data_2OQ4
#
_model_server_result.job_id            8lkkgKfFQ8x04L1Mbjy5eA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 08:53:31' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2oq4 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    2OQ4 
#
_exptl.entry_id    2OQ4 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2OQ4 
_cell.length_a            107.13 
_cell.length_b            107.13 
_cell.length_c            164.86 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2OQ4 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? trimeric 3 author_defined_assembly 1 
? trimeric 3 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,H,I,N,O,R 1 1 
C,D,F,G,J,K,L,M,P,Q,S 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 H N N 
? 5 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 B O3' DA 6 D DA 426 1_555 B P PED 7 D PED 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.609 ? 
covale ? covale2 B O3' PED 7 D PED 427 1_555 B P DG 8 D DG 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.601 ? 
covale ? covale3 B C1' PED 7 D PED 427 1_555 E N PRO 1 A PRO 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? 
covale ? covale4 D O3' DA 6 F DA 426 1_555 D P PED 7 F PED 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.599 ? 
covale ? covale5 D O3' PED 7 F PED 427 1_555 D P DG 8 F DG 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.612 ? 
covale ? covale6 D C1' PED 7 F PED 427 1_555 F N PRO 1 B PRO 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? 
metalc ? metalc1 E SG CYS 237 A CYS 237 1_555 H ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? 
metalc ? metalc2 E SG CYS 240 A CYS 240 1_555 H ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? 
metalc ? metalc3 E SG CYS 257 A CYS 257 1_555 H ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? 
metalc ? metalc4 E SG CYS 260 A CYS 260 1_555 H ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? 
metalc ? metalc5 F SG CYS 237 B CYS 237 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc6 F SG CYS 240 B CYS 240 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? 
metalc ? metalc7 F SG CYS 257 B CYS 257 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? 
metalc ? metalc8 F SG CYS 260 B CYS 260 1_555 J ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog1 A O6 DG 2 C DG 402 1_555 B N4 DC 12 D DC 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N3 DC 3 C DC 403 1_555 B N1 DG 11 D DG 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A N4 DC 3 C DC 403 1_555 B O6 DG 11 D DG 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A O2 DC 3 C DC 403 1_555 B N2 DG 11 D DG 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N3 DT 5 C DT 405 1_555 B N1 DA 9 D DA 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O4 DT 5 C DT 405 1_555 B N6 DA 9 D DA 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog7 A N3 DT 5 C DT 405 1_555 B N1 DA 10 D DA 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N3 DT 8 C DT 408 1_555 B N1 DA 6 D DA 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O4 DT 8 C DT 408 1_555 B N6 DA 6 D DA 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N3 DC 9 C DC 409 1_555 B N1 DG 5 D DG 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N4 DC 9 C DC 409 1_555 B O6 DG 5 D DG 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O2 DC 9 C DC 409 1_555 B N2 DG 5 D DG 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog13 A N4 DC 10 C DC 410 1_555 B O6 DG 4 D DG 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N1 DG 12 C DG 412 1_555 B N3 DC 2 D DC 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N2 DG 12 C DG 412 1_555 B O2 DC 2 D DC 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O6 DG 12 C DG 412 1_555 B N4 DC 2 D DC 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N3 DT 4 E DT 404 1_555 D N1 DA 10 F DA 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C O4 DT 4 E DT 404 1_555 D N6 DA 10 F DA 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N3 DT 5 E DT 405 1_555 D N1 DA 9 F DA 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C O4 DT 5 E DT 405 1_555 D N6 DA 9 F DA 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N3 DC 6 E DC 406 1_555 D N1 DG 8 F DG 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N4 DC 6 E DC 406 1_555 D O6 DG 8 F DG 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C O2 DC 6 E DC 406 1_555 D N2 DG 8 F DG 428 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog24 C O4 DT 8 E DT 408 1_555 D N6 DA 6 F DA 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N3 DC 9 E DC 409 1_555 D N1 DG 5 F DG 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N4 DC 9 E DC 409 1_555 D O6 DG 5 F DG 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C O2 DC 9 E DC 409 1_555 D N2 DG 5 F DG 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C N3 DT 11 E DT 411 1_555 D N1 DA 3 F DA 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C O4 DT 11 E DT 411 1_555 D N6 DA 3 F DA 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog30 C N2 DG 12 E DG 412 1_555 D N3 DC 2 F DC 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2OQ4 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009334 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009334 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006066 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 4 NA F 1 701 701 NA NA . 
H 5 ZN A 1 501 501 ZN ZN . 
I 6 SO4 A 1 601 601 SO4 SO4 . 
J 5 ZN B 1 501 501 ZN ZN . 
K 6 SO4 B 1 602 602 SO4 SO4 . 
L 6 SO4 B 1 603 603 SO4 SO4 . 
M 4 NA B 1 702 702 NA NA . 
N 7 HOH C 1 1103 1103 HOH WAT . 
N 7 HOH C 2 1104 1104 HOH WAT . 
O 7 HOH D 1 1018 1018 HOH WAT . 
O 7 HOH D 2 1028 1028 HOH WAT . 
O 7 HOH D 3 1040 1040 HOH WAT . 
O 7 HOH D 4 1041 1041 HOH WAT . 
O 7 HOH D 5 1053 1053 HOH WAT . 
O 7 HOH D 6 1056 1056 HOH WAT . 
P 7 HOH E 1 1005 1005 HOH WAT . 
P 7 HOH E 2 1065 1065 HOH WAT . 
Q 7 HOH F 1 1058 1058 HOH WAT . 
Q 7 HOH F 2 1088 1088 HOH WAT . 
Q 7 HOH F 3 1092 1092 HOH WAT . 
Q 7 HOH F 4 1093 1093 HOH WAT . 
Q 7 HOH F 5 1098 1098 HOH WAT . 
Q 7 HOH F 6 1114 1114 HOH WAT . 
R 7 HOH A 1 1001 1001 HOH WAT . 
R 7 HOH A 2 1010 1010 HOH WAT . 
R 7 HOH A 3 1011 1011 HOH WAT . 
R 7 HOH A 4 1012 1012 HOH WAT . 
R 7 HOH A 5 1020 1020 HOH WAT . 
R 7 HOH A 6 1021 1021 HOH WAT . 
R 7 HOH A 7 1023 1023 HOH WAT . 
R 7 HOH A 8 1024 1024 HOH WAT . 
R 7 HOH A 9 1025 1025 HOH WAT . 
R 7 HOH A 10 1026 1026 HOH WAT . 
R 7 HOH A 11 1031 1031 HOH WAT . 
R 7 HOH A 12 1032 1032 HOH WAT . 
R 7 HOH A 13 1033 1033 HOH WAT . 
R 7 HOH A 14 1034 1034 HOH WAT . 
R 7 HOH A 15 1042 1042 HOH WAT . 
R 7 HOH A 16 1046 1046 HOH WAT . 
R 7 HOH A 17 1052 1052 HOH WAT . 
R 7 HOH A 18 1055 1055 HOH WAT . 
R 7 HOH A 19 1057 1057 HOH WAT . 
R 7 HOH A 20 1061 1061 HOH WAT . 
R 7 HOH A 21 1063 1063 HOH WAT . 
R 7 HOH A 22 1067 1067 HOH WAT . 
R 7 HOH A 23 1068 1068 HOH WAT . 
R 7 HOH A 24 1069 1069 HOH WAT . 
R 7 HOH A 25 1073 1073 HOH WAT . 
R 7 HOH A 26 1075 1075 HOH WAT . 
R 7 HOH A 27 1076 1076 HOH WAT . 
R 7 HOH A 28 1077 1077 HOH WAT . 
R 7 HOH A 29 1081 1081 HOH WAT . 
R 7 HOH A 30 1083 1083 HOH WAT . 
R 7 HOH A 31 1090 1090 HOH WAT . 
R 7 HOH A 32 1094 1094 HOH WAT . 
R 7 HOH A 33 1095 1095 HOH WAT . 
R 7 HOH A 34 1096 1096 HOH WAT . 
R 7 HOH A 35 1113 1113 HOH WAT . 
R 7 HOH A 36 1115 1115 HOH WAT . 
R 7 HOH A 37 1116 1116 HOH WAT . 
R 7 HOH A 38 1119 1119 HOH WAT . 
S 7 HOH B 1 1003 1003 HOH WAT . 
S 7 HOH B 2 1004 1004 HOH WAT . 
S 7 HOH B 3 1007 1007 HOH WAT . 
S 7 HOH B 4 1008 1008 HOH WAT . 
S 7 HOH B 5 1013 1013 HOH WAT . 
S 7 HOH B 6 1014 1014 HOH WAT . 
S 7 HOH B 7 1016 1016 HOH WAT . 
S 7 HOH B 8 1017 1017 HOH WAT . 
S 7 HOH B 9 1019 1019 HOH WAT . 
S 7 HOH B 10 1022 1022 HOH WAT . 
S 7 HOH B 11 1027 1027 HOH WAT . 
S 7 HOH B 12 1035 1035 HOH WAT . 
S 7 HOH B 13 1036 1036 HOH WAT . 
S 7 HOH B 14 1037 1037 HOH WAT . 
S 7 HOH B 15 1039 1039 HOH WAT . 
S 7 HOH B 16 1044 1044 HOH WAT . 
S 7 HOH B 17 1045 1045 HOH WAT . 
S 7 HOH B 18 1047 1047 HOH WAT . 
S 7 HOH B 19 1048 1048 HOH WAT . 
S 7 HOH B 20 1049 1049 HOH WAT . 
S 7 HOH B 21 1051 1051 HOH WAT . 
S 7 HOH B 22 1054 1054 HOH WAT . 
S 7 HOH B 23 1059 1059 HOH WAT . 
S 7 HOH B 24 1062 1062 HOH WAT . 
S 7 HOH B 25 1066 1066 HOH WAT . 
S 7 HOH B 26 1071 1071 HOH WAT . 
S 7 HOH B 27 1072 1072 HOH WAT . 
S 7 HOH B 28 1074 1074 HOH WAT . 
S 7 HOH B 29 1080 1080 HOH WAT . 
S 7 HOH B 30 1085 1085 HOH WAT . 
S 7 HOH B 31 1087 1087 HOH WAT . 
S 7 HOH B 32 1089 1089 HOH WAT . 
S 7 HOH B 33 1091 1091 HOH WAT . 
S 7 HOH B 34 1097 1097 HOH WAT . 
S 7 HOH B 35 1099 1099 HOH WAT . 
S 7 HOH B 36 1100 1100 HOH WAT . 
S 7 HOH B 37 1101 1101 HOH WAT . 
S 7 HOH B 38 1102 1102 HOH WAT . 
S 7 HOH B 39 1117 1117 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       5 
_atom_site.Cartn_x               82.256 
_atom_site.Cartn_y               34.489 
_atom_site.Cartn_z               -118.012 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        66.7 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           501 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              11 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    7 
_model_server_stats.query_time_ms           291 
_model_server_stats.encode_time_ms          7 
_model_server_stats.element_count           1 
#