data_2M2W # _model_server_result.job_id Wyx-GoVQhJK_RGyrgWWpQQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 20:40:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2m2w # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":202}' # _entry.id 2M2W # _exptl.entry_id 2M2W _exptl.method 'SOLUTION NMR' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 D N N ? 4 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B O3' DC 22 B DC 22 1_555 B P DOC 23 B DOC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 49 A ASP 49 1_555 D MG MG . A MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 100 A ASP 100 1_555 D MG MG . A MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 100 A ASP 100 1_555 D MG MG . A MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc4 C O1A DGT . A DGT 201 1_555 D MG MG . A MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc5 C O1A DGT . A DGT 201 1_555 E MG MG . A MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc6 C O2B DGT . A DGT 201 1_555 E MG MG . A MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 DG 1 B DG 1 1_555 B N3 DC 9 B DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 DG 1 B DG 1 1_555 B O2 DC 9 B DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 DG 1 B DG 1 1_555 B N4 DC 9 B DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N1 DG 2 B DG 2 1_555 B N3 DC 8 B DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N2 DG 2 B DG 2 1_555 B O2 DC 8 B DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O6 DG 2 B DG 2 1_555 B N4 DC 8 B DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N3 DC 3 B DC 3 1_555 B N1 DG 7 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N4 DC 3 B DC 3 1_555 B O6 DG 7 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B O2 DC 3 B DC 3 1_555 B N2 DG 7 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N1 DG 11 B DG 11 1_555 B N3 DOC 23 B DOC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B N2 DG 11 B DG 11 1_555 B O2 DOC 23 B DOC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B O6 DG 11 B DG 11 1_555 B N4 DOC 23 B DOC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N1 DG 12 B DG 12 1_555 B N3 DC 22 B DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N2 DG 12 B DG 12 1_555 B O2 DC 22 B DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B O6 DG 12 B DG 12 1_555 B N4 DC 22 B DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N3 DT 13 B DT 13 1_555 B N1 DA 21 B DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B O4 DT 13 B DT 13 1_555 B N6 DA 21 B DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 DG 14 B DG 14 1_555 B N3 DC 20 B DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N2 DG 14 B DG 14 1_555 B O2 DC 20 B DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B O6 DG 14 B DG 14 1_555 B N4 DC 20 B DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N3 DC 15 B DC 15 1_555 B N1 DG 19 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N4 DC 15 B DC 15 1_555 B O6 DG 19 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O2 DC 15 B DC 15 1_555 B N2 DG 19 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog24 B N2 DG 16 B DG 16 1_555 B N1 DA 18 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog25 B N3 DG 16 B DG 16 1_555 B N6 DA 18 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DA MISPAIR' hydrog26 B N1 DA 17 B DA 17 1_555 B N6 DA 18 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2M2W _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 DGT A 1 201 1 DGT DGT . D 4 MG A 1 202 2 MG MG . E 4 MG A 1 203 3 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 6.617 _atom_site.Cartn_y 1.534 _atom_site.Cartn_z -6.584 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 2.05 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 202 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 325 _model_server_stats.query_time_ms 3349 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 1 #