data_2OLQ # _model_server_result.job_id yMr-7hkpnXkoTGkKQkbkKQ _model_server_result.datetime_utc '2024-12-01 04:15:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2olq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":998}' # _entry.id 2OLQ # _exptl.entry_id 2OLQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 54.938 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MANGANESE (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 96.22 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2OLQ _cell.length_a 125.584 _cell.length_b 91.369 _cell.length_c 46.577 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2OLQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NZ LYS 213 A LYS 213 1_555 B MN MN . A MN 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 232 A HIS 232 1_555 B MN MN . A MN 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 255 A THR 255 1_555 C MG MG . A MG 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 269 A ASP 269 1_555 B MN MN . A MN 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc5 D O1G ATP . A ATP 541 1_555 B MN MN . A MN 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc6 D O2B ATP . A ATP 541 1_555 C MG MG . A MG 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc7 D O3G ATP . A ATP 541 1_555 C MG MG . A MG 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc8 F O HOH . A HOH 605 1_555 C MG MG . A MG 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc9 F O HOH . A HOH 619 1_555 C MG MG . A MG 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc10 F O HOH . A HOH 776 1_555 C MG MG . A MG 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc11 F O HOH . A HOH 777 1_555 B MN MN . A MN 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc12 F O HOH . A HOH 801 1_555 B MN MN . A MN 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? # _chem_comp.formula 'Mn 2' _chem_comp.formula_weight 54.938 _chem_comp.id MN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MANGANESE (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2OLQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007963 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000868 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010945 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.021597 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MN A 1 998 998 MN MN . C 3 MG A 1 999 999 MG MG . D 4 ATP A 1 541 541 ATP ATP . E 5 CO2 A 1 542 542 CO2 CO2 . F 6 HOH A 1 605 605 HOH WAT . F 6 HOH A 2 606 606 HOH WAT . F 6 HOH A 3 607 607 HOH WAT . F 6 HOH A 4 609 609 HOH WAT . F 6 HOH A 5 610 610 HOH WAT . F 6 HOH A 6 611 611 HOH WAT . F 6 HOH A 7 612 612 HOH WAT . F 6 HOH A 8 613 613 HOH WAT . F 6 HOH A 9 614 614 HOH WAT . F 6 HOH A 10 615 615 HOH WAT . F 6 HOH A 11 616 616 HOH WAT . F 6 HOH A 12 617 617 HOH WAT . F 6 HOH A 13 618 618 HOH WAT . F 6 HOH A 14 619 619 HOH WAT . F 6 HOH A 15 620 620 HOH WAT . F 6 HOH A 16 621 621 HOH WAT . F 6 HOH A 17 622 622 HOH WAT . F 6 HOH A 18 623 623 HOH WAT . F 6 HOH A 19 624 624 HOH WAT . F 6 HOH A 20 625 625 HOH WAT . F 6 HOH A 21 626 626 HOH WAT . F 6 HOH A 22 627 627 HOH WAT . F 6 HOH A 23 629 629 HOH WAT . F 6 HOH A 24 630 630 HOH WAT . F 6 HOH A 25 631 631 HOH WAT . F 6 HOH A 26 632 632 HOH WAT . F 6 HOH A 27 633 633 HOH WAT . F 6 HOH A 28 634 634 HOH WAT . F 6 HOH A 29 635 635 HOH WAT . F 6 HOH A 30 636 636 HOH WAT . F 6 HOH A 31 637 637 HOH WAT . F 6 HOH A 32 638 638 HOH WAT . F 6 HOH A 33 639 639 HOH WAT . F 6 HOH A 34 640 640 HOH WAT . F 6 HOH A 35 641 641 HOH WAT . F 6 HOH A 36 642 642 HOH WAT . F 6 HOH A 37 643 643 HOH WAT . F 6 HOH A 38 644 644 HOH WAT . F 6 HOH A 39 646 646 HOH WAT . F 6 HOH A 40 647 647 HOH WAT . F 6 HOH A 41 648 648 HOH WAT . F 6 HOH A 42 649 649 HOH WAT . F 6 HOH A 43 650 650 HOH WAT . F 6 HOH A 44 651 651 HOH WAT . F 6 HOH A 45 653 653 HOH WAT . F 6 HOH A 46 654 654 HOH WAT . F 6 HOH A 47 655 655 HOH WAT . F 6 HOH A 48 656 656 HOH WAT . F 6 HOH A 49 658 658 HOH WAT . F 6 HOH A 50 659 659 HOH WAT . F 6 HOH A 51 660 660 HOH WAT . F 6 HOH A 52 661 661 HOH WAT . F 6 HOH A 53 662 662 HOH WAT . F 6 HOH A 54 664 664 HOH WAT . F 6 HOH A 55 665 665 HOH WAT . F 6 HOH A 56 667 667 HOH WAT . F 6 HOH A 57 669 669 HOH WAT . F 6 HOH A 58 670 670 HOH WAT . F 6 HOH A 59 671 671 HOH WAT . F 6 HOH A 60 672 672 HOH WAT . F 6 HOH A 61 673 673 HOH WAT . F 6 HOH A 62 674 674 HOH WAT . F 6 HOH A 63 675 675 HOH WAT . F 6 HOH A 64 676 676 HOH WAT . F 6 HOH A 65 677 677 HOH WAT . F 6 HOH A 66 678 678 HOH WAT . F 6 HOH A 67 679 679 HOH WAT . F 6 HOH A 68 680 680 HOH WAT . F 6 HOH A 69 681 681 HOH WAT . F 6 HOH A 70 683 683 HOH WAT . F 6 HOH A 71 684 684 HOH WAT . F 6 HOH A 72 685 685 HOH WAT . F 6 HOH A 73 686 686 HOH WAT . F 6 HOH A 74 687 687 HOH WAT . F 6 HOH A 75 688 688 HOH WAT . F 6 HOH A 76 689 689 HOH WAT . F 6 HOH A 77 691 691 HOH WAT . F 6 HOH A 78 692 692 HOH WAT . F 6 HOH A 79 693 693 HOH WAT . F 6 HOH A 80 695 695 HOH WAT . F 6 HOH A 81 697 697 HOH WAT . F 6 HOH A 82 698 698 HOH WAT . F 6 HOH A 83 699 699 HOH WAT . F 6 HOH A 84 700 700 HOH WAT . F 6 HOH A 85 701 701 HOH WAT . F 6 HOH A 86 702 702 HOH WAT . F 6 HOH A 87 704 704 HOH WAT . F 6 HOH A 88 705 705 HOH WAT . F 6 HOH A 89 706 706 HOH WAT . F 6 HOH A 90 707 707 HOH WAT . F 6 HOH A 91 710 710 HOH WAT . F 6 HOH A 92 711 711 HOH WAT . F 6 HOH A 93 713 713 HOH WAT . F 6 HOH A 94 714 714 HOH WAT . F 6 HOH A 95 718 718 HOH WAT . F 6 HOH A 96 719 719 HOH WAT . F 6 HOH A 97 720 720 HOH WAT . F 6 HOH A 98 721 721 HOH WAT . F 6 HOH A 99 725 725 HOH WAT . F 6 HOH A 100 729 729 HOH WAT . F 6 HOH A 101 730 730 HOH WAT . F 6 HOH A 102 731 731 HOH WAT . F 6 HOH A 103 732 732 HOH WAT . F 6 HOH A 104 735 735 HOH WAT . F 6 HOH A 105 736 736 HOH WAT . F 6 HOH A 106 738 738 HOH WAT . F 6 HOH A 107 740 740 HOH WAT . F 6 HOH A 108 743 743 HOH WAT . F 6 HOH A 109 744 744 HOH WAT . F 6 HOH A 110 748 748 HOH WAT . F 6 HOH A 111 752 752 HOH WAT . F 6 HOH A 112 753 753 HOH WAT . F 6 HOH A 113 755 755 HOH WAT . F 6 HOH A 114 759 759 HOH WAT . F 6 HOH A 115 761 761 HOH WAT . F 6 HOH A 116 762 762 HOH WAT . F 6 HOH A 117 776 776 HOH WAT . F 6 HOH A 118 777 777 HOH WAT . F 6 HOH A 119 778 778 HOH WAT . F 6 HOH A 120 779 779 HOH WAT . F 6 HOH A 121 781 781 HOH WAT . F 6 HOH A 122 783 783 HOH WAT . F 6 HOH A 123 784 784 HOH WAT . F 6 HOH A 124 785 785 HOH WAT . F 6 HOH A 125 786 786 HOH WAT . F 6 HOH A 126 787 787 HOH WAT . F 6 HOH A 127 788 788 HOH WAT . F 6 HOH A 128 789 789 HOH WAT . F 6 HOH A 129 790 790 HOH WAT . F 6 HOH A 130 791 791 HOH WAT . F 6 HOH A 131 792 792 HOH WAT . F 6 HOH A 132 793 793 HOH WAT . F 6 HOH A 133 794 794 HOH WAT . F 6 HOH A 134 795 795 HOH WAT . F 6 HOH A 135 796 796 HOH WAT . F 6 HOH A 136 797 797 HOH WAT . F 6 HOH A 137 798 798 HOH WAT . F 6 HOH A 138 799 799 HOH WAT . F 6 HOH A 139 801 801 HOH WAT . F 6 HOH A 140 802 802 HOH WAT . F 6 HOH A 141 803 803 HOH WAT . F 6 HOH A 142 804 804 HOH WAT . F 6 HOH A 143 805 805 HOH WAT . F 6 HOH A 144 806 806 HOH WAT . F 6 HOH A 145 807 807 HOH WAT . F 6 HOH A 146 808 808 HOH WAT . F 6 HOH A 147 809 809 HOH WAT . F 6 HOH A 148 810 810 HOH WAT . F 6 HOH A 149 811 811 HOH WAT . F 6 HOH A 150 812 812 HOH WAT . F 6 HOH A 151 813 813 HOH WAT . F 6 HOH A 152 815 815 HOH WAT . F 6 HOH A 153 816 816 HOH WAT . F 6 HOH A 154 817 817 HOH WAT . F 6 HOH A 155 818 818 HOH WAT . F 6 HOH A 156 819 819 HOH WAT . F 6 HOH A 157 821 821 HOH WAT . F 6 HOH A 158 822 822 HOH WAT . F 6 HOH A 159 823 823 HOH WAT . F 6 HOH A 160 825 825 HOH WAT . F 6 HOH A 161 826 826 HOH WAT . F 6 HOH A 162 828 828 HOH WAT . F 6 HOH A 163 829 829 HOH WAT . F 6 HOH A 164 830 830 HOH WAT . F 6 HOH A 165 831 831 HOH WAT . F 6 HOH A 166 832 832 HOH WAT . F 6 HOH A 167 833 833 HOH WAT . F 6 HOH A 168 834 834 HOH WAT . F 6 HOH A 169 836 836 HOH WAT . F 6 HOH A 170 838 838 HOH WAT . F 6 HOH A 171 839 839 HOH WAT . F 6 HOH A 172 840 840 HOH WAT . F 6 HOH A 173 841 841 HOH WAT . F 6 HOH A 174 842 842 HOH WAT . F 6 HOH A 175 843 843 HOH WAT . F 6 HOH A 176 844 844 HOH WAT . F 6 HOH A 177 846 846 HOH WAT . F 6 HOH A 178 847 847 HOH WAT . F 6 HOH A 179 848 848 HOH WAT . F 6 HOH A 180 849 849 HOH WAT . F 6 HOH A 181 850 850 HOH WAT . F 6 HOH A 182 851 851 HOH WAT . F 6 HOH A 183 852 852 HOH WAT . F 6 HOH A 184 853 853 HOH WAT . F 6 HOH A 185 854 854 HOH WAT . F 6 HOH A 186 855 855 HOH WAT . F 6 HOH A 187 856 856 HOH WAT . F 6 HOH A 188 857 857 HOH WAT . F 6 HOH A 189 858 858 HOH WAT . F 6 HOH A 190 859 859 HOH WAT . F 6 HOH A 191 860 860 HOH WAT . F 6 HOH A 192 861 861 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MN _atom_site.label_atom_id MN _atom_site.label_comp_id MN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 26.177 _atom_site.Cartn_y 49.119 _atom_site.Cartn_z 36.275 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 11.4 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MN _atom_site.auth_comp_id MN _atom_site.auth_seq_id 998 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 308 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #