data_2IM8 # _model_server_result.job_id vJ2yQBGKXb8Tlja7ll7EYQ _model_server_result.datetime_utc '2025-02-18 00:23:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2im8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":201}' # _entry.id 2IM8 # _exptl.entry_id 2IM8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 94.971 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PHOSPHATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2IM8 _cell.length_a 44.735 _cell.length_b 70.83 _cell.length_c 76.237 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2IM8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D 1 1 B,E 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C MSE 1 A MSE 1 1_555 A N LEU 2 A LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale2 A C GLU 8 A GLU 8 1_555 A N MSE 9 A MSE 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale3 A C MSE 9 A MSE 9 1_555 A N THR 10 A THR 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale4 A C GLN 12 A GLN 12 1_555 A N MSE 13 A MSE 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale5 A C MSE 13 A MSE 13 1_555 A N ILE 14 A ILE 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale6 B C MSE 1 B MSE 1 1_555 B N LEU 2 B LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale7 B C GLU 8 B GLU 8 1_555 B N MSE 9 B MSE 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale8 B C MSE 9 B MSE 9 1_555 B N THR 10 B THR 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale9 B C GLN 12 B GLN 12 1_555 B N MSE 13 B MSE 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale10 B C MSE 13 B MSE 13 1_555 B N ILE 14 B ILE 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? # _chem_comp.formula 'O4 P -3' _chem_comp.formula_weight 94.971 _chem_comp.id PO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PHOSPHATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O1 PO4 doub 266 n n P O2 PO4 sing 267 n n P O3 PO4 sing 268 n n P O4 PO4 sing 269 n n # _atom_sites.entry_id 2IM8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.022354 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014118 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013117 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 PO4 A 1 201 1 PO4 PO4 . D 3 HOH A 1 202 1 HOH WAT . D 3 HOH A 2 203 2 HOH WAT . D 3 HOH A 3 204 3 HOH WAT . D 3 HOH A 4 205 4 HOH WAT . D 3 HOH A 5 206 5 HOH WAT . D 3 HOH A 6 207 7 HOH WAT . D 3 HOH A 7 208 8 HOH WAT . D 3 HOH A 8 209 9 HOH WAT . D 3 HOH A 9 210 10 HOH WAT . D 3 HOH A 10 211 11 HOH WAT . D 3 HOH A 11 212 12 HOH WAT . D 3 HOH A 12 213 13 HOH WAT . D 3 HOH A 13 214 14 HOH WAT . D 3 HOH A 14 215 15 HOH WAT . D 3 HOH A 15 216 16 HOH WAT . D 3 HOH A 16 217 18 HOH WAT . D 3 HOH A 17 218 19 HOH WAT . D 3 HOH A 18 219 20 HOH WAT . D 3 HOH A 19 220 21 HOH WAT . D 3 HOH A 20 221 22 HOH WAT . D 3 HOH A 21 222 23 HOH WAT . D 3 HOH A 22 223 24 HOH WAT . D 3 HOH A 23 224 26 HOH WAT . D 3 HOH A 24 225 27 HOH WAT . D 3 HOH A 25 226 29 HOH WAT . D 3 HOH A 26 227 31 HOH WAT . D 3 HOH A 27 228 33 HOH WAT . D 3 HOH A 28 229 34 HOH WAT . D 3 HOH A 29 230 35 HOH WAT . D 3 HOH A 30 231 36 HOH WAT . D 3 HOH A 31 232 38 HOH WAT . D 3 HOH A 32 233 39 HOH WAT . D 3 HOH A 33 234 41 HOH WAT . D 3 HOH A 34 235 42 HOH WAT . D 3 HOH A 35 236 45 HOH WAT . D 3 HOH A 36 237 46 HOH WAT . D 3 HOH A 37 238 48 HOH WAT . D 3 HOH A 38 239 49 HOH WAT . D 3 HOH A 39 240 51 HOH WAT . D 3 HOH A 40 241 52 HOH WAT . D 3 HOH A 41 242 53 HOH WAT . D 3 HOH A 42 243 54 HOH WAT . D 3 HOH A 43 244 57 HOH WAT . D 3 HOH A 44 245 58 HOH WAT . D 3 HOH A 45 246 63 HOH WAT . D 3 HOH A 46 247 65 HOH WAT . D 3 HOH A 47 248 66 HOH WAT . D 3 HOH A 48 249 67 HOH WAT . D 3 HOH A 49 250 68 HOH WAT . D 3 HOH A 50 251 69 HOH WAT . D 3 HOH A 51 252 70 HOH WAT . D 3 HOH A 52 253 71 HOH WAT . D 3 HOH A 53 254 72 HOH WAT . D 3 HOH A 54 255 73 HOH WAT . D 3 HOH A 55 256 75 HOH WAT . D 3 HOH A 56 257 76 HOH WAT . D 3 HOH A 57 258 77 HOH WAT . D 3 HOH A 58 259 78 HOH WAT . D 3 HOH A 59 260 79 HOH WAT . D 3 HOH A 60 261 83 HOH WAT . D 3 HOH A 61 262 84 HOH WAT . D 3 HOH A 62 263 85 HOH WAT . D 3 HOH A 63 264 86 HOH WAT . D 3 HOH A 64 265 87 HOH WAT . D 3 HOH A 65 266 89 HOH WAT . D 3 HOH A 66 267 90 HOH WAT . D 3 HOH A 67 268 91 HOH WAT . D 3 HOH A 68 269 93 HOH WAT . D 3 HOH A 69 270 94 HOH WAT . D 3 HOH A 70 271 95 HOH WAT . D 3 HOH A 71 272 96 HOH WAT . D 3 HOH A 72 273 97 HOH WAT . D 3 HOH A 73 274 98 HOH WAT . D 3 HOH A 74 275 99 HOH WAT . D 3 HOH A 75 276 104 HOH WAT . D 3 HOH A 76 277 106 HOH WAT . D 3 HOH A 77 278 107 HOH WAT . D 3 HOH A 78 279 109 HOH WAT . D 3 HOH A 79 280 111 HOH WAT . D 3 HOH A 80 281 114 HOH WAT . D 3 HOH A 81 282 117 HOH WAT . D 3 HOH A 82 283 119 HOH WAT . D 3 HOH A 83 284 122 HOH WAT . D 3 HOH A 84 285 124 HOH WAT . D 3 HOH A 85 286 125 HOH WAT . D 3 HOH A 86 287 126 HOH WAT . D 3 HOH A 87 288 128 HOH WAT . D 3 HOH A 88 289 132 HOH WAT . D 3 HOH A 89 290 136 HOH WAT . D 3 HOH A 90 291 137 HOH WAT . D 3 HOH A 91 292 141 HOH WAT . D 3 HOH A 92 293 142 HOH WAT . D 3 HOH A 93 294 143 HOH WAT . D 3 HOH A 94 295 146 HOH WAT . D 3 HOH A 95 296 147 HOH WAT . D 3 HOH A 96 297 149 HOH WAT . D 3 HOH A 97 298 150 HOH WAT . D 3 HOH A 98 299 154 HOH WAT . D 3 HOH A 99 300 158 HOH WAT . D 3 HOH A 100 301 162 HOH WAT . D 3 HOH A 101 302 163 HOH WAT . D 3 HOH A 102 303 164 HOH WAT . D 3 HOH A 103 304 167 HOH WAT . D 3 HOH A 104 305 168 HOH WAT . D 3 HOH A 105 306 170 HOH WAT . E 3 HOH B 1 132 6 HOH WAT . E 3 HOH B 2 133 17 HOH WAT . E 3 HOH B 3 134 25 HOH WAT . E 3 HOH B 4 135 28 HOH WAT . E 3 HOH B 5 136 30 HOH WAT . E 3 HOH B 6 137 32 HOH WAT . E 3 HOH B 7 138 37 HOH WAT . E 3 HOH B 8 139 40 HOH WAT . E 3 HOH B 9 140 43 HOH WAT . E 3 HOH B 10 141 44 HOH WAT . E 3 HOH B 11 142 47 HOH WAT . E 3 HOH B 12 143 50 HOH WAT . E 3 HOH B 13 144 55 HOH WAT . E 3 HOH B 14 145 56 HOH WAT . E 3 HOH B 15 146 59 HOH WAT . E 3 HOH B 16 147 60 HOH WAT . E 3 HOH B 17 148 61 HOH WAT . E 3 HOH B 18 149 62 HOH WAT . E 3 HOH B 19 150 64 HOH WAT . E 3 HOH B 20 151 74 HOH WAT . E 3 HOH B 21 152 80 HOH WAT . E 3 HOH B 22 153 81 HOH WAT . E 3 HOH B 23 154 82 HOH WAT . E 3 HOH B 24 155 88 HOH WAT . E 3 HOH B 25 156 92 HOH WAT . E 3 HOH B 26 157 100 HOH WAT . E 3 HOH B 27 158 101 HOH WAT . E 3 HOH B 28 159 102 HOH WAT . E 3 HOH B 29 160 103 HOH WAT . E 3 HOH B 30 161 105 HOH WAT . E 3 HOH B 31 162 108 HOH WAT . E 3 HOH B 32 163 112 HOH WAT . E 3 HOH B 33 164 113 HOH WAT . E 3 HOH B 34 165 115 HOH WAT . E 3 HOH B 35 166 116 HOH WAT . E 3 HOH B 36 167 118 HOH WAT . E 3 HOH B 37 168 120 HOH WAT . E 3 HOH B 38 169 121 HOH WAT . E 3 HOH B 39 170 127 HOH WAT . E 3 HOH B 40 171 129 HOH WAT . E 3 HOH B 41 172 130 HOH WAT . E 3 HOH B 42 173 131 HOH WAT . E 3 HOH B 43 174 133 HOH WAT . E 3 HOH B 44 175 134 HOH WAT . E 3 HOH B 45 176 135 HOH WAT . E 3 HOH B 46 177 138 HOH WAT . E 3 HOH B 47 178 139 HOH WAT . E 3 HOH B 48 179 140 HOH WAT . E 3 HOH B 49 180 145 HOH WAT . E 3 HOH B 50 181 148 HOH WAT . E 3 HOH B 51 182 152 HOH WAT . E 3 HOH B 52 183 153 HOH WAT . E 3 HOH B 53 184 155 HOH WAT . E 3 HOH B 54 185 157 HOH WAT . E 3 HOH B 55 186 160 HOH WAT . E 3 HOH B 56 187 161 HOH WAT . E 3 HOH B 57 188 165 HOH WAT . E 3 HOH B 58 189 169 HOH WAT . E 3 HOH B 59 190 171 HOH WAT . E 3 HOH B 60 191 172 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P PO4 . . . C 2 21.938 46.536 23.831 1 61.93 ? P PO4 201 A 1 HETATM 2 O O1 PO4 . . . C 2 22.678 47.774 23.46 1 60.04 ? O1 PO4 201 A 1 HETATM 3 O O2 PO4 . . . C 2 22.806 45.677 24.689 1 59.07 ? O2 PO4 201 A 1 HETATM 4 O O3 PO4 . . . C 2 21.565 45.793 22.598 1 59.77 ? O3 PO4 201 A 1 HETATM 5 O O4 PO4 . . . C 2 20.707 46.899 24.577 1 59.41 ? O4 PO4 201 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 29 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 1290 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 5 #