data_2NUP # _model_server_result.job_id JwGSQXdFNI_m36VUhOt84w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 15:17:35' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2nup # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1100}' # _entry.id 2NUP # _exptl.entry_id 2NUP _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90.23 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2NUP _cell.length_a 148.2 _cell.length_b 97.4 _cell.length_c 129.62 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2NUP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 D N N ? 4 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 65 A CYS 61 1_555 D ZN ZN . A ZN 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 70 A CYS 66 1_555 D ZN ZN . A ZN 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 89 A CYS 85 1_555 D ZN ZN . A ZN 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 92 A CYS 88 1_555 D ZN ZN . A ZN 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 91 B CYS 431 1_555 E ZN ZN . B ZN 1100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc6 B SG CYS 94 B CYS 434 1_555 E ZN ZN . B ZN 1100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 112 B CYS 452 1_555 E ZN ZN . B ZN 1100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 115 B CYS 455 1_555 E ZN ZN . B ZN 1100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2NUP _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006748 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000027 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010267 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007715 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 ZN A 1 800 800 ZN ZN . E 4 ZN B 1 1100 1100 ZN ZN . F 5 HOH A 1 801 1 HOH WAT . F 5 HOH A 2 802 4 HOH WAT . F 5 HOH A 3 803 7 HOH WAT . F 5 HOH A 4 804 10 HOH WAT . F 5 HOH A 5 805 13 HOH WAT . F 5 HOH A 6 806 15 HOH WAT . F 5 HOH A 7 807 16 HOH WAT . F 5 HOH A 8 808 18 HOH WAT . F 5 HOH A 9 809 19 HOH WAT . F 5 HOH A 10 810 23 HOH WAT . F 5 HOH A 11 811 26 HOH WAT . F 5 HOH A 12 812 29 HOH WAT . F 5 HOH A 13 813 30 HOH WAT . F 5 HOH A 14 814 31 HOH WAT . F 5 HOH A 15 815 32 HOH WAT . F 5 HOH A 16 816 33 HOH WAT . F 5 HOH A 17 817 34 HOH WAT . F 5 HOH A 18 818 35 HOH WAT . F 5 HOH A 19 819 36 HOH WAT . F 5 HOH A 20 820 37 HOH WAT . F 5 HOH A 21 821 38 HOH WAT . F 5 HOH A 22 822 41 HOH WAT . F 5 HOH A 23 823 42 HOH WAT . F 5 HOH A 24 824 44 HOH WAT . F 5 HOH A 25 825 47 HOH WAT . F 5 HOH A 26 826 49 HOH WAT . F 5 HOH A 27 827 55 HOH WAT . F 5 HOH A 28 828 58 HOH WAT . F 5 HOH A 29 829 59 HOH WAT . F 5 HOH A 30 830 60 HOH WAT . F 5 HOH A 31 831 62 HOH WAT . F 5 HOH A 32 832 63 HOH WAT . F 5 HOH A 33 833 65 HOH WAT . F 5 HOH A 34 834 70 HOH WAT . F 5 HOH A 35 835 71 HOH WAT . F 5 HOH A 36 836 72 HOH WAT . F 5 HOH A 37 837 73 HOH WAT . F 5 HOH A 38 838 74 HOH WAT . F 5 HOH A 39 839 77 HOH WAT . F 5 HOH A 40 840 81 HOH WAT . F 5 HOH A 41 841 83 HOH WAT . F 5 HOH A 42 842 84 HOH WAT . F 5 HOH A 43 843 86 HOH WAT . F 5 HOH A 44 844 87 HOH WAT . F 5 HOH A 45 845 88 HOH WAT . F 5 HOH A 46 846 99 HOH WAT . F 5 HOH A 47 847 102 HOH WAT . F 5 HOH A 48 848 104 HOH WAT . F 5 HOH A 49 849 106 HOH WAT . F 5 HOH A 50 850 115 HOH WAT . F 5 HOH A 51 851 116 HOH WAT . F 5 HOH A 52 852 123 HOH WAT . F 5 HOH A 53 853 124 HOH WAT . F 5 HOH A 54 854 125 HOH WAT . F 5 HOH A 55 855 126 HOH WAT . F 5 HOH A 56 856 128 HOH WAT . F 5 HOH A 57 857 130 HOH WAT . F 5 HOH A 58 858 132 HOH WAT . F 5 HOH A 59 859 133 HOH WAT . F 5 HOH A 60 860 135 HOH WAT . F 5 HOH A 61 861 141 HOH WAT . F 5 HOH A 62 862 142 HOH WAT . F 5 HOH A 63 863 143 HOH WAT . F 5 HOH A 64 864 145 HOH WAT . F 5 HOH A 65 865 149 HOH WAT . F 5 HOH A 66 866 150 HOH WAT . F 5 HOH A 67 867 153 HOH WAT . F 5 HOH A 68 868 157 HOH WAT . F 5 HOH A 69 869 158 HOH WAT . F 5 HOH A 70 870 159 HOH WAT . F 5 HOH A 71 871 164 HOH WAT . F 5 HOH A 72 872 165 HOH WAT . F 5 HOH A 73 873 166 HOH WAT . F 5 HOH A 74 874 167 HOH WAT . F 5 HOH A 75 875 168 HOH WAT . F 5 HOH A 76 876 169 HOH WAT . F 5 HOH A 77 877 170 HOH WAT . F 5 HOH A 78 878 171 HOH WAT . F 5 HOH A 79 879 172 HOH WAT . F 5 HOH A 80 880 173 HOH WAT . F 5 HOH A 81 881 174 HOH WAT . F 5 HOH A 82 882 175 HOH WAT . F 5 HOH A 83 883 176 HOH WAT . F 5 HOH A 84 884 177 HOH WAT . F 5 HOH A 85 885 178 HOH WAT . F 5 HOH A 86 886 179 HOH WAT . F 5 HOH A 87 887 180 HOH WAT . F 5 HOH A 88 888 181 HOH WAT . F 5 HOH A 89 889 205 HOH WAT . F 5 HOH A 90 890 212 HOH WAT . F 5 HOH A 91 891 214 HOH WAT . F 5 HOH A 92 892 220 HOH WAT . G 5 HOH B 1 2 2 HOH WAT . G 5 HOH B 2 3 3 HOH WAT . G 5 HOH B 3 5 5 HOH WAT . G 5 HOH B 4 6 6 HOH WAT . G 5 HOH B 5 8 8 HOH WAT . G 5 HOH B 6 9 9 HOH WAT . G 5 HOH B 7 11 11 HOH WAT . G 5 HOH B 8 12 12 HOH WAT . G 5 HOH B 9 14 14 HOH WAT . G 5 HOH B 10 17 17 HOH WAT . G 5 HOH B 11 20 20 HOH WAT . G 5 HOH B 12 21 21 HOH WAT . G 5 HOH B 13 22 22 HOH WAT . G 5 HOH B 14 24 24 HOH WAT . G 5 HOH B 15 25 25 HOH WAT . G 5 HOH B 16 27 27 HOH WAT . G 5 HOH B 17 28 28 HOH WAT . G 5 HOH B 18 39 39 HOH WAT . G 5 HOH B 19 40 40 HOH WAT . G 5 HOH B 20 43 43 HOH WAT . G 5 HOH B 21 45 45 HOH WAT . G 5 HOH B 22 46 46 HOH WAT . G 5 HOH B 23 48 48 HOH WAT . G 5 HOH B 24 50 50 HOH WAT . G 5 HOH B 25 51 51 HOH WAT . G 5 HOH B 26 52 52 HOH WAT . G 5 HOH B 27 53 53 HOH WAT . G 5 HOH B 28 54 54 HOH WAT . G 5 HOH B 29 56 56 HOH WAT . G 5 HOH B 30 57 57 HOH WAT . G 5 HOH B 31 61 61 HOH WAT . G 5 HOH B 32 64 64 HOH WAT . G 5 HOH B 33 66 66 HOH WAT . G 5 HOH B 34 68 68 HOH WAT . G 5 HOH B 35 75 75 HOH WAT . G 5 HOH B 36 76 76 HOH WAT . G 5 HOH B 37 78 78 HOH WAT . G 5 HOH B 38 79 79 HOH WAT . G 5 HOH B 39 80 80 HOH WAT . G 5 HOH B 40 82 82 HOH WAT . G 5 HOH B 41 85 85 HOH WAT . G 5 HOH B 42 89 89 HOH WAT . G 5 HOH B 43 90 90 HOH WAT . G 5 HOH B 44 91 91 HOH WAT . G 5 HOH B 45 92 92 HOH WAT . G 5 HOH B 46 93 93 HOH WAT . G 5 HOH B 47 94 94 HOH WAT . G 5 HOH B 48 100 100 HOH WAT . G 5 HOH B 49 101 101 HOH WAT . G 5 HOH B 50 103 103 HOH WAT . G 5 HOH B 51 105 105 HOH WAT . G 5 HOH B 52 107 107 HOH WAT . G 5 HOH B 53 108 108 HOH WAT . G 5 HOH B 54 109 109 HOH WAT . G 5 HOH B 55 110 110 HOH WAT . G 5 HOH B 56 111 111 HOH WAT . G 5 HOH B 57 112 112 HOH WAT . G 5 HOH B 58 113 113 HOH WAT . G 5 HOH B 59 114 114 HOH WAT . G 5 HOH B 60 118 118 HOH WAT . G 5 HOH B 61 119 119 HOH WAT . G 5 HOH B 62 120 120 HOH WAT . G 5 HOH B 63 121 121 HOH WAT . G 5 HOH B 64 122 122 HOH WAT . G 5 HOH B 65 127 127 HOH WAT . G 5 HOH B 66 129 129 HOH WAT . G 5 HOH B 67 131 131 HOH WAT . G 5 HOH B 68 134 134 HOH WAT . G 5 HOH B 69 136 136 HOH WAT . G 5 HOH B 70 137 137 HOH WAT . G 5 HOH B 71 138 138 HOH WAT . G 5 HOH B 72 140 140 HOH WAT . G 5 HOH B 73 146 146 HOH WAT . G 5 HOH B 74 147 147 HOH WAT . G 5 HOH B 75 148 148 HOH WAT . G 5 HOH B 76 151 151 HOH WAT . G 5 HOH B 77 152 152 HOH WAT . G 5 HOH B 78 154 154 HOH WAT . G 5 HOH B 79 155 155 HOH WAT . G 5 HOH B 80 156 156 HOH WAT . G 5 HOH B 81 160 160 HOH WAT . G 5 HOH B 82 161 161 HOH WAT . G 5 HOH B 83 162 162 HOH WAT . G 5 HOH B 84 182 182 HOH WAT . G 5 HOH B 85 183 183 HOH WAT . G 5 HOH B 86 184 184 HOH WAT . G 5 HOH B 87 185 185 HOH WAT . G 5 HOH B 88 186 186 HOH WAT . G 5 HOH B 89 187 187 HOH WAT . G 5 HOH B 90 188 188 HOH WAT . G 5 HOH B 91 189 189 HOH WAT . G 5 HOH B 92 190 190 HOH WAT . G 5 HOH B 93 191 191 HOH WAT . G 5 HOH B 94 192 192 HOH WAT . G 5 HOH B 95 193 193 HOH WAT . G 5 HOH B 96 194 194 HOH WAT . G 5 HOH B 97 195 195 HOH WAT . G 5 HOH B 98 196 196 HOH WAT . G 5 HOH B 99 197 197 HOH WAT . G 5 HOH B 100 198 198 HOH WAT . G 5 HOH B 101 199 199 HOH WAT . G 5 HOH B 102 200 200 HOH WAT . G 5 HOH B 103 201 201 HOH WAT . G 5 HOH B 104 202 202 HOH WAT . G 5 HOH B 105 203 203 HOH WAT . G 5 HOH B 106 204 204 HOH WAT . G 5 HOH B 107 206 206 HOH WAT . G 5 HOH B 108 207 207 HOH WAT . G 5 HOH B 109 208 208 HOH WAT . G 5 HOH B 110 209 209 HOH WAT . G 5 HOH B 111 210 210 HOH WAT . G 5 HOH B 112 211 211 HOH WAT . G 5 HOH B 113 213 213 HOH WAT . G 5 HOH B 114 215 215 HOH WAT . G 5 HOH B 115 216 216 HOH WAT . G 5 HOH B 116 217 217 HOH WAT . G 5 HOH B 117 218 218 HOH WAT . G 5 HOH B 118 219 219 HOH WAT . H 5 HOH C 1 196 67 HOH WAT . H 5 HOH C 2 197 69 HOH WAT . H 5 HOH C 3 198 95 HOH WAT . H 5 HOH C 4 199 96 HOH WAT . H 5 HOH C 5 200 97 HOH WAT . H 5 HOH C 6 201 98 HOH WAT . H 5 HOH C 7 202 117 HOH WAT . H 5 HOH C 8 203 139 HOH WAT . H 5 HOH C 9 204 144 HOH WAT . H 5 HOH C 10 205 163 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 42.416 _atom_site.Cartn_y 57.301 _atom_site.Cartn_z 53.86 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 34.71 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1100 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 69 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 328 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #