data_2NYQ
#
_model_server_result.job_id            b-foX-IRKScFY8e0tDWPFw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-18 20:23:19' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2nyq 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":300}' 
#
_entry.id    2NYQ 
#
_exptl.entry_id    2NYQ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            2NYQ 
_cell.length_a            107.8 
_cell.length_b            107.8 
_cell.length_c            99.6 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2NYQ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        178 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA,PQS 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 C N N 
? 3 D N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 223 A CYS 223 1_555 A SG CYS 227 A CYS 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 97 A HIS 97 1_555 D ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 117 A ASP 117 1_555 C ZN ZN . A ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 117 A ASP 117 1_555 D ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? 
metalc ? metalc4 A OE1 GLU 152 A GLU 152 1_555 C ZN ZN . A ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 179 A ASP 179 1_555 D ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? 
metalc ? metalc6 A NE2 HIS 256 A HIS 256 1_555 C ZN ZN . A ZN 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc7 D ZN ZN . A ZN 301 1_555 E O HOH . A HOH 441 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2NYQ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009276 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.005356 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010712 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.01004 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 ZN A 1 300 292 ZN ZN . 
D 3 ZN A 1 301 293 ZN ZN . 
E 4 HOH A 1 302 295 HOH WAT . 
E 4 HOH A 2 303 296 HOH WAT . 
E 4 HOH A 3 304 297 HOH WAT . 
E 4 HOH A 4 305 298 HOH WAT . 
E 4 HOH A 5 306 299 HOH WAT . 
E 4 HOH A 6 307 300 HOH WAT . 
E 4 HOH A 7 308 301 HOH WAT . 
E 4 HOH A 8 309 302 HOH WAT . 
E 4 HOH A 9 310 303 HOH WAT . 
E 4 HOH A 10 311 304 HOH WAT . 
E 4 HOH A 11 312 305 HOH WAT . 
E 4 HOH A 12 313 306 HOH WAT . 
E 4 HOH A 13 314 307 HOH WAT . 
E 4 HOH A 14 315 308 HOH WAT . 
E 4 HOH A 15 316 309 HOH WAT . 
E 4 HOH A 16 317 310 HOH WAT . 
E 4 HOH A 17 318 311 HOH WAT . 
E 4 HOH A 18 319 312 HOH WAT . 
E 4 HOH A 19 320 313 HOH WAT . 
E 4 HOH A 20 321 314 HOH WAT . 
E 4 HOH A 21 322 315 HOH WAT . 
E 4 HOH A 22 323 316 HOH WAT . 
E 4 HOH A 23 324 317 HOH WAT . 
E 4 HOH A 24 325 318 HOH WAT . 
E 4 HOH A 25 326 319 HOH WAT . 
E 4 HOH A 26 327 320 HOH WAT . 
E 4 HOH A 27 328 321 HOH WAT . 
E 4 HOH A 28 329 322 HOH WAT . 
E 4 HOH A 29 330 323 HOH WAT . 
E 4 HOH A 30 331 324 HOH WAT . 
E 4 HOH A 31 332 325 HOH WAT . 
E 4 HOH A 32 333 326 HOH WAT . 
E 4 HOH A 33 334 327 HOH WAT . 
E 4 HOH A 34 335 328 HOH WAT . 
E 4 HOH A 35 336 329 HOH WAT . 
E 4 HOH A 36 337 330 HOH WAT . 
E 4 HOH A 37 338 331 HOH WAT . 
E 4 HOH A 38 339 332 HOH WAT . 
E 4 HOH A 39 340 333 HOH WAT . 
E 4 HOH A 40 341 334 HOH WAT . 
E 4 HOH A 41 342 335 HOH WAT . 
E 4 HOH A 42 343 336 HOH WAT . 
E 4 HOH A 43 344 337 HOH WAT . 
E 4 HOH A 44 345 338 HOH WAT . 
E 4 HOH A 45 346 339 HOH WAT . 
E 4 HOH A 46 347 340 HOH WAT . 
E 4 HOH A 47 348 341 HOH WAT . 
E 4 HOH A 48 349 342 HOH WAT . 
E 4 HOH A 49 350 343 HOH WAT . 
E 4 HOH A 50 351 344 HOH WAT . 
E 4 HOH A 51 352 345 HOH WAT . 
E 4 HOH A 52 353 346 HOH WAT . 
E 4 HOH A 53 354 347 HOH WAT . 
E 4 HOH A 54 355 348 HOH WAT . 
E 4 HOH A 55 356 349 HOH WAT . 
E 4 HOH A 56 357 350 HOH WAT . 
E 4 HOH A 57 358 351 HOH WAT . 
E 4 HOH A 58 359 352 HOH WAT . 
E 4 HOH A 59 360 353 HOH WAT . 
E 4 HOH A 60 361 354 HOH WAT . 
E 4 HOH A 61 362 355 HOH WAT . 
E 4 HOH A 62 363 356 HOH WAT . 
E 4 HOH A 63 364 357 HOH WAT . 
E 4 HOH A 64 365 358 HOH WAT . 
E 4 HOH A 65 366 359 HOH WAT . 
E 4 HOH A 66 367 360 HOH WAT . 
E 4 HOH A 67 368 361 HOH WAT . 
E 4 HOH A 68 369 362 HOH WAT . 
E 4 HOH A 69 370 363 HOH WAT . 
E 4 HOH A 70 371 364 HOH WAT . 
E 4 HOH A 71 372 365 HOH WAT . 
E 4 HOH A 72 373 366 HOH WAT . 
E 4 HOH A 73 374 367 HOH WAT . 
E 4 HOH A 74 375 368 HOH WAT . 
E 4 HOH A 75 376 369 HOH WAT . 
E 4 HOH A 76 377 370 HOH WAT . 
E 4 HOH A 77 378 371 HOH WAT . 
E 4 HOH A 78 379 372 HOH WAT . 
E 4 HOH A 79 380 373 HOH WAT . 
E 4 HOH A 80 381 374 HOH WAT . 
E 4 HOH A 81 382 375 HOH WAT . 
E 4 HOH A 82 383 376 HOH WAT . 
E 4 HOH A 83 384 377 HOH WAT . 
E 4 HOH A 84 385 378 HOH WAT . 
E 4 HOH A 85 386 379 HOH WAT . 
E 4 HOH A 86 387 380 HOH WAT . 
E 4 HOH A 87 388 381 HOH WAT . 
E 4 HOH A 88 389 382 HOH WAT . 
E 4 HOH A 89 390 383 HOH WAT . 
E 4 HOH A 90 391 384 HOH WAT . 
E 4 HOH A 91 392 385 HOH WAT . 
E 4 HOH A 92 393 386 HOH WAT . 
E 4 HOH A 93 394 387 HOH WAT . 
E 4 HOH A 94 395 388 HOH WAT . 
E 4 HOH A 95 396 389 HOH WAT . 
E 4 HOH A 96 397 390 HOH WAT . 
E 4 HOH A 97 398 391 HOH WAT . 
E 4 HOH A 98 399 392 HOH WAT . 
E 4 HOH A 99 400 393 HOH WAT . 
E 4 HOH A 100 401 394 HOH WAT . 
E 4 HOH A 101 402 395 HOH WAT . 
E 4 HOH A 102 403 396 HOH WAT . 
E 4 HOH A 103 404 397 HOH WAT . 
E 4 HOH A 104 405 398 HOH WAT . 
E 4 HOH A 105 406 399 HOH WAT . 
E 4 HOH A 106 407 400 HOH WAT . 
E 4 HOH A 107 408 401 HOH WAT . 
E 4 HOH A 108 409 402 HOH WAT . 
E 4 HOH A 109 410 403 HOH WAT . 
E 4 HOH A 110 411 404 HOH WAT . 
E 4 HOH A 111 412 405 HOH WAT . 
E 4 HOH A 112 413 406 HOH WAT . 
E 4 HOH A 113 414 407 HOH WAT . 
E 4 HOH A 114 415 408 HOH WAT . 
E 4 HOH A 115 416 409 HOH WAT . 
E 4 HOH A 116 417 410 HOH WAT . 
E 4 HOH A 117 418 411 HOH WAT . 
E 4 HOH A 118 419 412 HOH WAT . 
E 4 HOH A 119 420 413 HOH WAT . 
E 4 HOH A 120 421 414 HOH WAT . 
E 4 HOH A 121 422 415 HOH WAT . 
E 4 HOH A 122 423 416 HOH WAT . 
E 4 HOH A 123 424 417 HOH WAT . 
E 4 HOH A 124 425 418 HOH WAT . 
E 4 HOH A 125 426 419 HOH WAT . 
E 4 HOH A 126 427 420 HOH WAT . 
E 4 HOH A 127 428 421 HOH WAT . 
E 4 HOH A 128 429 422 HOH WAT . 
E 4 HOH A 129 430 423 HOH WAT . 
E 4 HOH A 130 431 424 HOH WAT . 
E 4 HOH A 131 432 425 HOH WAT . 
E 4 HOH A 132 433 426 HOH WAT . 
E 4 HOH A 133 434 427 HOH WAT . 
E 4 HOH A 134 435 428 HOH WAT . 
E 4 HOH A 135 436 429 HOH WAT . 
E 4 HOH A 136 437 430 HOH WAT . 
E 4 HOH A 137 438 431 HOH WAT . 
E 4 HOH A 138 439 432 HOH WAT . 
E 4 HOH A 139 440 433 HOH WAT . 
E 4 HOH A 140 441 434 HOH WAT . 
E 4 HOH A 141 442 435 HOH WAT . 
E 4 HOH A 142 443 436 HOH WAT . 
E 4 HOH A 143 444 437 HOH WAT . 
E 4 HOH A 144 445 438 HOH WAT . 
E 4 HOH A 145 446 439 HOH WAT . 
E 4 HOH A 146 447 440 HOH WAT . 
E 4 HOH A 147 448 441 HOH WAT . 
E 4 HOH A 148 449 442 HOH WAT . 
E 4 HOH A 149 450 443 HOH WAT . 
E 4 HOH A 150 451 444 HOH WAT . 
E 4 HOH A 151 452 445 HOH WAT . 
E 4 HOH A 152 453 446 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         C 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               -41.477 
_atom_site.Cartn_y               58.89 
_atom_site.Cartn_z               23.174 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        29.06 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           300 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              66 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    4 
_model_server_stats.query_time_ms           295 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           1 
#