data_2O01
#
_model_server_result.job_id            UfZ1NzkZdw8LhFksr4gKZQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-25 07:58:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2o01 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"ID","auth_seq_id":3103}' 
#
_entry.id    2O01 
#
_exptl.entry_id    2O01 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              351.64 
_entity.id                          21 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          95.19 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2O01 
_cell.length_a            120.054 
_cell.length_b            188.784 
_cell.length_c            127.518 
_cell.Z_PDB               2 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2O01 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    heptadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      17 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 21 ED N N 
? 21 HD N N 
? 21 ID N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A SG CYS 586 A CYS 590 1_555 ED S1 SF4 . B SF4 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
covale ? covale2 C CB CYS 10 C CYS 11 1_555 ID S1 SF4 . C SF4 3103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
covale ? covale3 C SG CYS 10 C CYS 11 1_555 ID S1 SF4 . C SF4 3103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? 
covale ? covale4 F OE1 GLU 143 F GLU 143 1_555 F OE1 GLU 148 F GLU 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? 
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 78 A HIS 82 1_555 T MG CLA . A CLA 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 81 A GLN 85 1_555 U MG CLA . A CLA 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc3 A NE2 HIS 95 A HIS 99 1_555 V MG CLA . A CLA 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? 
metalc ? metalc4 A NE2 GLN 125 A GLN 129 1_555 X MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
metalc ? metalc5 A ND1 HIS 394 A HIS 398 1_555 MA MG CLA . A CLA 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc6 A NE2 HIS 395 A HIS 399 1_555 NA MG CLA . A CLA 1127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 586 A CYS 590 1_555 ED FE4 SF4 . B SF4 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 92 B ASP 93 1_555 UB MG CLA . B CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? 
metalc ? metalc9 B ND1 HIS 192 B HIS 193 1_555 ZB MG CLA . B CLA 1211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc10 B NE2 HIS 274 B HIS 275 1_555 BC MG CLA . B CLA 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc11 B NE2 HIS 276 B HIS 277 1_555 DC MG CLA . B CLA 1215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc12 B NE2 HIS 307 B HIS 308 1_555 HC MG CLA . B CLA 1219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? 
metalc ? metalc13 B NE2 HIS 413 B HIS 414 1_555 PC MG CLA . B CLA 1227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc14 B SG CYS 558 B CYS 559 1_555 ED FE1 SF4 . B SF4 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc15 B N ASP 559 B ASP 560 1_555 ED FE1 SF4 . B SF4 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.736 ? 
metalc ? metalc16 B N GLY 560 B GLY 561 1_555 ED FE1 SF4 . B SF4 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? 
metalc ? metalc17 B SG CYS 567 B CYS 568 1_555 ED FE2 SF4 . B SF4 3101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? 
metalc ? metalc18 B NE2 HIS 653 B HIS 654 1_555 MB MG CLA . B CLA 9010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? 
metalc ? metalc19 SB O2A CLA . B CLA 1203 1_555 OC MG CLA . B CLA 1226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.997 ? 
metalc ? metalc20 C N ILE 11 C ILE 12 1_555 ID FE3 SF4 . C SF4 3103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.84 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 47 C CYS 48 1_555 HD FE1 SF4 . C SF4 3102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? 
metalc ? metalc22 C O VAL 48 C VAL 49 1_555 HD FE4 SF4 . C SF4 3102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? 
metalc ? metalc23 C N CYS 50 C CYS 51 1_555 HD FE4 SF4 . C SF4 3102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? 
metalc ? metalc24 C SG CYS 53 C CYS 54 1_555 HD FE3 SF4 . C SF4 3102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? 
metalc ? metalc25 H OE1 GLN 16 H GLN 36 1_555 UD MG CLA . H CLA 1505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.825 ? 
metalc ? metalc26 L NE2 HIS 56 L HIS 60 1_555 FE MG CLA . L CLA 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? 
metalc ? metalc27 N OE1 GLU 105 1 GLU 109 1_555 OE MG CLA . 1 CLA 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? 
metalc ? metalc28 P OE2 GLU 24 3 GLU 77 1_555 OF MG CLA . 3 CLA 3006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe4 S4' 
_chem_comp.formula_weight    351.64 
_chem_comp.id                SF4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'IRON/SULFUR CLUSTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE1 S2 SF4 sing 610 n n 
FE1 S3 SF4 sing 611 n n 
FE1 S4 SF4 sing 612 n n 
FE2 S1 SF4 sing 613 n n 
FE2 S3 SF4 sing 614 n n 
FE2 S4 SF4 sing 615 n n 
FE3 S1 SF4 sing 616 n n 
FE3 S2 SF4 sing 617 n n 
FE3 S4 SF4 sing 618 n n 
FE4 S1 SF4 sing 619 n n 
FE4 S2 SF4 sing 620 n n 
FE4 S3 SF4 sing 621 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2O01 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.00833 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000757 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.005297 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007874 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
R 18 CLA A 1 1101 1101 CLA CLA . 
S 18 CLA A 1 1102 1102 CLA CLA . 
T 18 CLA A 1 1103 1103 CLA CLA . 
U 18 CLA A 1 1104 1104 CLA CLA . 
V 18 CLA A 1 1105 1105 CLA CLA . 
W 18 CLA A 1 1106 1106 CLA CLA . 
X 18 CLA A 1 1107 1107 CLA CLA . 
Y 18 CLA A 1 1108 1108 CLA CLA . 
Z 18 CLA A 1 1109 1109 CLA CLA . 
AA 18 CLA A 1 1110 1110 CLA CLA . 
BA 18 CLA A 1 1111 1111 CLA CLA . 
CA 18 CLA A 1 1113 1113 CLA CLA . 
DA 18 CLA A 1 1115 1115 CLA CLA . 
EA 18 CLA A 1 1116 1116 CLA CLA . 
FA 18 CLA A 1 1117 1117 CLA CLA . 
GA 18 CLA A 1 1118 1118 CLA CLA . 
HA 18 CLA A 1 1119 1119 CLA CLA . 
IA 18 CLA A 1 1120 1120 CLA CLA . 
JA 18 CLA A 1 1122 1122 CLA CLA . 
KA 18 CLA A 1 1123 1123 CLA CLA . 
LA 18 CLA A 1 1124 1124 CLA CLA . 
MA 18 CLA A 1 1126 1126 CLA CLA . 
NA 18 CLA A 1 1127 1127 CLA CLA . 
OA 18 CLA A 1 1128 1128 CLA CLA . 
PA 18 CLA A 1 1129 1129 CLA CLA . 
QA 18 CLA A 1 1131 1131 CLA CLA . 
RA 18 CLA A 1 1132 1132 CLA CLA . 
SA 18 CLA A 1 1133 1133 CLA CLA . 
TA 18 CLA A 1 1134 1134 CLA CLA . 
UA 18 CLA A 1 1135 1135 CLA CLA . 
VA 18 CLA A 1 1136 1136 CLA CLA . 
WA 18 CLA A 1 1137 1137 CLA CLA . 
XA 18 CLA A 1 1140 1140 CLA CLA . 
YA 18 CLA A 1 1142 1142 CLA CLA . 
ZA 18 CLA A 1 1143 1143 CLA CLA . 
AB 18 CLA A 1 1144 1144 CLA CLA . 
BB 18 CLA A 1 1146 1146 CLA CLA . 
CB 18 CLA A 1 1147 1147 CLA CLA . 
DB 18 CLA A 1 1148 1148 CLA CLA . 
EB 18 CLA A 1 1151 1151 CLA CLA . 
FB 18 CLA A 1 1152 1152 CLA CLA . 
GB 18 CLA A 1 9011 9011 CLA CLA . 
HB 18 CLA A 1 9013 9013 CLA CLA . 
IB 18 CLA A 1 1309 1309 CLA CLA . 
JB 19 PQN A 1 5001 5001 PQN PQN . 
KB 20 BCR A 1 6011 6011 BCR BCR . 
LB 18 CLA B 1 1138 1138 CLA CLA . 
MB 18 CLA B 1 9010 9010 CLA CLA . 
NB 18 CLA B 1 9012 9012 CLA CLA . 
OB 18 CLA B 1 9022 9022 CLA CLA . 
PB 18 CLA B 1 9023 9023 CLA CLA . 
QB 18 CLA B 1 1201 1201 CLA CLA . 
RB 18 CLA B 1 1202 1202 CLA CLA . 
SB 18 CLA B 1 1203 1203 CLA CLA . 
TB 18 CLA B 1 1205 1205 CLA CLA . 
UB 18 CLA B 1 1206 1206 CLA CLA . 
VB 18 CLA B 1 1207 1207 CLA CLA . 
WB 18 CLA B 1 1208 1208 CLA CLA . 
XB 18 CLA B 1 1209 1209 CLA CLA . 
YB 18 CLA B 1 1210 1210 CLA CLA . 
ZB 18 CLA B 1 1211 1211 CLA CLA . 
AC 18 CLA B 1 1212 1212 CLA CLA . 
BC 18 CLA B 1 1213 1213 CLA CLA . 
CC 18 CLA B 1 1214 1214 CLA CLA . 
DC 18 CLA B 1 1215 1215 CLA CLA . 
EC 18 CLA B 1 1216 1216 CLA CLA . 
FC 18 CLA B 1 1217 1217 CLA CLA . 
GC 18 CLA B 1 1218 1218 CLA CLA . 
HC 18 CLA B 1 1219 1219 CLA CLA . 
IC 18 CLA B 1 1220 1220 CLA CLA . 
JC 18 CLA B 1 1221 1221 CLA CLA . 
KC 18 CLA B 1 1222 1222 CLA CLA . 
LC 18 CLA B 1 1223 1223 CLA CLA . 
MC 18 CLA B 1 1224 1224 CLA CLA . 
NC 18 CLA B 1 1225 1225 CLA CLA . 
OC 18 CLA B 1 1226 1226 CLA CLA . 
PC 18 CLA B 1 1227 1227 CLA CLA . 
QC 18 CLA B 1 1228 1228 CLA CLA . 
RC 18 CLA B 1 1229 1229 CLA CLA . 
SC 18 CLA B 1 1230 1230 CLA CLA . 
TC 18 CLA B 1 1231 1231 CLA CLA . 
UC 18 CLA B 1 1232 1232 CLA CLA . 
VC 18 CLA B 1 1234 1234 CLA CLA . 
WC 18 CLA B 1 1235 1235 CLA CLA . 
XC 18 CLA B 1 1236 1236 CLA CLA . 
YC 18 CLA B 1 1237 1237 CLA CLA . 
ZC 18 CLA B 1 1238 1238 CLA CLA . 
AD 18 CLA B 1 1239 1239 CLA CLA . 
BD 18 CLA B 1 1241 1241 CLA CLA . 
CD 18 CLA B 1 1242 1242 CLA CLA . 
DD 18 CLA B 1 1301 1301 CLA CLA . 
ED 21 SF4 B 1 3101 3101 SF4 SF4 . 
FD 19 PQN B 1 5002 5002 PQN PQN . 
GD 20 BCR B 1 6017 6017 BCR BCR . 
HD 21 SF4 C 1 3102 3102 SF4 SF4 . 
ID 21 SF4 C 1 3103 3103 SF4 SF4 . 
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