data_2NQP # _model_server_result.job_id gupUnchdTcnu9DuirnhMXA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 14:07:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2nqp # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":77}' # _entry.id 2NQP # _exptl.entry_id 2NQP _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2NQP _cell.length_a 96.278 _cell.length_b 128.585 _cell.length_c 159.256 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2NQP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? trimeric 3 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,F,G,H,I,J,K 1 1 B,C 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O4' A 21 F A 20 1_555 I K K . F K 80 1_555 A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.027 ? metalc ? metalc2 A O2' U 20 F U 20 1_555 I K K . F K 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.332 ? metalc ? metalc3 A O3' U 20 F U 20 1_555 I K K . F K 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? metalc ? metalc4 A O2' U 20 F U 20 1_555 J K K . F K 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.448 ? metalc ? metalc5 A O4 U 59 F U 48 1_555 J K K . F K 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc6 A OP1 G 60 F G 49 1_555 G K K . F K 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc7 A O4 U 65 F U 54 1_555 H K K . F K 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? metalc ? metalc8 A O4 U 66 F U 55 1_555 H K K . F K 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.112 ? metalc ? metalc9 A O3' G 70 F G 59 1_555 G K K . F K 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.151 ? metalc ? metalc10 A O2' G 70 F G 59 1_555 G K K . F K 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? metalc ? metalc11 A OP1 G 70 F G 59 1_555 J K K . F K 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? metalc ? metalc12 A OP2 G 70 F G 59 1_555 J K K . F K 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.632 ? metalc ? metalc13 A OP1 U 71 F U 60 1_555 F K K . F K 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.462 ? metalc ? metalc14 A O4 U 71 F U 60 1_555 J K K . F K 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.316 ? metalc ? metalc15 A N4 C 73 F C 62 1_555 F K K . F K 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc ? metalc16 I K K . F K 80 1_555 J K K . F K 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc ? metalc17 D O ALA 89 C ALA 89 1_555 K K K . C K 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.481 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 5 F G 5 1_555 A N3 C 79 F C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 5 F G 5 1_555 A O2 C 79 F C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 5 F G 5 1_555 A N4 C 79 F C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 6 F G 6 1_555 A N3 C 78 F C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 6 F G 6 1_555 A O2 C 78 F C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 6 F G 6 1_555 A N4 C 78 F C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 A 7 F A 7 1_555 A N3 U 77 F U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N6 A 7 F A 7 1_555 A O4 U 77 F U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog9 A N3 U 8 F U 8 1_555 A O6 G 13 F G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog10 A O6 G 9 F G 9 1_555 A N4 C 24 F C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog11 A N1 G 10 F G 10 1_555 A N3 C 26 F C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog12 A N3 U 11 F U 11 1_555 A N1 A 25 F A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N1 G 12 F G 12 1_555 A N3 C 24 F C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N2 G 12 F G 12 1_555 A O2 C 24 F C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A O6 G 12 F G 12 1_555 A N4 C 24 F C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog16 A N2 G 13 F G 13 1_555 A N7 A 23 F A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-A MISPAIR' hydrog17 A N6 A 14 F A 14 1_555 A N3 A 21 F A 20 1_555 ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog18 A N1 A 15 F A 15 1_555 A N3 U 59 F U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog19 A N6 A 15 F A 15 1_555 A O2 U 59 F U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog20 A N1 G 18 F G 18 1_555 A O2 U 66 F U 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog21 A N2 G 19 F G 19 1_555 A N3 C 67 F C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog22 A O6 G 22 F G 21 1_555 A N1 G 58 F G 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog23 A N6 A 27 F A 26 1_555 A N3 C 45 F C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N1 A 28 F A 27 1_555 A N3 U 44 F U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N6 A 28 F A 27 1_555 A O4 U 44 F U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N1 G 29 F G 28 1_555 A N3 C 43 F C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N2 G 29 F G 28 1_555 A O2 C 43 F C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A O6 G 29 F G 28 1_555 A N4 C 43 F C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N1 G 30 F G 29 1_555 A N3 C 42 F C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N2 G 30 F G 29 1_555 A O2 C 42 F C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O6 G 30 F G 29 1_555 A N4 C 42 F C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N1 G 31 F G 30 1_555 A N3 C 41 F C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N2 G 31 F G 30 1_555 A O2 C 41 F C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O6 G 31 F G 30 1_555 A N4 C 41 F C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A N1 A 32 F A 31 1_555 A N3 U 40 F U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N6 A 32 F A 31 1_555 A O4 U 40 F U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog37 A N2 G 46 F G 45 1_555 A O2 U 57 F U 46 1_555 A ? ? L ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N1 G 47 F G 45 1_555 A N3 C 56 F C 46 1_555 B ? ? K ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N2 G 47 F G 45 1_555 A O2 C 56 F C 46 1_555 B ? ? K ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A O6 G 47 F G 45 1_555 A N4 C 56 F C 46 1_555 B ? ? K ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A N3 C 48 F C 45 1_555 A N1 G 55 F G 46 1_555 C ? ? J ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N4 C 48 F C 45 1_555 A O6 G 55 F G 46 1_555 C ? ? J ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O2 C 48 F C 45 1_555 A N2 G 55 F G 46 1_555 C ? ? J ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog44 A O2 C 61 F C 50 1_555 A N1 G 75 F G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog45 A O6 G 62 F G 51 1_555 A N4 C 74 F C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog46 A N1 G 63 F G 52 1_555 A N3 C 73 F C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N1 G 64 F G 53 1_555 A N3 C 72 F C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A N2 G 64 F G 53 1_555 A O2 C 72 F C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A O6 G 64 F G 53 1_555 A N4 C 72 F C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-A PAIR' hydrog50 A N3 U 65 F U 54 1_555 A N7 A 69 F A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2NQP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010387 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007777 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006279 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 3 K F 1 77 1 K K . G 3 K F 1 78 2 K K . H 3 K F 1 79 3 K K . I 3 K F 1 80 5 K K . J 3 K F 1 81 6 K K . K 3 K C 1 271 4 K K . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -7.809 _atom_site.Cartn_y -43.54 _atom_site.Cartn_z 5.015 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 56.4 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 77 _atom_site.auth_asym_id F _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #