 HOH WAT . H 4 HOH P 61 2154 2154 HOH WAT . H 4 HOH P 62 2155 2155 HOH WAT . H 4 HOH P 63 2156 2156 HOH WAT . H 4 HOH P 64 2169 2169 HOH WAT . H 4 HOH P 65 2188 2188 HOH WAT . H 4 HOH P 66 2189 2189 HOH WAT . H 4 HOH P 67 2190 2190 HOH WAT . H 4 HOH P 68 2192 2192 HOH WAT . H 4 HOH P 69 2193 2193 HOH WAT . H 4 HOH P 70 2194 2194 HOH WAT . H 4 HOH P 71 2196 2196 HOH WAT . H 4 HOH P 72 2197 2197 HOH WAT . H 4 HOH P 73 2199 2199 HOH WAT . H 4 HOH P 74 2200 2200 HOH WAT . H 4 HOH P 75 2201 2201 HOH WAT . H 4 HOH P 76 2204 2204 HOH WAT . H 4 HOH P 77 2205 2205 HOH WAT . H 4 HOH P 78 2206 2206 HOH WAT . H 4 HOH P 79 2207 2207 HOH WAT . H 4 HOH P 80 2208 2208 HOH WAT . H 4 HOH P 81 2209 2209 HOH WAT . H 4 HOH P 82 2212 2212 HOH WAT . H 4 HOH P 83 2213 2213 HOH WAT . H 4 HOH P 84 2235 2235 HOH WAT . H 4 HOH P 85 2236 2236 HOH WAT . H 4 HOH P 86 2237 2237 HOH WAT . H 4 HOH P 87 2238 2238 HOH WAT . H 4 HOH P 88 2239 2239 HOH WAT . H 4 HOH P 89 2240 2240 HOH WAT . H 4 HOH P 90 2241 2241 HOH WAT . H 4 HOH P 91 2242 2242 HOH WAT . H 4 HOH P 92 2243 2243 HOH WAT . H 4 HOH P 93 2244 2244 HOH WAT . H 4 HOH P 94 2245 2245 HOH WAT . H 4 HOH P 95 2246 2246 HOH WAT . H 4 HOH P 96 2247 2247 HOH WAT . H 4 HOH P 97 2248 2248 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GLC . . . C 2 48.034 35.893 133.328 1 75.66 ? C1 GLC 1952 O 1 HETATM 2 C C2 GLC . . . C 2 47.128 35.512 134.514 1 75.24 ? C2 GLC 1952 O 1 HETATM 3 C C3 GLC . . . C 2 46.654 36.787 135.208 1 74.83 ? C3 GLC 1952 O 1 HETATM 4 C C4 GLC . . . C 2 47.875 37.625 135.679 1 75.34 ? C4 GLC 1952 O 1 HETATM 5 C C5 GLC . . . C 2 48.731 37.949 134.42 1 76.36 ? C5 GLC 1952 O 1 HETATM 6 C C6 GLC . . . C 2 49.969 38.765 134.634 1 76.25 ? C6 GLC 1952 O 1 HETATM 7 O O2 GLC . . . C 2 46.043 34.768 133.99 1 74.83 ? O2 GLC 1952 O 1 HETATM 8 O O3 GLC . . . C 2 45.804 36.422 136.324 1 72.38 ? O3 GLC 1952 O 1 HETATM 9 O O4 GLC . . . C 2 47.441 38.845 136.309 1 73.78 ? O4 GLC 1952 O 1 HETATM 10 O O5 GLC . . . C 2 49.149 36.679 133.796 1 77.24 ? O5 GLC 1952 O 1 HETATM 11 O O6 GLC . . . C 2 51.031 37.997 135.155 1 75.87 ? O6 GLC 1952 O 1 # _model_server_stats.io_time_ms 60 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 21 _model_server_stats.query_time_ms 328 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 11 #