data_2IUB
#
_model_server_result.job_id            xEVN8SqXSqygv1EU6LBzfw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-06 09:29:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2iub 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"FA","auth_seq_id":1352}' 
#
_entry.id    2IUB 
#
_exptl.entry_id    2IUB 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    21 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          98.88 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2IUB 
_cell.length_a            116.23 
_cell.length_b            151.46 
_cell.length_c            143.32 
_cell.Z_PDB               20 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2IUB 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PQS pentameric 5 software_defined_assembly 1 
PQS pentameric 5 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,MA,NA,OA,PA 1 1 
F,G,H,I,J,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,QA,RA,SA,TA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
? 3 Q N N 
? 3 T N N 
? 3 U N N 
? 3 V N N 
? 3 W N N 
? 3 X N N 
? 3 Y N N 
? 3 Z N N 
? 3 BA N N 
? 3 CA N N 
? 3 FA N N 
? 3 GA N N 
? 3 HA N N 
? 3 IA N N 
? 3 JA N N 
? 3 KA N N 
? 3 LA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 101 A ASP 89 1_555 X MG MG . D MG 1356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 265 A ASP 253 1_555 L MG MG . A MG 1351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc3 L MG MG . A MG 1351 1_555 MA O HOH . A HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc4 L MG MG . A MG 1351 1_555 B OD1 ASP 101 B ASP 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc5 M MG MG . A MG 1352 1_555 NA O HOH . B HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc6 B OD1 ASP 265 B ASP 253 1_555 P MG MG . C MG 1350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.979 ? 
metalc ? metalc7 O MG MG . B MG 1351 1_555 NA O HOH . B HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? 
metalc ? metalc8 NA O HOH . B HOH 2003 1_555 P MG MG . C MG 1350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc9 C OD1 ASP 101 C ASP 89 1_555 P MG MG . C MG 1350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? 
metalc ? metalc10 C OD1 ASP 265 C ASP 253 1_555 Q MG MG . C MG 1351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.831 ? 
metalc ? metalc11 Q MG MG . C MG 1351 1_555 E OD1 ASP 101 E ASP 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
metalc ? metalc12 Q MG MG . C MG 1351 1_555 E OD2 ASP 101 E ASP 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? 
metalc ? metalc13 D O LEU 24 D LEU 12 1_555 W MG MG . D MG 1355 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? 
metalc ? metalc14 D OD1 ASP 101 D ASP 89 1_555 U MG MG . D MG 1353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? 
metalc ? metalc15 D OD1 ASP 265 D ASP 253 1_555 X MG MG . D MG 1356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.678 ? 
metalc ? metalc16 D OD2 ASP 289 D ASP 277 1_555 T MG MG . D MG 1352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? 
metalc ? metalc17 T MG MG . D MG 1352 1_555 E OD2 ASP 289 E ASP 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? 
metalc ? metalc18 U MG MG . D MG 1353 1_555 E OD1 ASP 265 E ASP 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc19 W MG MG . D MG 1355 1_555 PA O HOH . E HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc20 F OD1 ASP 101 F ASP 89 1_555 CA MG MG . F MG 1353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc21 F OD1 ASP 265 F ASP 253 1_555 GA MG MG . G MG 1353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? 
metalc ? metalc22 Z MG MG . F MG 1350 1_555 TA O HOH . I HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? 
metalc ? metalc23 Z MG MG . F MG 1350 1_555 TA O HOH . I HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? 
metalc ? metalc24 CA MG MG . F MG 1353 1_555 QA O HOH . F HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? 
metalc ? metalc25 CA MG MG . F MG 1353 1_555 I OD1 ASP 265 I ASP 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.717 ? 
metalc ? metalc26 G OD1 ASP 101 G ASP 89 1_555 GA MG MG . G MG 1353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc27 G OD2 ASP 101 G ASP 89 1_555 GA MG MG . G MG 1353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? 
metalc ? metalc28 G OD1 ASP 265 G ASP 253 1_555 FA MG MG . G MG 1352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.652 ? 
metalc ? metalc29 FA MG MG . G MG 1352 1_555 H OD1 ASP 101 H ASP 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? 
metalc ? metalc30 H OD1 ASP 265 H ASP 253 1_555 KA MG MG . J MG 1351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.872 ? 
metalc ? metalc31 SA O HOH . H HOH 2002 1_555 LA MG MG . J MG 1352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc32 I OD1 ASP 101 I ASP 89 1_555 JA MG MG . J MG 1350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? 
metalc ? metalc33 J OD1 ASP 101 J ASP 89 1_555 KA MG MG . J MG 1351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.933 ? 
metalc ? metalc34 J OD1 ASP 265 J ASP 253 1_555 JA MG MG . J MG 1350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.965 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2IUB 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008604 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001344 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006602 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007062 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 2 CL A 1 1350 1350 CL CL . 
L 3 MG A 1 1351 1351 MG MG . 
M 3 MG A 1 1352 1352 MG MG . 
N 2 CL B 1 1350 1350 CL CL . 
O 3 MG B 1 1351 1351 MG MG . 
P 3 MG C 1 1350 1350 MG MG . 
Q 3 MG C 1 1351 1351 MG MG . 
R 2 CL D 1 1350 1350 CL CL . 
S 2 CL D 1 1351 1351 CL CL . 
T 3 MG D 1 1352 1352 MG MG . 
U 3 MG D 1 1353 1353 MG MG . 
V 3 MG D 1 1354 1354 MG MG . 
W 3 MG D 1 1355 1355 MG MG . 
X 3 MG D 1 1356 1356 MG MG . 
Y 3 MG E 1 1350 1350 MG MG . 
Z 3 MG F 1 1350 1350 MG MG . 
AA 2 CL F 1 1351 1351 CL CL . 
BA 3 MG F 1 1352 1352 MG MG . 
CA 3 MG F 1 1353 1353 MG MG . 
DA 2 CL G 1 1350 1350 CL CL . 
EA 2 CL G 1 1351 1351 CL CL . 
FA 3 MG G 1 1352 1352 MG MG . 
GA 3 MG G 1 1353 1353 MG MG . 
HA 3 MG G 1 1354 1354 MG MG . 
IA 3 MG H 1 1350 1350 MG MG . 
JA 3 MG J 1 1350 1350 MG MG . 
KA 3 MG J 1 1351 1351 MG MG . 
LA 3 MG J 1 1352 1352 MG MG . 
MA 4 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
MA 4 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
NA 4 HOH B 1 2001 2001 HOH HOH . 
NA 4 HOH B 2 2002 2002 HOH HOH . 
NA 4 HOH B 3 2003 2003 HOH HOH . 
OA 4 HOH C 1 2001 2001 HOH HOH . 
PA 4 HOH E 1 2001 2001 HOH HOH . 
QA 4 HOH F 1 2001 2001 HOH HOH . 
RA 4 HOH G 1 2001 2001 HOH HOH . 
SA 4 HOH H 1 2001 2001 HOH HOH . 
SA 4 HOH H 2 2002 2002 HOH HOH . 
TA 4 HOH I 1 2001 2001 HOH HOH . 
TA 4 HOH I 2 2002 2002 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         FA 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               -37.365 
_atom_site.Cartn_y               38.39 
_atom_site.Cartn_z               85.639 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        44.03 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           1352 
_atom_site.auth_asym_id          G 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              13 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    251 
_model_server_stats.query_time_ms           255 
_model_server_stats.encode_time_ms          8 
_model_server_stats.element_count           1 
#