data_2NYM # _model_server_result.job_id lyeX2QiVo-1J7K-WqYWDug _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 12:52:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2nym # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":502}' # _entry.id 2NYM # _exptl.entry_id 2NYM _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 54.938 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MANGANESE (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2NYM _cell.length_a 108.17 _cell.length_b 158.86 _cell.length_c 270.75 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2NYM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? tetrameric 4 author_defined_assembly 1 ? tetrameric 4 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,I,J 1 1 D,E,F,H,K,L 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 I N N ? 5 J N N ? 5 K N N ? 5 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C PRO 172 A PRO 179 1_555 A N MSE 173 A MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale2 A C MSE 173 A MSE 180 1_555 A N VAL 174 A VAL 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale3 A C PRO 200 A PRO 207 1_555 A N MSE 201 A MSE 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale4 A C MSE 201 A MSE 208 1_555 A N PHE 202 A PHE 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale5 A C VAL 237 A VAL 244 1_555 A N MSE 238 A MSE 245 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale6 A C MSE 238 A MSE 245 1_555 A N PRO 239 A PRO 246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale7 A C TYR 254 A TYR 261 1_555 A N MSE 255 A MSE 262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale8 A C MSE 255 A MSE 262 1_555 A N VAL 256 A VAL 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale9 A C LEU 283 A LEU 290 1_555 A N MSE 284 A MSE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale10 A C MSE 284 A MSE 291 1_555 A N LYS 285 A LYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale11 A C ILE 315 A ILE 322 1_555 A N MSE 316 A MSE 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale12 A C MSE 316 A MSE 323 1_555 A N SER 317 A SER 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale13 A C ILE 342 A ILE 349 1_555 A N MSE 343 A MSE 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale14 A C MSE 343 A MSE 350 1_555 A N GLY 344 A GLY 351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale15 A C TYR 419 A TYR 426 1_555 A N MSE 420 A MSE 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale16 A C MSE 420 A MSE 427 1_555 A N PRO 421 A PRO 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale17 A C CYS 440 A CYS 447 1_555 A N MSE 441 A MSE 448 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale18 A C MSE 441 A MSE 448 1_555 A N ALA 442 A ALA 449 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale19 A C ALA 481 A ALA 488 1_555 A N MSE 482 A MSE 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale20 A C MSE 482 A MSE 489 1_555 A N SER 483 A SER 490 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale21 A C ARG 491 A ARG 498 1_555 A N MSE 492 A MSE 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale22 A C MSE 492 A MSE 499 1_555 A N THR 493 A THR 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale23 A C HIS 513 A HIS 520 1_555 A N MSE 514 A MSE 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale24 A C MSE 514 A MSE 521 1_555 A N LEU 515 A LEU 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale25 A C ARG 520 A ARG 527 1_555 A N MSE 521 A MSE 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale26 A C MSE 521 A MSE 528 1_555 A N ALA 522 A ALA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale27 B C GLU 38 B GLU 65 1_555 B N MSE 39 B MSE 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale28 B C MSE 39 B MSE 66 1_555 B N VAL 40 B VAL 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale29 B C HIS 60 B HIS 87 1_555 B N MSE 61 B MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale30 B C MSE 61 B MSE 88 1_555 B N PHE 62 B PHE 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale31 B C ASN 65 B ASN 92 1_555 B N MSE 66 B MSE 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale32 B C MSE 66 B MSE 93 1_555 B N PHE 67 B PHE 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale33 B C VAL 249 B VAL 276 1_555 B N MSE 250 B MSE 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale34 B C MSE 250 B MSE 277 1_555 B N ALA 251 B ALA 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale35 B C VAL 265 B VAL 292 1_555 B N MSE 266 B MSE 293 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale36 B C MSE 266 B MSE 293 1_555 B N PHE 267 B PHE 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale37 B C ILE 286 B ILE 313 1_555 B N MSE 287 B MSE 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale38 B C MSE 287 B MSE 314 1_555 B N GLU 288 B GLU 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale39 B C ILE 318 B ILE 345 1_555 B N MSE 319 B MSE 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? covale ? covale40 B C MSE 319 B MSE 346 1_555 B N SER 320 B SER 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale41 B C ILE 332 B ILE 359 1_555 B N MSE 333 B MSE 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale42 B C MSE 333 B MSE 360 1_555 B N PHE 334 B PHE 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? covale ? covale43 B C PHE 360 B PHE 387 1_555 B N MSE 361 B MSE 388 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale44 B C MSE 361 B MSE 388 1_555 B N GLU 362 B GLU 389 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale45 B C GLU 362 B GLU 389 1_555 B N MSE 363 B MSE 390 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale46 B C MSE 363 B MSE 390 1_555 B N ASN 364 B ASN 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale47 B C LYS 385 B LYS 412 1_555 B N MSE 386 B MSE 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale48 B C MSE 386 B MSE 413 1_555 B N LYS 387 B LYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale49 C SG CYS 268 C CYS 269 1_555 G CB DAM 7 G DAM 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? covale ? covale50 D C PRO 172 D PRO 179 1_555 D N MSE 173 D MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale51 D C MSE 173 D MSE 180 1_555 D N VAL 174 D VAL 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale ? covale52 D C PRO 200 D PRO 207 1_555 D N MSE 201 D MSE 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale53 D C MSE 201 D MSE 208 1_555 D N PHE 202 D PHE 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale54 D C VAL 237 D VAL 244 1_555 D N MSE 238 D MSE 245 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale55 D C MSE 238 D MSE 245 1_555 D N PRO 239 D PRO 246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale56 D C TYR 254 D TYR 261 1_555 D N MSE 255 D MSE 262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale57 D C MSE 255 D MSE 262 1_555 D N VAL 256 D VAL 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale58 D C LEU 283 D LEU 290 1_555 D N MSE 284 D MSE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale59 D C MSE 284 D MSE 291 1_555 D N LYS 285 D LYS 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale60 D C ILE 315 D ILE 322 1_555 D N MSE 316 D MSE 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale61 D C MSE 316 D MSE 323 1_555 D N SER 317 D SER 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.314 ? covale ? covale62 D C ILE 342 D ILE 349 1_555 D N MSE 343 D MSE 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale63 D C MSE 343 D MSE 350 1_555 D N GLY 344 D GLY 351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? covale ? covale64 D C TYR 419 D TYR 426 1_555 D N MSE 420 D MSE 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale65 D C MSE 420 D MSE 427 1_555 D N PRO 421 D PRO 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale66 D C CYS 440 D CYS 447 1_555 D N MSE 441 D MSE 448 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale67 D C MSE 441 D MSE 448 1_555 D N ALA 442 D ALA 449 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale68 D C ALA 481 D ALA 488 1_555 D N MSE 482 D MSE 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale69 D C MSE 482 D MSE 489 1_555 D N SER 483 D SER 490 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale70 D C ARG 491 D ARG 498 1_555 D N MSE 492 D MSE 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale71 D C MSE 492 D MSE 499 1_555 D N THR 493 D THR 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale72 D C HIS 513 D HIS 520 1_555 D N MSE 514 D MSE 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale73 D C MSE 514 D MSE 521 1_555 D N LEU 515 D LEU 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale74 D C ARG 520 D ARG 527 1_555 D N MSE 521 D MSE 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale75 D C MSE 521 D MSE 528 1_555 D N ALA 522 D ALA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale76 E C GLU 38 E GLU 65 1_555 E N MSE 39 E MSE 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale77 E C MSE 39 E MSE 66 1_555 E N VAL 40 E VAL 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale78 E C HIS 60 E HIS 87 1_555 E N MSE 61 E MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? covale ? covale79 E C MSE 61 E MSE 88 1_555 E N PHE 62 E PHE 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale80 E C ASN 65 E ASN 92 1_555 E N MSE 66 E MSE 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale81 E C MSE 66 E MSE 93 1_555 E N PHE 67 E PHE 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? covale ? covale82 E C VAL 249 E VAL 276 1_555 E N MSE 250 E MSE 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale83 E C MSE 250 E MSE 277 1_555 E N ALA 251 E ALA 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale84 E C VAL 265 E VAL 292 1_555 E N MSE 266 E MSE 293 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale85 E C MSE 266 E MSE 293 1_555 E N PHE 267 E PHE 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale86 E C ILE 286 E ILE 313 1_555 E N MSE 287 E MSE 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale87 E C MSE 287 E MSE 314 1_555 E N GLU 288 E GLU 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale88 E C ILE 318 E ILE 345 1_555 E N MSE 319 E MSE 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale89 E C MSE 319 E MSE 346 1_555 E N SER 320 E SER 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale90 E C ILE 332 E ILE 359 1_555 E N MSE 333 E MSE 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale91 E C MSE 333 E MSE 360 1_555 E N PHE 334 E PHE 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale ? covale92 E C PHE 360 E PHE 387 1_555 E N MSE 361 E MSE 388 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale93 E C MSE 361 E MSE 388 1_555 E N GLU 362 E GLU 389 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale94 E C GLU 362 E GLU 389 1_555 E N MSE 363 E MSE 390 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale95 E C MSE 363 E MSE 390 1_555 E N ASN 364 E ASN 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale96 E C LYS 385 E LYS 412 1_555 E N MSE 386 E MSE 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale97 E C MSE 386 E MSE 413 1_555 E N LYS 387 E LYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale98 F SG CYS 268 F CYS 269 1_555 H CB DAM 7 H DAM 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.796 ? covale ? covale99 G C DAL 1 G DAL 1 1_555 G N LEU 2 G LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale100 G N DAL 1 G DAL 1 1_555 G C DAM 7 G DAM 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale101 G CG ACB 3 G ACB 3 1_555 G N ARG 4 G ARG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale102 G C ARG 4 G ARG 4 1_555 G N 1ZN 5 G 1ZN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale103 G C 1ZN 5 G 1ZN 5 1_555 G N FGA 6 G FGA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale104 G CD FGA 6 G FGA 6 1_555 G N DAM 7 G DAM 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale105 H C DAL 1 H DAL 1 1_555 H N LEU 2 H LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale106 H N DAL 1 H DAL 1 1_555 H C DAM 7 H DAM 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale107 H CG ACB 3 H ACB 3 1_555 H N ARG 4 H ARG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale108 H C ARG 4 H ARG 4 1_555 H N 1ZN 5 H 1ZN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale109 H C 1ZN 5 H 1ZN 5 1_555 H N FGA 6 H FGA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale110 H CD FGA 6 H FGA 6 1_555 H N DAM 7 H DAM 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? metalc ? metalc1 C OD2 ASP 56 C ASP 57 1_555 J MN MN . C MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc2 C NE2 HIS 58 C HIS 59 1_555 J MN MN . C MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc3 C OD2 ASP 84 C ASP 85 1_555 I MN MN . C MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc4 C OD2 ASP 84 C ASP 85 1_555 J MN MN . C MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? metalc ? metalc5 C OD1 ASN 116 C ASN 117 1_555 I MN MN . C MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? metalc ? metalc6 C NE2 HIS 166 C HIS 167 1_555 I MN MN . C MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc7 C ND1 HIS 240 C HIS 241 1_555 I MN MN . C MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc8 I MN MN . C MN 501 1_555 J MN MN . C MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.85 ? metalc ? metalc9 F OD2 ASP 56 F ASP 57 1_555 L MN MN . F MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc10 F NE2 HIS 58 F HIS 59 1_555 L MN MN . F MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc11 F OD2 ASP 84 F ASP 85 1_555 K MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc12 F OD2 ASP 84 F ASP 85 1_555 L MN MN . F MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? metalc ? metalc13 F OD1 ASN 116 F ASN 117 1_555 K MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc ? metalc14 F NE2 HIS 166 F HIS 167 1_555 K MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc15 F ND1 HIS 240 F HIS 241 1_555 K MN MN . F MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc16 K MN MN . F MN 501 1_555 L MN MN . F MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? # _chem_comp.formula 'Mn 2' _chem_comp.formula_weight 54.938 _chem_comp.id MN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MANGANESE (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2NYM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009245 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006295 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003693 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 5 MN C 1 501 501 MN MN . J 5 MN C 1 502 502 MN MN . K 5 MN F 1 501 501 MN MN . L 5 MN F 1 502 502 MN MN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MN _atom_site.label_atom_id MN _atom_site.label_comp_id MN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id L _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x -10.333 _atom_site.Cartn_y 53.665 _atom_site.Cartn_z -46.851 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 33.5 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MN _atom_site.auth_comp_id MN _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id F _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 27 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 318 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #